• 대한전자공학회:학술대회논문집
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• 대한전자공학회 2007년도 하계종합학술대회 논문집
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• pp.203-204
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• 2007

In this work, we propose a compression algorithm for depth images, which are obtained from multi-view sequences. The proposed algorithm represents a depth image using a 3-D regular triangular mesh and predictively encodes the mesh vertices using a linear prediction scheme. The prediction errors are encoded with a arithmetic coder. Simulation results demonstrate that the proposed algorithm provides better performances than the JPEG2000 lossless coder.

• Journal of Forest and Environmental Science
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• 제28권4호
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• pp.278-281
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• 2012

Comparative sequence analyses were conducted on complete mtDNA sequences from four small mammal species in Korea and revealed the presence of 30 well conserved sequences in various regions of the complete mtDNA sequences. The conserved sequences were found in 9 regions in protein coding genes, 10 regions in tRNA genes, 10 in rRNA genes, one region in replication origin and 2 regions in D loop. They could be used to design primers for amplifying complete mtDNA sequences of small mammals.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제29권12호
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• pp.1688-1695
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• 2016

The maternally inherited mitochondrial DNA (mtDNA) D-loop region is widely used for exploring genetic relationships and for investigating the origin of various animal species. Currently, domestic ducks play an important role in animal protein supply. In this study, partial mtDNA D-loop sequences were obtained from 145 samples belonging to six South-East Asian duck populations and commercial duck population. All these populations were closely related to the mallard duck (Anas platyrhynchos), as indicated by their mean overall genetic distance. Sixteen nucleotide substitutions were identified in sequence analyses allowing the distinction of 28 haplotypes. Around 42.76% of the duck sequences were classified as Hap_02, which completely matched with Anas platyrhynchos duck species. The neighbor-joining phylogenetic tree also revealed that South-East Asian duck populations were closely related to Anas platyrhynchos. Network profiles were also traced using the 28 haplotypes. Overall, results showed that those duck populations D-loop haplotypes were shared between several duck breeds from Korea and Bangladesh sub continental regions. Therefore, these results confirmed that South-East Asian domestic duck populations have been domesticated from Anas platyrhynchos duck as the maternal origins.

• Earthquakes and Structures
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• 제3권3_4호
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• pp.231-248
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• 2012

In this study, a systematic investigation is carried out on the seismic behaviour of plane moment resisting steel frames (MRF) to repeated strong ground motions. Such a sequence of earthquakes results in a significant damage accumulation in a structure because any rehabilitation action between any two successive seismic motions cannot be practically materialised due to lack of time. In this work, thirty-six MRF which have been designed for seismic and vertical loads according to European codes are first subjected to five real seismic sequences which are recorded at the same station, in the same direction and in a short period of time, up to three days. Furthermore, the examined frames are also subjected to sixty artificial seismic sequences. This investigation shows that the sequences of ground motions have a significant effect on the response and, hence, on the design of MRF. Additionally, it is concluded that ductility demands, behaviour factor and seismic damage of the repeated ground motions can be satisfactorily estimated using appropriate combinations of the corresponding demands of single ground motions.

• 정보처리학회논문지D
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• 제12D권1호
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• pp.51-62
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• 2005

하나의 아미노산 서열의 기능이 밝혀지면, 그와 유사한 서열 구조를 가지고 있는 서열의 기능도 유추해 낼 수 있다. 또한 기능이 밝혀진 단백질의 아미노산 서열을 변화시키거나 유용한 단백질을 만드는 것도 가능하다. 이 과정에서 하나의 원본 단백질 서열에 대하여 다른 서열 구성을 가지고 있는 여러 가지 단백질 서열이 생겨 날 수 있다. 여기서, 원본 단백질을 변화시켜 만든 단백질 버전 서열과 단백질의 주석정보를 저장 및 관리하는 체계적인 기법이 요구된다. 따라서 이 논문에서는 로컬 서열 정렬 기법을 적용한 단백질 아미노산 서열의 버전관리 기법과 트리거를 적용한 단백질 주석데이터의 이력 관리 기법을 제시하였다. 제안된 기법을 통하여 원본 서열과 버전서열의 유사도 측정 및 버전 관리의 자동화와 저장 공간을 감소시킬 수 있다. 또한 단백질 정보의 이력을 저장하고 서열 변화 정보를 분석하여 돌연변이 연구에 의한 유용한 단백질 개발 및 신약 개발이 가능하다.

• 정보처리학회논문지D
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• 제13D권2호
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• pp.199-206
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• 2006

순차패턴 탐색은 다양한 응용 분야에서 매우 중요한 데이터 마이닝 작업으로 간주된다. 그러나 기존의 순차패턴 탐색 방법들은 길이가 긴 순차패턴이나 노이즈 정보를 다수 포함한 데이터베이스에 대한 마이닝에서는 한계가 있다. 해당 방법들은 매우 짧고 사소한 패턴들은 탐색하지만 다수의 순차 정보들에서 공유되는 중요 패턴들을 분석하는데 어려움을 겪는다. 본 논문에서는 이러한 문제를 해결하기 위한 방법으로 대용량 데이터베이스에 대한 근사 순차패턴 탐색 방법을 제안한다. 근사 순차패턴은 다수의 순차 정보들에서 근사적으로 공유되는 순차패턴을 의미한다. 제안된 방법은 두 과정으로 구분된다. 하나는 유사도에 따라 분석 대상 순차 정보들을 몇 개의 군집으로 나누는 과정이며, 다른 하나는 다중 정렬 방식을 적용하여 각 군집으로부터 대표 패턴을 찾는 과정이다. 이를 위해서 다수의 순차 정보들을 하나로 표현할 수 있는 가중치 순차패턴을 제시하며, 다수의 순차 정보들은 가중치 순차패턴 형태로 통합된다. 이렇게 통합된 정보를 가진 각 가중치 순차패턴을 이용하여 여러 순차 정보와 근사한 하나의 대표 패턴을 생성한다. 끝으로, 다양한 실험을 통해서 제안된 방법의 유용성을 검증한다.

• 정보처리학회논문지D
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• 제13D권3호
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• pp.347-356
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• 2006

비디오 스트림은 다차원 공간에서 데이터 포인트의 시퀀스로 표현될 수 있다. 본 논문에서는 시퀀스 내의 데이터 포인트들의 값들의 근사치에 대한 정보와 시퀀스 내의 포인트들의 방향성에 대한 정보를 내포하고 있는 트랜드 벡터(trend vector)에 대한 소개와 이 벡터를 이용하여 데이터 시퀀스를 위한 유사 패턴 검색 기법을 제안한다. 시퀀스는 복수 개의 세그먼트로 분할되며 각 세그먼트는 트랜드 벡터로 표현된다. 질의처리는 시퀀스 내의 각각의 포인트들에 대하여 수행되는 대신, 트랜드 벡터들에 대하여 처리된다. 제안한 기법은 이 벡터를 사용하여 질의와 무관한 데이터 시퀀스들을 데이터베이스로부터 여과하고 질의 시퀀스와 유사한 시퀀스들을 검색하도록 설계되었다. 제안한 기법을 검증하기 위하여 비디오 스트림과 가상으로 생성된 데이터에 관하여 실험을 수행하였으며, 실험 결과 제안한 기법의 정밀도(precision)는 기존의 방법에 비하여 2.1배까지 향상되었으며 처리시간은 45%까지 감소되었음을 보여주고 있다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제45권3호
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• pp.181-190
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• 2007

The phylogenie relationships existing among 14 parasitic Platyhelminthes in the Republic of Korea were investigated via the use of the partial 28S ribosomal DNA (rDNA) D1 region and the partial mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (mCOI) DNA sequences. The nucleotide sequences were analyzed by length, G + C %, nucleotide differences and gaps in order to determine the analyzed phylogenie relationships. The phylogenie patterns of the 28S rDNA D1 and mCOI regions were closely related within the same class and order as analyzed by the PAUP 4.0 program, with the exception of a few species. These findings indicate that the 28S rDNA gene sequence is more highly conserved than are the mCOI gene sequences. The 28S rDNA gene may prove useful in studies of the systematics and population genetic structures of parasitic Platyhelminthes.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제48권3호
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• pp.231-236
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• 2010

Anopheles fluviatilis James (Oiptera: Culicidae) is one of the known malaria vectors in south and southeastern Iran. Earlier ITS2 sequences analysis of specimens from Iran demonstrated only a single genotype that was identical to species Y in India, which is also the same as species T. We identified 2 haplotypes in the An. fluviatilis populations of Iran based on differences in nucleotide sequences of D3 domain of the 28S locus of ribosomal DNA (rDNA). Comparison of sequence data from 44 Iranian specimens with those publicly available in the Genbank database showed that all of the 288-D3 sequences from Kazeroun and Khesht regions in Fars Province were identical to the database entry representing species U in India. In other regions, all the individuals showed heterozygosity at the single nucleotide position, which identifies species U and T. It is argued that the 2 species may co-occur in some regions and hybridize; however, the heterozygosity in the 288-D3 locus was not reflected in ITS2 sequences and this locus for all individuals was identical to species T. This study shows that in a newly diverged species, like members of An. fluviatilis complex, a single molecular marker may not be sufficiently discriminatory to identify all the taxa over a vast geographical area. In addition, other molecular markers may provide more reliable information for species discrimination.

• 정보처리학회논문지B
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• 제14B권7호
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• pp.473-480
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• 2007

비디오 영상 프레임들에서 2D 특징점들을 지속적으로 추적하는 문제는 프레임 간의 빈번한 특징점 매칭 실패로 인하여 어려움을 겪어왔다. 본 논문에서는 긴 비디오 프레임들에서 강건하게 2D 특징점들을 추적하는 기법을 제안한다. 이전 프레임까지 추적되어온 각 특징점에 대해 움직임 상태변수를 정의하고 이들 상태변수로부터 현재 프레임에서의 움직임을 예측한다. 예측된 움직임은 추적을 위한 탐색 윈도우를 설정을 위한 초기 위치로 지정된다. 유사성 검사를 통해서 탐색 윈도우 내에서 대응점을 결정한다. 측정 데이터를 반영하여 현재 프레임에서의 특징점의 움직임 상태 변수를 수정하는 과정을 갖는다. 특징점의 추적 결과는 오차를 포함하고 있고 잘못된 추적이 발생될 수 있다. 잘못 추적된 이상값들은 RANSAC 알고리즘을 적용하여 제거함으로써 정확한 특징점 추적이 지속될 수 있도록 한다. 실제 비디오 프레임들에 대해 특징점 추적을 실시한 결과 긴 비디오 프레임들에 대해서도 특징점 추적이 안정적으로 수행됨을 확인할 수 있었다.