Anthracnose, caused by Colletotrichum gloeosporioides (C. gloeosporioides; Teleomorph: Glomerella cingulata), is the most destructive disease that affects sweet persimmon production worldwide. However, the biology, ecology, and genetic variations of C. gloeosporioides remain largely unknown. Therefore, in this study, the development of fungicide resistance and genetic diversity among an anthracnose pathogen population with different geographical origins and the exposure of this population to different cultivation strategies were investigated. A total of 150 pathogen isolates were tested in fungicide sensitivity assays. Five of the tested fungicides suppressed mycelial pathogen growth effectively. However, there were significant differences in the sensitivities exhibited by the pathogen isolates examined. Interestingly, the isolates obtained from practical management orchards versus organic cultivation orchards showed no differences in sensitivity to the same fungicide. PCR-restriction fragment length polymorphism (RFLP) analyses were performed to detect internal transcribed spacer regions and the ${\beta}$-tubulin and glutamine synthetase genes of the pathogens examined. Both the glutamine synthetase and ${\beta}$-tubulin genes contained a complex set of polymorphisms. Based on these results, the pathogens isolated from organic cultivation orchards were found to have more diversity than the isolates obtained from the practical management orchards.
Ramdial, Hema;Abreu, Kathryn De;Rampersad, Sephra N.
The Plant Pathology Journal
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v.33
no.2
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pp.118-124
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2017
Bell pepper is an economically important crop worldwide; however, production is restricted by a number of fungal diseases that cause significant yield loss. Chemical control is the most common approach adopted by growers to manage a number of these diseases. Monitoring for the development to resistance to fungicides in pathogenic fungal populations is central to devising integrated pest management strategies. Two fungal species, Fusarium incarnatum-equiseti species complex (FIESC) and Colletotrichum truncatum are important pathogens of bell pepper in Trinidad. This study was carried out to determine the sensitivity of 71 isolates belonging to these two fungal species to fungicides with different modes of action based on in vitro bioassays. There was no significant difference in log effective concentration required to achieve 50% colony growth inhibition ($LogEC_{50}$) values when field location and fungicide were considered for each species separately based on ANOVA analyses. However, the $LogEC_{50}$ value for the Aranguez-Antracol locationfungicide combination was almost twice the value for the Maloney/Macoya-Antracol location-fungicide combination regardless of fungal species. $LogEC_{50}$ values for Benomyl fungicide was also higher for C. truncatum isolates than for FIESC isolates and for any other fungicide. Cropping practices in these locations may explain the fungicide sensitivity data obtained.
This study was carried out to develop bioassay for detection of pesticide residues in agricultural products by using the soil microbial isolates sensitive to pesticides. One hundred bacterial isolates and eighty five fungal isolates were obtained from soil and their sensitivity to 10 ppm of several pesticides was examined in vitro. Five bacterial isolates and three fungal isolates were found sensitive to organochloride fungicide and two fungal isolates sensitive to organocopper fungicide. Among these isolates, B46, B93 and F67 were tested to find out the difference in sensitivity according to the methods of fungicide treatment. All of the isolates were found sensitive to 10 ppm of organochloride fungicides mixed directly in PDA. But they were found insensitive to the fungicide mixed in PDA after filtering through membrane filter. In case of organocopper fungicide, the isolates were found sensitive only when it was treated in PDA. And their sensitivity showed difference among various kinds of organochloride fungicides. B46 and B93 were employed to check the possibility as the agent for detection of the pesticidal residues in twenty eight agricultural products including rice. It was found that all samples had not residues because the samples did not inhibit the growth of isolates. When organochloride fungicides were applied to the above products, it was possible to detect the residues in fruits and vegetables at the concentration of 10 ppm, but not in starch-rich grains. B46 and B93 were identified as Bacillus sp. according to their bacterial characteristics in culture.
Fungicide resistance study in Korea is still in its infancy, and most of those resistance studies are largely limited to newness of the detected resistant strains. In future, detection of fungicide-resistant strains has to be based on sensitivity distribution of pathogen populations to certain fungicides, and standard levels of certain fungicides for resistance should be determined under the basis of this data. Most of the early research on fungicide resistance in Korea has overlooked this point, and resulted in inconsistency and confusion for monitoring sensitivity shift of pathogen population among individual researchers. Fungicide resistance detected in vitro tests has to be documented in field trials by examining control efficacy against resistant and wild-type pathogen populations. Resistance detection in wife has to be correlated with lower activity in practice. Using this process, fungicide resistance will have a practical meaning. Fitness evaluation of resistant strains for survival is, in particular, of importance to determine the future stability of the resistance in the pathogen population. In fields, sensitivity change of pathogen populations should be carefully monitored with and without fungicide selection pressures to establish long-term management strategies against fungicide resistance. It is becoming an urgent task to provide information through research for designing and implementing successful counter-measures against fungicide resistance problems in Korea.
We identified two genes related to fungicide resistance in Fusarium fujikuroi through random mutagenesis. Targeted gene deletions showed that survival factor 1 deletion resulted in higher sensitivity to fungicides, while deletion of the gene encoding F-box/WD-repeat protein increased resistance, suggesting that the genes affect fungicide resistance in different ways.
For a biosensor development, an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) of the fungicide iprovalicarb was developed by minimizing the processing time. The time for whole incubation process was reduced from 135 minutes to 15 minutes. The concentration of antibody was varied to improve sensitivity. The total processing time was reduced from 2.5 hours to 20 minutes, the final sensitivity ($IC_{50}$ value) of 7.93 ng/mL and the lowest detection limit of 0.045 ng/mL were obtained. This ELISA was applied to potatoes and onions, and the recoveries were in the range of 98.85 $\sim$ 101.20% and 87.97 $\sim$ 102.70%, respectively. Accordingly, this method can be used as basis for a biosensor for rapid monitoring of iprovalicarb residues in crops.
Sensitivity to the new carboxylic acid amide fungicide, mandipropamid, of Phytophthora capsici causing pepper Phytophthora blight was determined on 187 isolates collected in Korea over 3 years, from 2005 to 2007. All isolates were sensitive to mandipropamid, with $EC_{30}$ values for growth of mycelia ranging from 0.001 to $0.037\;{\mu}g/ml$. Among the isolates, 147 (79.0%) isolates were sensitive to metalaxyl, whereas others were resistant to this fungicide. Mandipropamid had the same effect on mycelium growth of both metalaxyl-sensitive and metalaxyl-resistant isolates, indicating an absence of cross-resistance between these two fungicides. Comparison of the sensitivities of P. capsici isolates showed a positive correlation between sensitivity to mandipropamid and dimethomorph ($r^2$=0.8533). The results of this study indicate that there is no evidence for development of resistance to mandipropamid in this population of P. capsici isolates collected in Korea.
Chemical management of dollar spot in turf may lead to the development of Sclerotinia homoeocarpa populations with reduced fungicide sensitivity. The objective of this study was to investigate resistance of S. homoeocarpa isolates to triazole fungicides and to test cross-resistance among three triazole fungicides. A total of 66 isolates of S. homoeocarpa were collected from 15 golf courses across Korea, and tested via in vitro sensitivity assay against hexaconazole, propiconazole and tebuconazole. $EC_{50}$ values of the isolates to these fungicides were distributed in the range of $0.001-1.1\;a.\;i.\;{\mu}g\;ml^{-1}$. Based on the $EC_{50}$ values, twelve representative strains were selected as sensitive isolates including control and insensitive isolates with respect to each fungicide. At a concentration of $0.1\;a.\;i.\;{\mu}g\;ml^{-1}$ for all fungicides, the selected strains were distinguished as sensitive or resistant isolates with the mycelial growth inhibition rate of 50% as the criterion. The $EC_{50}$ values of resistant strains exposed to hexaconazole, propiconazole and tebuconazole were 20-50 times, 50-70 times, and 77 times greater, respectively, than that of the control strains. Two isolates of S. homoeocarpa S0-41 and Sh14-2-1 showed sensitivity toward all the fungicides used, while two other isolates Sh7-5-1 and Sh2-1-1 showed resistance to all fungicides. Each isolate showed similar resistance to the three types of triazole fungicides, whereby cross-resistance of isolates was confirmed in the present study; all three triazole fungicide combinations displayed significant correlation coefficients equivalent to or greater than 0.8.
Kim, Joon-Oh;Shin, Jong-Hwan;Gumilang, Adiyantara;Chung, Keun;Choi, Ki Young;Kim, Kyoung Su
The Plant Pathology Journal
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v.32
no.6
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pp.570-574
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2016
Botrytis cinerea is a necrotrophic pathogen causing a major problem in the export and post-harvest of strawberries. Inappropriate use of fungicides leads to resistance among fungal pathogens. Therefore, it is necessary to evaluate the sensitivity of B. cinerea to various classes of fungicide and to determine the effectiveness of different concentrations of commonly used fungicides. We thus evaluated the effectiveness of six classes of fungicide in inhibiting the growth and development of this pathogen, namely, fludioxonil, iprodione, pyrimethanil, tebuconazole, fenpyrazamine, and boscalid. Fludioxonil was the most effective ($EC_{50}$ < $0.1{\mu}g/ml$), and pyrimethanil was the least effective ($EC_{50}=50{\mu}g/ml$), at inhibiting the mycelial growth of B. cinerea. Fenpyrazamine and pyrimethanil showed relatively low effectiveness in inhibiting the germination and conidial production of B. cinerea. Our results are useful for the management of B. cinerea and as a basis for monitoring the sensitivity of B. cinerea strains to fungicides.
In August 2020, 377 anthracnose strains were isolated from anthracnose-infected peppers collected from 25 farms in Sunchang-gun, Jeollabuk-do. Inhibition rate of mycelial growth of 11 pepper anthracnose fungicides registered in Korea was investigated for 62 strains selected by region and the degree of susceptibility to each fungicide was investigated. As a result of the fungicide susceptibility test of anthracnose to the fungicide, no resistant strains were observed in fluazinam, prochloraz manganese, and benomyl, but resistant strains appeared in at least three areas for other fungicides, and all strains in all regions were resistant to dithianon. Through this, it was confirmed that the fungicide resistance was expressed in the strain group due to the continuous treatment of the fungicide in some areas. By region, resistant strains to seven pesticides appeared in Sunchang-eup and Paldeok-myeon, and resistant strains to six pesticides appeared in Geumgwa-myeon, Bokheung-myeon, Ssangchi-myeon, Yudeung-myeon, and Pungsan-myeon. There was no significant correlation between fungicide registration time and emergence of resistant strains.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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