• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제56권4호
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• pp.325-334
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• 2018

Toxoplasma gondii is an apicomplexan zoonotic protozoan parasite that infects most species of warm-blooded animals, including humans. The heavy incidence and severe or lethal damage caused by T. gondii infection clearly indicate a need for the development of an effective vaccine. T. gondii GRA8 is a member of the dense granules protein family and is used as a marker of acute infection. In the present study, we evaluated the protective immunity induced by DNA vaccination based on a recombinant eukaryotic plasmid, pDsRed2-GRA8, against acute toxoplasmosis in mice. BALB/c mice were intramuscularly immunized with the pDsRed2-GRA8 plasmid and then challenged by infection with the highly virulent GFP-RH strain of T. gondii. The specific immune responses and protective efficacy against T. gondii of this vaccine were analyzed by measuring cytokine and serum antibody titers, splenocyte proliferation assays, and the survival times of mice after challenge. Our results showed that mice immunized with pDsRed2-GRA8 demonstrated specific humoral and cellular responses, induced higher IgG antibody titers with predominant IgG2a production; increased levels of IL-10, IL-12 (p70), $IFN-{\gamma}$, $TNF-{\alpha}$, and splenocyte proliferation; and prolonged survival times compared to those of control mice. The present study showed that DNA immunization with pDsRed2-GRA8 induced humoral and cellular immune responses, and all immunized mice showed greater Th1-type immune responses and longer survival times than those of control mice. These results indicated that T. gondii GRA8 DNA immunization induces a partial protective effect against acute toxoplasmosis.

• Journal of Microbiology
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• 제38권1호
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• pp.44-47
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• 2000

The cDNA of VP2/NS junction region on segment A of the marine birnavirus (MBV) isolated from flounder (DS strain) was amplified using the reverse transcription (RT)-polymerase chain reaction (PCR). Its cDNA nucleotide and deduced amino acid sequences were analyzed, and compared with the reference strains of MBV and infectious pancreatic necrosis virus (IPNV). Analyses of the nucleotide and deduced amino acid sequences revealed that the DS strain is very similar to the reference strains of MBV, distant from the IPNV.

• 한국잠사곤충학회지
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• 제50권2호
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• pp.87-92
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• 2012

본 연구의 목적은 누에형질전환 기술을 이용하여 적색형광실크를 개발하는 것으로서, 본 실험에서는 피브로인 H-chain의 N-말단과 C-말단을 이용하여 피브로인 재조합 단백질 발현 시스템을 제작하였고, 종결 코돈이 없는 DsRed2 유전자를 위의 발현 시스템에 클로닝하여 적색형광실크를 제작하였다. 누에형질전환체 선발을 위해서는 3xP3 promoter와 EGFP 유전자를 이용하여 선발하였고, 1020개의 누에알에 microinjection 하여 F1 세대에서 6 broods의 형질전환체를 선발하였다. 선발된 누에형질전환체는 초기배 단계의 눈과 신경조직, 유충과 번데기 그리고 성충의 눈에서 EGFP 형광단백질이 발현되는 것을 확인 할 수 있었다. 또한 실크의 피브로인에서 DsRed2 단백질이 발현되는 것을 확인하기 위해, F2세대의 누에형질전환체 중에서 5령 5일 유충을 해부하여 견사선을 형광현미경으로 관찰하였고, 중부와 후부 견사선에서 적색형광단백질이 발현되는 것을 확인 할 수 있었고, F2 세대의 고치에서도 적색형광단백질의 발현을 확인할 수 있었다. 이상의 결과에서 적색형광실크를 생산하는 누에형질전환체가 성공적으로 제작되었음을 확인할 수 있었고 이러한 결과를 토대로 새로운 산업소재로서 실크를 활용할 수 있을 것으로 기대한다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제4권4호
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• pp.264-269
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• 1994

To determine the nucleotide sequence of the ds RNA segment B containing the RNA dependent RNA polymerase (RdRp) gene of the DRT strain of infectious pancreatic necrosis virus (lPNV), the cDNA of the ds RNA segment B of the DRT strain of IPNV was synthesized using the reverse transcriptase (RT)-polymerase chain reaction (PCR) and its cDNA nucleotide sequence was determined. The DRT segment B was 2, 783 bp long and contained only a single long open reading frame (ORF) of 2, 535 bp in length. This ORF nucleotides encoded the VPl protein, the putative RdRp of IPNV. The VPl protein comsisted of 845 amino acids. The molecular weight of the RdRp, as deduced from the nucleotide sequence, is 94, 426. The nucleotide sequence of the ORF of the DRT showed 89.7% homology to the Jasper strain, but 80.8% to the Sp strain. The amino acid sequence of the ORF of the DRT sho.wed 97.6% homology to the Jasper strain, but 88.7% to the Sp strain. The conserved GTP-binding motif was detected in VPl protein.

• Molecules and Cells
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• 제27권2호
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• pp.243-250
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• 2009

Recent studies suggest a novel role of $HIF-1{\alpha}$ under nonhypoxic conditions, including antibacterial and antiviral innate immune responses. However, the identity of the pathogen-associated molecular pattern which triggers $HIF-1{\alpha}$ activation during the antiviral response remains to be identified. Here, we demonstrate that cellular administration of double-stranded nucleic acids, the molecular mimics of viral genomes, results in the induction of $HIF-1{\alpha}$ protein level as well as the increase in $HIF-1{\alpha}$ target gene expression. Whole-genome DNA microarray analysis revealed that double-stranded nucleic acid treatment triggers induction of a number of hypoxia-inducible genes, and induction of these genes are compromised upon siRNA-mediated $HIF-1{\alpha}$ knock-down. Interestingly, $HIF-1{\alpha}$ knock-down also resulted in down-regulation of a number of genes involved in antiviral innate immune responses. Our study demonstrates that $HIF-1{\alpha}$ activation upon nucleic acid-triggered antiviral innate immune responses plays an important role in regulation of genes involved in not only hypoxic response, but also immune response.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제41권4호
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• pp.456-461
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• 2013

단일가닥 DNA와 이중가닥 DNA의 흡착 율의 차이를 이용하여, 본 연구는 산화 그래핀에 흡착된 단일 가닥 DNA을 사용하여 Klenow fragment의 효소 활성을 검출하기 위하여 실시간 형광에세이 방법을 사용했다. 실험 결과에 의하면, 산화그래핀에 흡착된 형광표지 ssDNA는 형광이 ��칭(quenching) 되지만, cDNA 첨가에 의해서 흡착된 단일가닥 DNA가 유리되었다. Klenow fragment의 활성을 측정하기 위해서 형광표지 틀(template) DNA, 산화그래핀과 시발체(primer)가 존재할 때, 고분자 반응이 진행됨에 따라 ��칭된 형광세기가 증가하였다. 그리고 겔 전기영동 실험은 산화 그래핀에서 DNA 합성과 hybridization 반응을 확인하였다.

• 식물병연구
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• 제14권1호
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• pp.71-75
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• 2008

전형적인 모자이크 증상을 나타낸 토끼풀로부터 Peanut stunt virus(PSV)를 분리하여 Tr-PSV로 명명하였다. 이 연구에서는 Tr-PSV의 특성을 기주반응, 혈청학적 성질, dsRNA분석, RT-PCR 및 RFLP 분석 등을 통하여 지금까지 잘 알려진 ER-PSV Fny-CMV 및 LS-CMV와 비교하였다. Tr-PSV는 접종한 Nicotiana속 식물에서는 모두 전신감염되었으며, C. amaranticolor에서는 접종엽에 국부병반을 형성하였다. 그러나 동부에서는 대조로 이용한 ER-PSV와 마찬가지로 전신감염되어, 접종엽에 국부병반을 형성하는 대조의 CMV계통과는 구분되었다. Tr-PSV에 감염된 N. benthamiana 잎으로부터 추출한 dsRNA는 대조의 PSV나 CMV와 유사한 분자 크기의 4종의 dsRNA가 확인되었고, satellite RNA의 존재는 인정되지 않았다. Cucumovirus 특이적 프라이머를 이용하여 증폭시킨 PCR산물은 약 950 bp의 cDNA가 얻어졌고, 이를 이용하여 조사한 RFLP패턴은 ER-PSV와 같았다. 이와 같은 RFLP분석과 Er-PSV의 항혈청을 이용한 혈청학적 성질의 결과로부터 Tr-PSV는 ER-PSV와 같은 서브그룹 I에 속하는 PSV의 한 계통으로 판단되었다. 국내에서 토끼풀로부터 PSV가 분리 동정된 것은 이 논문이 처음이다.

• 식물병연구
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• 제15권3호
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• pp.254-258
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• 2009

전형적인 모자이크 증상의 표주박(Lagenaria leucantha var. gourda)으로부터 CMV를 분리하고 Lag-CMV로 명명하였다. 표주박에서 분리한 Lag-CMV는 N. benthamiana에서 전신감염되어 전형적인 모자이크 증상을 나타내 대조로 공시한 CMV들과 유사하였다. 그러나 N. tabacum. cv. Xanthi nc에서 접종엽에 퇴록반점이 형성되는 점이 As-CMV와 유사하였으며, 접종엽에 무병징을 나타낸 Fny-CMV와 구분되었다. 또한 Fny-CMV에 감염된 오이와 쥬키니 호박은 매우 심한 모자이크 증상을 나타낸 반면, Lag-CMV와 As-CMV에 감염된 식물은 비교적 엷은 모자이크 병징이 발현되었다. 고추에서는 Fny-CMV와 As-CMV가 접종상엽에 모자이크 증상이 발현되으나, Lag-CMV는 무병징으로 감염되었다. Lag-CMV에 감염된 N. benthamiana로부터 추출한 dsRNA의 전기영동 패턴은 대조의 Fny-CMV나 As-CMV의 dsRNA와 종류 및 분자 크기에서 차이를 나타내지 않았다. Lag-CMV에 감염된 N. benthamiana로부터 추출한 total RNA를 외피단백질 유전자와 IR 및 3' 비번역영역 일부를 포함하는 약 950 bp의 cDNA합성을 위한 프라이머를 이용하여 RT-PCR을 실시한 결과 약 950 bp의 cDNA가 검출되었다. 이 cDNA를 제한효소 EcoRI, HindIII, MspI, SalI 및 XhoI으로 처리한 후 RFLP분석을 실시한 결과, Lag-CMV의 RFLP패턴은 As-CMV와 일치하였다. 한편 이 cDNA를 이용하여 염기서열을 분석한 결과, 염기서열의 유사도는 As-CMV와 99.1%, Fny-CMV와는 94.5%였으며, 외피단백질의 아미노산서열 유사도는 As-CMV는 100%, Fny-CMV와 97.3%를 나타냈다. 이와 같은 결과들로부터 표주박에서 분리한 Lag-CMV는 As-CMV와 같은 서브그룹 IB에 속하는 것으로 확인되었다.

• Journal of Microbiology
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• 제33권3호
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• pp.191-195
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• 1995

IciA protein has been shown as an inhibitor for the initiation of E. coli chromosomal DNA replication at oriC. IciA protein binds the AT-rich region in oriC and then blocks the initiation of chromosomal DNA replication. Two binding sites for IciA protein were identified in dnaA gene, encoding the initiator for the E. coli chromosomal replication, promoter region by gel-shift assay and DNase I footprinting, One, named as IciA site I, is located upstream of the dnaA promoter 1P. The other, named as IciA site II, is located downstream of the dnaA promoter 2P. The sequence comparison of the regions protected from the DNase I cleavage did not result in a clear consensus sequence for the binding of IciA protein, suggesting that IciA protein may be a member of multimeric complex dsDNA binding proteins. This study provided information about the binding mode of IciA protein. Even though the IciA site II and IciA binding site in oriC seem to be composed of two IciA binding units, one binding unit is likely enough to cause the binding of IciA protein to the IciA site I. The binding of IciA protein to the dna4 promoter implies that IciA protein may involve not only the control of the initiation of chromosomal DNA replication but also the control of the dna4 gene expression.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제22권5호
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• pp.649-653
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• 2012

A temperate phage was isolated from emetic Bacillus cereus NCTC 11143 by mitomycin C and characterized by transmission electron microscopy and DNA and protein analyses. Whole genome sequencing of Bacillus phage 11143 was performed by GS-FLX. The phage has a dsDNA genome of 39,077 bp and a 35% G+C content. Bioinformatic analysis of the phage genome revealed 49 putative ORFs involved in replication, morphogenesis, DNA packaging, lysogeny, and host lysis. Bacillus phage 11143 could be classified as a member of the Siphoviridae family by morphology and genome structure. Genomic comparisons at the DNA and protein levels revealed homologous genetic modules with patterns and morphogenesis proteins similar to those of other Bacillus phages. Thus, Bacillus phages might have a mosaic genetic relationship.