Small molecule tyrosine kinase inhibitors targeting HER 2 receptors have emerged as an important therapeutic approach in inhibition of downstream proliferation and survival signals for the treatment of breast cancers. Recent drug discovery efforts have demonstrated that naturally occurring polyphenolic compounds like delphinidin have potential to inhibit proliferation and promote apoptosis of breast cancer cells by targeting HER2 receptors. While delphinidin may thus reduce tumour size, it is associated with serious side effects like dysphonia. Owing to the narrow therapeutic window of delphinidin, the present study aimed to identify high affinity compounds targeting HER2 with safer pharmacological profiles than delphinidin through virtual screening approaches. Delphinidin served as the query parent for identification of structurally similar compounds by Tanimoto-based similarity searching with a threshold of 95% against the PubChem database. The compounds retrieved were further subjected to Lipinski and Verber's filters to obtain drug like agents, then further filtered by diversity based screens with a cut off of 0.6. The compound with Pubchem ID: 91596862 was identified to have higher affinity than its parent. In addition it also proved to be non-toxic with a better ADMET profile and higher kinase activity. The compound identified in the study can be put to further in vitro drug testing to complement the present study.
Sushil K. Dwivedi;Abhinav Bhise;Rajkumar Subramani;Jeongsoo Yoo
대한방사성의약품학회지
/
제7권1호
/
pp.33-40
/
2021
Recently, antibody-drug conjugates (ADCs) are used to deliver efficient cytotoxic payloads selectively in cancer cells. In the designing of an ADC, the antibody is connected to a toxic payload via a covalent linker, which helps to solubilizes the typical hydrophobic payload as well as stabilizes the linkage over circulation. The development of the linkers for the antibody drug conjugate is still in demand. Initially, the acid, disulfide, and cathepsin-sensitive ADCs attracted considerable attention for the delivery of a potent cytotoxic payload but suffer from instability in human and mouse plasma with a short half-life. In addition, It also suffer from a solubility issue that induces aggregation, which is the major problem in their development. ADCs associated with sulfatase and phosphatase cleavable linker are highly soluble due to the anionic nature of sulfate and phosphate groups. The ADCs also showed high stability in human and mouse plasma. Therefore, to overcome these limitations, sulfatase and phosphatase cleavable linkers were developed. This review focuses on the recently reported advantages of sulfatase and phosphatase cleavable linkers for ADCs.
Kumar, Satish;Jena, Lingaraja;Galande, Sneha;Daf, Sangeeta;Mohod, Kanchan;Varma, Ashok K.
Genomics & Informatics
/
제12권2호
/
pp.64-70
/
2014
Human papillomavirus (HPV) infection is the leading cause of cancer mortality among women worldwide. The life-threatening infection caused by HPV demands the need for designing anticancerous drugs. In the recent years, different compounds from natural origins, such as carrageenan, curcumin, epigallocatechin gallate, indole-3-carbinol, jaceosidin, and withaferin, have been used as a hopeful source of anticancer therapy. These compounds have been shown to suppress HPV infection by different researchers. In the present study, we explored these natural inhibitors against E6 oncoprotein of high-risk HPV-16, which is known to inactivate the p53 tumor suppressor protein. A robust homology model of HPV-16 E6 was built to anticipate the interaction mechanism of E6 oncoprotein with natural inhibitory molecules using a structure-based drug designing approach. Docking analysis showed the interaction of these natural compounds with the p53-binding site of E6 protein residues 113-122 (CQKPLCPEEK) and helped the restoration of p53 functioning. Docking analysis, besides helping in silico validation of natural compounds, also helps understand molecular mechanisms of protein-ligand interactions.
Background: Breast cancer is the serious health concern in India causing the highest mortality rate in females, which occurs due to uncontrolled cell division and can be metastasize to other parts of the human body. Interactions with estrogen receptor (ER) alpha are mainly responsible for the malignant tumors with regulation of the transcription of various genes as a transcription factor. Most of the drugs currently used for the breast cancer treatment produce various side effects and hence we focused on natural compounds which do not exhibit any toxic effect against normal human cells. Materials and Methods: Structure of human ER was retrieved from the Protein Data Bank and the structures of flavonoid compounds have been collected from PubChem database. Molecular docking and drug likeness studies were performed for those natural compounds to evaluate and analyze the anti-breast cancer activity. Results: Finally two compounds satisfying the Lipinski's rule of five were reported. The two compounds also exhibited highest binding affinity with human ER greater than 10.5 Kcal/mol. Conclusions: The results of this study can be implemented in the drug designing pipeline.
Over the years, nanoparticle drug delivery systems have demonstrated versatile potentials in biological, medical and pharmaceutical applications. In the pharmaceutical industry nanotechnology research has mainly focused on providing controlled drug release, targeting their delivery to specific organs, and developing parenteral formulations for poorly water soluble drugs to improve their bioavailability. Achievement in polymer industry has generated numerous polymers applicable to designing nanoparticles. From viewpoints of product development, a nanocarrier material should meet requirements for biodegradability, biocompatibility, availability, and regulatory approval crieteria. Albumin is indeed a material that fulfills such requirements. Also, the commercialization of a first albumin-bound paclitaxel nanoparticle product (Abraxane$^{TM}$) has sparked renewed interests in the application of albumin in the development of nanoparticle formulations. This paper reviews the intrinsic properties of albumin, its suitability as a nanocarrier material, and albumin-based parenteral formulation approaches. Particularly discussed in detail are albumin-based particulate injectables such as Abraxane$^{TM}$. Information on key roles of albumin in the nab$^{TM}$ technology and representative manufacturing processes of albumin particulate products are provided. It is likely that albumin-based particulate technology would extend its applications in delivering drugs, polypeptides, proteins, vaccines, nucleic acids, and genes.
Recent advances in energetic materials modeling and high-resolution hydrocode simulation enable enhanced computational analysis of bio-medical treatments that utilize high-pressure shock waves. Of particular interest is in designing devices that use such technology in medical treatments. For example, the generated micro shock waves with peak pressure on orders of 10 GPa can be used for treatments such as kidney stone removal, transdermal micro-particle delivery, and cancer cell removal. In this work, we present a new computational methodology for applying the high explosive dynamics to bio-medical treatments by making use of high pressure shock physics and multi-material wave interactions. The preliminary calculations conducted by the in-house code, GIBBS2D, captures various features that are observed from the actual experiments under the similar test conditions. We expect to gain novel insights in applying explosive shock wave physics to the bio-medical science involving drug injection. Our forthcoming papers will illustrate the quantitative comparison of the modeled results against the experimental data.
Malathy, P.;Jagadeesan, G.;Gunasekaran, K.;Aravindhan, S.
통합자연과학논문집
/
제9권4호
/
pp.268-274
/
2016
Filariasis causing nematode Brugia malayi is shown to harbor wolbachia bacteria as symbionts. The sequenced genome of the wolbachia endosymbiont from B.malayi (wBm) offers an unprecedented opportunity to identify new wolbachia drug targets. Hence the enzyme carbonic anhydrase from wolbachia endosymbiont of Brugia malayi (wBm) which is responsible for the reversible interconversion of carbon dioxide and water to bicarbonate and protons (or vice versa) is chosen as the drug target for filariasis. This enzyme is thought to play critical functions in bacteria by involving in various steps of their life cycle which are important for survival, The 3D structure of wBm carbonic anhydrase is predicted by selecting a suitable template using the similarity search tool, BLAST. The BLAST results shows a hexapeptide transferase family protein from Anaplasma phagocytophilum (PDB ID: 3IXC) having 77% similarity and 54% identity with wBm carbonic anhydrase. Hence the above enzyme is chosen as the template and the 3D structure of carbonic anhydrase is predicted by the tool Modeller9v7. Since the three dimensional structure of carbonic anhydrase from wolbachia endosymbiont of Brugia malayi has not yet solved, attempts were made to predict this protein. The predicted structure is validated and also molecular docking studies are carried out with the suitable inhibitors that have been solved experimentally.
Recent advances in energetic materials modeling and high-resolution hydrocode simulation enable enhanced computational analysis of bio-medical treatments that utilize high-pressure shock waves. Of particular interest is in designing devices that use such technology in medical treatments. For example, the generated micro shock waves with peak pressure on orders of 10 GPa can be used for treatments such as kidney stone removal, trans-dermal micro-particle delivery. and cancer cell removal. In this work, we present a new computational methodology for applying the high explosive dynamics to bio-medical treatments by making use of high pressure shock physics and multi-material wave interactions. The preliminary calculations conducted by the in-house code, GIBBS2D, captures various features that are observed from the actual experiments under the similar test conditions. We expect to gain novel insights in applying explosive shock wave physics to the bio-medical science involving drug injection. Our forthcoming papers will illustrate the quantitative comparison of the modeled results against the experimental data.
An, Ju-Hyun;Song, Woo-Jin;Li, Qiang;Bhang, Dong-Ha;Youn, Hwa-Young
Journal of Veterinary Science
/
제22권3호
/
pp.25.1-25.16
/
2021
Background: Malignant lymphoma is the most common hematopoietic malignancy in dogs, and relapse is frequently seen despite aggressive initial treatment. In order for the treatment of these recurrent lymphomas in dogs to be effective, it is important to choose a personalized and sensitive anticancer agent. To provide a reliable tool for drug development and for personalized cancer therapy, it is critical to maintain key characteristics of the original tumor. Objectives: In this study, we established a model of hybrid tumor/stromal spheroids and investigated the association between canine lymphoma cell line (GL-1) and canine lymph node (LN)-derived stromal cells (SCs). Methods: A hybrid spheroid model consisting of GL-1 cells and LN-derived SC was created using ultra low attachment plate. The relationship between SCs and tumor cells (TCs) was investigated using a coculture system. Results: TCs cocultured with SCs were found to have significantly upregulated multidrug resistance genes, such as P-qp, MRP1, and BCRP, compared with TC monocultures. Additionally, it was revealed that coculture with SCs reduced doxorubicin-induced apoptosis and G2/M cell cycle arrest of GL-1 cells. Conclusions: SCs upregulated multidrug resistance genes in TCs and influenced apoptosis and the cell cycle of TCs in the presence of anticancer drugs. This study revealed that understanding the interaction between the tumor microenvironment and TCs is essential in designing experimental approaches to personalized medicine and to predict the effect of drugs.
약물 전달 시스템(Drug Delivery System, DDS)은 인체에 발생한 질환을 치료를 할 때 약물을 효과적으로 투약하므로써 약물성분에 의한 부작용을 최소화하고, 약물의 효능을 최대한으로 크게하기 위해 기존의 알려진 성분의 약물이나 새로운 성분의 제형을 설계하여 환자의 약물치료 과정을 최적화하는 목적을 지향하는 기술로 정의된다. 본 연구에서는 Tripolyphosphate (TPP)의 농도가 키토산과의 가교결합을 통하여 제조되는 Chitosan nanoparticles (CNPs)의 크기에 미치는 영향을 측정하여 TPP의 농도가 낮을수록 작은 크기의 입자가 형성되는 것을 확인하였다. 그리고 산화철(Fe3O4)의 양에 따른 CNPs-Fe3O4의 특성을 측정하여 Fe3O4의 양이 많을수록 자성 약물 전달체로써의 특성이 잘 나타남을 확인하였다. 닌히드린 반응(Ninhydrin test)를 통하여 저농도 구간(0.004~0.02 wt%)에서는 Y = 0.00373 exp(179.729X) - 0.0114 (R2 = 0.989), 고농도구간(0.02~0.1wt%)에서는 Y = 21.680X - 0.290 (R2 = 0.999)의 γ-aminobutyric acid (GABA)의 농도에 따른 검량선을 얻었다. 이 검량선을 사용하여 흡수를 위하여 넣어주는 GABA의 양에 따른 최대 흡수율의 관계식 Y = -136.527 exp [(-90.0862)X] + 64.724 (R2 = 0.997) 을 얻었으며, 초기에 넣어주는 GABA의 양이 약 0.04 g인 지점부터는 약 62.5%로 흡수율이 일정해 지고, 시간에 따른 GABA-Fe3O4-CNPs로부터 방출되는 GABA의 양을 측정하여 약 24 hr 이후부터 약물 방출이 종료되는 것을 확인하였다. 또한 최적의 조건에서 만들어진 GABA-Fe3O4-CNPs는 약 150 nm의 구형 입자이며, 그에 따른 입자의 특성이 잘 나타나는 것을 확인하여 약물 전달체로써 적합함을 알 수 있었다.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.