• Pediatric Infection and Vaccine
• /
• 제22권3호
• /
• pp.194-200
• /
• 2015

목적: 요로감염은 소아에서 흔한 세균 감염이며, Escherichia coli가 주요 원인균이다. 본 연구는 우리나라에서 소아 요로감염을 일으키는 E. coli의 계통 분류와 독성인자를 분석하고자 하였다. 방법: 2010년 10월부터 2013년 4월까지 요로감염으로 입원한 33명의 소아 환자로부터 검출된 E. coli균주를 대상으로 하였다. 중합효소연쇄반응을 통해 E. coli의 계통 분류 및 5가지 독성인자(fimH, sfa, papA, hylA, and cnf1)를 조사하였다. E. coli의 분자유전학적 특징을 환자의 임상적 진단과 동반된 방광요관 역류에 따라 분석하였다. 결과: 대부분의 요로병원성 E. coli 는 계통 분류에서 B2군(84.8%)에 속했으며, 나머지는 모두 D군(15.2%)에 해당되었다. 독성인자는 fimH (100%), sfa (100%), hylA (63.6%), cnfI (63.6%), 그리고 papA (36.4%)의 분포를 보였다. 임상 진단에 따른 계통 분류에서 급성 신우신염의 경우 B2군이 92.3%, D군이 7.7%를 나타냈으며, 방광염에서는 B2군에서 57.1%, D2군은 42.9%였다. 독성인자는 양 군에서 비슷하게 분포하였다. 급성 신우신염에서 방광요관 역류의 유무에 따른 계통 분류의 분포에는 차이가 없었으나, 독성인자의 경우 papA 유전자가 방광요관 역류가 동반되지 않은 군에서보다 방광요관 역류 군에서 적게 나타났다(43.8% vs. 20.0%, P=0.399). 결론: 본 연구는 국내 소아 요로감염의 원인 E. coli 균주의 분자유전학적 역학 자료를 제시하였으며, 이 결과는 향후 소아 요로감염의 발생 기전을 이해하는 데 기초가 될 것으로 생각된다.

• The Korean Journal of Ecology
• /
• 제25권5호
• /
• pp.353-358
• /
• 2002

소나무과 식물(곰솔, 리기다소나무 및 소나무)이 지닌 monoterpene의 표준시약 12가지를 4가지 농도별로 Escherichia coli와 Aspergillus nidulans에 처리하여 성장 저해 효과를 조사하였다. E. coli의 성장 저해 효과가 있는 것들은 (R)(-)carvone, (S)(+)carvone, (1R)(-)fenchone, (-)menthone, α-pinene, (1S)(-)verbenone 그리고 (+)β-pinene이었고, 이들 중에서 가장 높은 성장 저해 효과를 보이는 것은 (+)β-pinene이었다. 그리고 A. nidulans에 성장 저해 효과를 보이는 것들은 (R)(-)carvone, (S)(+)carvone, (+)β-pinene, geranyl-acetate, α-pinene 그리고 (1S)(-)verbenone이었다. 본 실험에서 A. nidulans에 성 장 저해 효과를 나타내는 monoterpene은 대부분 E. coli에서도 저해효과를 보이는데, 다만 geranyl-acetate는 E. coli에서는 전혀 영향을 미치지 않는 것으로 나타났다. 또한 (1R)(-)fenchone과 (-)menthone은 E. coli의 성장 억제를 하는 반면. A. nidulans의 성장에는 영향이 없었다. 특히 주목할 만한 점은 myrcene, sabinene, bornyl acetate 그리고 limonene의 경우 두 종 모두에서 성장 저해 효과가 전혀 나타나지 않았다.

• KSBB Journal
• /
• 제19권4호
• /
• pp.331-334
• /
• 2004

재조합 E. coli를 이용한 MCL-PHA의 생산에서 fatty acid pathway로부터 PHA 생합성 전구체 물질들이 만들어진다는 사실과 함께 이에 관여하는 enzymes이 밝혀지고 있다. 본 논문에서는 protein homology search로부터 탐색된 paaG와 ydbU genes의 PHA 생합성에서의 역할을 확인하기 위하여 paaG와 ydbU gene이 각각 knock-out된 mutant E. coli strains 를 제작하였다. 제작된 mutant E. coli들은 모균주들보다 낮은 PHA 농도와 함량을 가졌으며, 이러한 결과들로부터 paaG와 ydbU는 fatty acid pathway에서 PHA synthesis의 전구체 물질들을 공급한다는 사실을 확인하였다. 또한, 새로운 FadB homologous enzyme YgfG를 탐색하였으며, ygfG gene이 overexpression된 균주와 ygfG mutant를 제작하여 PHA 합성을 실험한 결과 ygfG도 paaG와 ydbU와 유사한 역할을 한다는 사실을 밝혔다. 이러한 연구결과들은 E. coli에서의 MCL-PHA 단량체들의 합성 경로를 확인하여 효과적인 PHA 생산 균주를 제작할 수 있게 할 것이다.

• 한국미생물·생명공학회지
• /
• 제14권2호
• /
• pp.161-168
• /
• 1986

E. coli-S. cerevisiae shuttle vector인 plasmid YRp7을 이용하여 B. amyloliquefaciens의 $\alpha$-amylase gene을 E. coli 내에 cloning하였다. 이때 제한 효소 Sau 3 AI에 의해 얻어진 $\alpha$-amylase gene의 크기는 약 1.95kb정도였으며 E. coli내에서 비교적 안정하게 유지되고 발현되었다. 재조합 plasmid p-EA24를 함유한 E. coli는 B. amyloliquefaciens의 약 65% 정도의 $\alpha$-amylase를 생성하였으며, 최적온도, pH, CaCl$_2$의 영향등 $\alpha$-amylase의 효소학적인 성질을 비교 조사해 본 결과 B. amyloliquefaciens의 $\alpha$-amylase와 동일하였다. 또한 E. coli에서 생성된 $\alpha$-amylase로 70% 정도가 periplasmic space에 존재하였으며 나머지는 세포 내부에 존재함을 알았다.

• 한국환경보건학회지
• /
• 제38권1호
• /
• pp.73-81
• /
• 2012

Objectives: With the goal of quantifying the risk of children contracting gastroenteritis while playing at interactive waterscape facilities and evaluating the adequacy of current water quality regulations, risk assessment was performed with Escherichia coli as pathogen. Methods: Abundances of E. coli in the waters of interactive water features in South Korea were acquired from survey reports. A gamma distribution describing the volume of water swallowed by children during swimming activities was adopted. Exposure rate and risk were calculated by Monte Carlo simulation and dose-response models for various pathogenic E. coli. Results: E. coli was detected in 25 out of 40 facilities, with range of ~1,600 CFU/100 ml. The abundance fitted an exponential distribution. Simulated exposures ranged ${\sim}1.9{\times}10^{10}$ CFU, varying greater along E. coli abundance than the volume of water. Risk of children being infected by enterohemorrhagic E. coli was high, with range of ~0.85. When E. coli abundance was <200 CFU/100 ml, which is the current government threshold, the risk decreased to <0.43. Although the guideline successfully reduced the risk of adults being infected by a less virulent E. coli strains (<0.03), the risk for children could not be quantified due to lack of dose-response models for those pathogens for children. Conclusions: Under the current guideline, children are at risk of being infected if water is contaminated with by enterohemorrhagic E. coli. For other E. coli strains, the risk appears to be considerably less. The result warrants need for developing dose-response models for children for each pathogenic E. coli strain.

• Clinical and Experimental Reproductive Medicine
• /
• 제49권1호
• /
• pp.33-39
• /
• 2022

Objective: Male genital tract infections have been associated with infertility, and Escherichia coli has drawn increasing attention as an important bacterium in this context. This investigation aimed to characterize and compare the distributions of O-antigen serogroups of E. coli in the semen samples of fertile and infertile men. Methods: In this case-control study, semen samples were collected from 618 fertile and 1,535 infertile men. The E. coli-positive samples were evaluated in terms of concentration, morphology, viability, and motility parameters according to the World Health Organization 2010 guidelines. Finally, different serogroups of E. coli were identified by multiplex polymerase chain reaction targeting the O-antigen variations of the bacterium. Results: The prevalence of E. coli among fertile men was significantly higher than among infertile men (p<0.001). The sperm morphology, viability, and motility in the E. coli-positive fertile group were significantly higher than in the E. coli-positive infertile group (p<0.001). E. coli O6 was the most prevalent serogroup found in both groups. However, there was no significant difference in the frequency of different serogroups of E. coil between the two groups (p=0.55). Conclusion: Despite the higher prevalence of E. coli among fertile men, E. coli had more detrimental effects on semen parameters in infertile men. There was no significant difference in E. coli serogroups between the fertile and infertile groups.

• Journal of Biosystems Engineering
• /
• 제28권2호
• /
• pp.167-172
• /
• 2003

This study was performed to fabricate a batch-type SPR biosensing system using a thiolated E. coli antibody coupling, and to explore the feasibility of real-time detection of E. coii in a stagnant sample solution. In advance. “O” and “K” antigenic serotype E. coli antibodies were thiolated with sulfo-LC-SPDP and dithiothreitol, and immobilized by chemisorption in the gold surface of compact SPR sensors. When the SPR biosensor immobilized with E. coli antibody monitored a E. coli solution, it took 3 to 5 min to stabilize. The SPR biosensing system developed in this study was able to detect E. coli in the range above 10$^4$ CFU/mL at the 0.05 significant level. Also, the SPR biosensor had possibility to significantly detect E. coli in the range of 10$^2$ to 10$^4$ CFU/mL in E. coli solutions. Meanwhile, when the SPR biosensor immobilized with 5. coli antibody was cleaned with NaOH solutions, its ability to detect E. coli largely decreased due to wash-out of the immobilized antibody. In order to reuse the SPR sensor, it should be antibody-immobilized newly.

• 한국생물공학회:학술대회논문집
• /
• 한국생물공학회 2000년도 추계학술발표대회 및 bio-venture fair
• /
• pp.672-675
• /
• 2000

E.coli ATCC 33456은 6가 크롬 환원능이 있다고 보고되어진 미생물보다 비교적 높은 활성을 지닌다. E.coli ATCC 33456에서 6가 크롬 환원효소를 클로닝하기 위해서 colony hybridization과 southern hybridization을 통하여 2개의 형질 전환 균주를 획득할 수 있었다. 두 균주 모두 E.coli ATCC 33456이 가진 6가 크롬 환원능보다 약 2.5-4배정도 높은 활성을 보였으며, 두 균주의 조효소액을 가지고 immuno-blotting을 실시한 결과, E.coli ATCC 33456에서 분리 정제된 6가 크롬 환원효소의 항체가 약 42Kda에서 반응하는 것을 확인할 수 있었으며, 이 결과는 분리 정제된 6가 크롬 환원효소와 매우 유사한 유전자 산물이 두 균주에서 나온다는 것을 보여주었다.

• 한국축산식품학회지
• /
• 제36권2호
• /
• pp.186-193
• /
• 2016

This study aimed to inhibit Escherichia coli (E. coli) O157:H7 artificially contaminated in fresh meat using bacteriophage. Among 14 bacteriophages, the highly lytic bacteriophage BPECO19 strain was selected to inhibit E. coli O157:H7 in artificially contaminated meat samples. Bacteriophage BPECO19 significantly reduced E. coli O157:H7 bacterial load in vitro in a multiplicity of infection (MOI)-dependent manner. E. coli O157:H7 was completely inhibited only in 10 min in vitro by the treatment of 10,000 MOI BPECO19. The treatment of BPECO19 at 100,000 MOI completely reduced 5 Log CFU/cm² E. coli O157:H7 bacterial load in beef and pork at 4 and 8h, respectively. In chicken meat, a 4.65 log reduction of E. coli O157:H7 was observed at 4 h by 100,000 MOI. The treatment of single bacteriophage BPECO19 was an effective method to control E. coli O157:H7 in meat samples.

• 한국식품영양과학회지
• /
• 제24권2호
• /
• pp.280-285
• /
• 1995

To develop natural food preservatives, antimicrobial effect of the ethanol extract of leaf mustard against E. coli and S. aureus were examined in terms of compositions and leakage of cellular materials in the microorganisms treated with the extract. No effect of the concentration of ethanol extract on the fatty acid composition of E. coli and S. aureus at logarithmic phase was showen, but the content of palmitic and palmitoleic acid of E. coli slightly increased and decreased, respectively, and the content of palmitic and margaric acid of S. aureus slightly increased, when compared to each control. Ethanol extract did not affect most of the amino acids E. coli and S. aureus at logarithmic phase ; however, some of them(proline, glycine, valine and histidine of E. coli and proline, methionine and histidine of s. aureus) were elevated and some other amino acid(aspartic acid, glutamic acid, tyrosine and arginine of E. coli and aspartic acid, glutamic acid, glycine, alanine and lysine of Staph. aureus) found to be decreased. The amount of cell body protein leaked from E. coli and S. aureus increased to 1.02 and 0.22mg/g cell weight, respectively, as compared to controls. Similarly, the substances with absorbance at 260 nm from E. coli and s. aureus increased to 0.12 and 0.06mg/g cell weight, respectively.