• 제목/요약/키워드: chemical graph

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화학 데이타베이스에서 부분구조 검색을 위한 인덱스 구조 (An Index Structure for Substructure Searching In Chemical Databases)

  • 이환구;차재혁
    • 한국정보과학회논문지:데이타베이스
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    • 제31권6호
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    • pp.641-649
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    • 2004
  • 약물의 화학적 구조와 그 약물의 약리작용간의 연관성은, 'Medicinal Chemistry' 분야에서 활발히 연구된다. 이는 화학구조를 기반으로 하여 신약을 설계하려는 시도로서, 약학자는 신약 개발 시 만들고자 하는 약물과 비슷한 화학구조를 가지고 있는 기존 약물들에는 어떠한 것들이 있는지 조사하며, 특정 화학구조가 어떤 약물들에서 나타나는지 신속히 검색하기를 원한다. 이처럼 어떤 화차구조에서, 특정한 부분구조가 존재하는지를 검사하는 것을 부분구조검색(Substructure Searching)이라 하며, 이는 그래프 이론에서 NP-complete인 동형성 판정(Subgraph Isomorphism) 문제로 귀결된다. 검색 시간을 단축시키고자 여러 다른 전근방법들이 연구되었는데, 1990년대에는 구조에 대한 인덱스를 미리 만들어 RDBMS에 저장한 후, 검색시 이론 이용하여 성능을 높이는 방법으로 미국 특허를 획득한 RS3 시스템(http://www.acelrys.com/rs3)이 현재 상용화되어 쓰이고 있다. 본 논문에서는 RS3 시스템의 문제점을 규명하고, 이의 개선방안으로서 새로운 인덱스를 제안한다 RS3 시스템은 각 원자를 중심으로 다른 원자와의 구조를 문자연로 표현하고, 부분구조검색 쿼리를 부분문자열 검색을 실행함으로써 수행하는데, 이의 화학구조를 기술하는 인덱스에는 동일 원자, 동릴 결합에 대한 정렬이 불가능하여 재현율(Recall)과 정도(Precision)가 낮다. 이론 개선하기 위하여 본 논문에서는 2차원의 화학구조를 나누어 1차원의 구조 단편으로 만들고 이를 문자열로 기술하는 방안을 제시하며 구체적인 방법으로 한 인자를 중심으로 최소비용신장트리를 구성한 다음 레벨별로 경로를 나누어 기술하는 방안을 제안하며, 이와 같은 방법의 새로운 인덱스로 재현율과 정도가 급격히 향상됨을 보인다.

Process fault diagnostics using the integrated graph model

  • Yoon, Yeo-Hong;Nam, Dong-Soo;Jeong, Chang-Wook;Yoon, En-Sup
    • 제어로봇시스템학회:학술대회논문집
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    • 제어로봇시스템학회 1991년도 한국자동제어학술회의논문집(국제학술편); KOEX, Seoul; 22-24 Oct. 1991
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    • pp.1705-1711
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    • 1991
  • On-line fault detection and diagnosis has an increasing interest in a chemical process industry, especially for a process control and automation. The chemical process needs an intelligent operation-aided workstation which can do such tasks as process monitoring, fault detection, fault diagnosis and action guidance in semiautomatic mode. These tasks can increase the performance of a process operation and give merits in economics, safety and reliability. Aiming these tasks, series of researches have been done in our lab. Main results from these researches are building appropriate knowledge representation models and a diagnosis mechanism for fault detection and diagnosis in a chemical process. The knowledge representation schemes developed in our previous research, the symptom tree model and the fault-consequence digraph, showed the effectiveness and the usefulness in a real-time application, of the process diagnosis, especially in large and complex plants. However in our previous approach, the diagnosis speed is its demerit in spite of its merits of high resolution, mainly due to using two knowledge models complementarily. In our current study, new knowledge representation scheme is developed which integrates the previous two knowledge models, the symptom tree and the fault-consequence digraph, into one. This new model is constructed using a material balance, energy balance, momentum balance and equipment constraints. Controller related constraints are included in this new model, which possesses merits of the two previous models. This new integrated model will be tested and verified by the real-time application in a BTX process or a crude unit process. The reliability and flexibility will be greatly enhanced compared to the previous model in spite of the low diagnosis speed. Nexpert Object for the expert system shell and SUN4 workstation for the hardware platform are used. TCP/IP for a communication protocol and interfacing to a dynamic simulator, SPEEDUP, for a dynamic data generation are being studied.

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An application of wave equation analysis program to pile dynamic formulae

  • Tokhi, H.;Ren, G.;Li, J.
    • Geomechanics and Engineering
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    • 제9권3호
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    • pp.345-360
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    • 2015
  • Wave equation analysis programs (WEAP) such as GRLWEAP and TNOWave were primarily developed for pre-driving analysis. They can also be used for post-driving measurement applications with some refinements. In the case of pre-driving analysis, the programs are used for the purpose of selecting the right equipment for a given ground condition and controlling stresses during pile driving processes. Recently, the program is increasingly used for the post-driving measurement application, where an assessment based on a variety of input parameters such as hammer, driving system and dynamic behaviour of soil is carried out. The process of this type of analysis is quite simple and it is performed by matching accurately known parameters, such as from CAPWAP analysis, to the parameters used in GRLWEAP analysis. The parameters that are refined in the typical analysis are pile stresses, hammer energy, capacity, damping and quakes. Matching of these known quantities by adjusting hammer, cushion and soil parameters in the wave equation program results in blow counts or sets and stresses for other hammer energies and capacities and cushion configuration. The result of this analysis is output on a Bearing Graph that establishes a relationship between ultimate capacity and net set per blow. A further application of this refinement method can be applied to the assessment of dynamic formulae, which are extensively used in pile capacity calculation during pile driving process. In this paper, WEAP analysis is carried out to establish the relationship between the ultimate capacities and sets using the various parameters and using this relationship to recalibrate the dynamic formula. The results of this analysis presented show that some of the shortcoming of the dynamic formula can be overcome and the results can be improved by the introduction of a correction factor.

폐 FRP 선박에서 분리하여 얻은 F섬유의 염기성 용액에서의 강도저하 (Strength toss of F-Fiber Obtained from Recycling FRP Ship in a Basic Solution)

  • 이승희;김용섭;윤구영
    • 한국해양환경ㆍ에너지학회지
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    • 제11권1호
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    • pp.42-45
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    • 2008
  • FRP 선박에서 발생하는 폐FRP를 처리하는 방법으로 분쇄하지 않고 판상으로 박리(剝離)하는 것을 제시한 바 있다. 폐 FRP에서 분리한 층상의 로빙층으로부터 얻은 F섬유는 FRP제조시 사용하였던 수지를 포함하여 원 유리섬유에 비해 그 인장강도가 우수하다(90% 이상). F섬유의 SEM 이미지로 많은 수지의 존재를 확인하였다. F섬유의 활용성을 건축자재에서의 대체물로 가정하고 염기성 용액(NaOH+KOH)에서의 강도를 측정하였다. 이 때 일어날 수 있는 반응 메카니즘은 유리섬유의 Si-O-Si결합 조직을 수산기 이온($OH^-$)이 공격하는 것으로 보았다. 측정된 인장강도 변화에 대해 $r^2$=96%로 맞추어 얻은 시뮬레이션 그래프로 반응 메카니즘을 추정할 수 있었다. 반응 초기에는 속도적인 반응에 의해 급격한 강도저하를 보이나 30일 이후에는 수산기 이온의 확산에 의존하는 패턴으로 강도가 저하되었다. 이는 앞서 보고된 AR유리에 대한 강도저하와 유사한 결과이며, 그래프를 외연하여 F섬유의 수명을 예측할 수 있다.

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폴리피롤 막으로 변성시킨 유리질 탄소 및 백금 전극에서 Cr(Ⅵ) 이온의 정량 (Determination of Cr(Ⅵ) by Glassy Carbon and Platinum Electrodes Modified With Polypyrrole Film)

  • 유광식;우상범;정지영
    • 대한화학회지
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    • 제43권4호
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    • pp.407-411
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    • 1999
  • 본 연구에서는 유리질 탄소전극과 백금 전극의 표면에 폴리피롤 막을 도포 시킨 PPy/GC 및 PPy/Pt 변성전극을 제조하고, 이들 변성 전극들을 작업전극으로 구성한 3-전극 장치를 이용하여 Cr(VI)의 정량분석을 시도하였다. 변성전극들은 +1.0V∼-1.0V를 50 mV/sec로 전위를 걸어주어 순환 전압 전류법으로 쉽게 제조할 수 있었으며, 26회 반복 주사함으로써 연구에 필요한 막의 두께를 조절하였다. PPy/GC 변성전극에서 Cr(VI)의 환원 반응은 +0.6V∼-0.5V(vs. Ag/AgCl)까지 넓은 범위에서 환원되는 경향을 보였으며,-0.25V(vs.Ag/AgCl)의 전위에서 최대 환원 봉우리를 가짐을 알 수 있었다. 이 전위에서 검량곡선을 조사한 결과, 0.1 ppm에서 60.0 ppm의 농도범위에서 기울기가 1.75 mA/ppm이고, 상관계수가 0.998인 좋은 직선관계를 가졌다. PPy/Pt 변성전극에서도 Cr(VI)의 환원 거동은 PPy/GC 변성전극과 유사하였으며, 검량곡선은 1.0 ppm∼60.0ppm의 농도범위에서 직선관계를 가졌다. 이때의 기울기와 상관계수는 각각 0.5 mA/ppm 및 0.923이었다. 그러나 선택성은 PPy/GC 변성전극이 약 3 배정도 우수하였다. PPy/GC 변성전극에서 Cu(II), As(III), pb(II) 및 Cd(II)등은 환원 경향을 보이지 않았으므로, Cr(VI)의 정량분석에는 방해하지 않았다.

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HMX의 양에 따른 최대압력 및 폭풍파속도 분석 (Maximum Pressure and the Blast Wave Analysis of a Amount of HMX)

  • 권휘웅;탁경재;김정환;오민;채주승;김현수;문일
    • Korean Chemical Engineering Research
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    • 제52권6호
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    • pp.706-712
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    • 2014
  • 폭약은 높은 에너지를 포함하는 반응성 물질이며 폭발이 발생할 경우 강한 빛, 높은 열, 소음 및 고압을 발생시킨다. 폭발 지점 주변의 손상은 대부분 높은 과압과 폭풍파에 영향을 받는다. 따라서 폭발에 의한 압력 및 폭풍파의 분석이 매우 중요하다. 본 연구에서는 HMX와 같은 고폭화약의 최대 과압 및 폭풍파 속도를 분석하였다. 먼저 HMX 폭발에 관하여 4가지 경우를 선정하고 폭발현상을 모델링하였으며 HMX의 양에 따른 폭발시뮬레이션을 통하여 최대 과압 및 폭풍파 속도를 도출하였다. 또한, 폭발이 Geometry 중심에서 일어난다고 가정하고 계산된 과압과 폭풍파 속도로부터 폭심에서 인접해 있는 위치의 영향을 분석하였다. 대조군으로 이용된 TNT도 함께 시뮬레이션 및 분석하였으며 HMX 시뮬레이션 결과와 비교함으로써 HMX의 상대적인 과압 및 폭풍파속도를 확인하였다. 본 연구는 HMX가 포함된 복합화약이 폭발하였을 경우 최대 과압 및 폭풍파속도 산정 시 기초데이터로 활용할 수 있다.

The Investigation of a Novel Indicator System for Trace Determination and Speciation of Selenium in Natural Water Samples by Kinetic Spectrophotometric Detection

  • Gurkan, Ramazan;Ulusoy, Halil Ibrahim
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제31권7호
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    • pp.1907-1914
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    • 2010
  • A novel catalytic kinetic method is proposed for the determination of Se(IV), Se(VI) and total inorganic selenium in water based on the catalytic effect of Se(IV) on the reduction of bromate by p-nitrophenylhydrazine at pH 3.0. The generated bromine, $Br_2$ or $Cl_2$ plus $Br_2$ in 0.1 M NaCl (or NaBr) environment efficiently decolorized Calmagite and the reaction was monitored spectrophotometrically at 523 nm as a function of time. In this indicator reaction, bromide acted as an activator for the catalysis of selenium (IV) and a reducing agent for selenium (VI) at pH 3.0, which allowed the determination of total selenium. The fixed time method was adopted for the determination and speciation of inorganic selenium. Under the optimum conditions, the calibration graph are linear in the range 1 - 35 ${\mu}gL^{-1}$ of Se(IV) for the fixed time method at $25^{\circ}C$. The detection limit based on statistical $3S_{blank}$/m-criterion was 0.215 ${\mu}gL^{-1}$ for the fixed time method (7 min). All of the variables that affect the sensitivity at 523 nm were investigated, and the optimum conditions were established. The interference effect of various cations and anions on the Se (IV) determination was also studied. The selectivity of the selenium determination was greatly improved with the use of the strongly cation exchange resin such as Amberlite IR120 plus. The proposed kinetic method was validated statistically and through recovery studies in natural water samples. The RSDs for ten replicate measurements of 5, 15 and 25 ${\mu}gL^{-1}$ of Se(IV) and Se(VI) was changed between 2.1 - 4.85%. Analyses of a certified standard reference material (NIST SRM 1643e) for selenium using the fixed-time method showed that the proposed kinetic method has good accuracy. Se(IV), Se(VI) and total inorganic selenium in environmental water samples have been successfully determined by this method after selective reduction of Se(VI) to Se(IV).

Application of Polyurethane Foam Loaded with a Schiff Base Ligand for Determination of Trace Amounts of Copper in Water Samples by Flame Atomic Absorption Spectroscopy

  • Moftakhar, Mahdieh Koorehpazan;Yaftian, Mohammad Reza;Nahaei, Samaneh;Zamani, Abbas Ali
    • 대한화학회지
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    • 제58권3호
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    • pp.283-288
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    • 2014
  • A column solid phase extraction procedure based on modified polyurethane foam (PUF) by a newly synthesized Schiff base ionophore, named 2,2'-{iminobis[propane-3,1-diylnitrilo(1E)prop-1-yl-1-ylidene]}diphenol, was developed for preconcentration step of trace amounts determination of copper ions in water samples by atomic absorption flame spectroscopy. The influence of parameters on the adsorption process such as sample pH, amount of modified PUF packed in the column, type and volume of stripping reagent and its flow rate were investigated and optimized. Under optimum experimental conditions, the calibration graph was linear in a relatively wide range ($0.005-210{\mu}g/ml$) with a limit of detection $0.002{\mu}g/ml$ of copper. The proposed method allows achieving to a concentration factor of >133. The capacity of a column (1.6 cm i.d.) packed by 6 g of PUF modified by 12 mg of the Schiff base was found to be $247.7({\pm}2.1){\mu}g$ of copper. It was found that the adsorption process was highly selective towards copper ions with respect to some associated metal ions. The presented procedure was successfully applied for determination of copper in some water samples.

치환체-Arendiazocyanide, Nitrosobenzene의 (4 + 2) 고리첨가 반응에 대한 분자궤도론적 연구 (MO Studies on (4 + 2) Cycloadditions of Substituted-Arenediazocyanides and Nitrosobenzenes)

  • 전용구;박성규;김일두;이익춘
    • 대한화학회지
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    • 제28권5호
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    • pp.284-292
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    • 1984
  • 치환체-E-arene-diazocyanides와 nitrosobenzenes의 (4+2) 고리첨가 반응의 배향성에 대한 치환기 및 산 촉매효과와 반응성을 예측하기 위하여 Diels-Alder 반응의 열 또는 촉매반응에 대하여 Frontier orbital theory (FMO)이론을 적용해서 CNDO/2 방법과 EHT-SPD 방법으로 고찰하였다. (1) 위 반응은 Hammett 식의 rho(${\rho}$)값이 양이므로 normal electron demand 반응형태를 가지며 4-FMO 및 Anh 방법이 실험적인 주 배향체와 일치함을 알았다. (2)전자끄는 기로 치환되면 dienophile의 HOMO, LUMO 궤도함수에너지가 낮아지고 반응성이 커지는 것을 알았다. (3)Lewis 산은 dienophile과 착물을 형성하고 dienophile의 LUMO계수를 정 반대로 분극시켜 주므로 주 배향제는 B형으로 예측된다. (4) diene HOMO-dienophile LUMO 상호작용의 안정화 에너지 (${\Delta}$E)와 Hammett식의 시그마 (${\sigma}$)값과의 그라프에서는 좋은 직선성을 보여 주었다.

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흑연로 원자 흡수흡광법에 의한 고순도 구리 합금중의 안티몬의 직접 분석 방법 (Direct Determination Method of Antimony in High Purity Copper Metal by Graphite Furnace Atomic Absorption Spectrometry)

  • 유광식;경종대;권진기;이중주
    • 대한화학회지
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    • 제39권4호
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    • pp.252-256
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    • 1995
  • 고순도 구리 금속중에 존재하는 미량의 안티몬을 사전 분리시키지 않고 직접 분석할 수 있는 GFAAS 조건을 조사하였다. 과량 존재하는 구리가 안티몬의 감도를 향상시키는 matrix modifier의 역할을 하고 있음을 알았다. 희화 온도는 $600^{\circ}C(20s){\sim}700^{\circ}C(10s)$를 이용할 때에 $1000^{\circ}C(20s){\sim}1100^{\circ}C(10s)$보다 감도가 향상되며, 원자화 온도는 $2200^{\circ}C$에서 가장 좋은 Sb의 흡광도를 보였다. Ar 기체의 압력은 $2.0\; kg/cm^2$일때에 최적임을 확인하였으며, 20 ppb에서 200 ppb Sb 범위에서 변화율(coefficient of variation)이 5% 미만이며 직선 관계를 보였다.

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