• 제목/요약/키워드: argG

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Development of a Highly Active Fluorescence-Based Detector for Yeast G Protein-Coupled Receptor Ste2p

  • Hong, Jin Woo;Ahn, Hee Jun;Baek, Jee Su;Hong, Eun young;Jin, Dong Hoon;Khang, Yong Ho;Hong, Nam Joo
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제28권10호
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    • pp.1589-1603
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    • 2018
  • Twenty analogs of $[Orn^6,D-Ala^9]{\alpha}-factor$ were synthesized and assayed for their biological activities: seven analogs of $[Orn^6,X^9]{\alpha}-factor$, seven analogs of $[X^6,D-Ala^9]{\alpha}-factor$, five analogs of $[X^5,X^6,D-Ala^9]{\alpha}-factor$, and native ${\alpha}-factor$ (X = amino acids). Their biological activities (halo, gene induction, and affinity) were measured using S. cerevisiae Y7925 and LM102 and compared with those of native ${\alpha}-factor$ (100%). G protein-coupled receptor was expressed in strain LM102 containing pESC-LEU-STE2 vector. $[Dap^6,D-Ala^9]{\alpha}-factor$ with weak halo activity (10%) showed the highest receptor affinity (> 230%) and the highest gene induction activity (167%). $[Arg^6,D-Ala^9]{\alpha}-factor$ showed the highest halo activity (2,000%). The number of active binding sites per cell (about 20,000 for strain LM102) was determined using a newly-designed fluorescence-based detector, $[Arg^6,D-Ala^9]{\alpha}-factor-Edan$, with high sensitivity (12,500-fold higher than the absorption-based detector $[Orn^6]{\alpha}-factor-[Cys]_3$).

국내 6형 뮤코다당증의 임상 양상, 분자유전학적 특징 및 효소치료의 효과에 대한 고찰 (Clinical Features, Molecular Analysis, and Outcome of ERT in Korean Patients with Mucopolysaccharidosis Type VI)

  • ;김진섭;양아람;손영배;이범희;유한욱;조성윤;진동규
    • 대한유전성대사질환학회지
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    • 제16권1호
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    • pp.24-33
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    • 2016
  • 뮤코다당증 6형(Mucopolysaccharidosis type VI)은 ARSB 유전자의 변이로 인하여 dermatan sulfate 대사에 관여하는 arylsulfatase B 효소의 결핍으로 유발되는 상염색체 열성 리소좀 축적 질환이다. 본 연구는 국내에서 뮤코다당증 6형으로 진단된 3명의 환자를 대상으로 하였다 3명의 환자는 최초 진단 시 뮤코다당증 6형의 특징적인 증상인 저신장, 다발성 골형성 부전, 심장 판막 이상 및 각막 혼탁을 보였으며 이후 손목 터널 증후군 및 제한성 폐질환의 양상을 보였다. 모든 환자에서 소변의 GAG (glycosaminoglycan)는 증가되어 있었으며 피부 섬유아세포 또는 백혈구에서 측정한 arylsulfatase B는 모두 감소되어 있었고 중합효소 연쇄반응-염기서열분석법에 의한 ARSB 유전자 검사에서는 c.200T>G (p.Ile67Ser), c.982G>A (p.Gly328Arg), c.571C>T (p.Arg191*), c.1054G>A (p.Asp352Asn)의 이형접합체 돌연변이 및 c.512G>A (p.Gly171Asp) 동형접합체 돌연변이를 발견할 수 있었다. recombinant human Arylsulfatase B (rhASB)를 통한 효소 대체 치료는 2008년부터 국내에서도 허가되었으며 효소대체치료 시행 후 소변 GAG (glyco-saminoglycan)는 감소하였으며 관절 운동 및 지구력은 향상되었다. 그러나 관절 침범 및 각막 혼탁, 심장 및 폐 침범 소견은 호전되지 않았다. 본 연구는 뮤코다당증 6형의 특징적인 증상을 보였으며 생화학적 검사 및 분자유전학적 검사를 통해 뮤코다당증 6형으로 확진된 3명의 환자를 대상으로 시행한 효소대체치료의 효과를 보고하는 바이다.

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A case of Galloway-Mowat syndrome with novel compound heterozygous variants in the WDR4 gene

  • Kim, Hamin;Lee, Hyunjoo;Lee, Young-Mock
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제17권2호
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    • pp.97-101
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    • 2020
  • The combination of central nervous system abnormalities and renal impairment is a notable characteristic of Galloway-Mowat syndrome (GAMOS), a disease which often accompanies microcephaly, developmental delay, and nephrotic syndrome. Many subtypes exist having various phenotypes and genotypes, and many genetic causes are still being identified. An 18-month-old boy first visited our clinic for seizure, delayed development, and microcephaly. During follow-up visits he developed proteinuria and nephrotic syndrome at the age of 6. Nephrotic syndrome became refractory to treatment. These phenotypes were suggestive of GAMOS. Next generation sequencing was performed for genetic analysis and revealed novel compound heterozygous variants in the WDR4 gene: c.494G>A (p.Arg165Gln) and c.540C>G (p.Ile180Met). This is the first case in Korea of GAMOS involving the WDR4 gene.

한국에서 분리된 리팜핀 내성 균주에서의 리파부틴 감수성 정도 및 관련 rpoB 유전자 돌연변이의 특성에 관한 연구 (The Proportion of Rifabutin-susceptible Strains among Rifampicin-resistant Isolates and Its Specific rpoB Mutations)

  • 류우진;박영길;김희진;장철훈;배길한;김성규
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제59권3호
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    • pp.257-265
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    • 2005
  • 연구 배경 : 리팜핀 내성 균주에서 리파부틴 약제의 교차 내성정도와 리팜핀 내성-리파부틴 감수성 결핵균의 rpoB 유전자 돌연변이의 특성을 알아보고자 연구를 실시하였다. 연구 방법 : 감수성검사에서 리팜핀에 내성인 균주를 선정하여 리파부틴 농도 $0-80{\mu}g/ml$ 농도로 재접종하여 감수성 여부를 확인하였다. 리팜핀-내성균주 모두 염기서열 분석을 통하여 리파부틴 감수성과의 관계를 조사하였다. 역교잡 방법으로 리파부틴 감수성균을 구별하였다. 연구 결과 : 우리나라에서 분리된 리팜핀 내성인 201균주 중에서 41균주(20.4%)는 리파부틴에 감수성을 보였다. 리파부틴 감수성을 보이는 rpoB 유전자 돌연변이는 Leu511Pro, Ser512Arg, Gln513Glu, Asp516Ala, Asp516Gly, Asp516Val, Asp516Tyr, Ser522Leu, His526Asn, His526Leu, His526Cys, Arg529Pro, Leu533Pro 등 이었다. 역교잡 방법을 이용하였을 경우 rpoB 돌연변이를 가진 균주 중에서 리파부틴 감수성균의 민감도는 92.5%이었고, 특이도는 96.1%이었다. 결 론 : 리팜핀 내성균이라도 약 20.4% (95% 신뢰구간: 14.8% to 26.0%)가 리파부틴 약제에 감수성이므로, 우리나라의 다제내성 결핵환자의 치료에서도 리파부틴이 중요한 약제로서 역할을 할 수 있음이 밝혀졌다. 향후 다제내성 결핵 환자에서의 리파부틴의 치료 효과에 대한 임상적 연구가 필요하다.

치아 씨앗으로부터 분리한 단백다당체의 성분분석과 보습 효과 (Moisturizing Effects and Composition Analysis of Proteoglycan Isolated from Chia (Salvia hispanica) Seed)

  • 이범천;주철규;허지연;이근하;김영진;이찬우;김진웅;박용일;김현숙;최태부
    • 대한화장품학회지
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    • 제36권2호
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    • pp.121-128
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    • 2010
  • 본 논문에서는 치아 씨앗으로부터 분리한 단백다당체(proteoglycan)의 성분분석과 분자량 측정 및 피부보습 효과를 연구하였다. 분리된 단백다당체의 성분분석 결과 치아 씨앗 단백다당체를 이루고 있는 당 성분(%)은 galactose (46.8), glucuronic acid (27.1), rhamnose (8.7), xylose (7.6), glucose (4.9), fructose (2.3), mannose (1.8), arabinose (0.9)로 확인되었으며, 함유된 단백질의 함량은 31.3 mg/g으로 이를 구성하는 아미노산 성분(mg/g)은 Asp (1.9), Glu (3.6), Ser (0.9), Gly (3.6), Thr (0.8), Arg (1.0), Ala (2.0), Tyr (0.4), Cys (4.8), Val (1.1), Phe (0.5), Ile (0.6), Leu (0.9)로 확인 되었다. Gel permeation chromatography (GPC)에 의해 측정한 치아 씨앗 단백다당체의 분자량 범위는 100,000~250,000 Da로 분자량 분포에 의한 평균 분자량은 170,000 Da이었다. 또한, 사람을 이용한 피부수분 보유 효과 및 피부 수분 손실량을 평가한 결과, 피부의 수분함량을 유지하는 효과가 우수하였으며 표피 수분 손실량 또한 적어서 피부 보습제로서 매우 우수하였다. 결론적으로 치아 씨앗의 다당체로부터 분리한 단백다당체를 화장품에 응용하면 우수한 보습효과를 가지는 화장품을 개발 할 수 있을 것으로 사료된다.

New Cytotoxic Benzopyrans from the Leaves of Mallotus apelta

  • Kiem Phan Van;Dang Nguyen Hai;Bao Ha Viet;Huong Hoang Thanh;Minh Chau Van;Huong Le Mai;Lee Jung Joon;Kim Young Ho
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제28권10호
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    • pp.1131-1134
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    • 2005
  • Two new benzopyrans 6-[1'-oxo-3'(R)-hydroxy-butyl]-5,7 -dimethoxy-2,2-dimethyl-2H-1-ben-zopyran (1) and 6-[1'-oxo-3'(R)-methoxy-butyl]-5,7 -dimethoxy-2,2-dimethyl-2H-1-benzopyran (2) were isolated from the leaves of Mallotus apelta Muell.-Arg., (Euphorbiaceae). Their chemical structures were elucidated by spectroscopic analyses, especially by 1D-, 2D-NMR and MS spectra. Compound 1 was found to have strong cytotoxic effect against two human cancer cell lines as human hepatocellular carcinoma (Hep-2, $IC_{50}\;:\;0.49\;{\mu}g/mL$) and rhabdosarcoma (RD, $IC_{50}\;:\;0.54\;{\mu}g/mL$), while compound 2 showed moderate activity against Hep-2 cell line ($IC_{50}\;:\;4.22\;{\mu}g/mL$) by in vitro assay.

발아에 의한 유채의 아미노산 및 비타민 함량의 조성변화 (Study on the Chemical Change of Amino Acid and Vitamin of Rapeseed during Germination)

  • 김인숙;한성희;한강완
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제26권6호
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    • pp.1058-1062
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    • 1997
  • The objective of this was to investigate the technical feasibility of producing toxicant-free by germination. To this end, rapeseed(Brassica napus L.) was germinated at $25^{\circ}C$ for 120 hours, and the chemical compositions of amino acids and vitamins were determinated in every 24 hours during germination. The results obtained are summarized as follows: Before germination, rapeseed contained 5.4g/16g N of glutamic acid and high percentage of the other amino acids in order of Asp>Leu>His>Pro>Arg>Lys>Gly>Ser>Ala>Val. The amino acids were gradually decreased until 96 hours during germination had tendency to show a slight increase in 120 hours. Vitamin B$_1$, B$_2$and C contents in rapeseed before germination were found to be 0.11, 0.21 and 3.72mg% respectively, and the vitamin E was 423ug/g. The vitamin C greatly increased in 72 hours during germination, while the vitamin B group was drastically decreased in 72 hours. The results obtained by this method clearly demonstrate that germination process is very effective to the removal of toxicants in rapeseed.

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국내에서 분리된 다제 내성 결핵균의 katG 와 inhA 변이 다양성 및 그 빈도 (Mutations of katG and inhA in MDR M. tuberculosis)

  • 림해화;김희연;윤여준;박찬근;김범준;박영길;국윤호
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제63권2호
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    • pp.128-138
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    • 2007
  • 연구배경: INH 내성은 katG 와 inhA(ORF와 promoter)의 변이에 의한 것으로 알려져 있다. 유전자 변이는 지역적으로 종류와 빈도가 다르게 나타날 수 있는데 기존 국내의 연구보고들은 흔하다고 알려진 katG의 463 코돈만을 추적한 것들이었다. 따라서 본 연구는 국내에서 분리된 INH 내성균들의 두 유전자에서 나타날 수 있는 변이의 종류와 빈도를 확인하고자 하였다. 연구방법: 대한결핵협회 결핵연구원에서 MDR-TB로 판명된 INH 내성 결핵균 29주로부터 bead beater-phenol법으로 DNA를 추출하여 katG(2,223 bp), inhA ORF(-77~897, 975 bp) 및 inhA promoter(-168~80, 248 bp) 염기서열 결정 및 분석은 ABI PRISM 3730 XL Analyzer 및 MegAlign package를 사용하였다. 결과: 모든 균주들은 분석 표적으로 사용한 세 유전자 부위 중에서 적어도 한 개 이상의 유전자 부위에 변이가 있었다. INH 내성균은 거의 대부분(>93%) katG의 변이를 갖고 inhA 유전자 변이만 있는 경우는 드물어 INH 내성을 결정하는 중요한 요인은 katG의 변이 인 것을 확인할 수 있었다. katG 부위에서 Arg463Leu 변이와 Ser315Thr 변이가 높은 빈도(62.1% 및 55.2%)로 발견되었고, katG 완전결실과 inhA promoter-15($C{\rightarrow}T$) 변이도 일정한 빈도로 나타남을 볼 수 있었다. 그 외 inhA ORF 변이도 1주에서 1종류의 변이가 발견되었다. 결론: 기존 연구결과에서는 보고되지 않고 본 연구에서 처음으로 확인된 변이들도 14 종류나 있어서, INH 내성은 주로 katG 혹은 일부 inhA 특정 부위의 변이가 주도하지만 이들 외에도 다양한 변이가 존재한다는 것을 알 수 있었다. 이들 새로이 확인된 변이들은 염기서열 분석에 의한 INH 내성 여부 판단 시, 기존 알려진 변이 외에 보조 자료로 사용할 수 있을 것으로 생각한다.

Polymorphic Diversity of UBX Domain D from cDNA Isolated from Pectoral Muscle of Korean Native Chicken

  • Sun, Sang-Soo;Kamyab, Abdolreza;Firman, Jeff
    • 한국가금학회지
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    • 제38권3호
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    • pp.191-195
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    • 2011
  • The objectives of this study are to identify specific functional genes which are related with growth and protein structure of the pectoral muscle of Korean native chicken. Pectoral muscle was isolated from three Korean native chickens (KNC, red brown, 12 months old, 2.41 ${\pm}$ 0.24 kg) and three Cornish chickens (16 month old, 2.76 ${\pm}$ 3.0 kg). The subtraction cDNA library was prepared in PCR4 Blunt-TOPO vector. The DNA sequence homology was compared with other breeds and species in GenBank. A clone NDS-81 was found to be unique for the DNA sequence homology with UBX family. Their partial sequence has high homology (98%) with chicken UBX domain D. Chicken UBX domain has chicken (93%), cattle (68%), dog (67%), mouse (64%) and, human (63%) nucleotide sequence homology. Several regions were mutated from T in chicken to C or G in the NDS-81 clone. The first site is LAD in chicken, but it was expressed as (L)RM in clone NDS-81. In this site, amino acids were changed from Ala to Arg, and from Asp to Met. The second site was changed from ER (Arg) in chicken to ED (Asp) in clone NDS-81. They are both containing functional side chains and play an important role in binding other proteins. Therefore, the clone NDS-81 could be a different candidate gene for the UBX family gene and could related with pectoral muscle structure of Korean native chicken.

Recombinant Glargine Insulin Production Process Using Escherichia coli

  • Hwang, Hae-Gwang;Kim, Kwang-Jin;Lee, Se-Hoon;Kim, Chang-Kyu;Min, Cheol-Ki;Yun, Jung-Mi;Lee, Su Ui;Son, Young-Jin
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제26권10호
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    • pp.1781-1789
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    • 2016
  • Glargine insulin is a long-acting insulin analog that helps blood glucose maintenance in patients with diabetes. We constructed the pPT-GI vector to express prepeptide glargine insulin when transformed into Escherichia coli JM109. The transformed E. coli cells were cultured by fed-batch fermentation. The final dry cell mass was 18 g/l. The prepeptide glargine insulin was 38.52% of the total protein. It was expressed as an inclusion body and then refolded to recover the biological activity. To convert the prepeptide into glargine insulin, citraconylation and trypsin cleavage were performed. Using citraconylation, the yield of enzymatic conversion for glargine insulin increased by 3.2-fold compared with that without citraconylation. After the enzyme reaction, active glargine insulin was purified by two types of chromatography (ion-exchange chromatography and reverse-phase chromatography). We obtained recombinant human glargine insulin at 98.11% purity and verified that it is equal to the standard of human glargine insulin, based on High-performance liquid chromatography analysis and Matrix-assisted laser desorption/ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry. We thus established a production process for high-purity recombinant human glargine insulin and a method to block Arg (B31)-insulin formation. This established process for recombinant human glargine insulin may be a model process for the production of other human insulin analogs.