In order to obtain the genetic information of the Korean isolates of porcine circovirus 2 (PCV2), complete genomes of five isolates from Korean PCVD weaned pigs with wasting syndromes were sequenced and compared with those of other published PCV2 isolates. Of the five PCV2 isolates, four (1767 nucleotides) were classified into PCV2b, and one (1,768 nucleotides) was PCV2a. Moreover, it appeared that PCV2b is now the dominant genotype circulating in Korea herds. Total complete genomes of four PCV2b isolates shared $99.1{\sim}99.4%$ nucleotide sequence homology each other, and were only $95.4{\sim}96.2%$ similar to one PCV2a isolate. ORF2 genome of four PCV2b isolates shared over 99% nucleotide sequence and deduced amino acid sequence identity to each other. Nevertheless, those were much divergent with the PCV2a isolate of this study and ranged from $92.3{\sim}92.7%$ nucleotide homology and $91.9{\sim}92.3%$ deduced amino acid sequence homology, respectively. The amino acid sequence alignments of the putative capsid protein identified three major regions of amino acid heterogeneity at residues $59{\sim}91$, $121{\sim}136$ and $190{\sim}210$. Two of those correspond with dominant immunoreactive areas. Phylogenetic analysis based on the complete genome of PCV2 isolates showed that four PCV2b isolates of this study existed the closest relationship with European strains (Netherland, UK and France). One PCV2a isolate was closely related to Japan and North America strains.
본 연구에서는 도축장과 도축물에서 plasmid 매개성 광범위 ${\beta}$-lactam (extended spectrum ${\beta}$-lactamase) 분해효소를 생성하는 Klebsiella pneumoniae와Escherichia coli가 분리됨으로서 한국에서는 이들 균주가 임상범위를 넘어 자연계까지 확산되었음을 확인하였다. 디스크 확산 시험, 등전점 수치, 접합시험 등을 통하여 돼지의 분변으로부터 최종 10균주의 접합자를 얻었고 이들의 형별결정은 아미노산서열분석과 기준주와 대조등을 BCM Search Laucncher 및 NCBI blast를 통해 이루어졌다. 광범위 ${\beta}$-lactam 유형은 Klebsiella pneumoniae 8균주가 TEM-52형이었고 2균주 Escherichia coli가 SHV-12형이었다. CMY-1형은 본 연구에서 분리되지 않았다.
본 논문에서는 번역지원 시스템을 위한 유사예문 검객 알고리즘을 제안한다. 유사예문 검색이란 질의문에 대하여 구조적, 의미적으로 유사한 예문을 찾는 것으로 번역지원 시스템의 핵심 요소이다. 제안하는 알고리즘은 생물정보학 분야에서 두 단백질의 아미노산열의 유사성을 판별하기 위한 Needleman-Wunsch 알고리즘에 기반하고 있다. 표면정보만 이용하는 Needleman-Wunsch 알고리즘을 그대로 문장 비교에 적용하였을 경우 단어 굴절요소에 민감하여 의미적으로 유사한 문장을 발견하지 못할 가능성이 높다. 따라서 표면 정보 외에 단어의 표제어 정보를 추가적으로 이용한다. 또한 문장 구조의 유사성 정도를 반영하기 위해 품사 정보를 이용한다. 즉, 본 논문에서는 단어의 표면 정보. 표제어 정보, 품사 정보를 융합한 문장 비교 척도를 제안한다. 그리고 이 척도를 이용하여 유사 문장을 검색하고, 유사성에 기여하는 부분쌍을 파악하여 결과로 제시한다. 제안하는 알고리즘은 전기통신 분야의 데이터에 대해 매우 우수한 성능을 보였다.
스테레오 카메라를 사용하여 입체영상을 획득하는 대표적인 방법으로는 수렴 및 평행방식이 있다. 본 연구는 수렴 및 평행타입의 장점을 갖추고 자연스런 입체영상을 획득할 수 있는 평행타입 기반의 변형평행타입 입체영상 획득 방법을 사용하여 수렴방식의 입체영상 획득방법을 모사할 수 있는 인자들의 추출 및 정량적 분석을 통하여 중요 핵심인자를 정의하였다. 결과적으로 변형평행 타입에서 수렴타입을 모사할 수 있는 인자들은 스테레오 카메라의 간격, 화각 및 수렴각이고, 융합영역 내에서의 핵심인자는 수렴각의 변화이다. 결론적으로 변형평행타입으로 수렴타입을 완벽히 모사할 수 있는 인자들의 정량적 범위는 사용환경에 따라 다르며, 초점길이가 짧을 수록, 수렴각이 작을수록 근거리 물체에 대한 수렴타입과 변형평행타입의 영상좌표의 오차량은 적다.
본 연구는 교정 운동이 전방머리자세 환자의 목뼈 정렬, 압력통증 역치, 통증에 미치는 영향에 대해 알아보았다. 대상자는 목 부위의 통증을 주로 호소하는 환자 중 전방머리자세로 판정되는 30명을 대상으로 연구를 실시하였다. 중재방법으로는 연구군은 등뼈 폄 운동, 네발기기 자세에서 뒤쪽락킹, 그리고 능동 목뼈 돌림 운동과 TECAR치료를 융합하였으며, 대조군은 등뼈 및 목뼈 교정운동만을 적용하였다. 평가는 목 척추 각도, 압력 통증 역치, 목장애지수, 시각적상사척도를 측정하였다. 중재는 2주간 주 6회 실시하였다. 연구결과 두 군 모두 목 척추각도, 압력통증 역치, 목장애 지수, 시각적상사척도에 유의한 차이를 나타내었다. 또한 목 척추각도를 제외한 압력통증역치, 목장애지수, 시각적상사척도에 연구군이 대조군 보다 유의하게 개선되었다. 이러한 결과는 교정 운동과 TECAR 치료를 융합하는 중재 방법이 전방머리자세 환자의 머리 정렬과 통증 및 일상생활능력에 보다 긍정적인 영향을 미친다고 사료된다.
한국형 낭충봉아부패병 바이러스는 2009년 국내에 발생하여, 현재 국내 토봉의 99% 이상을 소멸시킨 주요 원인으로 추정되고 있다. 본 연구는 보고된 낭충봉아부패병 바이러스(SBV) 32종의 전체 염기서열을 비교 분석하여, 2,100 염기 부근에 특징적인 결실들(deletions)을 발견하였으며, 이에 기반으로 SBV의 유전자형을 제안하게 되었다. 제안된 유전자형에 의한 분류에서, 각 SBV의 지역성 및 범지역성, 감염특성 등에 유관함을 볼 수 있었다. 아울러, 제안된 이 유전자형은, 검역과 이후의 침임에 대한 방호를 위하여, kSBV의 기원도 바로 암시하고 있음을 우리는 잘 인식하고 있다.
Roleda, Michael Y.;Aguinaldo, Zae-Zae A.;Crisostomo, Bea A.;Hinaloc, Lourie Ann R.;Projimo, Vicenta Z.;Dumilag, Richard V.;Lluisma, Arturo O.
ALGAE
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제36권1호
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pp.1-12
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2021
As the global demand for the carrageenophyte Kappaphycus is steadily increasing, its overall productivity, carrageenan quality, and disease resistance are gradually declining. In the face of this dilemma, wild Kappaphycus populations are viewed as sources of new cultivars that could potentially enhance production; therefore, assessment of their diversity is crucial. This study highlights the morphological and genetic diversity of wild Kappaphycus species obtained from two sites in the Philippines. Nucleotide alignments of available 5' region of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI-5P) and cox2-3 spacer sequences of Kappaphycus confirmed the presence of K. alvarezii in Guiuan, Eastern Samar and K. striatus in Bolinao, Pangasinan. Based on the concatenated sequences of the COI-5P and the cox2-3 spacer, nine novel haplotypes were observed along with other published haplotypes. However, there was no relationship between haplotype and morphology. These newly recognized haplotypes indicate a reservoir of unutilized wild genotypes in the Philippines, which could be taken advantage of in developing new cultivars with superior traits. DNA barcodes generated from this study effectively expand the existing databank of Kappaphycus sequences and can provide insights in elucidating the genetic diversity of Kappaphycus species in the country.
This study proposes and demonstrates a smart monitoring system that uses transmission lines embedded in a reinforced concrete structure to detect the presence of defects through changes in the electromagnetic waves generated and measured by a time-domain reflectometer. Laboratory experiments were first conducted to identify the presence of voids in steel-concrete composite columns. The results indicated that voids in the concrete caused a positive signal reflection, and the amplitude of this signal decreased as the water content of the soil in the void increased. Multiple voids resulted in a decrease in the amplitude of the signal reflected at each void, effectively identifying their presence despite amplitude reduction. Furthermore, the electromagnetic wave velocity increased when voids were present, decreased as the water content of the soil in the voids increased, and increased with the water-cement ratio and curing time. Field experiments were then conducted using bored piles with on-center (sound) and off-center (defective) steel-reinforcement cage alignments. The results indicated that the signal amplitude in the defective pile section, where the off-center cage was poorly covered with concrete, was greater than that in the pile sections where the cage was completely covered with concrete. The crosshole sonic logging results for the same defective bored pile failed to identify an off-center cage alignment defect. Therefore, this study demonstrates that electromagnetic waves can be a useful tool for monitoring the health and integrity of reinforced concrete structures.
현장에서 암반에 근입된 현장타설말뚝의 굴착공 벽면거칠기 및 연직도를 측정할 수 있는 잘치(BKS-LRPS)를 개발하였으며 개발된 장치에 대한 현장시험을 실시하였다. 여기서 현장 측정 과정에서 측정 장치의 흔들림 분석, 공기중과 수중에서의 보정계수 적용, 말뚝내부의 높은 수압에 따른 레이저 센서 시스템의 안정성 분석을 실시하였다. 또한 혼탁도에 따른 측정 가능 여부를 판단하기 위해 6개의 현장타설말뚝 굴착공에서 거칠기 및 연직도 측정을 실시하였다. 현장측정 결과 연직도는 공기중 이나 혼탁도가 낮은 수중조건에서 측정할 수 있었다. 그러나 거칠기도 공기중이나 수중 조건에서 측정할 수 있었는데 굴착공 하부의 혼탁도가 높은 수중조건에서는 측정할 수 없었다. 실시된 일련의 현장시험을 통하여 BKS-LRPS는 공기 중과 수중에서 적용 가능한 최초의 굴착공 거칠기 및 연직도 측정 시스템임을 알 수 있었다.
Objective: To determine the relationship between cervical sagittal parameters and the degree of the cervical disc degeneration at each cervical level by using cervical plain radiographs and disc degeneration grading. Method: This study analyzed 110 patients with posterior neck pain. Cervical radiographic measurements included the occipito-cervical (O~C2) angle; sagittal Cobb angles of C1~C2, C2~C7; and sagittal vertical axis (SVA) of C1~C7 and C2~C7. The degenerations of cervical discs at each level were evaluated through Pfirrmann grading system by magnetic resonance images of the cervical spine. The correlations between the cervical sagittal measurements and the disc degeneration at each level were analyzed by Spearman's correlation. Results: A significant correlation was found for the C2~C7 angle with disc degenerations at C2~C6 levels. O~C2 angle was correlated significantly with disc degenerations at C2~C4 and C5~C7 levels. There was significant correlation between C1~C2 angle and disc degeneration at C6~C7 level. No significant relationship was found between the cervical SVA and the cervical disc degeneration at all cervical levels. Conclusion: Cervical sagittal parameters representing cervical angles (C2~C7, O~C2, and C1~C2 angles) were significantly correlated with the degree of the cervical disc degeneration. These findings suggest that the loss of the natural cervical lordosis rather than loss of natural SVA could be correlated with progression of the cervical disc degeneration.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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