• 한국미생물·생명공학회지
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• 제30권1호
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• pp.21-25
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• 2002

토양으로부터 분리한 Bacillus sp. YJ-63으로부터 항진균성 항생물질을 분리하여 그 구조를 분석한 결과는 다음과 같다. 항생물질은 7개의 $\alpha$-amino acid와 1개의 $\beta$-amino acid가 결합한 환상구조를 가지는 iturin E 계에 속하며 특히. $\beta$-amino acid의 methylene 수가 기존의 iturin E 보다 더 많은 것으로 나타났다.

• 한국자기학회:학술대회 개요집
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• 한국자기학회 2010년도 임시총회 및 하계학술연구발표회
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• pp.70-71
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• 2010

In this study, We fabricated FePt-based perpendicular patterned media using a selective combination of E-beam lithography and either Ar plasma etching (deposition-first process) or FePt lift-off (deposition-last process). We employed the deposition-last process to avoid chemical and structural disordering by impinging Ar ions (deposition-first process). For a patterned medium with 100 nm patterns made by this process, the out-of-plane coercivity was measured to be 5 fold larger than its in-plane value. The deposition-last process may be a promising way to achieve ultra-high density patterned media.

• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제18권2호
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• pp.131-135
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• 2015

Two new bitter-tasting cyclic peptides comprising six amino acids, namely gamakamide C and D, were isolated from cultured oysters Crassostrea gigas. Dimethylaminoazobenzene sulfonyl-amino acid analysis detected Val and Leu in gamakamide C and Ile and Leu in gamakamide D. The molecular formula of gamakamide C was determined as $C_{43}H_{60}N_{7}O_8S$ by high-resolution fast atom bombardment mass spectroscopy (HR FAB-MS) ($[M+H]^+m/z822.4200{\Delta}-2.4mmu$), and that of gamakamide D was determined as $C_{43}H_{62}N_7O_8S$ by HR FAB-MS ($[M+H]^+m/z836.4379{\Delta}-2.0mmu$). Comparison of amino acid analyses and fragment ions by MS/MS among gamakamide C, D, and E (known), the structures of gamakamide C and D were confirmed $as-{\small{L}}-Val-{\small{L}}-Met(SO)-{\small{L}}-NMe-Phe-{\small{L}}-Leu-{\small{D}}-Lys-{\small{L}}-Phe-$ and $-{\small{L}}-Ile-{\small{L}}-Met(SO)-{\small{L}}-NMe-Phe-{\small{L}}-Leu-{\small{D}}-Lys-{\small{L}}-Phe-$, respectively.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제18권8호
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• pp.874-880
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• 1997

Various classes of phospholipids were investigated for the structural determination of fatty acyl groups by fast atom bombardment tandem mass spectrometry (FAB-MS/MS). Phospholipids were desorbed by FAB as molecules chelated with sodium ion (or ions). Collision-induced dissociation (CID) of intact sodium adduct molecular ions ([M+Na]+, [M-H+2Na]+ or [M+Na-2H]-) produced a series of homologous fragment ions via the charge-remote fragmentation along the fatty acid chains. These ions were found useful to locate the double bond positions even for the polyunsaturated fatty acid chains. The regiospecificity of the acyl chain linkages in phosphatidylcholine (PC) could also be determined based on the ratio of relative abundance of the product ions (i.e., [M+Na-85-R2COOH]+ vs [M+Na-85-R1COOH]+) in CID-MS/MS of [M+Na]+. These are generated by the loss of fatty acyl groups at sn-1 and sn-2, respectively, together with the choline group. In all the phospholipid compounds investigated, loss of the fatty acid at the sn-2 position was dominant. The present method was applied to the structural determination of molecular species of phosphatidylglycerols (PG) isolated from cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803.

• Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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• 제8권2호
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• pp.101-105
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• 2003

Recombinant bioluminescent bacteria were used to monitor and classify the to xicity of azo dyes. Two constitutive bioluminescent bacteria, Photobacterium phosphoreum and Es-Cherichia coli, E, coli GC2 (lac::luxCOABE), were used to detect the cellular toxicity of the azo dyes. In addition, four stress-inducible bioluminestent E. coli, DPD2794 (recA::luxCDABE), a DNA damage Sensitive strain; DPD2540 (fabA::luxCDABE), a membrane damage sensitive strain; DPD2511 (katG::luxCDABE), an oxidative damage sensitive strain; and TV1061 (grpE::luxCDABE), a protein damage sensitive strain, were used to provide information about the type of toxicity caused by crystal violet, the most toxic dye of the 16 azo dyes tested. These results suggest that azo dyes result in serious cellular toxicity in bacteria, and that toxicity monitoring and classific ation of some azo dyes, In the field, may be possible using these recombinant bioluminescent bacteria.

• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제15권1호
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• pp.15-19
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• 2012

A new cyclic peptide (six-membered amino acid), gamakamide-E (L-Leu-L-Met (SO)-L-Me-Phe-L-Leu-D-Lys-L-Phe), was isolated as a strongly bitter tasting compound from cultured oysters, Crassostrea gigas. The molecular formula of $C_{43}H_{61}N_7O_8S$ was deduced from high resolution fast atom bombardment mass spectrometry (HR FAB-MS) ($[M+H]^+$ m/z 836.4356 ${\Delta}$= -2.4 mmu). Its unique structure including a hydantoin structure was firstly elucidated by nuclear magnetic resonance (NMR) analysis. Stereochemistries of constituent amino acids were determined by chiral high performanced liquid chromatography analysis of natural and synthesized peptides.

• Korean Chemical Engineering Research
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• 제49권1호
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• pp.105-108
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• 2011

유가의 급등과 화석 연료에 의한 온난화 현상은 재생 가능한 대체 연료에 대한 필요성이 요구되었다. 수송용 바이오 연료를 비교하였을 때 에탄올보다 높은 알코올 경우 휘발유와 비슷한 장점을 갖는데 그 이유는 높은 에너지 밀도와 낮은 흡습성을 갖기 때문이다. 이러한 이유로 미생물의 발효는 지속적인 에너지를 얻을 수 있는 잠재적 생산자라 할 수 있다. 본 연구에서는 생물학적으로 생산되는 알코올 성분에 대하여 두 종의 세균과 한종의 효모인 Escherichia coli와 Clostridium acetobutylicum 그리고 Saccharomyces cerevisiae를 이용하여 바이오 알코올에 대한 세포 성장 정도와 함께 미생물내에 스트레스 반응 유전자들의 분석을 실시하였다. 분석한 알코올은 에탄올과 부탄올이며, 이들의 농도별 세균의 성장속도와 산화적 손상에 민감하게 반응하는 katG 유전자, 생물막 손상에 민감하게 반응하는 fabA 유전자, 단백질 손상에 민감하게 반응하는 grpE 유전자, 유전자 손상에 민감하게 반응하는 recA 유전자의 반응여부를 분석하였다. 그 결과, 에탄올과 부탄올 중 부탄올의 세포 독성이 더 높게 관찰되었으며, 부탄올의 경우 생물막 손상을 유발하는 세포내 독성효과를 지니고 있음을 확인하였다.

• 대한화학회지
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• 제40권8호
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• pp.557-564
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• 1996

각기 다른 양이온$(Na^+, Li^+, K^+, NH_4^+)$을 구조이성질체인 일련의 합성 올리고당에 첨가함으로써, 양이온의 결합정도가 올리고당의 연결위치에 따라 달라지리라는 것을 FAB CAD MS/MS(Fast Atom Bombardment Collision Activated Dissociation Mass Spectrometry/ Mass Spectrometry)를 이용하여 안정성 측면에서 연구하였다. 알카리 양이온화된(cationized) 올리고당들은 양성자화(protonated)된 형태보다 더 큰 안정성을 나타내어 -40 eV의 충돌 에너지 수중에서 연결부위와 작용기들이 분절된 스펙트럼형태를 보인 반면, 양성자화된 올리고당은 -10 eV에서 에서 같은 정도의 분절을 보였다. 첨가된 양이온 중, 칼륨 양이온이 첨가된 올리고당이 다른 것에 비해 안정화되어 triple quadrupole기종의 허용에너지 조건하에서는 분절이온을 생성하지 않는다. 다른 양이온화된 올리고당들은 충돌기체인 argon의 압력이 0.8mTorr 상태에서 양이온의 종류에 따라$Nap^+>Li^+>NH_4^+$순으로 안정성을 나타내었다. 올리고당과 결합하는 금속양이온들은 질소를 포함하고 있는 아미노당에 위치하며, 이는 아미노당을 포함하는 분절이온마다 각 양이온에 해당하는 만큼의 질량이 이동된 분절피크들이 나타나는 것으로 설명 가능하다. 또한 양이온화된 것이 양성자화된 것보다 더 큰 안정성을 지니는 이유는 금속 양이온과 아미노당의 N-acetyl 작용기 및 fucose의 산소 사이에 크라운에테르 형태의 결합을 형성하는 것으로 설명할 수 있다. 이 때 참여한 금속 양이온의 크기 및 연결위치-이성질 부분의 구조적 형태에 따라 결합정도의 차이를 보여 각기 다른 분절스펙트럼의 형태를 나타내며 안정성면에서도 1-6>1-4>1-3 연결위치의 순으로 나타났다.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제54권3호
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• pp.159-165
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• 2011

로즈마리 추출물의 phenol 함량은 25.7 mg/g으로 매우 높게 나타났다. Helicobacter pylori 에 대한 항균효과를 측정한 결과, clear zone이 $100{sim}200{\mu}/disc$의 phenol 농도에서 각각 11, 12, 14 mm의 clear zone을 형성하여 추출물의 농도가 증가할수록 H. pylori 에 대한 저해효과가 농도 의존적으로 높아지는 것을 확인 할 수 있었다. Sephadex LH-20과 MCI-gel CHP-20 column을 이용하여 normal phase type인 $ethanol{\rightarrow}H_2O$와 reverse phase type인 $H_2O{\rightarrow}methanol$로 용액의 농도를 증가시키면서 용출한 결과 H. pylori에 대한 탁월한 저해활성을 나타낸 5종류(compound A~E)의 단일 물질로 분리하였다. 5가지 각각의 물질은 H. pylori에 대한 항균력이 미약하였으나, 2종류 이상의 다중 물질의 항균 시너지 효과에 의해 각각 10~16 mm의 clear zone을 형성하여 우수한 항균력을 나타내었으며, fast atom bombardment (FAB)-Mass, $^1H$-NMR, $^{13}C$-NMR과 IR spectrum을 사용하여 구조 동정한 결과 protocatechuic acid, coumaric acid, caffeic acid, chlorogenic acid 및 rosmarinic acid 인 것으로 확인되었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제17권8호
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• pp.1390-1393
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• 2007

In this study, three of the representative EDCs, $17{\beta}$-estradiol, bisphenol A, and styrene, were employed to find their mode of toxic actions in E. coli. To accomplish this, four different stress response genes, recA, katG, fabA, and grpE genes, were used as a representative for DNA, oxidative, membrane, or protein damage, respectively. The expression levels of these four genes were quantified using a real-time RT-PCR after challenge with three different EDCs individually. Bisphenol A and styrene caused high-level expression of recA and katG genes, respectively, whereas $17{\beta}$-estradiol made no significant changes in expression of any of those genes. These results lead to the classification of the mode of toxic actions of EDCs on E. coli.