Human Coxsackievirus B5 (HuCoxV-B5) infection has been associated with various diseases such as myocarditis, aseptic meningitis, hand-foot-and mouth-disease, and insulin-dependent diabetes. HuCoxV-B5 is a virus transmitted through the fecal-oral route and is detected in clinics, aquatic environments, food, shellfish, etc. and is one of the more important viruses in public health because of its incidence rate reported worldwide. In this study, a combination of SYBR Green-based real-time PCR primers for molecular diagnosis including monitoring of HuCoxV-B5 was selected and the optimal reaction conditions were established. Compared with the previously reported TaqMan probe-based real-time PCR method, assessments including a sample applicability test were performed. Results showed that the real-time PCR method developed in this study was suitable for a molecular diagnostic technique for detecting HuCoxV-B5. This study is expected to contribute to efforts in responding to safety accidents in public health because the proposed method facilitates rapid diagnosis of clinical patients. It can also be used as a specific monitoring tool of HuCoxV-B5 in non-clinical areas such as aquatic environments among others.
In recent years, many researches are actively undertaken for environmental-friendly animal production according to the increased understanding about food safety because of the outbreak of various diseases such as mad cow disease, Foot and mouth disease and Poultry Influenza virus. However, high quality(higher safety)- animal production may not be successful without increasing of disease resistance of animal and the improvement of feeding environment. To increase the disease resistance is able to be accomplished by stimulating the immune function. The present study was undertaken to investigate the effects of enzyme mixture reinforced with ${\beta}$-glucanase activity which degrade polysaccharide to release ${\beta}$-glucan known as stimulator of immune function on the change of milk production and somatic cell count. After 12weeks of experimental feeding, milk production tended to be increased and somatic cell count was decreased from average $227{\times}10^4$ to $37.1{\times}10^4$. Milk protein and solid-fat content were tended to increase but milk fat showed decreasing tendency by the feeding of enzyme mixture. All together, it has been suggest6d that the improvement of high quality milk production may be possible through the dietary addition of immune modulating enzyme mixture in lactating dairy cows.
Seo, Seung Hwan;Jo, Si Hyang;Lee, Jihoo;Kim, Hak Yong
Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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2015.05a
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pp.223-224
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2015
구제역은 소, 돼지 등 발굽이 두 개로 갈라진 가축들에게 감염을 유발하는 전염성이 매우 높은 바이러스성 질병이다. 구제역 감염 시 입 주변, 구강 내, 코, 발굽사이 등에 수포가 생기며 고열과 식욕이 저하되어 심하게 앓거나 죽게 되는데, 강한 감염 전파력을 가졌음에도 치료제가 없고, 감염확인 즉시 확산 방지를 위한 살 처분만이 이루어지고 있다. 따라서 무엇보다도 빠른 감염여부 진단이 중요하다. 현재까지 구제역을 진단하는 방법으로는 감염 된 가축의 혈액에서 구제역 항원 단백질에 대한 항체형성 여부를 확인하는 항체진단법과 수포액과 같은 체액을 채취하여 세포배양을 통한 구제역 바이러스 분리방법이 있지만 두 가지 모두 짧은 잠복기를 갖는 구제역 바이러스를 빠른 시간 내 진단하기는 어렵다. 따라서 본 연구에서는 보다 빠른 구제역 진단 키트개발을 위해 NCBI Pubmed를 이용하여 구제역바이러스가 가지는 6개의 주요 단백질을 확인하였고, NCBI BLAST를 이용하여 6개의 단백질 중 구제역 바이러스에 특이적인 항원 단백질 peptidase C28을 선정하였다. 선정된 단백질의 아미노산 서열을 이용하여 IEDB analysis resource를 통해 peptidase C28의 epitope 부위를 예측하였다. 예측 된 부위의 아미노산 서열을 NCBI BLAST에서 정상 동물과 비교하여 구제역바이러스 특이 항원 단백질 epitope peptide를 최종 선정하였다. 이를 이용한 구제역 바이러스 진단키트 제작은 보다 빠른 진단을 통해 감염 확산을 조기에 차단하고 경제적 손실과 피해를 최소화 할 수 있다.
In recent years, the consumption of livestock products were markedly decreased by awareness of world-widely occurred diseases including mad cow disease, Foot and mouth disease, Hog cholera, and Poultry Influenza virus. the consumers ara also wanting to have highly safe food such as organic animal products because of concerning about residual of antibiotics in animal products. However, disease control and impairment of productivity are the major problem in organic animal production. On these points of view, the present study was undertaken to investigate the effects of 1% or 2% of dietary probiotics fortified with various minerals on improvement of egg production and egg quality in old lay6r feeding low quality feed mainly composed of food waste, sesame meal, and rice bran. After 4 weeks of experimental feeding, the diameter of spreading of egg white was clearly decreased from 11.2cm of control eggs to 10.5m and 10.1m in 1% and 2% treatment group eggs, respectively. The color of egg yolk was 9.3 in control eggs but remarkably increased in treatment groups showing 10.1~10.2. Egg production was 75.8% in control layers but significantly increased to 79.8% of 1% treatment group and 82.9% of 2% treatment group layers. Egg weights (C : 66.3g, 1% : 73.2g, and 2% : 76.7g) and egg shell thickness (C : 0.33mm, 1% : 0.35mm and 2% : 0.36mm) were also increased by the addition of 1% or 2% of probiotics when compared to those of control group eggs. All together, it has been suggested that dietary addition of probiotics fortified with various minerals can improve the egg quality and egg production in layer's productivities by the recycling of organic waste resources such as food waste and agricultural by-products.
In the event of an outbreak of a livestock epidemic, it has been considered that the existing burial-centered carcass disposal method should be improved ecofriendly for prevention of leachate and odors from burial basically in regard of pathogen inactivation. Therefore, the aim of this study is whether it was possible to treat the carcass of cattle and chickens using the chemical carcass treatment method. It was conducted to establish detailed treatment standards for the chemical treatment method of cattle and chicken carcasses based on the results of the proof of the absence of infectious diseases in cattle chickens. After inoculating cattle carcass with 10 pathogens (foot and mouth disease virus, bovine viral diarrhea virus, Mycobacterium bovis, Mycobacterium avium subsp. Paratuberculosis, Brucella abortus, Bacillus anthracis, Clostridium chauvoei, Clostridium perfringens, Escherichia coli, and Salmonella Typhimurium) and chicken carcasses with low pathogenic avian influenza virus, Clostridium perfringens type C, E. coli and Salmonella Typhimurium, these were treated at 90℃ for 5 hours in a potassium hydroxide liquid solution corresponding to 15% of the body weight. This method liquefies all cadaveric components and inactivates all inoculated pathogens by PCR and culture. Based on these results, it was possible to prove that chemical treatment of cattle and chicken carcasses is effective in killing pathogens and is a safe method without the risk of disease transmission. The chemical treatment method of livestock carcasses can be suggested as an alternative to the current domestic burial-centered livestock carcass treatment method, preventing environmental pollution, and contributing to public health.
Kang, Hyo Rin;Seong, Mi So;Ku, Bok Kyung;Cheong, JaeHun
Journal of Life Science
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v.30
no.11
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pp.947-955
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2020
The foot-and-mouth disease virus (FMDV), a member of the Aphthovirus genus in the Picornaviridae family, affects wild and domesticated ruminants and pigs. During replication of the FMDV RNA (ribonucleic acid) genome, FMDV-encoding RNA polymerase 3D acts in a highly location-specific manner. This suggests that specific RNA structures recognized by 3D polymerase within non-coding regions of the FMDV genome assist with binding during replication. One such region is the cis-acting replication element (CRE), which functions as a template for RNA replication. The FMDV CRE adopts a stem-loop conformation with an extended duplex stem, supporting a novel 15-17 nucleotide loop that derives stability from base-stacking interactions, with the exact RNA nucleotide sequence of the CRE producing different RNA secondary structures. Here, we show that CRE sequences of FMDVs isolated in Korea from 2010 to 2017 exhibit A and O genotypes. Interestingly, variations in the RNA secondary structure of the Korean FMDVs are consistent with the phylogenetic relationships between these viruses and reveal the specificity of FMDV infections for particular host species. Therefore, we conclude that each genetic clade of Korean FMDV is characterized by a unique functional CRE and that the evolutionary success of new genetic lineages may be associated with the invention of a novel CRE motif. Therefore, we propose that the specific RNA structure of a CRE is an additional criterion for FMDV classification dependent on the host species. These findings will help correctly analyze CRE sequences and indicate the specificity of host species for future FMDV epidemics.
Le, Tran Bac;Lee, Hyun-Jeong;Le, Van Phan;Choi, Kang-Seuk
Korean Journal of Poultry Science
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v.46
no.2
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pp.127-136
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2019
Three strains of infectious bronchitis viruses (IBVs), designated VNUA3, VNUA8 and VNUA11, were isolated from diseased/infected chickens in Hanoi, Thainguyen, and Haiphong provinces of Vietnam. These birds had received a live IBV vaccination but still suffered from infectious bronchitis. VNUA3, VNUA8 and VNUA11 harbor cleavage sites (RRTGR, HRRRR, and HRRKR, respectively) within the S protein. A BLASTN search revealed that the S gene of VNUA3, VNUA8, and VNUA11 showed the highest nucleotide identity with those of IBV strains CK/Italy/I2022/13, CK/CH/LHLJ/08-6, and GX-NN120084, respectively. Phylogenetic analyses based on the S gene nucleotide sequences revealed that VNUA3, VNUA8 and VNUA11 clustered with Q1-like, QX-like and TC07-2-like genotypes, respectively, and were closely related to reference IBV strains from China. However, the Vietnam IBVs showed high divergence from vaccine strains 4/91 and Ma5, which are used in the Vietnamese farms from which the isolates were obtained. Taken together, these results indicate that at least three genotypes of IBV are circulating among chickens in North Vietnam. This is the first report of the molecular epidemiology of IBV in Vietnam.
Objective: The ecosystem of an animal farm is composed of various elements, such as animals, farmers, plants, feed, soil, and microorganisms. A domesticated animal's health is largely connected with the reservoir of bacteria and viruses in animal farms. Although a few studies have focused on exploring the gut microbiome of animals, communities of microbiota and viruses in feedlots have not been thoroughly investigated. Methods: Here, we collected feces and dust samples (4 groups: cattle feces, C_F; horse feces, H_F; cattle dust, C_D; and horse dust, H_D) from cattle and horse farms sharing the same housing and investigated their microbiome/virome communities by Illumina sequencing. Results: Dust groups (C_D and H_D) showed higher microbial diversity than feces groups (C_F and H_F) regardless of animal species. From the microbial community analysis, all the samples from the four groups have major phyla such as Proteobacteria (min 37.1% to max 42.8%), Firmicutes (19.1% to 24.9%), Bacteroidetes (10.6% to 22.1%), and Actinobacteria (6.1% to 20.5%). The abundance of Streptococcus, which commonly recognized as equine pathogens, was significantly higher in the horse group (H_D and H_F). Over 99% among the classified virome reads were classified as Caudovirales, a group of tailed bacteriophages, in all four groups. Foot-and-mouth disease virus and equine adenovirus, which cause deadly diseases in cattle and horse, respectively, were not detected. Conclusion: Our results will provide baseline information to understand different gut and environmental microbial ecology between two livestock species.
Journal of Advanced Marine Engineering and Technology
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v.37
no.5
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pp.541-547
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2013
It is important to establish water treatment technologies for drinking water because Korea belongs to water-stressed country. Leachate from recent incident of foot-and-mouth disease has become an opportunity to be aware of the need to manage water quality. Water purifiers are adopted to four or five steps of filtration process. Each steps are composed of a sediment filter, a pre-carbon filter, an UF or a RO membrane filter and a post-carbon filter. And additionally a ceramic filter can be used as a final stage. In this study, operational conditions in each steps are examined and characteristics of each filters are investigated. SEM analysis is used for filter surface and shape investigation using 6 commercial samples. Pore sizes of the sediment filter, the UF membrane filter, and the RO membrane filter are 30~47 ${\mu}m$, 0.005~0.5 ${\mu}m$, and 0.025~0.25 ${\mu}m$, respectively. Specific surface areas of activated carbons are ranged from 622 to 1,308 $m^2/g$.
Epidemiological studies have shown the association between transportation of live animals and the potential transmission of infectious disease between premises. This finding was also observed in the 2014-2015 foot-and-mouth disease (FMD) outbreak in Korea. Furthermore, slaughterhouses played a key role in the global spread of the FMD virus during the epidemic. In this context, in-depth knowledge of the structure of direct and indirect contact between slaughterhouses is paramount for understanding the dynamics of FMD transmission. But the social network structure of vehicle movements to slaughterhouses in Korea remains unclear. Hence, the aim of this study was to configure a social network topology of vehicle movements between slaughterhouses for a better understanding of how they are potentially connected, and to explore whether FMD outbreaks can be explained by the network properties constructed in the study. We created five monthly directed networks based on the frequency and chronology of on- and off-slaughterhouse vehicle movements. For the monthly network, a node represented a slaughterhouse, and an edge (or link) denoted vehicle movement between two slaughterhouses. Movement data were retrieved from the national Korean Animal Health Integrated System (KAHIS) database, which tracks the routes of individual vehicle movements using a global positioning system (GPS). Electronic registration of livestock movements has been a mandatory requirement since 2013 to ensure traceability of such movements. For each of the five studied networks, the network structures were characterized by small-world properties, with a short mean distance, a high clustering coefficient, and a short diameter. In addition, a strongly connected component was observed in each of the created networks, and this giant component included 94.4% to 100% of all network nodes. The characteristic hub-and-spoke type of structure was not identified. Such a structural vulnerability in the network suggests that once an infectious disease (such as FMD) is introduced in a random slaughterhouse within the cohesive component, it can spread to every other slaughterhouse in the component. From an epidemiological perspective, for disease management, empirically derived small-world networks could inform decision-makers on the higher potential for a large FMD epidemic within the livestock industry, and could provide insights into the rapid-transmission dynamics of the disease across long distances, despite a standstill of animal movements during the epidemic, given a single incursion of infection in any slaughterhouse in the country.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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