• 제목/요약/키워드: bacterial populations

검색결과 291건 처리시간 0.028초

혹명나방 저항성벼 재배 논토양의 미생물상 (Microbial Communities in Rice Paddy Soils Following Cultivation of Genetically Modified Leaf Folder-resistant Rice Plants)

  • 권장식;노형준;서장선;신공식;권순종
    • 한국토양비료학회지
    • /
    • 제43권2호
    • /
    • pp.180-187
    • /
    • 2010
  • 유전자변형 벼 및 비변형 벼 재배시 근권미생물의 특성 및 군집변동상을 조사하였다. 유전자변형 벼 재배 및 비변형 벼 재배 근권토양 및 뿌리표면인 근면의 세균수는 큰 차이가 없었다. 수원지역 2006년도 포장시험에서 근권토양의 세균은 유전자변형 벼의 경우 Afipia가 12.5%, Spingomonas 10.0%, Ramlibacter 10.0%, Mycobacterium 7.5%, Tetrasphaera 7.5%였으며, 유전자비 변형 벼는 Afipia가 7.3%, Spingomonas 12.2%, Ramlibacter 7.3%, Mycobacterium 17.1%, Tetrasphaera 속이 14.6%로 우점하였다. 예산 시험포장에서 재배한 벼 뿌리표면의 우점세균은 2007년도에는 유전자 변형 벼 시험포에서 Arthrobacter 속 12.7% 유전자비 변형 벼 시험포에서는 Burkholderia 속 22.2%였으며, 2008년도에는 유전자변형 벼 시험포에서 Paucimonas 속이 26.6%, 비변형 벼 시험포에서는 Chryseobacterium 속이 15.4 %를 점유하였다. PLFA에 의한 미생물 군집은 유전자변형 벼 재배 유무에 따른 조건에서는 뚜렷한 경향이 없었지만 토양 간에는 다른 특성을 보였다.

PCR-SSCP of Serum Lysozyme Gene (Exon-III) in Riverine Buffalo and Its Association with Lysozyme Activity and Somatic Cell Count

  • Sahoo, Nihar Ranjan;Kumar, Pushpendra;Bhushan, Bharat;Bhattacharya, T.K.;Sharma, Arjava;Dayal, Sanker;Pankaj, Prabhat Kumar;Sahoo, Monalisa
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
    • /
    • 제23권8호
    • /
    • pp.993-999
    • /
    • 2010
  • Serum lysozyme gene is one of the important genes influencing the immune system as its product can cause lysis of bacterial cell wall by cleaving the peptidoglycan layer. The present investigation on the serum lysozyme gene of Indian riverine buffalo was undertaken with the objectives to identify and characterize single nucleotide polymorphic patterns by PCR-SSCP method as well as to study the effect of different genotypes on serum lysozyme activity and somatic cell count. A total of 280 animals comprising four different famous bubaline breeds (Murrah, Mehsana, Surti and Bhadawari), spread over six different farms across the country were used for this study. A 276 bp (partial intron 2, complete exon 3 and partial intron 3) fragment of lysozyme gene was screened for polymorphism using the SSCP technique. Four genotypes namely AA, AB, BC and AC were observed, out of which BC genotype was found to be the most frequent. Among these three alleles, C allele (0.38) was most prevalent in these populations. Various SSCP allelic variants were cloned for sequencing and sequences were submitted to NCBI Genbank. From the alignment of the nucleotide sequences of various allelic variants, it was found that there were differences in 12 positions among the alleles, out of which maximum variation (at 8 places) was found in the intronic region. The allele A was closer to allele-C than allele-B. Allele B was phylogenetically equidistant from both of the other alleles. Mean lysozyme activity determined in serum samples of different animals of Murrah buffalo was $27.35{\pm}2.42\;{\mu}g$ per ml of serum, whereas the mean somatic cell count was $1.25{\pm}0.13{\times}10^5$ cells per ml of milk. The SSCP pattern-wise effects of various genotypes on lysozyme activity and SCC were analyzed. Although the mean values were apparently different in various genotypes, these differences were statistically non-significant. It can be concluded that the riverine buffaloes are sufficiently polymorphic with respect to serum lysozyme gene. The absence of AA genotype in Bhadawari breed of buffalo can be considered as a marker for breed characterization. The difference of four nucleotides in exon-3 indicates high selection pressure on the gene.

염수계 철산화균 및 황환원균에 의한 금속 부식 및 최적 제어 방안 (Metal Corrosion Mechanism by Sulfate-reducing and Iron-oxidizing Bacteria in Saline System and its Optimal Inactivation)

  • 성은혜;한지선;김창균
    • 대한환경공학회지
    • /
    • 제30권8호
    • /
    • pp.798-807
    • /
    • 2008
  • 연안지역 주위에 설치된 각종 관망시설의 금속부식으로 인한 경제적 손실 때문에 실제적인 부식 거동을 이해하고 그것을 적절하게 조절하기 위한 부식과 관련된 원인-결과에 대한 정보를 필요로 하고 있다. 본 연구에서는 미생물 제어에 따라 금속 부식에 영향을 미치는지를 조사하기 위하여 실험실 규모로 연구를 수행하였다. 먼저 관망의 막힘 현상이 발생하는 곳(즉, I Gas Station)의 지하수를 채취한 후 16S rDNA방법으로 시료 속의 미생물 다양성을 조사하였다. 이로부터 금속을 부식시키는 거동이 관측된 미생물이 Leptothrix sp.(철산화)와 Desulfovibrio sp.(황환원)임을 알 수 있었다. 실험 결과, 철 시편의 경우 철산화 미생물에 의해 부식속도가 가장 크게 증가하였고, 반면 황환원 미생물에 의해 철침전물이 빠르게 형성되었다. 함석 시편과 스테인리스 스틸의 경우 주로 철산화 미생물이 부식뿐만 아니라 침전물 형성 속도를 증가시키는 데에도 매우 관련이 높았다. 아연 시편의 경우, 황환원 미생물이 철산화 미생물보다 더 부식에 대한 영향이 컸다. 또한 미생물 성장 제어실험에서는 염소주입이나 UV 처리는 효과적으로 미생물의 성장을 조절할 수 있었다. 그러나 미생물 제어 강도가 경계치보다 증가한다면 화학적 반응을 증가시키기 때문에 부식속도는 점차 증가하는 현상이 나타났다. 본 연구에서는 미생물 금속 부식은 미생물 종류나 금속재료에 따라 다르게 발생하며, 관련 미생물(Leptothrix sp.와 Desulfovibrio sp.)과 금속 부식 또는 침전물 생성에 높은 연관성을 가지고 있었다. 그리고 효과적인 미생물의 제어를 통해 부식 또는 침전 속도를 늦출 수 있음을 확인하였다.

전자빔과 감마선 조사된 무순 및 적양배추 종자의 발아 중 미생물학적 및 생리적 품질특성 (Microbiological and Physiological Qualities of Electron-beam and Gamma-ray Irradiated Sprout Seeds(Radish, Red cabbage) during Germination)

  • 박주환;김귀란;권중호
    • 한국식품저장유통학회지
    • /
    • 제16권2호
    • /
    • pp.186-191
    • /
    • 2009
  • 다수요 새싹채소 중 무순과 적양배추의 종자를 선택하여 전자선과 감마선(0, 1, 3, 5 kGy)을 처리한 다음 생리적 특성과 발아과정 중 미생물 제어효과를 비교하였다. 무순과 적양배추 종자의 총세균 농도는 각각 5.02와 2.86 log CFU/g 이었으나 3 kGy 이상의 방사선 조사에 의해 $2{\sim}3$ log cycle 정도 감소하였다. 새싹의 재배과정 중 총세균의 농도는 점차 증가하는 경향이었으나, 재배 3일까지는 조사구와 비조사구의 차이가 크게 나타났으나 5일 재배 후에는 비조사구와 조사구 간에 유사한 수준을 보였다. 새싹종자에는 대장균군이 검출되지 않았으나 새싹재배 중 농도가 증가하여 재배 말기에는 $4{\sim}5$ log CFU/g 수준을 나타내었다. 그러나 방사선 조사시료에서는 재배 1일까지는 발견되지 않다가 3일부터는 아주 낮은 농도를, 재배 5일째의 1 kGy 조사 무순은 1 log CFU/g 수준을, 적양배추는 2 log CFU/g 수준을 각각 보이면서 시료에 따른 차이를 나타내었다. 그리고, 3 kGy 이상 조사구에서는 대장균군이 매우 낮은 수준을 보이거나 검출되지 않았다. 방사선 조사는 선원에 관계없이 새싹의 수분함량을 유의적으로 감소시켰으며, 발아율은 1 kGy에서는 7%, 3 kGy에서는 18% 정도 감소되었다. 새싹의 수율은 1 kGy에서는 큰 차이가 나타나지 않았으나 3 kGy이상의 조사선량에서 약 $10{sim}50%$ 감소하였으며 길이 변화 또한 새싹의 수율과 유사한 경향을 나타내어 선량이 높을수록 감소하였다. 양배추 새싹의 수율과 길이는 감마선에 비해 전자선 조사(1, 3 kGy) 시료에서 양호하게 나타났다.

후춧가루의 위생화를 위한 감마선, 전자선 및 X-선 조사 효과 비교 (Comparison of the effects of gamma ray, electron beam, and X-ray irradiation to improve safety of black pepper powder)

  • 박재남;정구;윤영민;최수정;김재훈;이주운;송범석
    • 한국식품저장유통학회지
    • /
    • 제21권3호
    • /
    • pp.315-320
    • /
    • 2014
  • 본 연구에서는 후춧가루의 위생화를 위해 감마선, 전자선 및 X-선을 조사한 후 이에 따른 미생물학적 및 관능적 품질변화를 평가하였다. 후춧가루에 감마선, 전자선 및 X-선을 2, 4, 6, 8 및 10 kGy로 각각 조사한 후 미생물 변화와 관능품질 변화를 평가한 결과, 미생물의 경우 선종에 관계없이 흡수선량이 증가할수록 미생물 제어 효과가 증가하는 것으로 나타났으며, 선종별 D10값의 경우 2.24-2.75 kGy범위를 보였으며 방사선 선종에 따른 유의차가 없는 것으로 나타났다. 색도의 경우 명도, 적색도 및 황색도 모두 방사선 선종에 따른 변화가 없는 것으로 판단하였다. 관능적 품질 역시 방사선 선종에 관계없이 흡수선량에 따라 품질저하가 발생되는 것으로 나타났다. 이상의 결과를 종합하여 볼 때 방사선 선종에 따른 후춧가루의 품질변화 차이가 없는 것으로 판단하였으며, 이상의 결과는 X-선의 상업적 이용을 위한 기초 연구 자료로 활용될 수 있을 것으로 사료되었다.

시판(市販) 발효유(醱酵乳)의 미생물학적(微生物學的) 연구(硏究) (Microbiological Studies on the Commercial Fermented Milks)

  • 김종우
    • 농업과학연구
    • /
    • 제5권2호
    • /
    • pp.87-92
    • /
    • 1978
  • 시판(市販)되고 있는 발효유(醱酵乳)의 미생물학적(微生物學的) 성상(性狀)과 보존온도(保存溫度)에 따른 미생물(微生物)의 소장상태(消長狀態)를 확인(確認)하기 위하여 시판(市販) 발효유(醱酵乳)를 1978년(年) 7월(月)부터 10월(月)까지 수집(蒐集)하여 시험(試驗)한 결과(結果) 다음과 같은 결론(結論)을 얻었다. 1. 발효유중(醱酵乳中)에 함유(含有)된 생균수(生菌數)는 $50{\times}10^6$ 내지 $73{\times}10^7$, 유산균수(乳酸菌數)는 $40{\times}10^6$ 내지 $62{\times}10^7$였으며 대장균수(大腸菌秀)는 음성(陰性)을 나타내었다. 2. 발효유(醱酵乳)의 산도(酸度)는 0.468%~0.668%로서 대부분 기준(基準)에 달(達)하나 낮은 편이었다. 3. $5^{\circ}C$ 보존(保存)에서는 산도(酸度)의 변화(變化)가 거의 없었으며 $20^{\circ}C$ 보존(保存)에서는 평균(平均) 22.55%, $30^{\circ}C$ 보존(保存)에서는 평균(平均) 117.66%의 산도(酸度) 증가현상(增加現象)을 나타내었다. 4. 생균수(生菌數는) $5^{\circ}C$로 보존(保存)할 해 96시간(時間)에 이르기까지 큰 변화(變化)가 없었으며 보존온도(保存溫度)의 상승(上昇)에 따라 세균수(細菌數)는 24시한(時閒)까지 증가(增加)하다가 점차적(漸次的)으로 감소(減少)되었다. 5. 유산균수(乳酸菌數)는 $5^{\circ}C$로 보존(保存)할 때 가장 감소율이 적었으며 보존온도(保存溫度)가 상승(上昇)함에 따라 균수(菌數)는 현저하게 감소하였다.

  • PDF

바이러스 유래 시스타틴 재조합 단백질의 곤충 면역 및 발육 억제효과 (Inhibitory Effects of a Recombinant Viral Cystatin Protein on Insect Immune and Development)

  • 김영태;엄성현;박지영;김용균
    • 한국응용곤충학회지
    • /
    • 제53권4호
    • /
    • pp.331-338
    • /
    • 2014
  • 시스타틴(cystatin: CST)은 C1A류 시스테인 단백질분해효소에 대한 경쟁적 가역억제자로서 동식물류에서 파파인과 같은 캐셉신을 억제대상으로 작용하게 된다. 바이러스 유래 CST (CpBV-CST1)이 폴리드나바이러스의 일종인 CpBV (Cotesia plutellae bracovirus)에서 동정되었다. 기존 연구는 이 유전자의 과발현이 배추좀나방(Plutella xylostella) 유충의 면역 및 발육을 교란한다는 것을 보여 주었다. 본 연구는 이 유전자의 단백질 기능을 분석하기 위해 세균발현시스템을 이용하여 재조합단백질(rCpBV-CST1)을 형성하여 단백질분해효소에 대한 활성억제효과를 결정하고, 곤충의 면역과 발육에 대한 생리적 억제효과를 분석했다. 이 유전자 번역부위는 138 개 아미노산으로 약 15 kDa 크기의 단백질로 추정되었다. CpBV-CST1이 먼저 pGEX 발현벡터에 재조합되고, BL21 STAR (DE3) competent cells에 형질전환된 후 0.5 mM IPTG로 4 시간동안 과발현되었다. 분리된 재조합단백질은 파파인에 대한 뚜렷한 억제효과를 나타냈다. 이 재조합단백질은 파밤나방(Spodoptera exigua)에 대해서 혈구소낭형성의 세포성 면역반응을 억제하고, 경구로 처리할 때 배추좀나방의 유충발육을 처리 농도에 비례하여 제한시켰다. 이상의 결과는 CpBV-CST1이 해충 밀도 억제에 응용될 수 있음을 제시하고 있다.

Comparison of immune cell populations in bronchoalveolar lavage cells and PBMC cytokine expressions in porcine reproductive and respiratory syndrome and porcine respiratory disease complex

  • Yang, Myeon-Sik;Jeong, Chang-Gi;Nazki, Salik;Mattoo, Sameer ul Salam;Lee, Sang-Myeong;Kim, Won-Il;Kim, Bumseok
    • 한국동물위생학회지
    • /
    • 제42권4호
    • /
    • pp.201-216
    • /
    • 2019
  • Porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) is characterized by reproductive failure in sows and respiratory distress in all age pigs. Porcine respiratory disease complex (PRDC) is a disease caused by opportunistic bacterial infection secondary to a weakened immune system by a preceding respiratory infection. In this study, we tried to compare the immune responses in PRRS and PRDC groups to clearly characterize the disease severity. Eighty-five pigs were infected with various Korean field PRRS virus strains. Infected animals were classified into PRRS (n=32) and PRDC (n=53) groups based on lung lesions such as interstitial pneumonia, suppurative pneumonia, and pleuropneumonia. The immune cell population of bronchoalveolar lavage cells (BALc) was evaluated on 14 and 28 days post infection (dpi) and PMBC cytokine expression was measured on 0, 3, 7, 14 dpi to investigate early inflammatory reactions. Pulmonary lesion severity was negatively correlated with alveolar macrophage (AM) in both PRRS and PRDC groups on 14 and 28 dpi. AM in BALc was less populated in PRDC group on 28 dpi compared to PRRS group. AM in BALc was significantly less populated in PRDC group on 28 dpi compared to 14 dpi. In addition, cytotoxic T lymphocyte (CTL) in BALc was higher populated in PRDC group on 14 dpi and 28 dpi compared to PRRS group. In the case of PBMC cytokine TNF-α, IFN-α, IL-1β, IFN-γ, FoxP3, and IL-2, the PRRS group showed higher expression than the PRDC group on 7 dpi, 14 dpi, 7 dpi, 14 dpi, 14 dpi, and 14 dpi, respectively. On the other hand, in the case of IFN-β, IL-6, IL-8, IL-4, and IL-17, the PRDC group showed higher PBMC cytokine expression at 14 dpi, 7 dpi, 14 dpi, 3 dpi, and 3 dpi, respectively, than the PRRS group. Based on these results, our study could characterize differential immune responses in pigs with PRRS or PRDC.

산지농경지에 투입되는 모재성토의 특성과 농업환경에 미치는영향 (Evaluation of the Dressed Soil applied in Mountainous Agricultural Land)

  • 주진호;박철수;정영상;양재의;최중대;이원정;김성일
    • 한국토양비료학회지
    • /
    • 제37권4호
    • /
    • pp.245-250
    • /
    • 2004
  • 강원도 고령지 밭작물 재배지역에서는 2-4년 주기로 대량의 모재성토를 시용하고 있으나 모재성토의 질과 이들이 토양환경과 수질에 미치는 악영향에 관한 연구는 매우 부족한 상황이다. 따라서 모재성토의 물리 화학적질 및 생물학적 질을 평가하고. 모재성토의 시용현황을 조사하고 이들이 토양환경에 미치는 영향을 알아보고자 본 연구를 수행하였다 모재성토 자체의 화학성은 매우 낮았으며, 특히 유효인산과 유기물 함량은 작물이 생육하기에 매우 부족한 값을 나타냈다. 토양의 생물학적 질 지표의 하나인 토양효소 활성 값에 있어서도 모재성토는 매우 낮은 값을 보였는데, phosphatase 활성의 경우 우리나라 밭토양 평균치의 1/3 정도의 값을 나타냈다. 자운리 지역의 토양 미생물 조사 결과 세균 사상균, 방선균의 개체수는 모재성토의 경우 밭토양에 비해 각각세균은 6-10배. 사상균은 3-4배, 방선균은 11-13배 정도 적은 미생물상을 나타냈다. 홍천군 자운리 지역의 영농활동 및 토양조사를 실시한 결과, 이 지역의 43%에 해당하는 농경지에 모재성토가 행해졌으며, 토양침식한계허용치인 $11.2MT\;ha^{-1}\;yr^{-1}$을 초과하는 농경지는 40%에 달하는 것으로 조사되었다. 침사지를 설치하여 침사지의 토양 유실 방지 효과 및 토양 유실량을 측정한 결과 모재성토를 시용한 농경지에 설치한 침사지에서의 토양유실은 모재성토를 시용하지 않은 농경지에 비해 6배 이상의 토양유실이 발생한 것으로 나타났다. 침사지 유역에서의 토양 유실발생량을 조사한 바에 의하면 동일한 밭일지라도 경사도, 경운방법, 토성 및 강우강도 등의 영향인자에 따라 변화가 매우 큰 것으로 나타났다.

Electron Beam 조사에 의한 인삼분말의 살균효과 (Sterilizing Effect of Electron Beam on Ginseng Powders)

  • 이미경;이무하;권중호
    • 한국식품과학회지
    • /
    • 제30권6호
    • /
    • pp.1362-1366
    • /
    • 1998
  • 전자가속기(electron accelerator)에서 발생되는 electron beam을 이용하여 인삼분말류에 대한 새로운 살균기법을 확보할 목적으로 시중에서 유통되고 있는 백삼 및 홍삼분말을 시료로 하여 그 살균효과를 감마선 조사법과 비교하였다. 백삼 및 홍삼 분말의 미생물 농도는 총세균이 $10^5\;CFU/g$ 수준이었고, 대장균군(coliforms)은 백삼분말에서는 시료 g당 $10^3\;CFU$ 수준으로 검출되었으나 홍삼분말에서는 음성으로 나타났다. Electron beam 조사에 따른 오염미생물의 살균효과는 호기성 총세균이 7.5 kGy, 곰팡이 및 대장균군이 2.5 kGy 이하의 조사선량으로써 미생물의 농도를 검출한계 이하로 살균시킬 수 있었고, 실온에서 4개월 간 저장후에도 미생물의 생육은 없었다. 초기 오염 총세균의 농도를 90% 사멸시키는데 필요한 조사선량($D_{10}$값), 즉 총세균의 방사선 감수성을 확인해 본 결과, 전자선은 $2.85{\sim}3.75\;kGy$, 감마선은 $2.33{\sim}2.44\;kGy$ 범위로 시료의 미생물 농도와 에너지의 종류에 따라 다소 다른 값을 나타내었으나 전자선은 감마선과 유사한 살균력을 나타내어 실용 가능성이 인정되었다.

  • PDF