• 제목/요약/키워드: genetic divesity

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Universal Rice Primer (URP)-PCR에 의한 곰팡이 종의 유전적 다양성 검정 (Genetic Divesity Analysis of Fungal Species by Universal Rice Primer (URP)-PCR)

  • 강희완
    • 한국균학회지
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    • 제40권2호
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    • pp.78-85
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    • 2012
  • 20 mer의 URP primers 가 한국 재래적미의 반복배열 DNA 염기서열로부터 고안되어 다양한 곰팡이 종의 PCR 다형성검출에 적용 되어 왔다. URP-PCR 방법은 PCR반응중 $55^{\circ}C$이상의 고온에서 annealing반응을 함으로 하여 재생적인 PCR결과를 얻을 수 있으며 효모균류에서 담자균류의 고등 균류까지 33속, 142 종, 1,489 균주의 다양한 곰팡이 종의 유전체 DNA에 적용되어 그 유용성이 평가 되어 왔다. 본 논문은 URP-PCR의 특성과 지금까지 다양한 곰팡이 종 다양성 검정결과를 종합하여 보고 한다.

RAPD를 이용한 들깨 유전자원의 유전적 변이 분석 (Analysis of Genetic Variation of Perilla Germplasm Using RAPD)

  • 김도훈;양보경;김현경;김나영;정순재;김익수;남재성;이재헌;정대수
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제30권3호
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    • pp.221-226
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    • 2003
  • Genetic variation of Perilla germplasms was investigated using RAPD markers. Forty-two Perilla frutescens lines and cultivars collected form locals were subjected to RAPD analysis using 220 primers. Among them only 13 primers showed polymorphic bands and these 13 primers provided a total of 144 bands, consist of 115 polymorphic and 29 monomorphic ones. The polymorphic bands were subjected to phylogenetic analysis using UPGMA and maximum parsimony (MP) methods. In the UPGMA method, similarity coefficiency of 42 Perilla frutescens lines and cultivars ranged from 0 to 0.7842. The dendrogram of 42 lines and cultivars obtained through UPGMA method resulted in two major groups, and the similar clustering pattern was found by MP method, suggesting Perilla germplasms utilized in this study truly can be divided into two major groups. Although the two major groups were consistent roughly with their phenotypes (under of node, weight of 1,000 grains, and oil content), in detail, much inconsistency also was present.