• 제목/요약/키워드: chloroplast genotypes

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Characterization of a Novel Necrotic Response of Glycine max Line 'PI96188' to Xanthomonas axonopodis pv. glycines

  • Han, Sang-Wook;Choi, Min-Seon;Lee, Suk-Ha;Hwang, Duk-Ju;Hwang, Byung-Kook;Heu, Sung-Gi
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제23권3호
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    • pp.193-202
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    • 2007
  • Typical susceptible symptoms of the bacterial pustule disease caused by Xanthomonas axonopodis pv. glycines are pustule and chlorotic haloes that usually occur in leaves of Glycine max plants. The soybean genotype 'PI96188' showed an atypical response to all tested races X. axonopodis pv. glycines, accompanied with necrosis without chlorotic haloes on the underside of the necrotic symptoms. X. axonopodis pv. glycines 8ra grew to levels from 10 to 100 fold lower on PI96188 than on susceptible cultivar Jinjoo1, but 10-fold higher than on the resistant cultivar CNS. The chlorophyll content in PI96188 leaves remained unchanged until 12 days after bacterial infection. Ultrastructural observation showed that the infected leaf cells of PI96188 had intact normal chloroplasts compared to those of the susceptible cultivar Jinjoo1. Chloroplast degradation or the absence of chloroplasts in cells of the infected tissues was observed in Jinjoo1. Senescence-related ACS7 gene was significantly induced in PI96188 compared to those in Jinjoo1 at 2 days after inoculation. While photosynthesis-related rbcS gene showed the dramatic change in Jinjoo1, this gene was constitutively expressed in PI96188. However, expression of the defense-related genes, such as peroxidase and isoflavone synthase in the infected PI96188 leaves was similar to that in Jinjoo1. Together, these results suggest that the novel necrotic symptom in PI96188 is a kind of resistant response different from a typical hypersensitive response in the resistant genotypes.

안면도 소나무 채종원 교배양식 추정모수의 연간비교 (Two-Year Estimates of Mating System in Seed Orchard of Pinus densiflora Revealed by cpSSR and nSSR Markers)

  • 김영미;홍용표;박재인
    • 한국산림과학회지
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    • 제104권4호
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    • pp.578-587
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    • 2015
  • 교배양식 유전모수를 확인하기 위하여 nuclear SSR (nSSR) 표지와 chloroplast SSR (cpSSR) 표지를 이용하여 2006년과 2007년에 안면도 소나무 채종원(77년 조성)에서 생산된 종자를 대상으로 타가교배율과 화분오염율, 근친교배율을 확인하였다. cpSSR 유전형에 근거한 타가교배율은 2006년에 94.9~100%(평균 98.9%)이며, 2007년에는 91.2~100%(평균 97.7%)이다. nSSR 유전자형에 근거한 타가교배율은 2006년에 90.3~100%(평균 95.9%), 2007년에 81.6~100%(평균 95.3%)의 타가교배율이 산출되었다. 두 표지를 동시에 비교하여 확인한 결과 2006년 생산종자의 평균 누적 타가교배율 100%, 2007년 생산종자의 평균 누적 타가교배율은 98.9%로 추정되었다. 근친교배율($t_m-t_s$: biparental inbreeding)은 2006년에 -0.006과 2007년에 0.007으로 추정되었다. 평균 화분오염율은 2006년에 평균 48.9%, 2007년에 평균 42.4%이며, 종자의 cpSSR 유전형을 근거로 확인한 화분친 기여율(기여화분친 수)은 2006년에 0.458(평균 16.2개), 2007년에 0.512(평균 14.8개)로 확인되었다. 결론적으로, 2006년, 2007년 안면도 소나무 채종원(77년 조성) 내 클론간 높은 타가교배율이 확인됨으로써 채종원산 종자의 유전적 품질은 자가교배로 인한 근교약세가 원인이 되는 불량형질이 발생할 가능성이 낮을 것으로 기대된다. 안면도 소나무 채종원(77년 조성) 내 교배양식 연간 분석을 통해서 확인된 결과가 향후 진전세대 채종원 조성 및 관리에 유용한 정보를 제공할 것으로 기대된다.

참다래 유전체 연구 동향 (Current status and prospects of kiwifruit (Actinidia chinensis) genomics)

  • 김성철;김호방;좌재호;송관정
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제42권4호
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    • pp.342-349
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    • 2015
  • 키위는 세계적으로 1970년대 이후 상업화되어 최근 재배가 급속히 확대되고 있는 신종 과수이며, 국내에서도 재배와 소비량이 급격히 증가하고 있다. 키위는 자웅이주 낙엽성 덩굴 식물로 과피에 털이 있고 과육색이 다양한 특성을 가지고 있으며 배수성도 다양하나, 산업적인 품종 구성은 매우 단순하다. 독특한 식물적 특성에 기인한 진화 및 생물학적 관점은 물론 다양한 품종의 효율적 개발의 요구에 따라 최근 유전체 해석 및 활용 연구가 활발히 진행되고 있다. 키위 유전체 draft 서열과 엽록체 서열이 Illumina HiSeq 기반으로 각각 2013년과 2015년에 해독 되었으며 gene annotation 연구가 계속적으로 진행되고 있다. 과거 ESTs 기반의 전사체 분석에서 최근 RNA-seq 기반의 전사체 분석으로 전환되어 과일의 아스코르브산 생합성, 과육색 발현 및 성숙, 그리고 나무의 궤양병 저항성 관련 유전적 발현조절과 유전자 발굴 연구가 중점적으로 진행되고 있다. 전통육종의 효율을 증대하기 위한 분자표지 개발 및 유전자지도 작성에 있어서는 이전의 RFLP, RAPD, AFLP 기반의 연구에서 벗어나 NGS 기반의 유전체 및 전사체 정보의 해독에 의한 SSR 및 SNP 기반의 농업적으로 중요한 형질연관 분자마커 개발 및 고밀도 유전자지도 작성이 연구되고 있다. 그러나 국내 연구는 아직 제한적인 수준에서 진행되고 있다. 향후 키위 유전체 및 전사체 분석 연구는 가까운 장래에 실질적으로 분자육종에 적용될 것으로 전망된다.