Alsaker, Keith V.;Paredes, Carlos J.;Papoutsakis, Eleftherios T.
Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
/
v.10
no.5
/
pp.432-443
/
2005
Microarray technology has contributed Significantly to the understanding of bacterial genetics and transcriptional regulation. One neglected aspect of this technology has been optimization of microarray-generated signals and quality of generated information. Full genome microarrays were developed for Clostridium acetobutylicum through spotting of PCR products that were designed with minimal homology with all other genes within the genome. Using statistical analyses it is demonstrated that Signal quality is significantly improved by increasing the hybridization volume. possibly increasing the effective number of transcripts available to bind to a given spot, while changes in labeled probe amounts were found to be less sensitive to improving signal quality. In addition to Q-RT-PCR, array validation was tested by examining the transcriptional program of a mutant (M5) strain lacking the pSOL1 178-gene megaplasmid relative to the wildtype (WT) strain. Under optimal conditions, it is demonstrated that the fraction of false positive genes is 1% when considering differentially expressed genes and 7% when considering all genes with signal above background. To enhance genomic-scale understanding of organismal physiology, using data from these microarrays we estimated that $40{\sim}55%$ of the C. acetobutylicum genome is expressed at any time during batch culture, similar to estimates made for Bacillus subtilis.
Lee, Jin Young;Seo, Seok Jun;Kim, Dae-Woong;Hur, Min;Lee, Jae-Ok;Kang, Woo Seok
Journal of the Semiconductor & Display Technology
/
v.18
no.1
/
pp.5-9
/
2019
Optical emission spectroscopy is used to identify chemical species and monitor the changes of process results during the plasma process. However, plasma process monitoring or fault detection by using emission signal variation monitoring is vulnerable to background signal fluctuations. IR heaters are used in semiconductor manufacturing chambers where high temperature uniformity and fast response are required. During the process, the IR lamp output fluctuates to maintain a stable process temperature. This IR signal fluctuation reacts as a background signal fluctuation to the spectrometer. In this research, we evaluate the effect of infrared background signal fluctuation on plasma process monitoring and improve the plasma process monitoring accuracy by using simple infrared background signal subtraction method. The effect of infrared background signal fluctuation on plasma process monitoring was evaluated on $SiO_2$ PECVD process. Comparing the $SiO_2$ film thickness and the measured emission line intensity from the by-product molecules, the effect of infrared background signal on plasma process monitoring and the necessity of background signal subtraction method were confirmed.
Captive breeding and reintroduction are crucial strategies for conserving endangered species populations. However, fish raised in predator-free environments, show a lack of recognition of predationrelated stimuli such as chemical and visual signals. It is critical to recognize chemical signals from injured conspecifics, also known as alarm signals, and the order or shape of predators to indicate the spread of predation risk in the habitat. We conducted a laboratory experiment to determine and adjust the optimal exposure period to induce appropriate anti-predator behavior response to different types of stimuli (Chemical, Visual and Chemical+Visual) for the endangered species Microphysogobio rapidus. Our results demonstrate that predator avoidance behavior varies depending on the types of stimuli and the duration of predation risk exposure. First, the results showed captive-breed M. rapidus show lack of response against conspecific alarm signal (Chemical cue) before the predation risk exposure period and tend to increase response over predation risk exposure time. Second, response to predator (visual cue) tend to peak at 48 hours cumulative exposure, but show dramatic decrease after 72 hours cumulative exposure. Finally, response to the mixed cue (Chemical+visual) tend to peak prior to the predation risk exposure period and show reduced response during subsequent exposure periods. This experiment confirms the lack of responsiveness to conspecific alarm signals in captive-bred M. rapidus and the need for an optimal nature behavior enhancement program prior to release of endangered species. Furthermore, responsiveness to predator visual signal peak at 48 hours cumulative exposure, suggest an optimal predation risk exposure period of up to 48 hours.
A study was carried out to investigate the nutritive value and utilization of three grass species, batiki grass (lschaemum aristatum var. indicum), guinea grass (Panicum maximum) and signal grass (Bracharia decumbens) by growing goats. Eighteen growing crossbred goats $(Anglo-Nubian{\times}Fiji\;local)$ of between 9-11 months of age and pre-trial average live weight of $9.50{\pm}1.60kg$ were divided on the basis of weight to three treatment groups in a completely randomized design. The grasses constituted the diets and they were harvested fresh and chopped into pieces before they were offered to the goats. Chemical composition of the grasses, DMI, body weight gain (BWG) and apparent nutrient digestibility coefficients were measured. The grasses had similar DM content. The CP content of the grasses was in the range of 8.3-11.2%. Crude fiber (CF) content was between 30.9-35.2%. Ether extract (EE) was low with a range of 1.2-1.8%. Nitrogen free extract (NFE) was similar (40.9%) for batiki and guinea grasses, while signal grass had more NFE content (51.1%). The grasses are good sources of minerals (ash). OM content was higher in signal grass while guinea and batiki grasses had similar OM content. The goats on signal grass had higher DMI than those on batiki and guinea grasses (p<0.05). The goats on batiki grass had lower average BWG (p<0.05) than those on guinea and signal grasses. Nutrients digestibility were significantly (p<0.05) higher in the goats on signal grass compared to those on guinea and batiki grasses. The goats on guinea grass were better (p<0.05) in the digestibility of CP, OM, NFE and ME than those on batiki grass. However, goats on batiki were significantly better (p<0.05) in digestibility of CF than those on guinea grass. Signal and guinea grasses had more DCP than batiki grass. DE was lower in batiki grass (p<0.05) than in guinea and signal grasses. There was no significant difference (p>0.05) between batiki and guinea grasses in TON. Data obtained in this experiment demonstrated that signal grass is better than guinea and signal in the nutrition of growing goats in the tropical environment of Samoa. It had the highest nutritive value, better apparent digestibility coefficients which have better growth rate and feed efficiency. In ranking, signal grass was better than guinea and batiki grasses, while guinea grass was better than batiki in nutritive value in the parameters measured. For future pasture establishment in Samoa, signal grass is recommended for consideration because of its higher nutritive value as a replacement for batiki, the most predominant grass.
Developed fiber-optic biosensor for the detection of organophosphorus compounds in a contaminated water needs the analysis of an enzyme kinetics and the transport phenomena in the reaction part to analyze the sensor signal and to design the sensor. The enzyme inhibition kinetics was investigated and the reactor model was proposed to design the reaction part in the proposed sensor. Since the acetylcholinesterase was inhibited by the organophosphorus compounds, experiments for enzyme inhibition reaction were performed from 0 to 2 ppm to be detected by the developed sensor, and irreversible enzyme inhibition kinetics was proposed. The reactor parts were divided into the two phases, i.e. bulk phase and immobilized enzyme layer, to analyze the flow and diffusion. Sensor signal was able to be analyzed based on the total reactor model established by linking the enzyme reaction kinetics. Based on the proposed model, the effects of loading enzyme amount and enzyme layer thickness on the magnitude of readout signal were simulated.
Kim, Young-Kee;Min, Jun-Hong;Oh, Byung-Keun;Choi, Jeong-Woo
KSBB Journal
/
v.22
no.6
/
pp.378-386
/
2007
Bio-sensing devices, which are basically integrated and miniaturized assay systems consisted of bioreceptor and signal transducer, are advantageous in several ways. In addition to their high sensitivity, selectivity, simplicity, multi-detection capability, and real time detection abilities, they are both very small and require relatively inexpensive equipments. Two core technologies are required to develop bio-sensing devices; the fabrication of biological receptor module (both of receptor development and immobilisation of them) and the development of signal transducing instruments containing signal generation technique. Various biological receptors, such as enzymes, DNA/RNA, protein, and cell were tried to develop bio-sensing devices. And, the signal transducing instruments have also been extensively studied, especially with regard to electrochemical, optical, and mass sensitive transducers. This article addresses bio-sensing devices that have been developed in the past few years, and also discusses possible future major trends in these devices.
The immunosuppressive effects of thirty nine chemicals chosen by their potential toxicity were evaluated using a three-step testing method. The immunotoxicity test method developed in this study consisted of three simple assays of lymphoproliferation, mixed leukocyte response, and interleukin (IL)-2 production. The first step was mitogen-induced proliferation assay. Ten chemicals showed the inhibitory effects on the mitogen (lipopolysaccharide or concanavalin A)-induced proliferation in dose-dependent manners. The second step was mixed lymphocyte response. This step crosschecked the growth-suppressive effects detected at the first step. All of 10 chemicals, which showed suppression of lymphoproliferation, also exhibited the suppressive effects on the mixed lymphocyte response in the similar range of chemical concentration. The third step was planned to determine whether or not this growth suppression was mediated through an early activation of T-cell, which could be represented with IL-2 production. Six out of 10 chemicals decreased the interleukin-2 production in the similar concentration range used in the step 1 and 2. These results suggest that those 6 chemicals might have their targets on the signal transduction path-way toward the IL-2 production. In the meantime the other 4 chemicals might have their targets after the IL-2 production signal. Taken all together, the three-step test would be simple, fast, and efficient to deter-mine whether or not the chemical has immunosuppressive effects.
Effects of acids and pre-reductants in the analysis of arsenic have been studied by hydride generation-atomic absorption spectrometry. The analytical results were strongly dependent on the acid concentrations. All the pre-reductants was very effective to observe the arsenic signal at strong acid concentrations (3 M-5 M). However, at the low acid condition (${\leq}0.1M$), L-cysteine only showed a reasonable effect on the absorption signal. When the sample was treated with the nitric acid, absorption signal was unstable and was also decreased. Although interference effects were observed from metal ions such as $Cr^{6+}$ and $Br^{5+}$ at low acid condition, the generation of hydride could be increased by the strong acid condition.
Park, Sangeon;Shim, Jeong Hyun;Kim, Kiwoong;Jeong, Keunhong;Song, Nam Woong
Journal of the Korean Magnetic Resonance Society
/
v.24
no.2
/
pp.53-58
/
2020
Free radicals including reactive oxygen species (ROS) are important chemicals in the research area of biology, pharmaceutical, medical, and environmental science as well as human health risk assessment as they are highly involved in diverse metabolism and toxicity mechanisms through chemical reactions with various components of living bodies. Electron spin resonance (ESR) spectroscopy is a powerful tool for detecting and quantifying those radicals in biological environments. In this work we observed the ESR signal of 2,2,6,6-Tetra-methyl piperidine 1-oxyl (TEMPO) in aqueous solution at various concentrations to estimate the uncertainty factors arising from the experimental conditions and signal treatment methods. As the sample position highly influences the signal intensity, dual ESR tube geometry (consists of a detachable sample tube and a position fixed external tube) was adopted. This type of measurement geometry allowed to get the relative uncertainty of signal intensity lower than 1% when triple measurements are averaged. Linear dependence of signal intensity on the TEMPO concentration, which is required for the quantification of unknown sample, could be obtained over a concentration range of ~103 by optimizing the signal treatment method depending on the concentration range.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.