Saccharomyces cerevisiae의 class I 키틴생합성 효소인 Chsl의 활성측정법을 적용하여 Aspergillus nidulans의 영양균사에서 class I 키틴생합성 효소인 ChsC의 활성측정을 시도하였다. 그 결과, A. nidulans의 class I 키틴생합성효소도 효모류의 경우와 마찬가지로 트립신 처리에 의하여 활성화되는 효소전구체형태(zymogenic form)로 존재함을 알 수 있었다. 그리고 A. nidulans 야생형의 class I 키틴 생합성 효소활성은 트립신 처리에 의하여 6배 가량 증가되었다. 반면, chsC 유전자가 파괴된 돌연변이주는 트립신 처리에 의하여 효소활성이 증가되지 아니하였을 뿐만 아니라, 효소활성의 수준도 트립신을 처리하지 아니한 야생형의 class I 키틴생합성 효소활성과 거의 동일한 수준이었다. 따라서, 트립신을 처리하여 측정한A. nidulans 야생형의 class I 키틴생합성 효소활성 값에서 트립신을 처리하지 아니한 야생형의 class I 키틴생합성 효소활성을 제외한 값이 A. nidulans 야생형의 ChsC 효소활성임을 알았다. 이러한 조건을 토대로 영양균사 생장과정 동안 ChsC의 효소활성을 측정한 결과, chsC 유전자의 발현양상과 유사하게 액체배양상태의 영양균사가 무성분화능을 획득하는 시기로 알려진 시간대에 효소의 활성이 증가하였다. 이러한 결과는 이미 보고된 바와 같이 chs 유전자가 A. nidulans의 영양균사 생장에 관여함을 시사하고 있다.
Penicillium diversum KCTC 6786으로부터 두개의 chitin synthase 유전자 절편(PdCHSl과 PdCHS2)을 PCR로 증폭하고 cloning하였다. PdCHSl과 PdCHS2는 primer 서열을 제외하면 각각 570 bp 길이의 연속된 open reading frame (ORF)을 포함하고 있었다. BLASTP를 이용하여 유추된 아미노산 서열의 유사도를 분석한 결과, P. diversum은 자낭균류와 상당한 진화적 유연관계가 있음을 알 수 있었다. 이들 아미노산 서열을 CLASTAL W를 이용하여 분석한 결과, 본 실험에서 분리된 두 유전자 절편은 Bowen 등 (1992)이 제시한 몇 부류 중 서로 다른 부류, 즉, PdCHSl은 Class I에, PdCHS2는 Class II에 각각 속하는 것으로 확인되었다. 또한, Southern blot 분석을 통하여, 각 유전자는 P. diversum KCTC 6786의 genome에 1개씩만 존재함을 알 수 있었다.
We cloned seven genes encoding chitin synthases (CHSs) by PCR amplification from genomic DNAs of four strains of the genus Sporobolomyces and of Bensingtonia subrosea using degenerated primers based on conserved regions of the CHS genes. Though amino acid sequences of these genes were shown similar as 176 to 189 amino acids except SgCHS2, DNA sequences were different in size, which was due to various introns present in seven fragments. Alignment and phylogenetic analysis of their deduced amino acid sequences together with the reported CHS genes of basidiomycetes separated the sequences into classes I, II and III. This analysis also permitted the classification of isolated CHSs; SgCHS1 belongs to class I, BsCHS1, SaCHS1, SgCHS2, SpgCHS1, and SsCHS1 belong to class II, and BsCHS2 belongs to class III. The deduced amino acid sequences involving in class II that were discovered from five strains were also compared with those of other basidiomycetes by CLUSTAL X program. The bootstrap analysis and phylogenetic tree by neighbor-joining method revealed the taxonomic and evolutionary position for four strains of the genus Sporobolomyces and for Bensingtonia subrosea which agreed with the previous classification. The results clearly showed that CHS fragments could be used as a valuable key for the molecular taxonomic and phylogenetic studies of basidiomycetes.
Kim, Junseong;Choi, Youn Kyung;Lee, Ji-Hyeok;Kim, Seo-Young;Kim, Hyun-Soo;Jeon, You-Jin;Heo, Soo-Jin
한국키틴키토산학회지
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제22권3호
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pp.185-193
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2017
Red tide Heterosigma akashiwo (H. akashiwo), a microscopic alga of the class Raphidophyceae, causes extensive damage to all marine ecosystems. It is essential to reduce the damage to marine ecosystems for them to be used as a resource. In this study, we used organic solvent fractionation to obtain an ethyl acetate-methanol extract from H. akashiwo (HAEM80) and then evaluated its anti-inflammatory activity in lipopolysaccharide (LPS)-stimulated RAW 264.7 cells and a zebrafish model. HAME80 markedly inhibited the production of nitric oxide (NO) and prostaglandin $E_2$ ($PGE_2$). It also down-regulated the protein expression of inducible nitric oxide synthase (iNOS) and cyclooxygenase-2 (COX-2) and decreased the secretion of interleukin-$1{\beta}$ ($IL-1{\beta}$) in LPS-stimulated RAW 264.7 cells. HAME80 reduced yolk edema and improved the survival rate of LPS-stimulated zebrafish embryos; in addition, the extract significantly reduced the production of ROS and NO and attenuated cell death in this model. Gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) of the extract was used to confirm the identity of peaks 1-20. Taken together, our data suggest that H. akashiwo is a beneficial anti-inflammatory agent.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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