• 제목/요약/키워드: component protein

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Identification of Atg8 Isoform in Encysting Acanthamoeba

  • Moon, Eun-Kyung;Hong, Yeonchul;Chung, Dong-Il;Kong, Hyun-Hee
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제51권5호
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    • pp.497-502
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    • 2013
  • Autophagy-related protein 8 (Atg8) is an essential component of autophagy formation and encystment of cystforming parasites, and some protozoa, such as, Acanthamoeba, Entamoeba, and Dictyostelium, have been reported to possess a type of Atg8. In this study, an isoform of Atg8 was identified and characterized in Acanthamoeba castellanii (AcAtg8b). AcAtg8b protein was found to encode 132 amino acids and to be longer than AcAtg8 protein, which encoded 117 amino acids. Real-time PCR analysis showed high expression levels of AcAtg8b and AcAtg8 during encystation. Fluorescence microscopy demonstrated that AcAtg8b is involved in the formation of the autophagosomal membrane. Chemically synthesized siRNA against AcAtg8b reduced the encystation efficiency of Acanthamoeba, confirming that AcAtg8b, like AcAtg8, is an essential component of cyst formation in Acanthamoeba. Our findings suggest that Acanthamoeba has doubled the number of Atg8 gene copies to ensure the successful encystation for survival when 1 copy is lost. These 2 types of Atg8 identified in Acanthamoeba provide important information regarding autophagy formation, encystation mechanism, and survival of primitive, cyst-forming protozoan parasites.

방어 보통육과 혈합육의 단백질 및 아미노산조성의 사후변화 (Changes Occurred in Protein and Amino Acid Compositions during Postmortem Aging of White and Dark Muscle of Yellowtail at $2^{\circ}C$)

  • 김장양;최영준;변재형
    • 한국수산과학회지
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    • 제15권2호
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    • pp.123-136
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    • 1982
  • 방어의 배육 보통육과 측육 혈합육을 $2^{\circ}C$에 보장하여 두고 선도변화 총계별로 단백질의 조성과 각축의 구성 및 유리아미노산의 조성을 분석하였으며, 건향질단백질과 근원섬유단백질에 대하여는 구성단백질의 분포변화를 확인하기 위하여 $NaDodSO_4$변한 다음, polyacrylamide겔 전기영동상을 비교 해석함으로써 적색육어류의 선도변화와 보통육 및 혈합육의 단백질조성 변화와의 관련성을 검토하였다. K-값과 휘발성염기질소 및 pH값으로 판정했을 때, 혈합육은 보통육에 비하여 선도변화가 빨랐다. 사후 선도변화와 더불어 근원질단백질과 노원섬유단백질은 감소하는 반면, 세포내잔사단백질은 상대적으로 증가하였으며, 이러한 변화는 보통육에 비하여 혈합육이 훨씬 심한 편이었다. Sodium dodecyl sulfate 화한 단백질을 polyacrylamide겔 전기영동함으로 분석한 결과, 보통육의 근원질단백질은 16개 성분, 그리고 혈합육의 근원질단백질은 12개 성분으로 구성되어 있었으며, 보장 10일째부터 보통육의 근원질단백질은에는 41,000dalton과 18,000dalton의 양분이 조금씩 증가하였고, 26,000 dalton과 23,500 dalton 및 23,000 dalton되 각 성분은 점차 감소하였다. 혈합육의 근원질단백질에 있어서는 49,000 dalton의 성분은 감소하였고 47.000 dalton의 성분은 새로이 형성되었으며, 26,000 dalton의 성분은 소감하였다. 근원섬유단백질의 전기영동분석결과에 의하면, 보통육의 근원섬유단백질은 17개 성분, 그리고 혈합육의 근원조직단백질은 16개의 성분으로 구성되어 있었다. 보장 10일에부터 보통육의 근원섬유단백질중에는 40,000 dalton의 성분이 증가하였고, 37,500 dalton의 성분은 점차 감소하였으며, 32,000 dalton의 성분은 새로히 출현하였다. 혈합육의 근원섬유단백질은 보장 9일째부터 58,000 dalton과 64,000 dalton의 성분은 그 농도가 단가하였으며, 17,500의 light chain-2 단백질은 소감하였고, 32,000 dalton의 성분은 새로이 출현하였다. 이 같은 전기영동상의 변화는 근원질단백질이 근원섬유단백질에 비하여 빨랐으며, 근원섬유단백질의 경화에 있어서는 혈합육쪽이 보통육에 비하여 빨랐다. 양 육의 단백질을 구성하는 아미노산을 분석한 결과, 즉살한 방어의 보통육 단백질은 글루탐산, 아스팔트산, 류신. 알기닌, 알라닌 등은 그 양이 어느 정도 많았고, 프롤린과 트?토판은 그 양이 적었으며, 혈합육에 있어서도 비슷한 경형이었다. 그리고 10일이 경과한 보통육에 있어서는 글루탐산과 아스팔트산이 현저히 감소하였으며, 9일이 경과한 혈합육에 있어서는 알라닌, 글리신, 그리고 알기닌이 현저히 감소하였다. 유리아미노산의 조성을 분석 결과, 즉살한 방어의 보통육중에는 히스티딘이 총유리아미노산의 약 $63\%$를, 그리고 혈합육중에는 타우린이 총유리아미노산의 약 $67\%$를 차지하는 양을 보였다. 그리고 $2^{\circ}C$에서 10일이 경과했을 때, 보통육에서는 히스티딘, 발린, 타우린이 증가하였으며, 알라닌, 류신 및 글리신 등은 조금 감소하였다. 같은 온도에서 9일이 경과한 혈합육에서는 타우린, 페닐알라닌, 글리신은 증하였으며, 히스티딘, 알라닌, 세린 등은 감소하였다.

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분열효모 Pci2가 TREX-2 구성요소로서 mRNA 방출에 미치는 영향 (Fission yeast Pci2 has function in mRNA export as a component of TREX-2)

  • 박진희;윤진호
    • 미생물학회지
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    • 제54권4호
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    • pp.325-329
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    • 2018
  • PCI 영역을 포함하고 있는 Thp1/PCID2 단백질은 mRNA 전사와 방출을 연결하는, 진화적으로 보존된 TREX-2 복합체의 구성요소이다. 분열효모인 Schizosaccharomyces pombe에서 pci2 (SPBC1105.07c) 유전자는 TREX-2 복합체의 구성요소인 Thp1 (출아효모)/PCID2 (사람)의 분열효모 이종상동체로 추정되는 PCI 영역을 갖는 단백질을 암호화하고 있다. pci2 발현을 억제하면 생장과 mRNA 방출이 모두 억제되었다. 그리고 pci2 유전자의 과발현 또한 생장을 늦추고 $poly(A)^+$ RNA를 핵 안에 약간 축적되게 하였다. 뿐만 아니라 Yeast two-hybrid와 공동침전(Co-immunoprecipitation) 분석 실험에서 Pci2는 TREX-2 복합체의 다른 구성요소인 Sac3, Dss1 단백질들과 물리적으로 상호작용하였다. 이와 같은 관찰들은 S. pombe의 Pci2 단백질도 TREX-2 복합체의 구성요소로서 mRNA 방출에 관여함을 의미한다.

Crystal Structure of Osmotin, a Plant Antifungal Protein

  • Kyeongsik Min;Ha, Sung-Chul;Yun, Dae-Jin;Kim, Kyeong-Kyu
    • 한국생물물리학회:학술대회논문집
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    • 한국생물물리학회 2002년도 제9회 학술 발표회 프로그램과 논문초록
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    • pp.29-29
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    • 2002
  • In response to fungal invasion and other signals, plants accumulate a number of proteins that are involved in defense against pathogens. Osmotin is a 24 kDa protein belonging to the pathogenesis-related (PR) protein, a component of the hypersensitive response in leaves of tobacco plants exposed to tobacco mosaic virus.(omitted)

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Bence Jones 단백질(蛋白質)의 정제(精製) 및 N-말단검출(末端檢出) (Purification and N-Terminal Study of Bence Jones Proteins)

  • 김준평
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제13권1호
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    • pp.59-64
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    • 1970
  • Bence Jones 단백질(蛋白質)(As,Ik,In)를 DEAE-Sephadex A-50 Column으로 0.02M phosphate Buffer(pH8.)와 0.5M NaCl를 gradient로 사용(使用)해 정재(精製)하였다. 시료(試料) As(K-형(型))의 정재결과(精製結果) 주성분(主成分)인 F-1는 조단백질(粗蛋白質) 500mg로부터 350mg 얻었으며 다른 시료(試料) Im와 Ik($lambda$-형(型))에서도 각각 주성분(主成分)을 242mg(Im)와 146mg(Ik) 얻을 수 있었다. 정재(精製)한 시료(試料)는 그의 순도(純度)를 알기 위해 Poly acryl amide의 Disc electrophoresis로 확인한 후 K-형(型) Bence jones단백질(蛋白質)의 일종(一種)인 As와 $lambda$-형(型)의 일종(一種)인 IM를 6N-HCI로 $105^{\circ}C$에서 20시간(時間) 가수분해(加水分努)후 Amino 산(酸) 조정(組成)을 살펴보았다. DNP법(法)으로 시료(試料) K-형(型)(As, Ko, Ta)의 단백질(蛋白質)의 N-말단(末端)을 검출(檢出)해 Ta는 glutamic acid, Ko, As는 Aspartic acid임을 확인하였으며 Paper 상(上)에 나타난 DNP-Amino 산(酸)은 5% $NaHCO_3$ (pH8) 4ml에 추출(抽出)해 그 수량(收量)을 ${\varepsilon}=18.1{\times}10^3DNP$ $Asp\;{\varepsilon}=17.41{\times}10^(3){\;}DNP{\;}Glu$에 의(依)해 산출(算出)하였더니 Ko는 54.3%, As는 65%이였으며 Ta는 85%의 수량(收量)이였다. ${\lambda}$-형(型)의 Im,Ik의 시료(試料)도 DNP법(法)으로 N-말단(末端)을 검출(檢出)해 보았더니 검출(檢出)되지 아니하였다.

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도체등급별 한우육의 연도와 단백질특성에 대한 비교연구 (Comparative studies on Tenderness and Characteristics of Protein Obtained from Various Carcass grade in Korean native Cow)

  • 문윤희;강세주
    • 생명과학회지
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    • 제7권4호
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    • pp.336-341
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    • 1997
  • This study was conducted to investigate the effects of carcass grade on the hardness, myofibrillar fragmentations index, protein extractability and Mg-ATPase activity of myofibril and actomyosin obtained from 1, 2, 3 and D carcass grade)subgrade) in Korean native cow. Proximate component, hardness, chewiness, myofibril fragmentation index, protein extractability and Mg-ATPase activity if myofibril or actomyosin were not significantly different between 1st and 2nd carcass grade loin. The hardness and chewiness of 2nd carcass grade loin's were significantly lower than 3th grade loin's, but the myofibril fragmentation index, sarcoplasmic protein extractability and Mg-ATPase activity of myofibril were higher. The myofibrillar protein extractability and Mg-ATPase activity of actomyosin obtained from 3th carcase grade loin's were significantly higher than D grade loin's, but the hardness, chewiness and stroma protein extractability were lower. In conclusion, the degree of toughness in Korean native cow's loin was not significantly different between 1st and 2nd grade, but 3rd and D carcass grade were significantly higher, regardless of before and after aging.

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Development of Two-Component Nanorod Complex for Dual-Fluorescence Imaging and siRNA Delivery

  • Choi, Jin-Ha;Oh, Byung-Keun
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제24권9호
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    • pp.1291-1299
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    • 2014
  • Recently, multifunctional nanomaterials have been developed as nanotherapeutic agents for cellular imaging and targeted cancer treatment because of their ease of synthesis and low cytotoxicity. In this study, we developed a multifunctional, two-component nanorod consisting of gold (Au) and nickel (Ni) blocks that enables dual-fluorescence imaging and the targeted delivery of small interfering RNA (siRNA) to improve cancer treatment. Fluorescein isothiocyanate-labeled luteinizing hormone-releasing hormone (LHRH) peptides were attached to the surface of a Ni block via a histidine-tagged LHRH interaction to specifically bind to a breast cancer cell line, MCF-7. The Au block was modified with TAMRA-labeled thiolated siRNA in order to knock down the vascular endothelial growth factor protein to inhibit cancer growth. These two-component nanorods actively targeted and internalized into MCF-7 cells to induce apoptosis through RNA interference. This study demonstrates the feasibility of using two-component nanorods as a potential theranostic in breast cancer treatment, with capabilities in dual imaging and targeted gene delivery.

Purification of the NADH Reductase Component of the Steroid $9{\alpha}$-hydroxylase from Mycobacterium fortuitum

  • Kang, Hee-Kyoung;Lee, Sang-Sup
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제20권6호
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    • pp.590-596
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    • 1997
  • The NADH reductase component of the steroid 9.alpha.-hydroxylase from Mycobacterium fortuitum was purified to homogeneity. Recovery of the enzyme from the 50-60% ammonium sulfate saturated fraction was 49%, with a purification factor of 100-fold. The NADH reductase has a relative molecular of 60 KDa as determined by SDS-PAGE. The absorption maxima at 410 and 450 nm indicate the presence of iron-sulfur group and flavin. These prosthetic groups seemed to function as redox groups that transfer electrons from NADH to the following protein. The $K_M$ value for NADH as substrate was $68{\mu}M$. The $NH_2$-terminal amino acid sequence of the reductase was determined as Met-Asp-Ala-Ile-Thr-Asn-Val-Pro-Leu-Pro-Ala-Asn-Glu-Pro-Val-His-Asp-Tyr-Ala-Thr. This sequence does not show a homology with the $NH_2$ -terminal sequences reported for the reductase component of other monooxygenases, suggesting that the NADH reductase component of the steroid 9.alpha.-hydroxylase system is novel.

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영하의 저온에 노출된 'Campbell Early'와 'Muscat Bailey A' 포도나무 신초의 전사체 비교 (Transcriptomic analysis of 'Campbell Early' and 'Muscat Bailey A' grapevine shoots exposed to freezing cold stress)

  • 김선애;윤해근
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제43권2호
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    • pp.204-212
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    • 2016
  • 환경스트레스 중의 하나인 저온에 대한 생육기의 포도나무의 반응을 분석하고자 -$2^{\circ}C$에서 4일 동안 저온처리 한두 품종('Campbell Early'와 'Muscat Baily A')의 포도나무잎을 이용하여 전사체를 분석하였고 특이발현유전자(differentially expressed genes, DEGs)를 검색하였다. 영하의 저온에 반응한 'Campbell Early'의 DEG를 기능별로 분석한 결과 생물대사에서 17,424개, 세포구성에서 28,954개, 분자기능에서는 6,972개의 유전자와 관련이 있었다. 발현이 유도되는 유전자로는 dehydrin xero 1, K-box region and MADS-box transcription factor family protein과 MYB domain protein 36이 있으며, 억제되는 유전자로는 light-harvesting chlorophyll B-binding protein 3, FASCICLIN-like arabinoogalactan 9와 pectin methylesterase 61 등이 있었다. 'Muscat Baily A'의 DEG는 생물대사에서 1,157개, 세포구성에서 1,350개, 분자기능에서는 431개의 유전자와 관련이 있었다. 발현이 유도되는 유전자로는 NB-ARC domain-containing disease resistance protein, fatty acid hydrozylase syperfamily와 isopentenyltransferase 3이 있으며, 억제되는 유전자로는 binding, IAP-like protein 1과 pentatricopeptide repeat superfamily protein 등이 있었다. Real-time PCR을 이용하여 영하의 저온에서 특이적으로 발현하는 유전자들을 검정하였으며, InterPro Scan을 통해 단백질 도메인을 분석한 결과 두 품종 모두에서 ubiquitin-protein ligase가 가장 많았다. 영하의 저온에 노출된 신초의 전사체 정보를 바탕으로 포도나무에서 저온 내성을 발현하는 기작을 연하는 데에 분자수준의 정보를 제공하고, 내한성 포도를 육종하는데 이용될 수 있을 것이다.

은연어와 무지개 송어의 식품성분 (Food Components of Coho Salmon and Rainbowtrout)

  • 김경삼;최영준
    • 한국식품영양학회지
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    • 제6권2호
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    • pp.73-80
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    • 1993
  • In order to examine food components of coho salmon and rainbow-trout, We analyzed the composition of protein, amino acids and total lipids. The coho salmon muscle contained about 19.3% of protein with the composition of 29.9% in sarcoplasmic protein, 56.3oA in myofibrillar protein 12.5% alkali soluble protein and 2.6% in stroma. Those of rainbow-trout contained 34.1%, 56.4%, 8.3% and 2.9%, respectively. The sarcoplasmic and myofibrillar protein were composed of 13 subunits in coho salmon, and 16 and 15 subunits in rainbow-trout. Judging from the contents of essential amino acids, both muscle proteins were complete proteins. The most remarkable feature of free amino acids was that a large amount of dipeptide anserine was present with fairly lower levels of 1 methyl histidine, taurine, histidine, alanine and glycine in both muscle extracts. The total fatty acids of coho salmon was composed of 31.49% polyenes, 43.79% monoenes and 24.73% saturates. The composition of total fatty acid of coho salmon muscle was not different from that of rainbow-trout muscle.

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