• 제목/요약/키워드: antigenic determinant

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2019년부터 2023년까지 국내에서 분리된 참돔이리도바이러스의 계통 분류 및 항원 결정기 예측 (Phylogenetic analysis and antigenic determinant prediction of red sea bream iridovirus isolated in Korea from 2019 to 2023)

  • 김국현;민준규;정현도;김광일
    • 한국어병학회지
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    • 제37권1호
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    • pp.25-36
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    • 2024
  • In this study, we analyzed the phylogenetic classification, epitope prediction, and pathogenicity of red sea bream iridovirus (RSIV) isolated from rock bream between 2019 and 2023. Phylogenetics based on genes encoding MCP and ATPase indicated that all five RSIV isolates belonged to RSIV subtype II. The deduced amino acid sequence of the MCP for the amplicons (1362 bp) obtained from RSIV isolates had a length of 453 amino acids. Among these, the amino acid sequences of the RSIV-19, 21, 22, and 23 isolates showed 100% identity, while the RSIV-20 isolate showed 99.78% identity with one residue difference at position 306. As a result of antigenicity analysis based on amino acid sequence, the antigenicity score of the RSIV-20 isolate was 0.6386 and the other RSIV isolates were 0.6365. Additionally, the prediction of their antigenic determinants resulted in a total of 17 identical antigenic plots. When each RSIV was inoculated into rock bream, no significant differences were observed with 100% cumulative mortality in all groups. This study provides data on the potential for genetic variation of RSIV isolated in the same marine area over the past five years, and the antigenicity and pathogenicity results of each isolate are expected to be useful information for selecting future vaccine strains.

종특이 단세포군항체에 반응하는 간흡충의 당질항원 한 가지 (A carbohydrate antigen of Clonorchis sinensis recognized by a species-specific monolonal antibody)

  • 용태순;이종석
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제34권4호
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    • pp.279-282
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    • 1996
  • 간흡충 특이 단세포군항체인 CsHyb 0605-23과 반응하는 간흡충 항원의 특성을 밝히기 위하여 간흡충의 성충 조항원을 당지질 당질 단백으로 각각 분리한 후 각각 항원으로 사용하여 단세포 군항체와 효소떤역흡착검사법을 실시하였다. 그 결과. 오직 당질분획만이 단세포군항체와 반응하였다. 당질항원을 sodiumperiodate를 사용하여 약하게 산화시키자 단세포군항체와의 반응도가 떨어졌다. 따라서 이 단세포군항체에 반응하는 간흡충의 항원 및 항원결정기는 당질로 생각된다.

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B형 간염바이러스 표면단백질 중 preS2 부위의 항원적 특성 (Antigenic Pproperties of preS2 Region of Hepatitis B Virus Envelope Proteins)

  • 이기녕;이상철;권기선;정홍근;유명희
    • 미생물학회지
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    • 제28권1호
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    • pp.6-12
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    • 1990
  • adr 아형 B형 간염바이러스의 preS2염기서열을 베타갈락토시다세 유전자에 연결시켜 클론닝한 후, 융합단백질의 형태로 대장균에서 발현시켰다. 한국인 간염환자로부터 분리된 표면항원으로 유도한 단일 클론항체 H8는 preS2에 특이성을 지니고 있으며, 상기의 융합단백질과 특이적으로결합하였다. 이 단일 클론항체는 adw2아형 preS2 융합단백질과는 단지 낮은 수준의 결합성을 보여주었는데, 이와 같은 단일클론항체 H8의 adr 아형과 adw2아형에 대한 결합성의 차이는 preS2부위의 아미노산 차이에 기인한다고볼 수 있다.

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돼지 인플루엔자 바이러스의 혈청학적 역학조사 및 유전학적 분석 (Sero-epidemiology and genetic characterization of swine influenza virus)

  • 류영수;김로미
    • 대한수의학회지
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    • 제38권1호
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    • pp.53-63
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    • 1998
  • Total of 1085 swine sera (1996-1997) from nation-wide were tested for the presence of antibodies to influenza A virus. Fifty nine percent of the tested sera showed seropositive by HI test. Positive sera consisted of 24--- of H3, 15--- of H1, and 20--- of the sample had both antibodies, respectively. Sera collected from various region represented 7~27--- seropositivity to H1N1, 15~25--- to H3N2, respectively. Swine influenza field isolate from nasal swab was characterized antigenically and genetically to elucidate its relatedness with other known strains of influenza A virus. The study was focused on the HA gene which is related to pathogenecity and antigenic variability of the influenza virus. By RT-PCR using influenza A/H1N1 specific primers, influenza virus H1N1 specific DNA fragment was amplified from A/Swine/Iowa/15/30(H1N1), US field isolate but not in H3N2 strain. PCR products were sequenced by dideoxy chain termination method to determine nucleotide homology with other strains of influenza A virus. The US field isolate and A/Swine/Indiana/1726/88 strain had 97--- of nucleotide homology and 98--- of amino acid homology. Based on the results obtained from this experiment, the field isolate was genetically related to A/Swine/Indiana/1726/88 and had higher homology with A/Swine/Indiana/1726/88 than with classical swine influenza virus, A/Swine/Iowa/15/30. The field isolate had no amino acid changes at the antigenic site compare to that of the A/Swine/Indiana/1726/88. The proteolytic enzyme cleavage site between HA1 and HA2 had no alteration and the amino acid arginine was intact. There is no evidence has been found that the field isolate has genetic shift or genetic drift which might altered antigenic determinant.

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계난백(鷄卵白) Lysozyme의 N-말단(末端)과 C-말단(末端) 항원결정기(抗原決定基)에 대한 연구(硏究) (Further Studies on the Specificity of the N- and C-terminal Antigenic Determinant of Hen Egg-white Lysozyme)

  • 하윤문
    • 대한미생물학회지
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    • 제12권1호
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    • pp.19-32
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    • 1977
  • 계난백(鷄卵白) Lysozyme N-와 C 말단(末端) 항원결정기(抗原決定基)($P_{17}$: sequence $Lys^1-{cys-}^6-Asn^{27},\;{Trp^{12}}_2-Cys^{127}-Leu^{129}$)의 특이성(特異性)에 대(對)하여 연구(硏究)했다. $^{14}C-acetyl$ Lysozyme 과 정제(精製)한 guinea pig 항(抗)-$P_{17}$ 항체(抗體)와의 결합(結合)을 Scatchard plot 상(上)에서 나타낸 결과(結果) 그 실험치(實驗値)가 거의 r=1였다. 이것은 Lysozyme에 대(對)하여 각각(各各) 다른 친화성(親和性)을 가진 2개(個)의 항체군(抗體群)의 존재(存在)나 그렇잖으면 제(第)1의 항체결합부위(抗體結合部位)에 최초(最初)의 Lysozyme 분자(分子)가 결합(結合)함으로 인(因)하여 항체분자(抗體分子)의 제(第)2의 결합부위(結合部位)에 다른 Lysozyme 분자(分子)의 결합(結合)을 방해하는 즉 steric hindrance에 의한 가능성(可能性)을 시사(示唆)한다. 여러가지 peptides의 항원활성(抗原活性)을 $^{14}C-acetyl-P_{17}$과 항(抗)-$P_{17}$ 항체(抗體)와의 결합저해(結合沮害)시험에서 측정(測定)했다. 그 결과(結果) 단지 $P_{17}$$P_{17}t$(sequence $Lys^1-cys^5-Homoser^{12},\;Trp^{123}-cys^{127}-Leu^{128})$)만이 억제되었고 그 $K_1$치(値)가 각각(各各) $2.0{\times}10^4$$8.1{\times}10^3$이였다. 이들 결과(結果)를 종합(綜合)하면 $P_{17}$의 항(抗)-$P_{17}$ 항체(抗體)와의 직접적 결합부위(結合部位)는 $P_{17}$의 말단부위(末端部位)에 국재(局在)해 있는 것을 암시해 준다. 한편 $P_{17}$의 나머지 부분(部分)은 이 항원결정기(抗原決定基) 구조(構造)를 유지(維持)하는데 중요(重要)한 역할(役割)을 할 것으로 생각되며 또한 이 결정기내(決定基內)의 한 개의 disulphide 결합(結合)은 면역학적(免疫學的) 활성(活性)을 나타내는데 필수적(必須的)인 것으로 믿어진다.

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단세포군 항체를 이용한 간흡충 항원의 분석 및 간흡충증의 진단 (Analysis of Clonorchis sinensis antigens and diagnosis of clonorchiasis using monoclonal antibodies)

  • 용태순;임경일;정평림
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제29권3호
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    • pp.293-310
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    • 1991
  • 우리 나라의 중요한 인체 기생충인 간흡충(Cloncrchis sinensis)을 연구함에 있어, 단세포를 항체제조법을 이용하여 보았다. 간흡충의 성충 조(조)항원으로 면역한 마우스의 비장 림프구와 형질세포종(plasmacytoma) 세포를 융합하여 간흡충의 항원에 대한 단세포를 항체를 분비하는 융합 세포를 만들어, 간흡충 항원에 대한 특이 단세포군 항체를 얻은 후, 이의 특성 및 반응하는 항원의 특성을 분석하고, 아울러 ELISA 억제 검사법을 이용하여 면역 진단법 상 특이도의 개선을 모색하였다 그 결과, 간흡충 항원에 대한 항체를 분비하는 총 29개의 융합세포군을 확인하였는데, 이 중 8개는 다른 기생 충 항원에 대해 교차 반응을 나타내지 않는 높은 특이성을 지니고 있었다. 클로닝 후 선택된 6종류의 단세포군 항체는 Ig Gl이 넷이었고, 나머지는 Is G2b 및 Is A로 나타났다. 위와 같이 선택된 단세포를 항체 중 4개만이 자연 감염 시에도 표현되는 항원 결정기에 대하여 생성된 것으로 판단되었다. 효소 면역 전기영동 블로팅으로 분자량 l0KD, 34 KD 항원은 각각 CsHyb 0714-20 및 CsHyb 0605-10단세포군 항체와 항원항체 반응을 나타냄을 확인하였다. 간접형광항체법을 이용하여 카 항원 결정기의 충체 내 위치를 관찰한 결과, CsHyb 0714-20 단세포를 항체에 대한 항원은 충체의 표면 및 실질 대부분에 분포하였으며, CsHyb 0605-10 및 CsHyb 0714-25 단세포군 항체에 대한 항원은 충체의 실질 및 장관의 상피세포에 분포하고 있었다. 한편 CsHyb 0605-23 단세포군 항체에 대한 항원은 주로 자궁내 충란 주위에 많이 분포하고 있었다. 단세포군 항체와 반응하는 Sephadex G200 겔 여과 항원 분획을 검색한 결과, 검색한 항원 결정기는 모두 전반적으로 빨리 젤 여과를 통하여 나온 분회에 속하여 있는 것을 알 수 있었다. 한편 이 단세포군 항체를 인체 간흡충증의 진단에 응용하여 그 특이도를 개선하고자 하였다. 통상적인 방법의 ELISA로 시행한 항체가로는 간흡충 감염자의 75U가 양성 병위에 들었으며, 정상 대조군의 7.l%, 폐흡충 감염 자의 37.5%가 위 양성 반응을 보였다. 반면 CsHyb 0605-23 단세포군 항체를 함께 사용하여 ELISA억제 검사를 시행한 결과는 간흡충 감염자의 77.1%가 양성으로 판정되었으며, 정상 대조군 및 폐흡충 감염자에서는 양성 반 응을 찾아 볼 수 없어서 100%의 특이도를 나타내었다. 따라서 이러한 단세포군 항체를 이용한 ELISA 억제검사 는 통상적인 ELISA 검사에 비하여 같은 정도의 민감도를 유지하면서도 매우 높은 특이도를 가지는 것으로 판단되었다.

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Purification and Characterization of Recombinant Tadpole H-Chain Ferritin in Escherichia coli

  • Chang, So-Ran;Kim, Young-Taek;Kim, Kyung-Suk
    • BMB Reports
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    • 제28권3호
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    • pp.238-242
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    • 1995
  • The tadpole H-ferritin produced in E. coli was purified and its molecular properties were investigated to obtain information about the contribution of the H-subunit in the reaction of iron core formation. All the expressed subunits were assembled into complete holoprotein in vitro, presumably 24-mer, and the protein was heat-stable. Electron microscopy revealed that the recombinant ferritin forms spherically and contains iron core. No difference was observed in the absorption spectrum of the expressed protein compared to that of the natural ferritin. The Ouchterlony double diffusion of the expressed protein showed that the H-chain ferritin shares an antigenic determinant with natural tadpole ferritin. Rabbit anti-horse spleen ferritin discriminated the H-ferritin from natural ferritin. The rate of ferritin formation by the recombinant H-chain apoferritin was determined to be higher than that shown by natural tadpole ferritin, which consists of H, M and L-subunits. This phenomenon may be caused by the absence of M and L-subunits in the recombinant H-chain apoferritin.

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제초제내성 유전자재조합 콩의 검출을 위한 면역분석법 개발 (Development of Enzyme-Linked Immunosorbent Assay for Glyphosate-Tolerant Soybeans)

  • 곽보연;고승희;박춘욱;손대열;손동화
    • 한국식품과학회지
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    • 제35권3호
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    • pp.366-372
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    • 2003
  • 유전자재조합 콩의 Agrobacterium sp. CP4 유래 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase(CP4 EPSPS)를 편리하고 경제적으로 검출하고자 효소면역측정법(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA)을 개발하였다. CP4 EPSPS에 대해 특이적인 다클론 및 단클론항체를 생산하였다. 다클론 항체의 경우 sandwich ELISA(검출한계, 0.03${\mu}g/mL$)는 competitive indirect ELISA(1${\mu}/mLg$)보다 CP4 EPSPS의 검출감도가 낮았다. 생산된 단클론항체 3종의 CP4 EPSPS에 대한 인식부위는 Mab1과 Mab2는 서로 같은 부위를 Mab3는 다른 부위를 인식하는 것으로 나타났다. 한편, 다클론항체 및 단클론항체를 조합하여 실시한 sandwich ELISA의 검출감도를 서로 비교하였다. 그 결과, 항원 포획단계에서 단클론항체 Mab2를 코팅하고 다클론항체-horseradish peroxidase(HRP) conjugate를 사용하였을 때 가장 양호한 검출감도(검출한계, 0.02${\mu}g/mL$)를 나타내었다. 본 연구에서 개발한 sandwich ELISA는 제초제 저항성 유전자재조합 콩의 분석에 적용가능할 것으로 생각된다.

유전공학적 방법에 의한 토끼 글로빈 유전자의 재조합과 대장균에서의 발현 (Molecular Cloning and Expression in Escherichia coli of a Rabbit Globin Gene)

  • Jang, Sung-Key;Park, Hyune-Mo
    • 한국동물학회지
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    • 제27권2호
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    • pp.103-116
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    • 1984
  • 유전자 구조 및 유전정보 흐름의 차이로 인하여 고등생물의 유전자를 미생물에 직접 cloning하면 원하는 유전자 산물을 얻지 못하는 경우가 많다. 이것을 극복하기 위해서는 화학적인 방법으로 유전자를 합성하든지, 또는 역제효소를 사용하여 고등생물의 mRNA로부터 유전자를 합성하여 cloning하는 방법을 사용한다. 본 연구에서는 oligo(dT)-cellulose column 방법으로 순수분리한 plasmid pBR322의 Pst I site에 cloning하였다. 우선 AMV reverse transcriptase로 primary cDNA를 합성하고, 알칼리를 처리하여 주형 RNA를 제거했다. 이번에는 이 primary cDNA를 주형으로 Klenow enzyme과 reverse transcriptase를 차례로 처리하여 double stranded DNA를 합성하고, 이 때 5' end 근처에 형성되는 hairpin loop을 Sl nuclease로 제거했다. Terminal deoxynucleotidyl transferase를 사용하여, 합성된 dsDNA에는 poly(dC) track을, Pst I endonuclease를 처리한 plasmid DNA에서는 poly(dG) track을 각각 붙인다음 이들을 서로 annealing시키고 E. coli에 transformation시켜서 크기가 큰 plasmid를 갖는 clone을 cracking 방법으로 일처 선별하였다. 이렇게 선별된 clone을 in 냐셔 hybridization 방법으로 조사하여 globin DNA가 들어간 colony를 이차 선별하고 여러 restriction enzyme으로 잘라보아 globin DNA가 cloning된 것을 확인하였다. 토끼 hemoglobin으로 immunize한 rat (Wistar)에서 뽑은 제일차 혈청과 염소에서 뽑은 제이차 혈청의 antibody를 사용한 radioimmunoassay방법으로, cloning된 globin gene이 대장균내에서 발현되는 지의 여부를 살펴 보았는데, 박테리아의 $\\beta$-lactamase와 토끼의 globin이 결합된 chimeric protein이 대장균 내에서 다량 합성되며, 이 단백질은 토끼 hemoglobin의 antigenic determinant를 가지고 있음을 알 수 있었다.

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