Proceedings of the Korean Biophysical Society Conference
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2003.06a
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pp.74-74
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2003
We report here the results on N-acetyl-N'-methylamide of oxazolidine (Ac-Oxa-NHMe) calculated using the ab initio molecular orbital method with the self-consistent reaction field (SCRF) theory at the HF level of theory with the 6-3l+G(d) basis set. The displacement of the $\square$-CH$_2$ group in proline ring by oxygen atom has affected the structure of proline, cis$\^$∼/ trans equilibrium, and rotational barrier. The up-puckered structure is found to be prevalent for the trans conformers of the Oxa amide. The higher cis populations of the Oxa amide can be interpreted due to the longer distance between the acetyl methyl group and the 5-methylene group of the ring for the trans conformer of the Oxa amide than that of the Pro amide. The changes in charge of the prolyl nitrogen and the decrease in electron overlap of the C$\^$∼/ N bond for TS structures seem to play a role in lowering rotational barriers of the Oxa amide compared to that of the Pro amide. The calculated preferences for cis conformers in the order of Oxa > Pro amides and for trans-to-cis rotational barriers in the order of Pro > Oxa amide in water are consistent with experimental results on Oxa-containing peptides. The pertinent distance between the prolyl nitrogen and the N$\^$∼/ H amide group to form a hydrogen bond might indicate that this intramolecular hydrogen bond could contribute in stabilizing the TS structures of Oxa and Pro amides and play a role in prolyl isomerization.
Raman spectra for the carbonyl stretching mode of the amides, and amide-solvent systems have been recorded to investigate the effect of alkyl substitutions at the carbonyl carbon and at the nitrogen on the amide hydrogen-bonding. The data have shown that the interaction affinities are in the order of amide-amide > amide-water > amide-alcohol in formamide system, and amide-water > amide-amide > amide-alcohol in acetamide and propionamide systems. The strength of the proton acceptor of the carbonyl oxygen is increased by the presence of alkyl group to the carbonyl carbon and the proton donorcity of the amide is decreased by the alkyl substitution at the nitrogen. The above results are in good agreement with the ab initio SCF MO calculation.
Thermotropic behavior was observed in a number of aromatic copoly (ester amide)s containing a flexible spacer based on 4,4'$-dicarboxyalpha,\varpi-diphenoxy$ alkanes as an A component, di-acetylated p-aminophenol as a B, di-acetylated hydroquinone as a C gave the thermotropic copoly (ester amide)s containing a flexible spacer in the polymer backbone. 4,4'-diamino-3,3'-dimethoxybiphenyl as an amino group containing monomer as a D components. In the last case, up to 60 mol% of amide group was allowed to afford thermotropic liquid-crystallinity. The polymer structure and thermotropic nature were examined by solid-state and solution $^{13}C$ NMR spectroscopy, differential scanning calorimeter, polarizing microscopy, and IR spectroscopy.
A study has been made about some correlations in the chemical cyclization of precursors, poly(ether-amide-amic acid)s by treating in solution a mixture of acetic anhydride and pyridine in the presence of 4,4-dimethyl formamide, with the poly(ether-amic acid)s being respectively reacted between trimellitic anhydride chloride and 3 kinds of diamines, i.e., 4,4'-bis(m-aminophenoxy) benzophenone, 2,2'-bis[4-(m-aminophenoxy) phenyl] propane and 4,4'-bis(m-aminophenoxy) diphenyl sulfone. The cyclization of imide ring in the poly(ether-amide-amic acid)s may be regarded as an intramolecular acylation of amide group by o-carboxyl group. As a result of this reseach, the effects on the conversion to poly(ether-amide-imide)s have been found by changing the ratio of cosolvents in the cyclization mixture.
Objective: This study investigated the association between feed efficiency, physicochemical properties, flavor precursors and biomolecules in the thigh meat of Korat (KR) chickens. Methods: The feed intake and body weight of individual male KR chickens were recorded from 1 to 10 weeks old to calculate the individual residual feed intake (RFI) of 75 birds. At 10 weeks of age, chickens with the 10 highest (HRFI) and lowest RFI (LRFI) were slaughtered to provide thigh meat samples. The physicochemical properties (ultimate pH, water holding capacity [WHC], drip loss) and flavor precursors (guanosine monophosphate, inosine monophosphate (IMP), adenosine monophosphate and inosine) were analyzed conventionally, and Fourier transform infrared spectroscopy was used to identify the composition of biomolecules (lipids, ester lipids, amide I, amide II, amide III, and carbohydrates) and the secondary structure of the proteins. A group t-test was used to determine significant differences between mean values and principal component analysis to classify thigh meat samples into LRFI and HRFI KR chickens. Results: The physicochemical properties of thigh meat samples from LRFI and HRFI KR chickens were not significantly different but the IMP content, ratios of lipid, lipid ester, protein (amide I, amide II) were significantly different (p<0.05). The correlation loading results showed that the LRFI group was correlated with high ratios of lipids, lipid esters, collagen content (amide III) and beta sheet protein (rg loading >0.5) while the HRFI group was positively correlated with protein (amide I, amide II), alpha helix protein, IMP content, carbohydrate, ultimate pH and WHC (rg loading >0.5). Conclusion: The thigh meat from chickens with different RFI differed in physiochemical properties affecting meat texture, and in the contents of flavor precursors and biomolecules affecting the nutritional value of meat. This information can help animal breeders to make genetic improvements by taking more account of traits related to RFI.
An amide group was introduced to restrain the cohesion of silica nano-particles and copolymerized with polyamic acid. Amide block copolymers were prepared using silica and (3-mercaptopropyl) trimethoxysilane (MPTMS) with a siloxane group, using 2, 6-Lutidine as a catalyst. Amide block polymers and copolymers were synthesized via ATRP after brominating pyromellitic dianhydride (PMDA) and polyamic acid of methylene diphenyl diamine (MDA) using ${\alpha}$-bromo isobutyryl bromide. Characteristic peaks of copolymer with amide and imide groups and patterns of amorphous polymers were studied using FT-IR and XRD analyses; an analysis of the surface characteristic groups was conducted via XPS. Changes in the thermal properties were examined through DSC and TGA; solubility for solvents was also studied.
Phung, Doan Minh;Jeong, Woo-Chul;Choi, Chang-Shik;Lee, Ki-Hwan
Rapid Communication in Photoscience
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v.1
no.1
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pp.11-12
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2012
The naphthalic amide derivatives were synthesized by simple condensation and were crystallized by acetonitrile solution. The SEM images of products with methyl group and nitro group, respectively, showed rod shape while the SEM images of products with other groups ($N(CH_3)_2$, $OCH_3$, H, F, and Cl), respectively, showed plate shape. We were known from these results that the substituent of ending group played an important role in the crystallization of single molecule and the morphology of naphthalic derivatives could be controlled by only change of ending group in single molecule.
It is an inconvenience for silica nano-particles to dry again when using it in that they cohere each other through moisture in the air. Acrylamide groups were introduced to improve such inconvenience and copolymerized with silica nano-particles and then we copolymerized again with polyamic acid in order to increase thermal characteristic. Amide block copolymers were prepared using silica and (3-mercaptopropyl) trimethoxysilane (MPTMS) with a siloxane group, using 2,6-Lutidine as a catalyst. Amide block polymers and copolymers were synthesized via ATRP after brominating pyromellitic dianhydride (PMDA) and polyamic acid of methylene diphenyl diamine (MDA), using ${\alpha}$-bromo isobutyryl bromide. Characteristic peaks of copolymer with amide and imide groups and patterns of amorphous polymers were researched by FT-IR and XRD analyses and the analysis of surface characteristic groups was conducted via XPS. A change in thermal properties was examined through DSC and TGA and solubility for solvents was also researched.
A chiral stationary phase derived from (S)-N-(3,5-dinitrobenzoyl)leucine N-phenyl N-alkyl amide (CSP 2) was applied in separating the two enantiomers of various π-basic aromatic derivatives of leucine N-propyl amide in order to evaluate π-basic aromatic groups as an effective derivatizing group for the resolution of a-amino acids. Subsequently N-(3,5-dimethoxybenzoyl) group was found to be very effective as a π-basic aromatic derivatizing group. Based on these results, N-(3,5-dimethoxybenzoyl) derivatives of various a-amino N-propyl amides, N,N-diethyl amides and esters were resolved on the CSP derived from (S)-N-(3,5-dinitrobenzoyl) leucine N-phenyl N-alkyl amide (CSP 2) and the resolution results were compared with those on the CSP derived from (S)-N-(3,5-dinitrobenzoyl)leucine N-alkyl amide (CSP 1). The enantioselectivities exerted by CSP 2 were much greater than those exerted by CSP 1. In addition, racemic N-(3,5-dimethoxybenzoyl)-a-mino N,Ndiethyl amides were resolved much better than the corresponding N-(3,5-dimethoxybenzoyl)-a-mino N-propyl amides and esters on both CSPs. Based on these results, a chiral recognition mechanism utilizing the π-π donor-acceptor interaction and the two hydrogen bondings between the CSP and the analyte was proposed.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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