Background: We aimed to comprehensively review the evidence for using sputum DNA to detect non-small cell lung cancer (NSCLC). Materials and Methods: We searched PubMed, Science Direct, Web of Science, Chinese Biological Medicine (CBM), Chinese National Knowledge Infrastructure (CNKI), Wanfang, Vip Databases and Google Scholar from 2003 to 2013. The meta-analysis was carried out using a random-effect model with sensitivity, specificity, diagnostic odd ratios (DOR), summary receiver operating characteristic curves (ROC curves), area under the curve (AUC), and 95% confidence intervals (CI) as effect measurements. Results: There were twenty-two studies meeting the inclusion criteria for the meta-analysis. Combined sensitivity and specificity were 0.62 (95%CI: 0.59-0.65) and 0.73 (95%CI: 0.70-0.75), respectively. The DOR was 10.3 (95%CI: 5.88-18.1) and the AUC was 0.78. Conclusions: The overall accuracy of the test was currently not strong enough for the detection of NSCLC for clinical application. Dscovery and evaluation of additional biomarkers with improved sensitivity and specificity from studies rated high quality deserve further attention.
Baroreflex sensitivity (BRS) is a parameter of the cardiovascular system that is reflected in changes in pulse interval (PD and systolic blood pressure (SBP). BRS contains information about how the autonomic nervous system regulates hemodynamic homeostasis. Normally the beat-to-beat SBP measurement and the pulse interval measured from the electrocardiogram (ECG) are required to estimate the BRS. We investigated the possibility of measuring BRS in the absence of a beat-to-beat SBP measurement device. Pulse arrival time (PAT), defined as the time between the R-peak of the ECG and a single characteristic point on the pulse wave recorded from any arterial location was measured by photoplethysmography. By comparing the BRS obtained from conventional measurements with our method during controlled breathing, we confirmed again that PAT and SBP are closely correlated, with a correlation coefficient of -0.82 to -0.95. The coherence between SBP and PI at a respiration frequency of 0.07-0.12 Hz was similar to the coherence between PAT and PI. Although the ranges and units of measurement are different (ms/mmHg vs. ms/ms) for BRS measured conventionally and by our method, the correlation is very strong. Following further investigation under various conditions, BRS can be reliably estimated without the inconvenient and expensive beat-to-beat SBP measurement.
Over the past decade, mass spectrometry-based metabolomics, especially two dimensional gas chromatography mass spectrometry (GCxGC/TOF-MS), has become a key analytical tool for metabolomics data because of its sensitivity and ability to analyze complex biological or biochemical sample. However, the need to reduce variations within/between experiments has been reported and methodological developments to overcome such problem has long been a critical issue. Along with methodological developments, developing reasonable performance measure has also been studied. Following four numerical measures have been typically used for comparison: sensitivity, specificity, receiver operating characteristic (ROC) curves, and positive predictive value (PPV). However, more recently, such measures are replaced with F1 score in many fields including metabolomics area without any carefulness of its validity. Thus, we want to investigate the validity of F1 score on two examples, with the goal of raising the awareness in choosing appropriate performance comparison measure. We noticed that F1 score itself, as a performance measure, was not good enough. Accordingly, we suggest that F1 score be supplemented with other performance measure such as specificity to improve its validity.
fMRI, functional MRI introduced recently appears based on the gradient echo technique which is sensitive to the field inhomogeneity developed due to the local susceptibility changes of blood oxygenation and deoxygenation. Common to all the gradient echo techniques is that the signal due to the susceptibility effects is generally decreased with increasing inhomogeneity due to the $T2^*$ effect or conventionally known as blood oxygenation level dependent (BOLD) effect. It is, also found that the BOLD sensitivity is also dependent on the imaging modes, namely whether the imaging is in axial, or coronal or sagittal mode as well as the directions of the vessels against the main magnetic field. We have, therefore, launched a systematic study of imaging mode dependent signal change or BOLD sensitivity as well as the signal changes due to the tilting angle of the imaging planes. Study has been made or both TRFGE sequence and CGE sequence to compare the distinctions of the each mode since each technique has different sensitivity against susceptibility effect. Method of computation and both the computer simulations and their corresponding experimental results are presented.
Devices based on nanomaterials platforms are emerging as a powerful tool for ultrasensitive sensors for the direct detection of biological and chemical species. In this talk, we will report the preparation and the full characterization of electrochemical polymerization of biopolymers platforms and nano-structure formation for electrochemical detection of enzymatic activity and toxic compound in electrolyte for biosensor applications. Formation of an electroactive polymer film of two different compounds has been quantified by observing new redox peak at higher potentials in cyclic voltammogram measurements. RCT value of at various biopolymer concentration based hybrid films has been obtained from electrochemical impedance spectroscopy analysis and possible mechanism for formation of complexes during electrochemical polymerization on conducting substrates has been investigated. Biosensors developed based on these hybrid biopolymers have very high sensitivity.
Cutaneous electrogastrography is the measurement of electrical activity of the stomach on the abdominal surface. The validity of cutaneous electrogastrography is dependent upon the quality of the recording technique. The locations of electrodes are an important issue. We examined the influences of the inter-electrode distance of bipolar leads on electrogastrography measurements. The sensitivity distributions of EGG leads were calculated based on a 2D body fat model and evaluated according to the region of interest sensitivity ratio (ROISR). We simulated the ROISR of the inter-electrode distance in relation to various body fat thicknesses. The distance between the electrodes was proportional to the distance between the ROI and the surface of the abdomen. The results imply that inter-electrode distance can be applied in electrogastrography according to human body fat thickness.
Urine NMR analyses made by use of an 80 MHz proton NMR spectrometer show that aromatic proton NMR signals appear in most censer patients'urine. On the assumption that the signals may be caused by the phenolic compound of tyrosine excreted in the urine, a jellied reagent is used for identifying them by observing the urine color reaction. It is observed that the reagent reacted to the cancer urine becomes red. Such a change of the urine color seems to indicate the substance of tyrosine. Recently an attempt to determine the reagent sensitivity an specificity of the urine of 69 persons including cancer and noncancer patients has been made. The results of the attempt are respectively 85.3% for sensitivity and 91.4% for specificity. This seems to show a possibility that the reagent can be used for the diagnosis.
The objective of the present study was to develop an equivalent circuit model of glucose kinetics including the hepatic glucose balance functions which were neglected in the previous compartmental models. Using this circuit model, the insulin resistivity parameter and hepatic glucose sensitivity parameter were estimated in optimal fitting of the model based data of glucose and insulin concentration to the reported clinical intravenous glucose tolerance test(IVGTT) data in normal and diabetic subjects. The addition of the hepatic function in the model has improved the overall performance of the simulation. Also, the computed tissue insulin resistivity and the hepatic glucose sensitivity are shown to be significant in distinguishin four clinical groups of normal and diabetic groups.
Hyperpolarization methods are the most emerging techniques in the field of magnetic resonance (MR) researches since they make a contribution to overcoming sensitivity limitation of MR spectroscopy and imaging, leading to new fields of researches, real-time in vivo metabolic/molecular imaging and MR analysis of chemical/biological reactions in non-equilibrium conditions. Make use of enormous signal enrichments, it becomes feasible to investigate various chemical and biochemical systems with low ${\gamma}$ nuclei in real-time. This review deals with the theoretical principals of common hyperpolarization methods and their experimental features. In addition, more detailed theories, mechanisms, and applications of dissolution dynamic nuclear polarization (D-DNP) are discussed.
Respiration measurement method using an ultrasound sensor is influenced very little by an error of inertia and pressure. This device measures the amount and flow of respiration using a delivery speed difference of the ultrasound waves that are a return format by the pneumatic stream that is a flogging of ultrasound waves during transmission and receipt as having used a characteristic of ultrasound waves. This paper examines improving the sensor's sensitivity during transmission and receipt of the signal. Because the measurement must be performed on patients, clinicians need to be sure that it is accurately measuring even very weak breathing.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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