• BMB Reports
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• 제38권5호
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• pp.624-631
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• 2005

Tuberculosis, caused by Mycobacterium tuberculosis, continues to be one of the main diseases to mankind. It is urgent to discover novel drug targets for appropriate antimicrobial agents against this human pathogen. The shikimate pathway is onsidered as an attractive target for the discovery of novel antibiotics for its essentiality in bacteria and absence in mammalian cells. The Mycobacterium tuberculosis aroE-encoded shikimate dehydrogenase was cloned, expressed and purified. Sequence alignment analysis shows that shikimate dehydrogenase of Mycobacterium tuberculosis exhibit the pattern of G-X-(N/S)-V-(T/S)-X-PX-K, which is highly conserved within the shikimate dehydrogenase family. The recombinant shikimate dehydrogenase spectrum determined by CD spectroscopy showed that the percentages for $\alpha$-helix, $\beta$-sheet, $\beta$-turn, and random coil were 29.2%, 9.3%, 32.7%, and 28.8%, respectively. The enzymatic characterization demonstrates that it appears to be fully active at pH from 9.0 to 12, and temperature $63^{\circ}C$. The apparent Michaelis constant for shikimic acid and $NADP^+$ were calculated to be about $29.5\;{\mu}M$ and $63\;{\mu}M$. The recombinant shikimate dehydrogenase catalyzes the substrate in the presence of $NADP^+$ with an enzyme turnover number of $399\;s^{-1}$. Zymological studies suggest that the cloned shikimate dehydrogenase from M. tuberculosis has a pretty activity, and the work should help in the discovery of enzyme inhibitors and further of possible antimicrobial agents against Mycobacterium tuberculosis.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제13권2호
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• pp.119-127
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• 1985

여러 가지 Escherchia coli 변이주의, glucose 와 ammonium염과 같은 간단한 기질로부터 방향족 아미노산 특히 phenylanine을 생합성하는 능력을 비교 검토한 결과 방향족 아미노산 생합성과정중 common pathway의 첫 번째 반응이 phenylanine 생합성에 가장 큰 영향을 준다는 것을 확인하였다. 따라서 관계효소인 DAHP synthase의 효소활성과 생합성에 관련된 각종 대사 제어작용을 효과적으로 제거시킴으로서 phenylalanine 생산량을 크게 높일 수 있었으며 더욱이 phenylalanine terminal pathway의 첫 단계 반응을 촉매하는 prephenate de-hydratase의 효소활성과 효소생합성에 관련된 제어 작용도 동시에 제거하면 phenylalanine생산이 상승적으로 증가됨을 보였다. 한편 방향족아미노산의 transport system에 관계하는 arop유전자의 변이는 phenylalanine생산을 크게 저하시키는 효과를 나타내었다.

• 농업과학연구
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• 제28권1호
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• pp.33-40
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• 2001

아직까지 시도된 바 없는 살균성 phenylthionocarbamate 유도체들의 phenyl-치환기가 변화함에 따라 TOPKAT 계산으로 예측된 다양한 급성 및 만성 독성값에 미치는 정량적인 분자구조와 독성과의 관계 (QSTRs)를 검토한 결과는 다음과 같다. (1) 기질분자의 구조변화에 따른 독성치와 그의 판별점수 (D.S.) 에 기초하여 분자 중 특정부분 (fragment)이 양 (+)의 값으로 독성에 기여하는 대체적인 순서는 Aro. C=C, -O-, -NH- 및 할로겐 (X) 원자의 순이었다. (2) 대부분의 화합물들은 매우 높은 돌연변이와 발암성이 예측되었으며 특히, 치환기의 위치에 관계없이 fluoro-치환체는 $B_2$상수에 따른 입체효과 ($(B_2)_{opt.}=1.54{\AA}$)에 의하여 모두 100% 돌연변이를 발현한 반면에 trifluorornethyl-치환체는 돌연변이 발현 가능성이 전혀 없었다. (3) 가장 높은 독성 발현조건은 phenyl-치환기에 대한 소정의 적정값으로 돌연변이성에는 $(B_2)_{opt.}=1.54{\AA}$, 발암성에서 수컷 rat와 mouse는$(R)_{opt.}=0.16$ 및 $(\pi)_{opt.}=0.16$ 그리고 rat의 경구독성은 $LD_{50};({\varepsilon}LOMO)_{opt}=-0.52e.v.$, chronic LOAEL; $(B_3){opt.}=1.54{\AA}$, 어독성은 ${LC_50}$; $(logP)_{opt.}=4.25$ 및 물벼룩에 대한 독성은 $EC_{50};({\sigma})_{opt}=-0.68$를 나타내는 경우 이었다. (4) 돌연변이성에는 할로겐 중, fluoro-기를 위시하여 nitro 및 methyl-기 등의 순서로 기여하였고 phenyl 고리 상, 치환기의 위치와 전자 수수관계에는 대체로 무관한 경향을 나타내었다.