• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제29권5호
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• pp.785-793
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• 2019

Black rot caused by Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) is the most damaging disease in Brassica crops around the world. In this study, we developed a molecular marker specific to Xcc race 5. To do this, the available whole genome sequences of Xcc races/strains and Xc subspecies were aligned and identified a highly variable genomic region (XccR5-89.2). Subsequently, a primer set covering the 'XccR5-89.2' region was designed and tested against the genomic DNA of Xcc races/strains, Xc subspecies and other plant-infecting bacterial strains (Pseudomonas syringae pv. maculicola and Erwinia carotovora subsp. carotovora). The results showed that the 'XccR5-89.2' primer pair amplified a 2,172-bp fragment specific to Xcc race 5. Moreover, they also amplified a 1,515-bp fragment for Xcc race 1 and an over 3,000-bp fragment for Xcc race 3. However, they did not amplify any fragments from the remaining Xcc races/strains, subspecies or other bacterial strains. The 'XccR5-89.2' primer pair was further PCR amplified from race-unknown Xcc strains and ICMP8 was identified as race 5 among nine race-unknown Xcc strains. Further cloning and sequencing of the bands amplified from race 5 and ICMP8 with 'XccR5-89.2' primers revealed both carrying identical sequences. The results showed that the 'XccR5-89.2' marker can effectively and proficiently detect, and identify Xcc race 5 from Xcc races/strains, subspecies and other plant-infecting bacteria. To our knowledge, this is the first report for an Xcc race 5-specific molecular marker.

• 한국식물병리학회:학술대회논문집
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• 한국식물병리학회 2005년도 한국식물병리학회 임시총회 및 춘계학술발표회
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• pp.83.2-84
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• 2005

• 한국식물생명공학회:학술대회논문집
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• 한국식물생명공학회 2005년도 추계학술대회 및 한일 식물생명공학 심포지엄
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• pp.236-236
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• 2005

• 한국응용곤충학회지
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• 제16권1호
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• pp.55-63
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• 1977

감자 저장병으로서 중요한 Fusarium solani, F. roscum, F. oxysporum 및 Erwinia carotovora를 분리 동정하고 수확후에 공시품종 Epicure, Irish Cobbler, 및 Superior의 괴경을 절단하여 $4^{\circ},\;14^{\circ},\;24^{\circ},\;및\; 34^{\circ}$ 각 온도의 습실에 1, 3, 5, 및 7일간 예치한 후 suberin 및 periderm 형성을 검경하였다. 그리고 위와 같이 처리한 괴경에 4종의 병원균을 접종하여 9일간 정치한 후 부패도를 조사하였다. 예치온도가 높을수록 또 그 기간이 길어짐에 따라 보호막으로서의 suberin 및 periderm 형성이 증가하였으며 부패는 감소되었다. 공시균종간의 병원성, 품종에 대한 반응, 보호막 형성에도 차이가 있었으나 예치온도 및 기간의 효과가 부패방지에 더 중요하였다. $4^{\circ}C$에서는 7일이내의 예치기간에 보호막은 거의 형성되지 않았으며 부패는 심하였고 $34^{\circ}C$에서는 대체로 이와 반대하였다. 그러므로 절상감자를 바로 $4^{\circ}C$에 냉장함은 피해여야 할 것으로 본다. $24^{\circ}C$에서 3일 $14^{\circ}C$에서 5일이 지나면 부패되지 않았으며 suberin 및 periderm 형성은 중정도였다. 고온에서는 예치, 기간중에 기경이 부패되는 수도 있으므로 그 적온을 피하여 $14^{\circ}C$에 5일 이상 예치한 후에 저장하는 것이 실용적이라 생각된다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제37권2호
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• pp.110-117
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• 2009

독도에 자생하고 있는 야생 가지과 식물근권세균들의 특성을 밝히기 위해 까마중을 채집하였다. 까마중 근권으로부터 총 44종의 포자형성세균 혹은 질소고정세균을 분리하였다. 이 균주들은 16S rDNA 염기서열을 이용하여 부분 동정하였다. PGPR로써의 특성을 밝히기 위해 옥신 생산능, 인 가용능, 그리고 Siderophore 형성능을 측정하였다. 식물 생장호르몬인 옥신을 형성하는 균주는 19종, 난분해성 인을 분해할 수 있는 균주는 8종, 식물병원균을 억제하는 siderophore를 형성할 수 있는 균주는 13종으로 확인되었다. 우리나라에서 널리 재배되고 있는 가지과식물인 담배와 고추에 직접 적용하여, 식물의 생장 촉진 효과 및 식물 전신유도저항성 효과를 확인하였다. 특히 KUDC1009는 식물의 생장 촉진 효과 그리고 식물병원균에 대한 저항성을 증가시키는 등 다기능의 능력을 가지는 것을 확인할 수 있었다. 독도의 근권세균들은 다양한 스트레스 환경하에서 야생 까마중이 생존하는데 많은 도움을 주는 것을 추측 할 수 있었다.

• 한국식품저장유통학회지
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• 제11권3호
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• pp.411-416
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• 2004

식물성 천연항균제인 자몽종자추출제재(Boatanical antimicrohiagent-grapefruit seed extract mixture : BAAG)의 항균특성을 구명하고, 과채류의 선도유지제로서의 기능과 효능을 입증하기 위하여 BAAG를 조제하여 과채류의 저장, 유통중 발생하는 변패균주, Fuarium solani, Botrytis cinerea Pencilliumcrutosua Ewinia carotovora Phoma destructiva and Alternaria radirina등을 공시균주로 사용하여 Paper disk method에 의한 농도별 항균력을 실험한 결과,변패미생물에 대하여 농도에 비례하여 상당한 항균효과를 보였으며, 또한 생육저해곡선에서는 500 $\mu$g/mL 이상에서 미생물의 생육이 완전히 억제되는 것을 볼수 있었다. 그리고 열 및 pH 안전성에 대해서도 열처리의 온도와 pH 범위에 관계없이 항균력을 보임으로써 열과 pH에 안정한 것으로 나타났다. 또한 항균력에 의한 미생물의 생태변화에 대한 전자현미경적 검사(SEM에서도 항균물질이 미생물 세포벽 또는 세포막의 기능성을 파손하여 삼투기능이 상실됨으로 해서 미생물의 생리가 중단되고 생육이 억제되는 것을 볼 수 있으며, 균체내부에 빈 사멸 균체들이 증대함을 알 수 있었다. 이상의결과로 미루어, BAAG는 항균포장원지 또는 항균포장상자의기능성 소재로 이용될 수 있음을 확인할 수 있었다.

• 농약과학회지
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• 제13권4호
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• pp.275-282
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• 2009

선발된 PGPR 균주인 Bacillus subtilis C4와 Bacillus cereus D8 균주의 유채에 대한 생육촉진 및 무름병균인 Erwinia carotovora와 균핵병균인 Sclerotinia sclerotiorum에 대한 방제효과를 검정하기 위하여 실내검정과 온실검정을 실시하였다. 실내검정 결과, C4와 D8균주처리에 의하여 유채의 생육이 40.3%~74% 증가하였으며 무름병이 대조구에 비하여 80% 감소하였다. 실내검정에서 C4와 D8균주를 종자에 처리하였을 때 뿌리가 크게 신장되었다. 주요 식물병원균 Sclerotinia sclerotiorum, Rhizoctonia solani, Botrytis cinerea, Fusarium oxysporum, Phytophthora capsici, Colletotrichum acutatum에 대하여 항균활성시험을 수행한 결과 두 균주 중 C4균주는 모든 병원성 곰팡이에 대하여 항균활성을 나타내었다. 온실검정에서 C4와D8균주처리는 대조구에 비하여 유채의 초장, 엽폭 및 엽장을 19.5%~24.9%, 11.3%~15.3%, 14.1%~20.7% 각각 증가시켰으며 균핵병균인 Sclerotinia sclerotiorum에 대한 억제효과가 우수하였다. 이와 같은 결과를 볼 때 C4, D8 균주 처리는 유채의 생육을 촉진시키며 유채에 저항성을 유도하므로 친환경생물방제에 적용할 수 있을 것으로 생각된다.

• 한국식물병리학회:학술대회논문집
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• 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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• pp.101.2-102
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• 2003

The ability of P. chlororaphis O6 to induce resistance to Erwinia carotovora subsp. carotovara SCCI and to promote growth in tobacco was demonstrated in microtiter assays on plants pre-inoculated at the root level with the bacteria before challenge with the leaf pathogen. To identify th bacterial determinants involved in induced systemic resistance and plant growth promotion, cell culture of O6 grown in King's medium B was fractionated with organic solvents and purified using various columns. in vivo and in vitro assays with samples from successive fractionation steps of the O6 supernatant led to the conclusion that antibacterial compounds were observed in aqueous layer, and to the isolation of fractions containing metabolites that retained most of the resistance-inducing activity (70：30, methanol：water) and the plant growth promotion (80：20 and 90：10, methanol：water) after ODS column chromatography. Although these molecules remain to be purified further and structurally characterized, its isolation is an addition to the range of determinants from plant growth-promoting rhizobacteria known to stimulate plant defence.

• 한국식물병리학회지
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• 제1권1호
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• pp.56-60
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• 1985

본 실험은 질소 및 탄소원이 Cercospora kikuchii 균사생장에 미치는 영향과 여러 배양조건에서 생장한 C. kikuchii가 세균생장을 저지하는 정도를 알아보았다. C. kikuchii 균사생장에 적합한 질소원은 yeastextract였고, 탄소원으로는 sucrose, glucose, maltose, fructose를 첨가하였을 때 균사생장이 좋았다. C. kikuchii의 세균생장저지 실험에서 wild type은 pH 조건은 5.0에서, 질소원으로는 yeast-extract 또는 peptone.을 첨가하였을 때, 탄소원으로는 sucrose, maltose, glucose, fructose를 첨가한 배지에서 생장하였을 때 Erwinia carotovora와 Pseudomonas solanacearum의 생장을 크게 저지시켰다. 그러나 albino 돌연변이균주는 실허된 세균의 생장을 거의 저지시키지 못하였다.

• 한국작물학회지
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• 제48권2호
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• pp.113-119
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• 2003

Soybean sprout pathogenic bacteria were isolated from the large, deep containers of a commercial factory. Over a period of one year, 40 pathogenic-like bacteria were isolated among a total of 732 isolates. In addition to bacteria previously reported to be associated with rotting, such as Pseudomonas putida and Erwinia carotovora, several other genera were also identified: Acinetobacter spp., Chryseobacterium spp., Klebsiella sp., Pantoea agglomerans, Bacillus sp. Fatty acid methyl ester (FAME) analysis using the Microbial ID (MIDI) system, and 16s rRNA sequence analysis, yielded identical results, confirming the identities of these microorganisms. Several types of selective media were not good for identification and determination of population structure in commercial environments, as colony type was not specific to the genus. There was no dominant bacterium, and we were not able to find the main bacterium responsible for soybean spout rot. Even though we did not identify a major target for controlling rot or screening for resistant cultivars, the results of this study indicated that bacterial rot of soybean sprout is endemic. In addition, it emerged that factory epidemics in summer are not caused by the bacteria isolated in this study.