• 제목/요약/키워드: embB gene

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임상에서 분리된 에탐부톨 감수성균에서의 embB 유전자 돌연변이에 대한 고찰 (Implication of embB Gene Mutation in Ethambutol-Susceptible Clinical Isolates of Mycobacterium tuberculosis)

  • 박영길;;김상재;고원중;권오정;김범준;국윤호;조상래;류우진;배길한
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제59권3호
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    • pp.266-271
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    • 2005
  • 배 경 : 에탐부톨은 6개월 단기요법 중에 사용되는 1차 항결핵약제 중 하나이다. embB 유전자의 돌연변이는 에탐부톨의 내성과 관련이 있은 것으로 추측 되어왔다. 그러나 최근에 embB 유전자의 돌연변이는 에탐부톨 감수성인 균에서도 발견되어 이 유전자의 돌연변이가 에탐부톨 내성과 관련이 있는 것인지에 대한 논란이 있는 바, 이에 대한 이해를 높이고자 본 실험을 하게 되었다. 방 법 : 약제감수성검사에서 에탐부톨은 감수성이지만 타항결핵약제에 내성을 보인 36균주를 선택하였다. 이 균주들에서 embB 유전자에 대하여 중합효소연쇄반응를 실시한 후에 염기서열분석을 통해 돌연변이 여부를 조사하였다. 돌연변이가 있는 균주에 대하여 과거의 항결핵약제 감수성검사 결과를 비교하였다. 결 과 : 에탐부톨 감수성인 36균주 중에서 3균주(8.3%)만 이 embB 유전자의 codon 306과 codon 406에서 돌연변이를 나타냈다. 이 균주들은 적어도 아이소니아 짓에서도 내성을 가지고 있었고, 에탐부톨 1.0 mcg/ml를 함유한 LJ배지에서 모두 자랐다. 이 균주를 가진 결핵환자들은 꾸준히 치료를 하였음에도 불구하고 3년 동안이나 도말양성을 보였다. 또한 한 균주는 과거의 감수성검사에서 에탐부톨에 내성을 보인 경우도 있었다. 결 론 : 에탐부톨 감수성이지만 embB 유전자의 돌연변이를 가진 균주는 균주 자체의 특성이라기 보다는 일시적으로 생활력이 감소되어 약제 감수성으로 표현 될 수 있는 것으로 보인다.

역교잡 방법을 이용한 결핵균 embB 유전자 돌연변이 검출 (Detection of embB Gene Mutation of Mycobacterium tuberculosis by Reverse Hybridization Assay)

  • 박영길;유희경;박찬홍;류성원;이승헌;심명섭;류우진;고원중;권오정;조상래;배길한
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제58권2호
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    • pp.129-134
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    • 2005
  • 배 경 : 에탐부톨의 내성여부는 결핵 환자 처방 결정에 있어서 중요 변수의 하나가 된다. 에탐부톨 내성의 상당부분이 embB 유전자의 돌연변이와 관계가 있으므로 역교잡반응법으로 이 유전자의 돌연변이를 신속하게 검출하고자 하였다. 방 법 : 에탐부톨 내성에 관련된 embB 유전자의 306번, 406번, 497번 아미노산의 정상적인 염기서열과 돌연변이 염기서열에 대한 probe를 합성하였고, 약제감수성검사에서 에탐부톨 내성균으로 나타난 149균과 전약제 감수성으로 나타난 50개균을 대상으로 조사하였다. 결 과 : 149개의 에탐부톨 내성균 중에서 embB 유전자 전체에서 돌연변이가 나타난 균은 100균주(67.1%)였으며, 그 중 embB 유전자 중 306번 돌연변이를 가진 균주가 75주(50.3%), 406번 돌연변이를 가진 균주가 16주(10.7%), 497번 돌연변이가 있는 균주가 13주(8.7%)였다. 이 중 4균주는 306번과 406번 돌연변이를 동시에 가지고 있었다. 406번 돌연변이 하나만 가지고 있는 균은 12균주(8.1%)로 이는 다른 조사에서 볼 수 없었던 비교적 높은 수치이었다. 한편 에탐부톨 및 11가지 항결핵약제에서 감수성인 50개균에서는 embB 유전자의 돌연변이를 발견하지 못하였다. 결 론 : 역교잡반응법으로 에탐부톨 내성에 관련되어 있는 것으로 알려진 embB 유전자 돌연변이를 찾는 것이 가능하였으며, 에탐부톨 내성기전 및 관련 유전자가 더 발견되어 민감도가 향상된다면 신속한 에탐부톨내성균 검출이 가능할 것으로 본다.

Structural dynamics insights into the M306L, M306V, and D1024N mutations in Mycobacterium tuberculosis inducing resistance to ethambutol

  • Yustinus Maladan;Dodi Safari;Arli Aditya Parikesit
    • Genomics & Informatics
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    • 제21권3호
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    • pp.32.1-32.11
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    • 2023
  • Resistance to anti-tuberculosis drugs, especially ethambutol (EMB), has been widely reported worldwide. EMB resistance is caused by mutations in the embB gene, which encodes the arabinosyl transferase enzyme. This study aimed to detect mutations in the embB gene of Mycobacterium tuberculosis from Papua and to evaluate their impact on the effectiveness of EMB. We analyzed 20 samples of M. tuberculosis culture that had undergone whole-genome sequencing, of which 19 samples were of sufficient quality for further bioinformatics analysis. Mutation analysis was performed using TBProfiler, which identified M306L, M306V, D1024N, and E378A mutations. In sample TB035, the M306L mutation was present along with E378A. The binding affinity of EMB to arabinosyl transferase was calculated using AutoDock Vina. The molecular docking results revealed that all mutants demonstrated an increased binding affinity to EMB compared to the native protein (-0.948 kcal/mol). The presence of the M306L mutation, when coexisting with E378A, resulted in a slight increase in binding affinity compared to the M306L mutation alone. The molecular dynamics simulation results indicated that the M306L, M306L + E378A, M306V, and E378A mutants decreased protein stability. Conversely, the D1024N mutant exhibited stability comparable to the native protein. In conclusion, this study suggests that the M306L, M306L + E378A, M306V, and E378A mutations may contribute to EMB resistance, while the D1024N mutation may be consistent with continued susceptibility to EMB.