Vibrio parahaemolyticus in uncooked seafood causes acute gastroenteritis. The microorganism has two sets of type III secretion systems and two hemolysins. When it injects its effector proteins into a host cell via type III secretion system 1, one of the type III secretion systems induces secretion of interleukin (IL)-8, a proinflammatory chemokine, through the phosphorylation of ERK 1/2 and p38 MAPK. Although probiotics have beneficial effects on hosts and can help control some infectious diseases, there is little research on the efficacy of probiotics in V. parahaemolyticus infection. Here we pretreated V. parahaemolyticus-infected human intestinal epithelial cells with heat-killed Lactobacillus brevis KB290, a probiotic isolated from fermented vegetables (traditional Japanese pickles) and utilized as an ingredient of beverages and supplementary foods, and demonstrated its efficacy in enhancing IL-8 secretion from V. parahaemolyticus-infected cells. Among the three heat-killed lactic acid bacterial strains we tested, L. brevis KB290 induced the highest level of IL-8 secretions in the infected cells. Relative to control cells (Caco-2 cells pretreated with PBS), V. parahaemolyticus-infected Caco-2 cells pretreated with heat-killed L. brevis KB290 secreted IL-8 earlier, although concentrations were similar 450min after infection. Heat-killed L. brevis KB290 pretreatment also induced earlier ERK 1/2 phosphorylation, greater p38 MAPK phosphorylation, and enhanced IL-8 mRNA expression. Heat-killed L. brevis KB290 accelerated IL-8 secretion, a host cell immune response, in V. parahaemolyticus-infected cells. We consider this to be beneficial because IL-8 plays an important defensive role against infection, and would contribute to the repair of injured epithelial cells.
Proceedings of the Plant Resources Society of Korea Conference
/
2020.12a
/
pp.3-13
/
2020
Pseudomonas aeruginosa is a ubiquitous gram-negative bacterium causing serious infections. The P. aeruginosa T3SS is a syringe-like apparatus on the bacterial surface, with 4 effector toxins: ExoS, ExoT, ExoY, and ExoU. Here, we investigated the effect of ExoS and ExoT of the T3SS of P. aeruginosa K strain (PAK). The type three secretion system (T3SS) is a major virulence system of Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa). The effector protein Exotoxin S (ExoS) produced by P. aeruginosa is secreted into the host cells via the T3SS. For the purpose of screening the inhibitors with regard to ExoS secretion, we developed the sandwich-type enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) system. PAK clinical strains induce proinflammatory cytokine production through the T3SS, and this involves NF-κB activation in pneumonia mouse models. We tried to confirm the role of the NF-κB transcription factor in ExoS- and ExoT-induced pneumonia mouse models. pro-inflammatory cytokines induction in response to ExoS and ExoT infection relied on NF-κB activation. Our findings highlight the roles of natural poduct in inhibiting proinflammatory cytokine expression during ExoS and ExoT exposure in PAK infections, paving the way for a novel therapeutic approach for the treatment of pulmonary infections.
Most of the Helicobacter pylori strains containing the cag pathogenicity island (PAI) have been associated with more severe gastric disease in infected humans. The cag PAI is composed of 27 proteins, and some of the components are required for CagA translocation into host cells as well as induction of proinflammatory cytokines, such as interleukin-8 (IL-8); however, the exact function of most of the components remains unknown or poorly characterized. In this study, we demonstrated that CagT (HP0532), which is an essential structural component of the cag PAI apparatus, plays an important role in the translocation of CagA into host epithelial cells. In addition to being located on the bacterial surface, CagT is also partially localized in the inner membrane, where it acts as a chaperone-like protein and promotes CagA translocation. However, CagT secretion was not detected by immunoprecipitation analysis of cell culture supernatants. Meanwhile, CagT was related to the introduction of IL-8 of the host cell. These results suggest that CagT is expressed on both the inner and outer bacterial membranes, where it serves as a unique type IV secretion system component that is involved in CagA secretion and cag PAI apparatus assembly.
Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum (Pcc) is a gram-negative, broad host range bacterial pathogen which causes soft rot disease in potatoes as well as other vegetables worldwide. While Pectobacterium infection relies on the production of major cell wall degrading enzymes, other virulence factors and the mechanism of genetic adaptation of this pathogen is not yet clear. In the present study, we have performed an in-depth genome-wide characterization of Pcc strain ICMP5702 isolated from potato and compared it with other pathogenic bacteria from the Pectobacterium genus to identify key virulent determinants. The draft genome of Pcc ICMP5702 contains 4,774,457 bp with a G + C content of 51.90% and 4,520 open reading frames. Genome annotation revealed prominent genes encoding key virulence factors such as plant cell wall degrading enzymes, flagella-based motility, phage proteins, cell membrane structures, and secretion systems. Whereas, a majority of determinants were conserved among the Pectobacterium strains, few notable genes encoding AvrE-family type III secretion system effectors, pectate lyase and metalloprotease in addition to the CRISPR-Cas based adaptive immune system were uniquely represented. Overall, the information generated through this study will contribute to decipher the mechanism of infection and adaptive immunity in Pcc.
Mishghan Zehra;Jiwon Heo;Jeong Min Chung;Clarissa L Durie
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
v.33
no.12
/
pp.1543-1551
/
2023
The recently published high-resolution R388 T4SS structure provides exciting new details about the complete complex of T4SS, including the components making up the stalk and arches, numerous symmetry mismatches between regions of the complex, and an intriguing interpretation of the closed stalk and radial symmetry of the inner membrane complex, which is related to pilus biogenesis assembly. However, there are a few unidentified densities in the electron microscopy map and portions of the identified component sequences for which the structure is not yet known. It is also unclear how well this minimized DNA-transporting T4SS predicts the structure of other T4SSs, such as expanded systems and those that transport proteins rather than DNA. In this review, we evaluate what can be inferred from the recent high-resolution structure of the R388 T4SS with respect to the Cag and Dot/Icm systems. These systems were selected because, given what is currently known about these systems, we expect them to present most structural differences compared to the R388 T4SS structure. Furthermore, we discuss bacterial physiology and diversity, the T4SS structures and their variations between different bacterial species. These insights may prove beneficial for researchers who elucidate the structure and functions of T4SS in different bacterial species.
Lee, Yoo-Sup;Yoon, Won-Su;Chung, Il;Chung, Ka Young;Won, Hyung-Sik;Seo, Min-Duk
Journal of the Korean Magnetic Resonance Society
/
v.19
no.1
/
pp.36-41
/
2015
The causative agent of shigellosis, Shigella flexneri, is a Gram-negative anaerobic bacterial pathogen that causes one of the most infectious bacterial dysenteries in humans. It originates infection by invading cells of the colonic epithelium using a type III secretion system. Despite S. flexneri is closely linked with the human disease, structural study is very deficient. Here, we have initiated NMR study of SF1002 which is the uncharacterized protein from S. flexneri strain 5a M90T. Based on a series of triple resonance spectra, sequence-specific assignments of the backbone amide resonances of SF1002 could be completed. This NMR study would contribute to the structural genomics of S.flexneri.
We present here a draft genome sequence of Bifidobacterium dentium strain ATCC 15424, originally isolated from pleural fluid of an empyema patient. The genome is 2,625,535 bp in length and has a GC content of 58.5%. The genome includes 2,154 protein-coding genes, 4 rRNAs, and 55 tRNAs. Unlike other B. dentium strains isolated from human dental caries, ATCC 15424 carries 247 strain-specific genes, including prophage remnants and type III/IV secretion system proteins, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, and PRTRC system protein E. The sequence information will contribute to understanding of the natural variation of B. dentium as well as the genome diversity within the bacterial species.
Mi-Hyun Lee;Sung-Jun Hong;Dong Suk Park;Hyeonheui Ham;Hyun Gi Kong
The Plant Pathology Journal
/
v.39
no.4
/
pp.409-416
/
2023
Bacterial leaf blight of carrots caused by Xanthomonas hortorum pv. carotae (Xhc) is an important worldwide seed-borne disease. In 2012 and 2013, symptoms similar to bacterial leaf blight were found in carrot farms in Jeju Island, Korea. The phenotypic characteristics of the Korean isolation strains were similar to the type strain of Xhc. Pathogenicity showed symptoms on the 14th day after inoculation on carrot plants. Identification by genetic method was multi-position sequencing of the isolated strain JJ2001 was performed using four genes (danK, gyrB, fyuA, and rpoD). The isolated strain was confirmed to be most similar to Xhc M081. Furthermore, in order to analyze the genetic characteristics of the isolated strain, whole genome analysis was performed through the next-generation sequencing method. The draft genome size of JJ2001 is 5,443,372 bp, which contains 63.57% of G + C and has 4,547 open reading frames. Specifically, the classification of pathovar can be confirmed to be similar to that of the host lineage. Plant pathogenic factors and determinants of the majority of the secretion system are conserved in strain JJ2001. This genetic information enables detailed comparative analysis in the pathovar stage of pathogenic bacteria. Furthermore, these findings provide basic data for the distribution and diagnosis of Xanthomonas hortorum pv. carotae, a major plant pathogen that infects carrots in Korea.
Proceedings of the Korean Society of Plant Pathology Conference
/
2004.10a
/
pp.65-67
/
2004
During initial interactions of bacteria with their host plants, most plants recognize the bacterial infections and repel the pathogen by plant defense mechanism. The most active plant defense mechanism is the hypersensitive response (HR) which is the localized induced cell death in the plant at the site of infection by a pathogen. A primary locus induced in gram-negative phytopathogenic bacteria during this initial interaction is the Hrp locus. The Hrp locus is composed of a cluster of genes that encodes the bacteral Type 111 machinery that is involved in the secretion and translocation of effector proteins to the plant cell. DNA sequence analysis of hrp gene in phytopathogenic bacteria has revealed a Hrp pathogenicity is]and (PAI) with a tripartite mosaic structure. For many gram-negative pathogenic bacteria, colonization of the host's tissue depends on the type III protein secretion system (TTSS) which secrets and translocates effector proteins into the host cell. Effectors can be divided into several groups including broad host range effectors, host specific effectors, disease specific effectors, and effectors inhibit host defenses. The role of effectors carrying LRR domain in plant resistance is very elusive since most known plant resistance gene carry LRR domain. Host specific effectors such as several avr gene products are involved in the determination of the host specificity. Almost all the phytopathogenic Xanthomonas spp. carry avrBs1, avrBs2, and avrBs3 homologs. Some strains of X. oryzae pv. oryzae carry more than 10 copies of avrBs3 homologs. However, the functions of all those avr genes in host specificity are not characterized well.;
Innate immune cells sense and respond to the cytoplasmic infection of bacterial pathogens through NLRP3, NLRC4 or AIM2 inflammasome depending on the unique molecular pattern of invading pathogens. The infection of flagellin- or type III secretion system (T3SS)-containing Gram-negative bacteria such as Salmonella enterica serovar Typhimurium (S. typhimurium) or Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) triggers NLRC4-dependent caspase-1 activation leading to the secretion of proinflammatory cytokines such as interleukin-1-beta (IL-$1{\beta}$) and IL-18. Previous studies have shown that apoptosis-associated speck-like protein containing a CARD (ASC) is also required for Salmonella-induced caspase-1 activation, but it is still unclear how ASC contributes to the activation of NLRC4 inflammasome in response to S. typhimurium infection. In this study, we demonstrate that S. typhimurium triggers the formation of ASC oligomer in a potassium depletion-independent manner as determined by in vitro crosslinking and in situ fluorescence imaging. Remarkably, inhibition of potassium efflux failed to block Salmonella-promoted caspase-1 activation and macrophage cell death. These results collectively suggest that ASC is substantially oligomerized to facilitate the activation of caspase-1 in response to S. typhimurium infection. Contrary to NLRP3 inflammasome, intracellular potassium depletion is not critical for NLRC4 inflammasome signaling by S. typhimurium.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.