Kim, Dohun;Lee, Jong-Young;Yoo, Jin Young;Cho, Jun Yeun
Journal of Chest Surgery
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제53권5호
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pp.250-257
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2020
Background: Lung adenocarcinoma (LUAD) with ground-glass opacity (GGO) can become aggravated, but the reasons for this aggravation are not fully understood. The goal of this study was to analyze the genetic features and causes of progression of GGO LUAD. Methods: LUAD tumor samples and normal tissues were analyzed using an Illumina HiSeq 4000 system. After the tumor mutational burden (TMB) was calculated, the identified mutations were classified as those found only in GGO LUAD, those present only in nonGGO LUAD, and those common to both tissue types. Ten high-frequency genes were selected from each domain, after which protein interaction network analysis was conducted. Results: Overall, 227 mutations in GGO LUAD, 212 in non-GGO LUAD, and 48 that were common to both tumor types were found. The TMB was 8.8 in GGO and 7.8 in non-GGO samples. In GGO LUAD, mutations of FCGBP and SFTPA1 were identified. FOXQ1, IRF5, and MAGEC1 mutations were common to both types, and CDC27 and NOTCH4 mutations were identified in the non-GGO LUAD. Protein interaction network analysis indicated that IRF5 (common to both tissue types) and CDC27 (found in the non-GGO LUAD) had significant biological functions related to the cell cycle and proliferation. Conclusion: In conclusion, GGO LUAD exhibited a higher TMB than non-GGO LUAD. No clinically meaningful mutations were found to be specific to GGO LUAD, but mutations involved in the epithelial-mesenchymal transition or cell cycle were found in both tumor types and in non-GGO tissue alone. These findings could explain the non-invasiveness of GGO-type LUAD.
Background: Although radiotherapy is one of the most effective strategies in the treatment of cancers, it is associated with short and long term side effects on normal tissues. Zataria multiflora Boiss (Laminacea) (ZM) has several biological properties such as antioxidant and anti-inflammation activities.Here we investigated cell killing effects of a hydroalcoholic Zataria multiflora extract on cell death induced by ionizing radiation in a human glioblastoma cell line (A172) and human non-malignant fibroblasts (HFFF2) in vitro. Materials and Methods: A172 and HFFF2 cells were treated with a hydroalcoholic extract of dried aerial parts of Zataria multiflora at different concentrations (25, 50, 100, 150 and $200{\mu}g/ml$) and then exposed to ionizing radiation (IR). Cell proliferation and DNA fragmentation were evaluated. Thymol content in the extract was analyzed and quantified by HPLC methods. Results: A172 cell proliferation was significantly inhibited by ZM. The percentage cell survival was $91.8{\pm}8.57$ for cells treated with $200{\mu}g/ml$ of ZM extract alone while it was $76.0{\pm}4.27$ and $66.2{\pm}8.42$ for cells treated with ZM and exposed to IR at doses of 3Gy and 6Gy, respectively. Radiation-induced apoptosis in A172 cells was significantly increased following treatment with ZM at doses of $200{\mu}g/ml$. ZM extract did not exhibit any enhanced cell killing effects and apoptosis caused by IR on HFFF2 cells. Conclusions: These data show selective radiosensitization effects of ZM in A172 cells apparently due to increased radiation-induced apoptosis.
Curcumin (CM), a biphenyl compound, possesses anti-inflammatory, antioxidant and antimicrobial activity. MicroRNAs (miRNAs) are small noncoding RNAs which regulate gene expression and the molecular mechanisms of several biological processes. Liver fibrosis is a major cause of hepatic dysfunction and cancer and there are few effective therapies emphasizing the need for new approaches to control. The present study was conducted to investigate the effect of curcumin (CM) on liver fibrosis through modulating the expression level of miRNAs (199 and 200), the main miRNAs associated with liver fibrosis. Induction of liver fibrosis by carbon tetrachloride ($CCL_4$) was confirmed by histopathological examination. Mice were divided into 3 groups: group 1 were i.p injected with 10% $CCL_4$ twice weekly for 4 weeks and then once a week for the next 4 weeks followed by 4 weeks with olive oil only. Group 2 were i.p injected with 10% $CCL_4$ twice weekly for 4 weeks and then once a week for the next 4 weeks followed by curcumin (5 mg/mouse/day) once daily for the next 4 weeks. The third group was injected with olive oil. The expression level of miR-199 and miR-200 and some of their targeted genes were measured by real time PCR. miRNA (199 and 200) levels were significantly elevated in liver fibrotic tissues compared to control groups. Curcumin was significantly returned the expression levels of mir-199 and -200 with their associated target gene nearly to their normal levels. This is the first study that highlighted the effect of curcumin on liver fibrosis through regulation of miRNAs.
This review deals briefly with the various medicinal components(mainly saikosaponins), their biological activities and the variation of their contents by different cultivation environment and plant parts in Bupleurum species. Bupleuri radix, a crude drug, is the root of Bupleurum falcatum L. (Korea, Japan), B. chinense(China), and their related species (Umbelliferae). There are over 120 species in Bupleurum genus throughout world, mainly Asian area, and over 5 species in Korea, investigated up to now. These plants contain many physiological active compounds and the principal components are saikosaponins. Major activities of this crude drug and saikosaponins are the anti-inflammatory and antihepatotoxic activities. Saikosaponins and their derivatives in Bupleurum spp. have been chemically studied, isolated and identified over 70 compounds in over 50 species. Other components, physiologically active ones, also have been investigated, which are the groups of lignan, flavonoid, essential oil, polyacetylene, polysaccharide, etc. Saikosaponins belong to the group of triterpenoid saponin chemotaxonomically and occur the accumulation and turnover in plant tissues through secondary metabolism, mevalonic acid pathway. The contents and kinds of saikosaponins and other components in Bupleurum spp. plants are various due to different species and growing environments, as the plant growth characters and yield are various. Most of medicinal plants as well as Bupleurum species are very useful as agricultural products and traditional medicines, and also are very valuable as genetic resources and natural products. So we need to collect, evaluate, preserve, and utilize various medicinal plants, and also to under-stand secondary metabolism and improve the breeding and cultivation techniques for the safe production of crude drugs with high quality and yielding.
Mun Chi-Woong;Choi Ki-Sueng;Shin Oon-Jae;Yang Young-Ill;Chang Hee-Kyung;Hu Xiaoping;Eun Chung-Ki
대한의용생체공학회:의공학회지
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제27권2호
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pp.53-58
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2006
In this study, transverse relaxation time (T2) measurement and the evaluation of the characteristics of the spectral peak related to stomach tissue metabolites were performed using ex vivo proton magnetic resonance spectroscopic imaging (MRSI) at 1.5-T MRI/S instruments. Thirty-two gastric tissues resected from 12 patients during gastric cancer surgery, of which 19 were normal tissue and 13 were cancerous tissue, were used to measure the $T_2$ of the magnetic resonance spectroscopy (MRS) peaks. The volume of interest data results from the MRSI measurements were extracted from the proper muscle (MUS) layer and the composite mucosa/submucosa (MC/SMC) layer and were statistically analyzed. MR spectra were acquired using the chemical shift imaging (CSI) point resolved spectroscopy (CSI-PRESS) technique with the parameters of pulse repetition time (TR) and echo times (TE) TR/(TE1,TE2)=1500 msec/(35 msec, 144 msec), matrix $size=24{\times}24$, NA=1, and voxel $size=2.2{\times}2.2{\times}4mm^3$. In conclusion, the measured $T_2$ of the metabolite peaks, such as choline (3.21ppm) and lipid (1.33ppm), were significantly decreased (p<0.01 and p<0.05, respectively) in the cancerous stomach tissue.
Kim Ji Hyang;Chun Ki-Jung;Yoon Yang Dal;Kim Jin Kyu
환경생물
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제23권4호
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pp.398-404
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2005
Radioprotection is of practical importance for the normal tissues of tumor patients subject to radiotherapy, people with planned or accidental exposure to radiation, and the public and radiation workers. Since oxygen enhances radiation - induced biological damage, antioxidants should be related with the function as a radioprotectors. Ascorbic acid or caffeine is an essential component and antioxidant in the diet of humans and a small range of other mammals. The present study investigates functional radioprotection of caffeine and ascorbic acid against gamma radiation in irradiated C57BL/6N mice. Eight-week-old male C57BL/6N mice were irradiated with 6.5 Gy. A caffeine treated group was administered with $80mg\;kg^{-1}$ body weight by intraperitoneal injection, a single treatment 1 hr before irradiation. Ascorbic acid was administered $330\;mg\;L^{-1}$ in drinking water through all the experimental period. According to time schedules, animals were sacrificed by cervical dislocation. And the samples were collected 2 weeks after whole- body gamma irradiation. The caffeine treated group showed lower decrement of body and organ weights than the other experimental groups. The qualitative analysis of circulating testosterone in serum was performed by means of radioimmunoassay (RIA). The normal level of circulating testosterone was maintained by the treatment of caffeine and ascorbic acid. The change of weight of body and organ and the appearance of seminiferous tubules were improved by an effect of caffeine or ascorbic acid against irradiation. Taken together, caffeine and ascorbic acid protects impairment of spermatogenesis against gamma radiation and may act as a radio-protector.
Effect of 5-hydroxytryptamine(5-HT, serotonin) and its precursor tryptophan on the cell proliferation of brain and somite parts of 4 day chick embryo in Dulbeco's modified essential medium was examined morphologically at cellular level. It was realized that the externally added 5-HT and/or tryptophan disturbed cell proliferation and severve necrosis occured. Electron micrograph showed that the development of cell organelles were greatly impaired. The activities of both acetylcholine esterase and $Mg^{2+}$ -dependent ATPase of the brain tissues of 5 day chick embryo, which received 1mg of tryptophan and/or 0.1mg of 5-HT at primitive streak stage after 24 hrs incubation of the fertilized egg, were much lower(about 20-25%) than those of control group. These results were supported by the electron micrographs of chemically treated cells. Control cells showed clear densed bands of acetylcholine esterase activity around nucleus and rough endoplasmic reticulum but tryptophan or 5-HT treated groups showed discontinued activity bands. In the case of $Mg^{2+}$-ATPase, the control groups showed clear continuous activity bands but tryptophan and/or 5-HT treated groups were discontinuous. From the previous and present studies, it seems that the intracelluar 5-HT level is very important for the cell proliferation and normal morphogenesis.
매년 많은 소방공무원들이 화재나 고온 조건 등에 노출되어 화상으로 고통 받고 있어, 화상 예측에 대한 연구를 통해 화상을 방지할 수 있는 방법의 개발이 매우 중요하다. 그러나 피부조직의 비선형성, 혈류에 의한 열전달 분석의 불확실성 등 인체 내부의 복잡한 물리현상으로 인해 화상에 대한 연구는 매우 부족한 것이 실정이며, 특히 국내의 경우는 이에 대한 연구가 전무한 실정이다. 본 연구에서는 특히 심각한 화상을 유발할 수 있는 돌발화염(80 kW/$m^2$ 이상의 고열 유속 조건)하에서의 2도 화상 발생에 대한 예측을 수행하였다. 생체 열전달 방정식(Bio-heat transfer)을 이용하여 지배방정식을 유도하였으며, 유한차분법(Finite Difference Method)을 활용하여 화상에 대한 예측을 수행하는 수치해석 접근법을 사용하였다. 기존의 여러 연구결과로부터 인체 피부의 열물성치를 정리하였고, 그것을 바탕으로 계산을 수행하였다. 기존의 낮은 열유속에 대한 화상 실험 결과와 예측 결과를 비교하여 가장 오차가 적은 열물성치 모델을 파악하였고, 그 결과를 바탕으로 고열유속의 돌발화염에서의 2도 화상발생 노출시간을 예측하여 제시하였다.
Inflammation is the complex biological response of injured tissues to harmful stimuli. A cascade of biochemical events propagates and matures the inflammatory response, involving the local vascular system, the immune system, and various cells within the injured tissue. The immune system is often involved with inflammatory disorders, demonstrated in both allergic reactions and some myopathies, with many immune system disorders resulting in abnormal inflammation. An Arbitrary Waveform Generator (AWG) is a piece of electronic test equipment used to generate electrical waveforms for the treatment of patients. The patients with gastritis and arthritis have been known to have a relatively favorable prognosis with AWG treatment. Accordingly, we examined the effects of AWG treatment in gastritis and arthritis animal model. The compound 48/80 was used to induce animal gastritis model. The tissue malone dialdehyde (MDA) and serum histamine levels, and the activity of superoxide dismutase (SOD) in stomach tissue were measured. The tissue MDA and serum histamine levels in AWG treated groups exhibited the decreased tendency compared with control group, whereas the tissue SOD activity was slightly increased. The Freund's complete adjuvant was used to induce animal arthritis model as well. The paw edema volume and the width of ankle joint were determined. The AWG treatment significantly decreased the paw edema volume after 5th day of treatment. Although further studies should be performed to confirm the effects of AWG treatment, present study suggest that AWG treatment might be used as a complementary treatment for the gastritis or arthritis treatment.
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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제18권2호
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pp.113-120
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2009
Embryonic lethal abnormal visual (elav) is a lethal gene in Drosophila inducing the abnormal development and function of nervous system. We cloned a Bm-elav gene by bioinformatics and biological experiment, based on sequence of ELAV protein and dbEST of Bombyx mori. The full-length of Bm-elav cDNA is 1498 bp, contains a 906 bp open read frame (ORF) encoding a precursor of 301 amino acid residues with a calculated molecular weight of 34 kDa and pI of 8.99. Bm-ELAV protein precursor contains three RNA recognition motifs (RRM) in $24{\sim}91$, $110{\sim}177$ and $222{\sim}295$ bit amino acid residues respectively, and belongs to RNA-binding protein family. Bm-ELAV shared varying positives, ranging from 56% to 60% (Identities from 41% to 45%), with RRM from other species of Xenopus tropicalis, Apis mellifera, Tribolium castaneum, Branchiostoma belcheri and Drosophila. Gene localization indicated that Bm-elav is a single-copy gene, gene mapping within 12-chromosome from 7916.68 knt to 7918.16 knt region of nscaf2993. Spatiotemporal expressions pattern analysis revealed that Bm-elav expressed higher in most tested tissues and developmental stages in whole generation, such as silk gland, fat body, midgut, hemopoietic organ and ovary, but almost no expression in terminated diapause eggs. This suggested that the expression of Bm-elav in early developmental embryonic stages might induce abnormal development like in Drosophila. Cloning of the Bm-elav gene enables us to test its potential role in controlling pests by transferring the gene into field lepidopteran insects in the future.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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