During 2012 to 2014, a survey for the presence of viral diseases in yam plants was carried out in a field of the Institute for Bioresources Research in Gyeongsangbuk-do, Korea. A total of 88 leaf samples were collected and tested by reverse transcription polymerase chain reaction using specific primer sets. Eighty-one samples were positive for Broad bean wilt virus 2 (BBWV2), Chinese yam necrotic mosaic virus (ChYNMV), Cucumber mosaic virus (CMV), Japanese yam mosaic virus (JYMV), and Yam mild mosaic virus (YMMV), whereas Yam mosaic virus (YMV) was not detected. Additionally, seven samples were negative for all viruses. Several samples exhibited mixed (double and triple) infections. Three viruses (CMV, JYMV, and YMMV) were detected for the first time in yam plants in Korea. A BLAST search showed that three viruses shared nucleotide identities with CMV-Ca (98%), JYMV-O2 (91%), and YMMV-TG_NH_1 (86%). Thus, our findings confirmed that yam plants cultivated in Korea were infected with multiple viruses with three of these viruses reported for the first time in Korea.
Weeds are widely grown in the field and are infected by many viruses. A survey was conducted to identify viruses infecting weeds in Korea. Virus-infected weed samples including Rorippa indica (L.) Hiern, R. islandica (Oed.) Bord, Crepidiastrum denticulatum (Houtt.) Pak & Kawanno, Achyranthes japonica (Miq.) Nakai, and Chrysanthemum boreale (Makino) Makino were collected in Kyonggi Province. These weeds were grown in the greenhouse and were isolated on 10 test plants. Several virus isolates were isolated fron infected tissues and were further studied by host range assay, serological test, electron microscopy (EM), reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and sequencing. Each isolated virus strain was mechanically transmitted to weeds and various hosts including Nicotiana spp., Brassica spp., Vigna unguiculata, Capsicum annuum, and Cucumis sativus and showed systemic mosaic, vein clearing, necrosis, mottle, malformation, chlorosis, and/or death of host plants in some cases. Each virus was then purified using infected leaves and observed by EM. From these results three viruses were isolated and identified as Turnip mosaic virus (TuMV), Broad bean wilt virus (BBWV), and Cucumber mosaic virus (CMV). RT-PCR using virus-specific oligonucleotide primers and the cloning were conducted to determine the nucleotide sequences of coat proteins of the three viruses their amino acid sequence were deduced. The amino acid sequence homologies were about 92.7 to 99.7%, 96.2 to 97.7%, and 93.9 to 98.6% to other reported TuMV, BBWV, and CMV strains, respectively. These results suggest that many weeds may serve as primary inoculum source of diseases caused by TuMV, BBWV, CMV and that the management of these viral diseases can be achieved through weed control.
Park, Dong-Ju;Lee, Yong-Suk;Chang, Jie;Fang, Shu-Jun;Choi, Yong-Lark
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제23권3호
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pp.397-404
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2013
Paenibacillus xylanilyticus KJ-03 was isolated from soil samples obtained from a field with Amorphophallus konjac plants. A gene encoding xylanase was isolated from KJ-03 and cloned using a fosmid library. The xynA gene encodes xylanase; it consists of 1,035 bp and encodes 345 amino acids. The amino acid sequence deduced from the P. xylanilyticus KJ-03 xylanase showed 81% and 69% identities with those deduced from the P. polymyxa E681 and Paenibacillus sp. HPL-001 xylanases, respectively. The xynA gene comprises a single domain, consisting of a catalytic domain of the glycosyl hydrolase (GH) 10 family. The xynA gene was expressed in Escherichia coli BL21 (trxB), and the recombinant xylanase was purified by Niaffinity chromatography. The purified xylanase showed optimum activity with birchwood xylan as a substrate at $40^{\circ}C$ and pH 7.4. Treatment with $Mg^{2+}$ and $Li^+$ showed a slight decrease in XynA activity; however, treatment with 5 mM $Cu^{2+}$ completely inhibited its activity. The results of the thin layer chromatography analysis indicated that the major hydrolysis product was xylobiose and small amounts of xylose and xylotriose. XynA showed increased activity with oat spelt xylan and birchwood xylan, but showed only slight activity with locust bean gum.
Park, Jin-Hee;Lee, Heon-Hak;Han, Chang-Hoon;Yoo, Jeoung-Ah;Yoon, Min-Ho
농업과학연구
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제43권3호
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pp.401-414
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2016
The synergistic effect on phosphate solubilization of single- and co-inoculation of two phosphate solubilizing bacteria, Burkholderia anthina PSB-15 and Enterobacter aerogenes PSB-16, was assessed in liquid medium and green gram plants. Co-inoculation of two strains was found to release the highest content of soluble phosphorus ($519{\mu}g\;mL^{-1}$) into the medium, followed by single inoculation of Burkholderia strain ($492{\mu}g\;mL^{-1}$) and Enterobacter strain ($483{\mu}g\;mL^{-1}$). However, there was no significant difference between single inoculation of bacterial strain and co-inoculation of two bacterial strains in terms of phosphorous release. The highest pH reduction, organic acid production, and glucose consumption were observed in the culture medium co-inoculated with PSB-15 and PSB-16 strains rather than that of single inoculation. Based on the plant growth promotion bioassay, co-inoculated mung bean seedlings recorded 9% and 8% higher shoot and root growth, respectively, compared to the control. Therefore, in conclusion, co-inoculation of the strains B. anthina and E. aerogenes displayed better performance in stimulating plant growth than inoculation of each strain alone. However, considering the short assessment period of the present study, we recommend engaging in further work under field conditions in order to test the suitability of these strains as bio-inoculants.
황색콩과 검은콩의 원산지를 판별하기 위하여 일반성분 및 20 MHz pulsed NMR을 이용하여 자기완화시간을 측정하였다. 일반성분으로는 황색콩은 조지방 함량 만이 원산지별 차이를 나타내었고, 검은콩의 경우에는 수분과 단백질 함량이 원산지별 차이를 보였다. 20 MHz pulsed NMR을 이용하여 자기완화시간 및 고형지방함량을 측정한 결과 황색콩은 고형지방함량과 $T_2-CPMG$ 측정시 원산지에 따라 유의적인 차이를 나타내었으며, 검은콩은 $T_1-SR$을 제외한 모든 측정항목에서 원산지별 차이를 나타내었다. 황색콩과 검은콩의 원산지 판별 분석시 일반성분만으로 정준판별분석을 시행한 결과 $70{\sim}91.7%$의 정확도를 나타내었으나, NMR 자기완화시간 및 고형지방함량을 이용한 경우 100%의 정확성으로 원산지를 판별해낼 수 있었다.
Single or co-inoculation of phosphate solubilizing bacterial and fungal strains (Burkholderia anthina and Aspergillus awamori respectively) was performed separately to assess their synergistic and antagonistic interactions and the potential to be used as bio-inoculants. Co-inoculation was found to release the highest content of soluble phosphorus (1253 ${\mu}g\;ml^{-1}$) into the medium, followed by single inoculation of fungal strain (1214 ${\mu}g\;ml^{-1}$) and bacterial strain (997 ${\mu}g\;ml^{-1}$). However, there was no significant difference between single inoculation of fungal strain and co-inoculation of fungal and bacterial strain in terms of the phosphorous release. The highest pH reduction, organic acid production and glucose consumption were observed in the sole A. awamori inoculated culture medium. According to the plant growth promotion bioassays, co-inoculation of the microbial strains resulted in 21% and 43% higher shoot and root growth of the mung bean seedlings respectively as compared to the respective controls. Therefore, co-inoculation of B. anthina and A. awamori showed better performance in stimulating plant growth than that in inoculation of each strain alone. However, assessment period of the present study being short, we recommend in engaging further experimentation under field conditions in order to test the suitability of the strains to be used as bio-inoculants.
The seeds of bean(Glycine max M.) and corn(Zea mays L.) soaked in 5000ppm lead solution for 24 hours were sowed in the flowerpots being placed sandy-clay soil under the field condition. The fixed concentrations of various anions and 2000 ppm lead were supplied alternately in the sandy-clay soi of the flowerpots at two days interval from May to July in 1976. After the plants were harvested prior to the flowering stage, the lead contents of plnat and soil were analyzed by atomic absorption spectrophotometer. The lead contents absorbed by the plant roots showed the highest in an weak acid soil of the best suitable condition of plant growth. The absorption of lead by the plant roots was inhibited by the various anions, especially divalent anions of the soil. Some phosphate anions inhibited lead absorption more than otehr various anions in the soil. The more various anions were in the soil, the more plants could be protected from the lead toxicity. In the case of lead supply in the soil, 99.5% of lead was accumulated in the upper layer of the soil(0-10cm), and 0.5% of lead accumulated in the lower layer (10-20cm). Therefore, the yellow-brown and white symptoms on the leaves and the inhibition of root growth by lead toxicity was increased in the early stage of the germination, however decreased in accordance with the progress of the growing stage becuase of the root growth toward beneath the lower layer of the soil. In spite of the contents of 3773ppm lead in the soil, the symptoms of lead toxicity was not found in the grown plants. At that time the lead contents of the plants absorbed from the soil were minimum 0.78ppm and maximum 3.64ppm through the growing stage.
The purpose of this study is to determine the amount of irrigation water for upland crop growth based on the 30 year of historical rainfall data and the water management guidelines as a reference. Five regions and ten crops were selected by their cultivation size. The changes of soil moisture contents were calculated using daily mean rainfall and irrigation demand. This study assumed that crops are irrigated when the soil moisture contents fell below of the field capacity for more than 5 days, which is the drought condition defined by RDA. The maximum irrigation water requirements was 167.2 mm for chinese cabbage during the growing season, which was followed by corn (112.0 mm), daikon (102.3 mm), spinach (66.1 mm), lettuce (56.7 mm), pepper (46.5 mm), potato (33.9 mm), sweet tomato (27.4 mm), peanut (11.5 mm) and bean (10.3 mm), The results of this study could contribute to providing valuable data to determine the capacity of irrigation facilities and to establish the emergency operation plans under extreme unfavorable weather condition (heat wave, etc.) for crop growth.
Background and objective: Urbanization caused a reduction in urban green space and a lack of community spaces. An attempt to solve these problems, urban gardens, have become popular and are currently being implemented in various downtown areas. However, urban gardens have some inadequate aspects from a visual or landscape perspective. The goal of this study was to examine the possibility of an aesthetic and productive garden space by introducing cultivation methods through the planting system design process. Methods: The design process using plants was classified and presented to suggest the importance of the landscape and aesthetic value. An urban garden space was designed according to the perspective of 'production scenery' and 'participation aesthetics'. According to the characteristics of the plant, urban gardens were divided into vertical type (corn, millet, sorghum), climbing type (kidney bean, cucumber, bitter gourd), and runner type (melon, watermelon, peanut). After classifying plants according to the shape of the root, the structure supporting climbing was installed and the crops were cultivated in an upright form with a tunnel. Results: In the designed cultivation, each crop cooperates, without invading each other's space. Compared with the conventional cultivation, there was little difference in production, and management was made more convenient since weed outbreaks were effectively suppressed while runner type crops cover over the land's surface. Since the positions of each crop are clearly distinguished, the aesthetic value is improved by offering a sense of rhythm with a balanced design. Conclusion: The results suggest that the cultivation methods through the plant system design process have aesthetic as well as productive value, and the design using plants, an infinite living resource, could lead to an expansion of the design field. Moreover, it would enable a sustainable symbiosis between industry and environment. There is potential for the design industry to make significant progress through collaboration with agriculture, horticulture, and landscape architecture.
집합페로몬 트랩의 색깔, 설치높이 및 장소에 따른 노린재류 유인효과를 구명하였다. 톱다리개미허리노린재는 황색트랩에 가장 많이 유인되었으며, 다음은 백색>흑색>녹색>청색>갈색의 순 이었다. 트랩설치높이에 따른 톱다리개미허리노린재와 가로줄노린재의 유인은 지상 80 cm 높이에서 성별에 관계없이 가장 많았으며, 성별간에는 톱다리개미허리노린재는 40 및 80 cm에서 암컷이 수컷보다 많이 유인되었으나, 120 및 160 cm에서 유의한 차이가 없었다. 가로줄노린재는 40 및 80 cm에서 암컷이 수컷보다 많이 유인되는 경향이었으나, 120 및 160 cm에서는 오히려 수컷이 암컷보다 약간 많이 유인되는 경향이었다. 콩 및 들깨 재배포장에서 트랩설치 위치에 따른 톱다리개미허리노린재의 유인은 들깨포장에서 가장 많았으며, 콩포장과 콩들깨의 경계지점에서는 차이가 없었다. 또한 콩포장, 약용작물포장 및 단감원에서 톱다리개미허리노린재의 유인효과는 단감원에서 가장 높았으며, 콩 및 약용작물포장간에는 유의한 차이가 없었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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