• 생명과학회지
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• 제20권8호
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• pp.1214-1220
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• 2010

대한민국 순천의 병원 입원 환자의 검체로부터 imipenem 내성 세균을 분리하였다. 54개의 분리균을 16S rRNA 유전자와 gyrB 유전자 염기서열 비교를 기초로 하여 계통분류학적으로 동정하였다. 분리균들은 Pseudomonas aeruginosa (30균주; 55.6%), Acinetobacter baumannii (21; 38.9%), Enterobacter hormaechei (2)와 Pseudomonas putida (2)에 속했다. 22개의 균주가 metallo-$\beta$-lactamase (MBL)를 생산하였으며 종별 구성은 다음과 같다; Acinetobacter baumannii 12균주, Pseudomonas aeruginosa 7균주, P. putida 2균주 그리고 Enterobacter hormaechei 1균주. 분리균들의 항생제 감수성은 디스크 확산법과 Vitek 을 이용하여 조사하였다. IMP 와 VIM 형의 metallo-$\beta$-lactamase를 생산하는 균주들은 OXA 와 SHV 형 $\beta$-lactamase를 생산하는 균주들에 비해 ceftazidime, aztreonam, amikacin과 gentamicin에 대한 내성율이 높았다.

• 천문학회보
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• 제35권2호
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• pp.83.1-83.1
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• 2010

Recent observations of Sloan Digital Sky Survey (SDSS) for the ugriz filters have provided the largest and the most homogeneous photometric database. Especially, the ugriz systems have been used in many telescopes, such as SDSS, CFHT, and Gemini, and will be applied next generation large telescopes. In addition, many stellar evolution models, like as PADOVA, BaSTI and DSEP, have introduced theoretical isochrones in ugriz system, to apply the isochrones into the photometry of stars in globular clusters. In this study, we transformed Yonsei-Yale($Y^2$) isochrones to ugriz photometric system and fit the isochrones to the (g-r, r), (g-i, r), and (r-i, r) CMDs of 13 globular clusters (Chun et al. 2009, Clem et al. 2008, An et al. 2008). We found that the derived ages from $Y^2$-isochrones are 1~3Gyr younger and the estimated distance moduli are 0.3mag larger than the values inferred from the other isochrones in r-band. Also, the E(B-V) are 0.02~0.04mag less than those estimated from the other models. The ages of each globular cluster estimated from $Y^2$-isochrones are 12~14Gyr and distance moduli show good agreement with previous studies. From this result, we confirmed the availability of the $Y^2$-isochrones in gri filters. However, it is a problem which will improve that E(B-V) values obtained from $Y^2$-isochrones are too small. Finally, the result of this study is expected to be used research of globular cluster in ugirz photometric system.

• 한국균학회지
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• 제46권1호
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• pp.83-90
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• 2018

Podosphaera fusca에 의한 멜론 흰가루병은 우리나라에서 멜론의 심각한 식물병 중의 하나이다. 본 연구에서는 선발한 길항세균의 다양한 식물병원균에 대한 균사 생육 억제 및 메론 흰가루병 방제에 대한 효과를 평가하였다. 16S rDNA 및 gyrA 유전자의 염기서열을 바탕으로 선발한 길항세균 Bacillus sp. M09, M70 및 M99-1을 동정한 결과 B. velezensis로 동정되었다. B. velezensis M09, M70 및 M99-1는 다양한 식물병원균에 47~69%의 균사생육 억제 효과를 보였을뿐만 아니라 흰가루병균의 발생을 현저히 감소시켰다. 본 연구에서 선발한 3균주는 멜론 흰가루병뿐만 아니라 다양한 식물병에 대한 잠재적인 생물방제제로 활용될 수 있을 것으로 생각되었다.

• 천문학회지
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• 제32권2호
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• pp.119-126
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• 1999

The standard stellar models for $\alpha$ Cen A and B have been constructed without resorting to the arbitrary constraint of the Solar mixing length ratio. Assuming that the chemical compositions and the ages of the two stars are the same, series of models have been constructed. Using the observational constraints, [Z/X], we were able to constrain the number of the 'possible' models. We find that utilizing the observational constraints of [Z/X] the best models for $\alpha$ Cen system are with the initial Z = 0.03, X = 0.66$\~$0.67. In particular, the primary and the secondary stars may have the same mixing length ratio 1.6$\~$1.7, which is the same as that of the calibrated Solar model. And, the age of the system is about 5.4 Gyr. Finally, the large spacing of the p-modes is predicted to be 104 $\pm$ 4$\mu$Hz for $\alpha$ Cen A.

• 천문학회지
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• 제50권3호
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• pp.79-92
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• 2017

We present a BV I optical photometric study of the old open cluster Ruprecht 6 using the data obtained with the SMARTS 1.0 m telescope at the CTIO, Chile. Its color-magnitude diagrams show the clear existence of the main-sequence stars, whose turn-off point is located around $V{\approx}18.45mag$ and $B-V{\approx}0.85mag$. Three red clump (RC) stars are identified at V = 16.00 mag, I = 14.41 mag and B - V = 1.35 mag. From the mean $K_s-band$ magnitude of RC stars ($K_s=12.39{\pm}0.21mag$) in Ruprecht 6 from 2MASS photometry and the known absolute magnitudes of the RC stars ($M_{K_S}=-1.595{\pm}0.025mag$), we obtain the distance modulus to Ruprecht 6 of $(m-M)_0=13.84{\pm}0.21mag$ ($d=5.86{\pm}0.60kpc$). From the ($J-K_s$) and (B - V ) colors of the RC stars, comparison of the (B - V ) and (V - I) colors of the bright stars in Ruprecht 6 with those of the intrinsic colors of dwarf and giant stars, and the PARSEC isochrone fittings, we derive the reddening values of E(B - V ) = 0.42 mag and E(V - I) = 0.60 mag. Using the PARSEC isochrone fittings onto the color-magnitude diagrams, we estimate the age and metallicity to be: $log(t)=9.50{\pm}0.10(t=3.16{\pm}0.82Gyr)$ and $[Fe/H]=-0.42{\pm}0.04dex$. We present the Galactocentric radial metallicity gradient analysis for old (age > 1 Gyr) open clusters of the Dias et al. catalog, which likely follow a single relation of $[Fe/H]=(-0.034{\pm}0.007)R_{GC}+(0.190{\pm}0.080)$ (rms = 0.201) for the whole radial range or a dual relation of $[Fe/H]=(-0.077{\pm}0.017)R_{GC}+(0.609{\pm}0.161)$ (rms = 0.152) and constant ([Fe/H] ~ -0.3 dex) value, inside and outside of RGC ~ 12 kpc, respectively. The metallicity and Galactocentric radius ($13.28{\pm}0.54kpc$) of Ruprecht 6 obtained in this study seem to be consistent with both of the relations.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제49권3호
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• pp.440-448
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• 2021

Helicobacter pylori (H. pylori) establishes long-term infections associated with severe gastric diseases such as peptic ulceration and gastric cancer. Exposure to an antibacterial agent can help regulate the expression levels of its pathogenic genes. In this study, we analyzed the transcriptional changes in H. pylori genes induced by β-caryophyllene. We used next-generation sequencing (NGS) to analyze RNA expression changes, and reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) was performed as required to verify the results. The NGS results showed that 30 out of 1,632 genes were expressed differentially by β-caryophyllene treatment. Eleven genes associated with DNA replication, virulence factors, and T4SS components were significantly downregulated. RT-PCR confirmed that treatment reduced the expression levels of 11 genes. RT-PCR showed the reduced expression of 11 genes (dnaE, dnaN, holB, gyrA, cagA, vacA, secA, flgE, virB2, virB4, and virB8) following β-caryophyllene treatment. These results suggest that β-caryophyllene can modulate various H. pylori pathogenic determinants and be a potential therapeutic agent for H. pylori infection.

• 한국균학회지
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• 제41권4호
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• pp.261-267
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• 2013

Pseudoperonospora cubensis에 의한 오이 노균병의 생물적 방제를 위하여 오이 재배단지의 오이 식물체 126균주를 분리하였다. 그 중에서 잎 절편 생물검정 통하여 5균주를 선발하였다. CC110균주는 오이노균병 예방과 치료효과 검정에서 전혀 병이 발생하지 않았지만 무처리는 15.0~18% 노균병이 발생하였다. CC110균주는 gyrB gene sequence 분석에 의하여 Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum로 동정하였다. CC110균주를 TSB배지에서 배양한 배양액은 LB, NB와 KB 배지에서 배양한 배양액보다 오이 노균병 발생이 적어 효과적이었다. CC110균주를 TSB배지에서 배양한 배양액의 원액, 2배와 5배 희석한 처리구에서 0%, 3.0%와 8.0% 그리고 배양여액을 원액, 2배와 5배 희석한 처리구에서 0%, 4.0%와 7.0% 노균병이 발생하였고, 무처리는 21.0% 발생하였다. 오이 유묘검정에서 CC110균주를 TSB배지에서 배양한 배양액은 오이 노균병이 35.0% 발생하였고 무처리는 82.0% 발생하였다. 비닐하우스 포장에서 오이 노균병에 대하여 B. amyloliquefaciens CC110균주를 5일 간격 4회 처리가 7일 간격 3회 처리보다 방제효과가 높았다.

• 식물병연구
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• 제10권4호
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• pp.331-336
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• 2004

결구상추에 심각한 피해를 일으키는 균핵병의 생물학적 방제를 위한 기초연구로서 균핵병원균 S. sclerotioum YR-1 대한 우수 길항세균을 선발하고 동정하였다. 건전 결구상추에서 분리한 세균들 중 균핵병원균의 균사생육저지 효과가 큰 10 균주를 길항세균으로 1차 선발하고 이들 일차 길항세균에 의한 방제효과를 생육실내 포트검정한 결과, A-2, A-7 및 RH-4 균주의 방제가가 각각 73.0%, 85.0%, 80.0%이었으며, 이 중 가장 높은 방제가를 보인 A-7 균주를 우수 길항균으로 최종선발하였다. A-7 균주의 생화학적 특성 및 16S rDNA와 gyrA 염기서열을 분석한 결과 Bacillus amyloliquefaciens로 동정되었으며, B. amyloliquefaciens A-7으로 명명하였다.

• 식물병연구
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• 제22권3호
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• pp.158-167
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• 2016

육묘장과 재배포장의 애호박에서 새롭게 발생한 병원균의 특성을 분석하여 동정하였다. 병징은 잎에 수침상의 병반과 강한 노란색의 둘레무리를 가진 점무늬, 꽃에서 갈색 병반, 열매에 노란색의 점무늬였다. 잎의 점무늬로부터 분리된 세균은 박과작물 8개의 식물체, 흑종호박, 애호박, 쥬키니호박, 풋호박, 참박, 참외, 멜론, 오이에 병원성이 있었지만 수박과 밤호박에서는 병을 일으키지 못했다. 분리세균은 다발모를 가진 막대형으로 그람음성이며 King's B 배지에서 형광성이었으며, LOPAT 1a 그룹에 속했다. 그들의 Biolog 기질이용성은 Biolog database의 P. syringae pv. syringae 이용성과 유사하였다. 16S rRNA 유전자 염기서열을 이용한 계통수와 4개의 항존유전자(gapA, gltA, gyrB, rpoD)의 염기서열과 PAMDB에 있는 P. syringae균주들의 염기서열을 이용한 MLST는 애호박 분리균주들이 P. syringae pv. syringae 균주들과 동일한 그룹(clade)으로 그룹화되었고, MLST 계통수에서 애호박 분리균주들의 그룹(clade)은 genomospecies 1에 속하였다. 표현형적, 유전적 특성은 애호박 분리균이 P. syringae pv. syringae임을 제시하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제27권1호
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• pp.112-121
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• 2017

Edwardsiella tarda is a gram-negative pathogenic bacterium in aquaculture that can cause hemorrhagic septicemia in fish. Many secreted proteins have already been identified as virulent factors of E. tarda. Moreover, since virulent phenotypes are based on the expression regulation of virulent genes, understanding the expression profile of virulent genes is important. A quantitative RT-PCR is one of the preferred methods for determining different gene expressions. However, this requires the selection of a stable reference gene in E. tarda, which has not yet been systematically studied. Accordingly, this study evaluated nine candidate reference genes (recA, uup, rpoB, rho, topA, gyrA, groEL, rpoD, and 16S rRNA) using the Excel-based programs BestKeeper, GeNorm, and NormFinder under different culture conditions. The results showed that 16S rRNA was more stable than the other genes at different culture growth phases. However, at the same culture time, topA was identified as the reference gene under the conditions of different strains, different culture media, and infection, whereas gyrA was identified under the condition of different temperatures. Thus, in experiments, the expression of gapA and fbaA in E. tarda was analyzed by RT-qPCR using 16S rRNA, recA, and uup as the reference genes. The results showed that 16S rRNA was the most suitable reference gene in this analysis, and that using unsuitable reference genes resulted in inaccurate results.