• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제20권12호
• /
• pp.1735-1743
• /
• 2010

The full-length genes gyrB (2,415 bp), parC (2,277 bp), and parE (1,896 bp) in Edwardsiella tarda were cloned by PCR with degenerate primers based on the sequence of the respective quinolone resistance-determining region (QRDR), followed by elongation of 5' and 3' ends using cassette ligation-mediated PCR (CLMP). Analysis of the cloned genes revealed open reading frames (ORFs) encoding proteins of 804 (GyrB), 758 (ParC), and 631 (ParE) amino acids with conserved gyrase/topoisomerase features and motifs important for enzymatic function. The ORFs were preceded by putative promoters, ribosome binding sites, and inverted repeats with the potential to form cruciform structures for binding of DNA-binding proteins. When comparing the deduced amino acid sequences of E. tarda GyrB, ParC, and ParE with those of the corresponding proteins in other bacteria, they were found to be most closely related to Escherichia coli GyrB (87.6% identity), Klebsiella pneumoniae ParC (78.8% identity), and Salmonella Typhimurium ParE (89.5% identity), respectively. The two topoisomerase genes, parC and parE, were found to be contiguous on the E. tarda chromosome. All 18 quinolone-resistant isolates obtained from Korea thus far did not contain subunit alternations apart from a substitution in GyrA (Ser83$\rightarrow$Arg). However, an alteration in the QRDR of ParC (Ser84$\rightarrow$Ile) following an amino acid substitution in GyrA (Asp87$\rightarrow$Gly) was detected in E. tarda mutants selected in vitro at $8{\mu}g/ml$ ciprofloxacin (CIP). A mutant with a GyrB (Ser464$\rightarrow$Leu) and GyrA (Asp87$\rightarrow$Gly) substitution did not show a significant increase in the minimum inhibitory concentration (MIC) of CIP. None of the in vitro mutants exhibited mutations in parE. Thus, gyrA and parC should be considered to be the primary and secondary targets, respectively, of quinolones in E. tarda.

• 한국수산과학회지
• /
• 제27권5호
• /
• pp.509-514
• /
• 1994

키조개 부산물을 이용하여 속성 젓갈화를 시도하였다. 마쇄한 키조개부산물에 Protin P $5\%$를 가하여 pH 7.0, $55^{\circ}C$에서 1시간 동안 가수분해시킨 후 불활성화를 위하여 $100^{\circ}C$에서 40분간 열처리시키되, 풍미를 개선하기 위하여 $10\%$의 invert sugar를 첨가하였다. 또한 제품의 물성개선을 위하여 PGDG을 $8\%$ 가하여 유화시킨 후 $2\%$의 한천과 $6\%$의 전분을 함께 첨가하여 조직감을 갖는 반고형 상태로 하고 최종적으로 식염농도를 $15\%$로 조절하였다. 시료로 사용한 키조개부산물은 패주를 제외한 나머지 부분으로 전내용고형물 중량의 $51.6\%$를 차지하였다. 풍미개선을 위하여 $10\%$의 invert sugar를 첨가하여 열처리한 것이 비린내와 쓴맛을 억제시켰다. 또한 한천 $2\%$ 및 전분 $6\%$의 첨가는 대조구에 비하여 hardness, springiness 및 chewiness를 개선시키는 효과를 보였다. 그리고 $23{\pm}3^{\circ}C$에서 저장하였을 때 생균수는 60일째까지 검출되지 않았다. 키조개부산물로 제조한 젓갈중의 주요 아미노산들로는 Glu, Arg, Asp, Leu, Lys, Gly 및 Ala 순으로, 전체 유리아미노산 함량의 $60\%$ 이상을 차지하였고, 저장 90일후에도 양적순서와 함량이 크게 변하지 않았다.

• 대한유전성대사질환학회지
• /
• 제21권1호
• /
• pp.22-27
• /
• 2021

프로피온산혈증은 PCCA 및 PCCB 유전자의 돌연변이로 발생하며 대사산물의 축적으로 신생아기부터 근긴장 저하, 구토, 케톤산증, 고암모니아혈증, 경련 등이 나타나 사망에 이를 수 있고, 비교적 후기에 신경학적 증상과 함께 발현하는 경과를 보이기도 한다. 저자들은 특별한 과거력 없이 지내던 중 확장성 심근병증이 확인된 16세 남아에서 유전자 검사로 프로피온산혈증이 진단된 1례를 보고하는 바이다.

• 한국잠사곤충학회지
• /
• 제16권1호
• /
• pp.21-48
• /
• 1974

본 연구는 fibroin을 피복하여 견섬유의 경막적 성질을 지배하는 sericin에 대한 일연의 연구를 수행하여 다음과 같은 결론을 얻었다. I. Sericin Fraction의 물리화학적 특성에 관한 실험 1) 난용성 sericin은 역용성 sericin에 비하여 polar side chain을 가진 amino산(Tyr, Ser)은 적은 반면 alanine과 leucine 등의 수화성이 적은 amino산이 측정되었다. 2) 수화성의 amine산은 견사의 외층부에서, 그리고 수화성이 적은 amino산은 fibroin에 가까운 부위에 많이 존재하였다. 3) 용수에 대한 sericin의 팽윤, 용해성은 alnino산 조성만으로 해석하기는 곤란하며 sericin의 결정구조나 이차구조와의 복합구조로 변화한다고 생각된다. 4) 견사의 간섭은 환상에 가까우나 정연처리로서 소멸하였다. 5) 작잠견 sericin은 가잠견 sericin과 차이가 있었는데 자오선상에 강한 환상 Ring이 많았다. 6) Mosher 법으로 분별한 A와 B fraction 사이의 amino산 조성에는 차이가 없었다. 7) Sericin I, II, III의 X-선도에 있어서는 큰 차이는 인정되지 않으나 측쇄간격에 해당 하는 Ring에서 차이가 인정되었다. 8) 분자량 150이상의 amino산(Cys, Tyr, Phe, His,Arg)은 6N-HCl, 60분의 가수분해로서 정양되지 않았다. 9) 4.6$\AA$의 X-선 간섭은 습열과 ether 및 alcohol로 처리하므로서 소멸하는 경향이었다. 10) sericin의 가수분해물(6N-HCl)은 자오선상에 간섭 Ring(2$\AA$)을 출현시켰다. 11) 가수분해 sericin 잔사는 어느 특정한 amino산의 peptide로 추정된다. 12) Seriein III의 분해온도는 Sericin I과 II보다 높았다. 13) 견층 부위별 sericin의 D.T.A 곡선에 었어서, 내층의 sercin은 15$0^{\circ}C$와 245$^{\circ}C$에서 흡열 peak가 나타나고 외, 중층의 것보다 고온측에 이동하였다. 14) IR-spectrum에 의한 sericin fraction(Sericin I, II, III, 외층, 중층 및 내층의 sercin)의 적외선흡수 결과는 일치하였다. II. 제사공정에서의 Sericin의 팽윤, 용해특성에 관한 실험 1) 3,000 R.P.M으로 침지처리된 견층의 자유성수분은 15분간으로 탈수가 가능하고 이 경우의 원심력은 13$\times$$10^4$dyne/g 이었다. 2) sericin에 대한 Folin시약의 발색에 필요한 시간은 실온에서 30분이었다. 3) 가시광선중 측정가능파장은 500~750m$\mu$이다. 4) 실제 비색정량의 경우 정도가 높은 측정치를 얻기 위해서는, 저농도(10$\mu\textrm{g}$/$m\ell$)인 때는 650m$\mu$에서 그 이상의 농도에서늘 500m$\mu$으로 측정해야 했다. 5) sericin과 egg albumin의 파장별 흡광도곡선형은 일치하나 흡광도는 sericin이 높았다. 6) 비색분석법에 의하여 측정된 sericin의 량은 Kjeldahl 법에 비해 적은 값을 나타냈다. 7) 견층의 팽윤, 용해도에 영향하는 처리조건으로서는 온도와 시간으로서 시간보다도 온도의 방과가 켰다. 8) 팽윤, 용해도를 촉진하는 처리온도와 시간과의 관계는 저온(7$0^{\circ}C$)에서는 시간의 증가에 따라서 팽윤, 용해도는 서서히 증대하나 고온에 있어서는 단시간의 처리로 현저히 증대했다. 9) 생견의 건조온도가 높아지면 견층의 팽윤, 용해도는 반대로 감소했다. 10) 견층의 두께가 크게 되면 일정시간에 있어서의 팽윤, 용해성은 저하하였다. 11) 견층부위별 팽윤, 용해성은 외>중>내층의 순이고 품종에 따라서는 견층부위별로 차이가 있었다. 12) 견층의 납물질제거처리를 하게 되면 sericin의 팽윤, 용해성은 대조구에 비해 감소하였다. 13) 음 ion 활성제는(pH 6.0 부근) sericin의 팽윤, 용해도를 촉진시켰다. 14) 양 ion 활성제는 위와 같은 조건에서 sericin 의 흡착현상을 나타내었다. 15) 경도성분(Ca, Mg)의 농도가 증가하면, 용수의 pH는 발성방향으로 이동하였다. 16) 용수중의 경도성분과 sericin과는 서로 완충작용을 나타내었다. 17) Ca와 Mg의 경도성분이 sericin의 팽윤, 용해에 미치는 영향을 비교하면 Ca 성분이 팽윤, 용해를 억제하였 다. 18) 용수중의 경도성분의 용존은 전기전도도를 증가시켰다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
• /
• 제22권1호
• /
• pp.99-106
• /
• 2009

For Exp. 1, 120 ((Yorkshire${\times}$Landrace)${\times}$Duroc) weaned pigs (7.96${\pm}$0.01 kg average initial BW, 21 days weaning) were used in a 28 d-growth assay to determine the effects of replacing soy protein concentrate (SPC) with fermented soy protein (FSP) in a starter diet (d 0 to 7) on the growth performance, apparent fecal amino acid digestibility and subsequent performance in weaned pigs. Dietary treatments included: i) FSP0 (basal diet; whey-skim milk powder-SPC based diet); ii) FSP5 (replacing SPC with 5% FSP); iii) FSP10 (replacing SPC with 10% FSP). Pigs were fed the phase I diet for 7 days, and then each group was fed a common commercial diet for 21 days to determine the effect of previous diet on subsequent performance. Average daily gain (ADG) from d 5 to 7 (linear effect, p = 0.01) and d 7 to 14 (linear effect, p<0.001) were increased as FSP level increased. The pigs fed with FSP was heavier than the pigs fed with SPC at d 5 to 7 and d 7 to 14 after weaning (p<0.05). In the entire period (d 0 to 28), there were no significant differences in weight gain and final weight between SPC and FSP diets (p>0.05). Average daily feed intake (ADFI) was higher in pigs fed with the 5% FSP diet than those fed with the other diets at d 0 to 2 post-weaning (quadratic effect, p = 0.05). Also, for the entire period of phase I (d 0 to 7), pigs consumed more 5% FSP diet compared to other treatments (quadratic effect, p = 0.03). Gain/feed (G/F) was not affected by dietary SPC or FSP in phase I and subsequent periods, but G/F from d 5 to 7 after weaning was improved linearly (p = 0.04) as dietary FSP level increased. Pigs fed with 10% FSP also improved G/F compared with those fed only SPC (p<0.05). At d 7, there were linear increments in fecal dry matter (DM) (p<0.1) and nitrogen (N) (p<0.01) digestibilities as the dietary FSP level increased. The digestibilities of fecal essential and total amino acids were increased as the FSP level increased (linear effect, p<0.1). For Exp. 2, three ((Yorkshire${\times}$Landrace)${\times}$Duroc) weaned barrows (average initial BW of 7.32 kg) were surgically fitted with a simple T-cannula approximately 15 cm prior to the ileo-cecal junction. The experimental designs were 3${\times}$3 latin squares with pigs and periods as blocking criteria. Dietary treatments and composition were the same as in Exp. 1. Apparent ileal N digestibility was increased as FSP level was increased (linear effect, p<0.05). The dietary treatments (SPC and FSP) did not affect apparent ileal DM digestibility (p>0.05). Among essential amino acids, apparent digestibility of ileal arginine (Arg), lysine (Lys), methionine (Met) and phenylalanine (Phe) were improved as the FSP level increased (linear effect, p<0.1). Also, apparent ileal total essential, non-essential and total amino acid digestibilities were increased linearly (p<0.1). In conclusion, replacing SPC with fermented soy protein appeared beneficial in growth performance, N and amino acid digestibility during the early 7 days after weaning, and an equivalent effect showed on growth performance in subsequent period of 7 to 28 days after weaning.

• 대한수의학회지
• /
• 제35권2호
• /
• pp.327-336
• /
• 1995

This study was carried out to develop the animal protein(feed for fry) that was isolated, purified and lyophilized the rumen ciliates from the healthy rumen contents which have $10^5-10^6/g$ ciliates and were discarded in abattoirs. The rumen ciliates are non-pathogenic, anaerobic and the weight of this protozoa is 2% of rumen content. The rumen protozoan and bacterial proteins both have a biological value for rats of 80-81, which is higher than the 72 of brewer's yeasts. Furthermore, the true digestibility and net protein utility of the protozoan protein are 91 and 73, much higher than those of bacterial(74 and 60) or yeast(84 and 60) proteins. The amino acids of rumen protozoa is nutritionally superior than the others. The size of rumen ciliates is $30-200{\times}20-110{\mu}m$ and so we had isolated and purified the rumen ciliates from the rumen contents by the physical methods. The purified rumen protozoa was lyophilized with freezing dryer. The results of this experiment were as follows : 1. Population dynamics of protozoan ciliates in slaughtered rumens; % of samples which small ciliates were predominated was 82.5%(52/63) and that of large ciliates was 17.5%(11/63). 1) predominant species of small ciliates were Entodinium ovinum and E nanellum. 2) predominant species of large ciliates were Epidinium ecaudatum and Diploplastron affine. 2. The lyophilized rumen ciliates which were isolated and purified from 1 kg of rumen content at the pH 6.2-6.8 was about 7.0 gram. 3. The nutrient analysis of lyophilized rqmen ciliates(LRC) was as follows: 1) Proximate analysis of the LRC and the composition of fry feed; moisture 8.05%(below 10.0), protein 35.37%(45), fat 5.39%(4.5), fiber 1.23%(below 2.5), ash 2.25%(below 15.0), Ca 0.26%(below 2.0), P 0.14%(below 1.1), energy 4,608.11(fish meal 5000 cal/g) 2) Amino acids (% in crude protein) of the LRC and the rotifer(Brachionus plicatilis); Arg 5.19%(4.50), His 2.50%(1.55), Ile 5.29%(3.45), Leu 8.11%(5.85), Lys 10.34%(6.15), Met 2.25% (0.85), Phe 5.66%(3.80), Thr 5.14% (3.45), Val 4.18%(3.90), Ala 4.13%(3.35), Asp 13.26%(8.25), Glu 16.62%(9.20), Gly 4.23%(3.10), Pro 3.25%(5.05), Ser 4.85%(3.85), Tyr 5.04%(3.05) 3) Fatty acids(% in fat) of the LRC and the rotifer(biological feed ; Brachionus plicatilis); myristic acid(C14:0) 3.27%(0.3), myristoleic acid(C14:1) 0.83%(-), palmitic acid(C16:0) 39.11% (23.5), palmitoleic acid(C16:1) 2.81%(2.0), stearic acid(C18:0) 9.36%(5.6), oleic acid(C18:1) 25.54%(3.5), linoleic acid(C18:2) 15.05%(32.9), linolenic acid(C18:3) 1.74%(9.8). Judging from the above investigated results, the analytical data of proximate analysis, amino acids, fatty acids of the purified and lyophilized rumen protozoa are reasonable for the feed of freshwater fishes(fry and fingerling). But it was disappointed of our expectation that the crude protein of lyophilized rumen ciliates contains low percentage, it was thought that because of the small ciliates(starch digester) in beef cattle rumens which were administered the concentrated feed, is much difficult to isolate and purify than the large ciliates(fiber digester).

• Clinical and Experimental Pediatrics
• /
• 제48권10호
• /
• pp.1068-1075
• /
• 2005

목 적 : 성장호르몬 분비를 촉진하는 ghrelin는 여러 질병에서의 역할은 아직까지 잘 알려져 있지 않았다. 그러나 최근에 ghrelin 유전자 변이가 비만과 당뇨병과 관련이 있는 것으로 알려졌다. 현재까지 보고된 ghrelin 유전자 이상으로는 SNP인 Arg51Gln, Leu72Met, G274A가 있으며 이중 가장 흔한 이상인 Leu72Met 변이이다. 일반적으로 ghrelin 유전자의 Leu72Met와 같은 diallelic 다형성을 스크리닝하는데 SSCP, RFLP, sequencing 등이 사용되어 왔으나 향후 비만 환자들에서 가장 효과적이고 정확하게, 손쉽게 ghrelin 유전자의 Leu72Met 다형성 분석을 검출할 수 있는 스크리닝 방법을 찾아 임상적 적용에 이용하고자 하였다. 방 법 : 비만소아에서 ghrelin 유전자의 Leu72Met 다형성 분석을 PCR-RFLP, PCR-SSCP와 ARMS 분석 방법을 이용하여 비교분석하고 이들의 검사방법의 장단점을 알아보았다. 결 과 : PCR-RFLP, PCR-SSCP와 ARMS 분석 모두에서 allele 특이산물의 밴드가 뚜렷이 구별할 수 있었으며 상기 방법에 의한 결과는 모두에서 일치하였다. PCR-SSCP 방법은 점돌연변이의 존재 여부를 많은 시료를 대상으로 쉽게 분자학적 스크리닝할 수 있는 장점이 있으나 조작이 간단하지 않고 비용부담이 많다. BsrI 제한효소를 이용한 PCR-RFLP법은 비교적 용이하고 간단하여 널리 쓰이는 방법이지만 충분한 고농도의 DNA가 필요하며 전기영동 결과의 올바른 해석이 쉽지 않았다. 이에 비하여 ARMS 분석법은 위의 방법들보다는 간편하여 검사의 소요시간도 짧으며, 검출률이 높고 결과 해석이 매우 쉬웠다. 결 론 : 따라서 본 실험에서 시행한 ghrelin의 Leu72Met 유전자의 다형성을 결정하는 방법 중에는 ARMS 분석법이 정확하고 검사 분석법 및 결과 해석이 매우 쉽고 검사의 소요시간도 짧아 대량 검체에 적용에 매우 효과적으로 사료된다.

• 한국패류학회지
• /
• 제31권2호
• /
• pp.93-101
• /
• 2015

본 연구는 3년산 북방전복을 해상가두리에서 1년 동안 수용밀도별로 양식순기에 따라 사육하여 성장 및 생존율 조사를 통해 적정 수용밀도를 구명하고 생산성을 향상시키고자 수행하였다. 해상가두리 ($2.4{\times}1.2m$) 내 수용밀도는 셀터 단면적 (square meter, $m^2$, sq m) 당 점유율로 15, 30, 45, 60 percentage (= per)/sq m로 설정하여 2반복으로 실시하였다. 사육기간 동안 수온은 $8.2^{\circ}C-22.1^{\circ}C$, 염분은 평균 $33.5{\pm}0.6psu$, 용존산소는 평균 $7.87{\pm}0.86mg/L$이었다. 월별 각장변화에서는 2014년 5월, 7월부터 10월, 2015년 4월에 15 per/sq m, 30 per/sq m가 45 per/sq m, 60 per/sq m보다 유의적으로 높았다 (P < 0.05). 각장의 FML, AGR, DGR, SGR과 각폭의 FMB, AGR, DGR은 15 per/sq m와 30 per/sq m는 45 per/sq m, 60 per/sq m보다 유의적으로 높았고 (P < 0.05), 각폭의 SGR에서 60 per/sq m는 모든 실험구 보다 낮았다 (P < 0.05). 중량에 대한 FMW, WG, DWG, SWG에서도 같은 결과를 나타내었다 (P < 0.05). 생존율에서는 15 per/sq m, 30 per/sq m가 50%이상으로 45 per/sq m, 60 per/sq m 보다 유의적으로 높았다 (P < 0.05). 따라서, 본 실험결과 70 mm 이상의 3년산 북방전복의 해상가두리 내 적정 수용밀도는 셀터 총 단면적 기준으로 15 per/sq m ($2.4{\times}2.4m$, 1칸 당 354마리) 가 빠른 성장과 생존율을 위한 적정 수용밀도지만 경제성을 고려할 경우 30 per/sq m ($2.4{\times}2.4m$, 1칸 당 710마리) 수용해야 한다.