• 한국균학회지
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• 제42권1호
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• pp.91-94
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• 2014

2013년 6월, 경기도 여주시에서 저장 중인 고구마 괴근 표면에 갈색의 썩음 증상이 관찰되었다. 병징은 둥글고, 옅은 갈색 내지 진한 갈색이며, 단단하고 건조한 편으로 표피에 한하여 얄팍하게 나타났다. 병반 부위는 오래된 부위에서 움푹 패이고, 괴근의 내부로 깊게 썩히지 않았다. 병든 고구마에서 7개의 Fusarium균을 분리하였고, CLA 배지에서 균학적 특징을 조사한 결과 F. oxysporum으로 동정되었다. 이러한 결과를 확인하기 위하여 elongation factor 1 ${\alpha}$ 유전자 부위의 염기서열을 분석하였다. 그 결과, 7개 균주 중 4개는 F. commune으로, 3개는 F. oxysporum으로 확인되었다. 고구마 괴근을 상처구와 무상처구로 구분하고, 균사절편을 접종하여 병원성을 확인한 결과, 접종 7일 후 F. commune을 접종한 상처구에서만 병징이 관찰되었다. 따라서 본 병을 Fusarium commune에 의한 고구마 표피썩음병으로 명명하며, 국내에서 최초로 보고한다.

• 한국균학회지
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• 제26권1호통권84호
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• pp.103-107
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• 1998

Coprinus cinereus에서 tryptophan 생합성에 관여하는 trp2 유전자의 이종 버섯에서의 발현여부를 조사하였다. 유전자 상동성을 확인하기 위하여, C. cinereus trp2 유전자를 함유하는 재조합 DNA인 pHIONA8을 probe로 사용하여 southern blot을 한 결과 S. commune 1-71의 tryptophan 생합성 유전자와 상당한 homology가 있는 것으로 나타났다. pHIONA8 DNA를 이용한 S. commune T1(tryptophan 영양요구주)의 상보성 검증에서는 pertri-dish당 약 50개의 형질전환체가 나타났으며, 이들 형질전환체는 다른 S. commune의 다른 화합성 균주와의 교배 실험에서 clamp cell의 유도와 동시에 약 $2{\sim}3$주만에 자실체를 관찰하였다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제42권1호
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• pp.67-72
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• 2014

A new substrate, breadcrumbs, was investigated for biomass accumulation, the pH of the cultural broth, the formation of primary metabolites such as the proteins and endopolysaccharides of Schizophyllum commune 1768 and Trametes versicolor 353, as well as its bioconversion efficiency. The results showed that S. commune gives more mycelial mass ($23.96{\pm}0.8g/l$) and in a shorter period (4 days) than T. versicolor ($15.76{\pm}0.5g/l$ in 5 days). The pH values changed from the initial 6.1 to 3.6 in S. commune cultural broth and to 4.4 in T. versicolor cultural broth. Maximal endopolysaccharide content in the mycelia of S. commune and T. versicolor were 7.13% and 6.42%, correspondingly. Crude protein content in S. commune mycelium was 18.83 % on the 4th day of cultivation, and 20.03%, in the mycelium of T. versicolor, on the 6th day of cultivation. Kinetic parameters for the quantitative estimation of cultivation efficiency were calculated for biomass, endopolysaccharide, and crude protein concentrations.

• 한국식품영양과학회지
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• 제26권3호
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• pp.468-474
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• 1997

The chemical composition and hypocholoesterolaemic effect of Nostoc commune were studied. Proximate analysis data, composition of dietary fiber and oxalic acid-ammonium oxalate soluble substance of Nostoc commune were presented. Thirty rats were fed with the one of the following diet for three weeks: The control diet contained 0.75% cholesterol, 0.25% sodium cholate and 5% cellulose powder, CF was cholesterol free, PNC, ONC and RNC diet contained 7.2% powder, 2.2% extracts and 5% residue of Nostoc commune respectively. The lipid components of serum were assayed. The concentration of the total cholesterol was significantly lower in PNC, ONC than the control. The concentration of the total cholesterol was significantly lower in PNC, ONC than the control. The concentration of HDL-choloesterol was significantly higher in PNC than the control. The concentration of LDL, VLDL and chylomicron were comparatively lower in CF and PNC. The concentration of seum triglyceride and phospholipid was lower in PNC group than in the other group.

• Mycobiology
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• 제50권5호
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• pp.357-365
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• 2022

Schizophyllum commune has emerged as the most promising model mushroom to study developmental stages (mycelium, primordium), which are two primary processes of fruit body development. Long non-coding RNA (lncRNA) has been proved to participate in fruit development and sex differentiation in fungi. However, potential lncRNAs have not been identified in S. commune from mycelium to primordium developmental stages. In this study, lncRNA-seq was performed in S. commune and 61.56 Gb clean data were generated from mycelium and primordium developmental stages. Furthermore, 191 lncRNAs had been obtained and a total of 49 lncRNAs were classified as differently expressed lncRNAs. Additionally, 26 up-regulated differently expressed lncRNAs and 23 down-regulated between mycelium and primordia libraries were detected. Further, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analysis showed that differentially expressed lncRNAs target genes from the MAPK pathway, phosphatidylinositol signal, ubiquitin-mediated proteolysis, autophagy, and cell cycle. This study provides a new resource for further research on the relationship between lncRNA and two developmental stages (mycelium, primordium) in S. commune.

• 생명과학회지
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• 제28권11호
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• pp.1321-1331
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• 2018

본 연구에서 N. commune으로부터 U937과 SK-HEP-1 세포에 대해 apoptosis를 유도하는 광과민성물질을 순수 분리하였다. N. commune을 dichloromethane : Methanol (1:1)로 추출하여 Hexane, EtOAc, MeOH로 분획하였다. 높은 광역학활성을 나타내는 EtOAc 분획물에서 NC-1을 분리하였으며, 분자량 870의 pheophytin a ($C_{55}H_{74}N_4O_5$)인 것으로 구조를 동정하였다. 광역학활성 조사는 NC-1을 $1.15{\mu}M$에서 $23.00{\mu}M$까지 5개의 농도를 처리하여 광을 조사하는 것과 조사하지 않는 조건으로 나누어 평가하였다. U937과 SK-HEP-1 두 세포에서 apoptotic body 형성, cell blebbing 등의 형태적 변화와 세포독성, caspase 활성, 세포핵의 응축, DNA 단편화 등이 광 의존적이며 농도 의존적으로 활성이 증가하였다. 추가적으로 유세포분석을 통한 apoptosis 유도의 정량적 분석 결과에서도 광조건에서 농도가 증가할수록 apoptosis 유도가 증가하는 것을 확인하였다. 이러한 결과를 통해 NC-1의 U937과 SK-HEP-1 세포에 대한 사멸은 광역학적 apoptosis에 의한 것임을 확인하였다. 본 연구 내용을 N. commune으로부터 광감각제 개발의 기초자료로 활용할 수 있을 것이다.

• Journal of the Korean Wood Science and Technology
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• 제38권6호
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• pp.547-560
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• 2010

본 연구에서는 Schizophyllum commune의 당 분해효소 생산을 위한 최적 배양 조건과 목질바이오매스에 대한 당화 특성에 대하여 연구하였다. S. commune 균체 외 효소에는 endo-${\beta}$-1,4-glucanase (EG), cellobiohydrolase (CBH), ${\beta}$-glucosidase (BGL)와 같은 cellulase와 ${\beta}$-1,4-xylosidase (BXL)이 함유되어 있고 그 중에서 EG 및 BGL활성이 비교적 높은 활성을 나타낸 것으로 밝혀졌다. S. commune에서 생산된 EG, BGL, 및 CBH의 최적 온도는 $50^{\circ}C$이었으나, 열안정성을 가지는 온도범위는 $30{\sim}40^{\circ}C$였다. 그리고 최적 pH는 5.5이었으며 열 안정성을 나타내는 온도범위에서의 적정 pH는 동일한 pH 5.5이었다. Cellulase 생산을 위한 S. commune의 최적배양 조건은, 탄소원으로 천연 cellulose, 질소원으로는 corn steep, 또는 peptone/yeast extract 혼합물, 비타민은 첨가하지 않는 것이 cellulase 효소활성 증가에 적절한 것으로 밝혀졌다. 또한 탄소원의 최적 첨가 농도는 2% (w/w), 적정 배양 pH 및 온도는 5.5~6.0과 $25{\sim}30^{\circ}C$로 밝혀졌다. 본 연구에서 도출된 최적 배양 조건으로 S. commune를 배양시키고 40배로 농축한 결과, EG가 3670.5 U/$m{\ell}$, BGL과 CBH가 각각 631.9 U/$m{\ell}$, 398.5 U/$m{\ell}$, BXL이 15.2 U/$m{\ell}$로 매우 높은 효소 활성을 나타냈다. 동일한 효소의 Filter Paper Unit도 11 FPU/$m{\ell}$로 상당히 높았다. 최적배양조건에서 얻어진 S. commune 효소로 다양한 기질에 대해 당화 시험을 실행한 결과, 전처리를 하지 않은 공시 활엽수에 대하여 낮은 당화율을 나타냈으나 천연 cellulose (Aldrich, ~20 micron) 및 볏짚의 경우에는 각각 50.5% 및 33.1%의 높은 당화성능을 나타냈다. 이 같은 당화 수준은 동일 효소농도 (30 FPU/g, glucan)로 비교했을 때 Trichoderma reesei 유래 상용화 효소인 Celluclast 1.5L의 약 110% 수준을 나타냄으로써, 대량생산기술 개발과정을 통해 목질계 당화 효소로의 상용화 가능성이 높은 균주로 평가되었다.

• 생명과학회지
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• 제12권2호
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• pp.173-181
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• 2002

북미산 S. commune UVMl-34의 A $\alpha$ 3 mating locus를 지니는 cosmid clone pSC13의 mating activity에 필요한 sequence 함유여부를 확인한 후 sequencing을 행하고 이에 대한 비교분석을 실시하였다. 그 결과 blast program을 사용한 전체 nucleotide 염기서열의 homology비교분석에서 남미산 1-71에 패하여 약 96%의 높은 homology를 나타내었으며, 1-71 A $\alpha$ 3 mating locus에서 모두 7개로 추정되는 exon의 염기서열의 비교실험에서도 거의 96% 이상에 이르는 homology를 나타내었다. 부분적으로는 AR (acidic rich region)에서 약 97%, HD (homeodomain)에서는 약 99%, BR (basic rich region)에서 약 97%, 그리고 Ser (serine rich regon)에서 약 95%의 높은 homology를 나타내어 지역간에 유전자상의 큰 변화는 나타나지 않는 것으로 확인되었다. 그리고 translated polypeptide sequence 를 이용하여 자생지가 다른 남미산 S. commune A $\alpha$ 3 mating locus 내의 Y-region은 비롯하여 다른 $A\alpha$ alleles내의 Y-region과 비교 분석한 결과 남미산에 대해 전체적으로 약 97%의 높은 homology를 나타내고 있지만 그 외 $A\alpha$ mating alllele gene의 Y-region과는 41~49%의 낮은 homology로 mating activity에 관여하고 있는 것으로 나타났다. 특히 mating에 있어 transcription regulator로 알려진 homeodomain에서는 약 98%의 homology가 나타남으로서 Z-region의 74%에 비하여 대륙간에 상당히 높은 유전자 보존상이 확인되었다. 또한 AR에서 97%, BR에서 100% 그리고 Ser에서도 98%의 상당히 높은 homology를 지니는 사실을 확인하였다. 이러한 결과로 보아 남미와 북미에 자생하는 같은 mating allele type간에는 상당히 높은 비율의 염기서열 보존이 이루어지고 있음을 알 수 있었으며, 비록 다른 $A\alpha$ alleles간의 비교 이지만 다른 mating alleles간의 약 50% homology와 비교할 때 보다 상당히 높은 결과로 보인다. 특히 homeodomain motif의 비교에서 Y1을 비롯한 다른 mating allele gene과도 85% 이상의 높은 homology를 나타내었으며 그 외 AR, BR, Ser 부위에서는 10~50%에 이르는 낮은 비율로 나타났다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제28권3호
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• pp.311-316
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• 2012

Fusarium root disease can be a serious problem in forest and conservation nurseries in the western United States. Fusarium inoculum is commonly found in most container and bareroot nurseries on healthy and diseased seedlings, in nursery soils, and on conifer seeds. Fusarium spp. within the F. oxysporum species complex have been recognized as pathogens for more than a century, but attempts to distinguish virulence by correlating morphological characteristics with results of pathogenicity tests were unsuccessful. Recent molecular characterization and pathogenicity tests, however, revealed that selected isolates of F. oxysporum are benign on Douglas-fir (Pseudotsuga menziesii) seedlings. Other morphologically indistinguishable isolates, which can be virulent, were identified as F. commune, a recently described species. In a replicated greenhouse study, inoculating Douglas-fir seedlings with one isolate of F. oxysporum prevented expression of disease caused by a virulent isolate of F. commune. Moreover, seedling survival and growth was unaffected by the presence of the F. oxysporum isolate, and this isolate yielded better biological control than a commercial formulation of Bacillus subtilis. These results demonstrate that an isolate of nonpathogenic F. oxysporum can effectively reduce Fusarium root disease of Douglas-fir caused by F. commune under nursery settings, and this biological control approach has potential for further development.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제16권1호
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• pp.52-56
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• 2006

The effect of bensulfuron-methyl on the nontargeted cyanobacteria was greater on A. variabillis than N. commune. Both A. variabillis and N. commune were initially able to utilize low concentrations of the herbicide, bensulfuron-methyl, whereas higher concentrations of bensulfuron-methyl or the hydrolyzed products of the herbicide were found to be toxic. Growth and photosynthesis inhibitions of over $50\%$ were observed, when 8 to 10 ppm of the herbicide was applied. Nitrogenase activities of the cyanobacteria were decreased by $94-98\%$ in A. variabillis and by $85-86\%$ in N. commune after 24 h of incubation with 10 ppm and 20 ppm of bensulfuron-methyl. Nitrogenase activities were also inhibited by the addition of ammonium salts as low as 0.05 mM. Furthermore, the toxic effect of the herbicide was the highest at pH 4-6, showing approximately $42-60\%$ toxicity, whereas much lower toxicity $(9-28\%)$ was observed at higher pH of 7-10, due to base-catalyzed hydrolysis of bensulfuron-methyl.