Self-sufficient P450s, due to their fused nature, are the most effective tools for electron transfer to activate C-H bonds. They catalyze the oxygenation of fatty acids at different omega positions. Here, two new, self-sufficient cytochrome P450s, named 'CYP102A15 and CYP102A170,' from polar Bacillus sp. PAMC 25034 and Paenibacillus sp. PAMC 22724,respectively, were cloned and expressed in E. coli. The genes are homologues of CYP102A1 from Bacillus megaterium. They catalyzed the hydroxylation of both saturated and unsaturated fatty acids ranging in length from C12-C20, with a moderately diverse profile compared to other members of the CYP102A subfamily. CYP102A15 exhibited the highest activity toward linoleic acid with Km 15.3 μM, and CYP102A170 showed higher activity toward myristic acid with Km 17.4 μM. CYP10A170 also hydroxylated the Eicosapentaenoic acid at ω-1 position only. Various kinetic parameters of both monooxygenases were also determined.
Kim, Jae-Hwan;Byun, Mi Jeong;Kim, Myung-Jick;Suh, Sang Won;Ko, Yeoung-Gyu;Lee, Chang Woo;Jung, Kyoung-Sub;Kim, Eun Sung;Yu, Dae Jung;Kim, Woo Hyun;Choi, Seong-Bok
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
/
v.26
no.2
/
pp.163-170
/
2013
In order to analyze the genetic diversity and phylogenetic status of the Korean Chikso breed, we determined sequences of mtDNA cytochrome b (cyt b) gene and performed phylogenetic analysis using 239 individuals from 5 Chikso populations. Five non-synonymous mutations of a total of 15 polymorphic sites were identified among 239 cyt b coding sequences. Thirteen haplotypes were defined, and haplotype diversity was 0.4709 ranging from 0.2577 to 0.6114. Thirty-five haplotypes (C1-C35) were classified among 9 Asia and 3 European breeds. C2 was a major haplotype that contained 206 sequences (64.6%) from all breeds used. C3-C13 haplotypes were Chikso-specific haplotypes. C1 and C2 haplotypes contained 80.5% of cyt b sequences of Hanwoo, Yanbian, Zaosheng and JB breeds. In phylogenetic analyses, the Chikso breed was contained into B. taurus lineage and was genetically more closely related to two Chinese breeds than to Korean brown cattle, Hanwoo. These results suggest that Chikso and Hanwoo have a genetic difference based on the mtDNA cyt b gene as well as their coat color, sufficient for classification as a separate breed.
Purpose: Neuronal apoptotic events induced by aging and hypoxic/ischemic conditions is an important risk factor in neurodegenerative diseases such as ischemia stroke and Alzheimer's disease. The peel of Citrus sunki Hort. ex Tanaka has long been used as a traditional medicine, based on multiple biological activities including anti-oxidant, anti-inflammation, and anti-obesity. In the current study, we examined the actions of fermented C. sunki peel extract against cobalt chloride ($CoCl_2$)-mediated hypoxic death in human neuroblastoma SH-SY5Y cells. Methods: Cell viability was measured by trypan blue exclusion. Expression of apoptosis related proteins and release of cytochrome c were detected by western blot. Production of intracellular reactive oxygen species (ROS) and apoptotic morphology were examined using 2',7'-dichlorofluorescin diacetate (DCF-DA) and 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) staining. Results: Exposure to $CoCl_2$, a well-known mimetic agent of hypoxic/ischemic condition, resulted in neuronal cell death via caspase-3 dependent pathway. Extract of fermented C. sunki peel significantly rescued the $CoCl_2$-induced neuronal toxicity with the cell viability and appearance of apoptotic morphology. Cytoprotection with fermented C. sunki peel extract was associated with a decrease in activities of caspase-3 and cleavage of poly (ADP ribose) polymerase (PARP). In addition, increase in the intracellular ROS and release of cytochrome c from mitochondria to the cytosol were inhibited by treatment with extract of fermented C. sunki peel. Conclusion: Based on these data, fermented C. sunki peel extract might have a protective effect against $CoCl_2$-induced neuronal injury partly through generation of ROS and effectors involved in mitochondrial mediated apoptosis.
Several peroxovanadium(V) complexes with an organic chelate ligand decompose spontaneously, depending on the nature of the chelate ligand. The self-decomposition reactions of the dinuclear peroxovanadium(V) complex with 2-oxo-l,3-diaminopropane-N,N,N',N'-tetraacetate (dpot) and the peroxovanadium(V) complexes with N-carboxymethylhistidinate (cmhist) and histamine-N,N-diacetate (histada) accompany the reduction of vanadium(V) to vanadium(IV). This implies that the peroxide anion acts as a reducing agent and thus the peroxide is oxidized in the decomposition process of the peroxovanadium(V) complexes. The oxidized dioxygen species have been characterized spectrophotometrically. Superoxide anion has been detected in 2-3 % yields using the reduction of cytochrome c method and chemiluminescence method utilized MCLA as a fluorescer. Singlet oxygen has also been detected in higher yields on the basis of chemiluminescence of tryptophan.
Background: To evaluate the effects of bufalin in A549 human lung adenocarcinoma epithelial cells in vitro and assess the underlying mechanisms. Materials and Methods: Human A549 non-small cell lung cancer (NSCLC) cells were treated with various concentrations of bufalin. Cell proliferation was measured by CCK-8 assay, apoptotic cell percentage was calculated by flow cytometry and morphological change was observed by inverted phase contrast microscopy/transmission electron microscopy. In addition, the membrane potential of mitochondria was detected by JC-1 fluorescence microscopy assay, and the related protein expression of cytochrome C and caspase-3 was analyzed by Western blotting. Results: Bufalin could inhibit the proliferation of A549 cells via induction of apoptosis, with the evidence of characteristic morphological changes in the nucleus and mitochondria. Furthermore, bufalin decreased the mitochondrial membrane potential with up-regulation of cytochrome C in the cytosol, and activation of caspase-3. Conclusions: Bufalin inhibits the proliferation of A549 cells and triggers mitochondria-dependent apoptosis, pointing to therapeutic application for NSCLC.
Background: Terpinen-4-ol, a monoterpene, is found as the main component of essential oil extracts from many plants. In this study apoptotic and autophagic types of cell death induced by terpinen-4-ol and associated mechanisms were investigated in human leukemic HL-60 cells. Materials and Methods: The cytotoxicity of human leukemic U937 and HL-60 cells was determined by MTT assay. Cytochrome c release, expression of Bax, Bcl-2, Bcl-xl and cleaved Bid were determined by Western blotting. Cell morphology was examined under a transmission electron microscope. LC3-I/II, ATG5 and Beclin-1 levels were detected by immunoblotting. Results: Terpinen-4-ol exhibited cytotoxicity to human leukemic HL-60 but not U937 cells. The apoptotic response to terpinen-4-ol in HL-60 cells was due to induction of cytochrome c release from mitochondria and cleavage of Bid protein after the stimulation of caspase-8. There was a slightly decrease of Bcl-xl protein level. The characteristic cell morphology of autophagic cell death was demonstrated with multiple autophagosomes in the cytoplasm. At the molecular level, the results from Western blot analysis showed that terpinen-4-ol significantly induced accumulation of LC3-I/II, ATG5 and Beclin-1, regulatory proteins required for autophagy in mammalian cells. Conclusions: Terpinen-4-ol induced-human leukemic HL-60 cell death was via both autophagy and apoptosis.
In the course of screening for novel cell cycle inhibitors and apoptotic inducers, CR389, elucidated as 5-(1H-benzoimidazol-2-yl)-1H-pyridin-2-one, was generated as a new hit compound. Flow cytometric analysis and western blots of PA-1 cells treated with $60{\mu}M$ CR389 revealed an appreciable cell cycle arrest at the G2/M phase through direct inhibition of the CDK1 complex. In addition, activation of p53 via phosphorylation at Ser15 and subsequent up-regulation of p21CIP1 showed that CR389 also induces p53-dependent-p21CIP1-mediated cell cycle arrest. Furthermore, apoptotic induction in $60{\mu}M$ CR389-treated PA-1 cells is associated with the release of cytochrome c from mitochondria through up-regulation of the proapoptotic Bax protein, which results in the activation of procaspase-9 and -3, and the cleavage of poly(ADP-ribose) polymerase (PARP). Accordingly, CR389 seems to have multiple mechanisms of antiproliferative activity through p53-mediated pathways against human ovarian cancer cells. Therefore, we conclude that CR389 is a candidate therapeutic agent for the treatment of human ovarian cancer via the activation of p53.
Kim, Young-Mi;Lim, Jung-Mi;Kim, Byung-Chul;Han, Sanghwa
Molecules and Cells
/
v.21
no.1
/
pp.161-165
/
2006
Dichlorodihydrofluorescein ($DCFH_2$) is a widely used probe for intracellular $H_2O_2$. However, $H_2O_2$ can oxidize $DCFH_2$ only in the presence of a catalyst, whose identity in cells has not been clearly defined. We compared the peroxidase activity of Cu,Zn-superoxide dismutase (CuZnSOD), cytochrome c, horseradish peroxidase (HRP), $Cu^{2+}$, and $Fe^{3+}$ under various conditions to identify an intracellular catalyst. Enormous increase by bicarbonate in the rate of $DCFH_2$ oxidation distinguished CuZnSOD from cytochrome c and HRP. Cyanide inhibited the reaction catalyzed by CuZnSOD but accelerated that by $Cu^{2+}$ and $Fe^{3+}$. Oxidation of $DCFH_2$ by $H_2O_2$ in the presence of a cell lysate was also enhanced by bicarbonate and inhibited by cyanide. Confocal microscopy of $H_2O_2$-treated cells showed enhanced DCF fluorescence in the presence of bicarbonate and attenuated fluorescence for the cells pre-incubated with KCN. Moreover, DCF fluorescence was intensified in CuZnSOD-transfected HaCaT and RAW 264.7 cells. We propose that CuZnSOD is a potential intracellular catalyst for the $H_2O_2$-dependent oxidation of $DCFH_2$.
Kim, Ji Min;Kim, Jong-Gwan;Kim, So Yeon;Choi, Woo Yong;Kim, Hyung Seop;Kim, Min-Seop
Animal Systematics, Evolution and Diversity
/
v.36
no.3
/
pp.228-231
/
2020
Pseudohelice subquadrata (Dana, 1851) is endangered due to its restricted habitat; hence, it has been designated as a marine protected species and endangered species by law in Korea. It has been recorded only Jeju-do and Geomun-do, Republic of Korea. The present study, is the first report on a cytochrome c oxidase subunit I DNA barcode for P. subquadrata. The maximum intra-specific genetic distance among all P. subquadrata individuals was found to be 0.5%, whereas inter-genetic distance within the same genus was 17.2-21.5% compared with Helice tientsinensis (Rathbun, 1931), H. tridens (De Haan, 1835), H. epicure (Ng et al., 2018), and Helicana wuana (Rathbun, 1931). Our barcoding data can thus be used as reference for restoration and conservation studies on P. subquadrata, which are designated as marine protected species.
The rats with protein-calorie malnutrition (PCM, 5% casein diet for a period of 4-week) were reported to exhibit 60 and 80% suppression in the hepatic microsomal cytochrome P450 (CYP) 1 A2 and CYP2C11 levels, respectively, and 40-50% decreases in CYP2E1 and CYP3A 1/2 levels compared to control (23% casein diet for a period of 4-week) based on Western blot analysis. In addition, Northern blot analysis showed that CYP1 A2, CYP2E1, CYP2C11, and CYP3A1/2 mRNAs decreased in the state of PCM as well. Hence, pharmacokinetic changes of the drugs in rats with PCM [especially the area under the plasma concentration-time curve from time zero to time infinity (AUC) changes of metabolite(s)] reported from literatures were tried to explain in terms of CYP isozyme changes in the rats. Otherwise, the time-averaged nonrenal clearance ($CL_{NR}$) of parent drug was compared. Pharmacokinetic changes of the drugs in other types of malnutritional state, such as kwashiorkor and marasmus, in both human and animal models were also compared. The drugs reviewed are as follows: diuretics, antibiotics, anticancer agents, antiepileptics, antiarrythmics, analgesics, xanthines, antimalarials, and miscellaneous.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.