Cytokinin은 식물의 성장과 발달에 중요한 역할을 하는 필수 호르몬이다. Cytokinin의 작용 기작을 이해하기 위하여 단백체를 이용하여 cytokinin 관련 단백질들을 동정하였다. 대조구와 t-zeatin을 처리한 애기장대로부터 추출한 단백질을 이차원 전기영동하여 분석하였다. 발현양에 차이가 있는 단백질 spot들을 MALDI-TOF 단백질 질량분석기와 database 검색을 통하여 동정하였다. 그 결과 t-zeatin 처리에 의하여 발현이 증가하는 10개의 단백질과 감소하는 한 개의 단백질을 분리할 수 있었다. Cytokinin에 의하여 발현이 증가하는 단백질은 pollen allergen like protein, L-ascorbate peroxidase, tetrapyrrole methylase family protein, SGT1 protein homolog, disease resistance related protein, maternal embryogenesis control protein, paxneb related protein, gluthathione S-transferase, 그리고 IAA amino acid hydrolase homolog들로 밝혀졌다.
본 연구에서는 가축의 면역증강용 생균제 개발을 위하여 Pediococcus acidilactici SRCM102607의 프로바이오틱스 특성 및 면역활성을 조사하였다. 전통발효식품으로부터 유산균을 분리 하였고, 분리 유산균을 대상으로 가축유해 미생물 5종에 대한 항균활성을 측정하였다. 우수한 결과를 나타내는 5종의 유산균을 1차 선별하였고, 이를 대상으로 생균제 소재 활용 가능성을 확인하기 위해 용혈성, 담즙산염 분해효소, 항산화 활성 분석을 실시하여 최종적으로 SRCM102607을 선별하였으며, 16S rRNA 유전자 염기서열 분석을 통해 Pediococcus acidilactici SRCM102607로 명명하였다. SRCM102607의 pH 2 조건에서 내산성은 1.54×105 CFU/ml의 생균수를 보였으며, 0.5% 이상의 oxgall이 포함된 조건에서도 105 CFU/ml 이상의 높은 생균수를 나타내었다. 또한, 선발균주의 산업적으로 활용할 수 있는 가능성을 검토하기 위해 항생제 내성 및 분해 효소능을 측정하였고 다양한 항생제에 대한 내성과 유해 효소를 생성하지 않음을 확인하였고, 최종적으로 면역 증강제로서의 활용 여부를 확인하기 위해 TNF-α 생성능(171.86±4.00 ng/ml)을 확인하였다. 본 연구를 기반으로 SRCM102607은 가축 생균제 소재로 활용 가능성과 면역활성이 뛰어난 유산균으로 생균제 산업에서의 잠재적 적용 가능성을 확인하였다.
본 연구의 목적은 한국 전통 음식 김치에서 분리한 유산균의 특성을 연구하기 위해 형태학적, 생화학적 특성을 조사하였다. 한국의 전통 발효 식품에서 젖산균을 확인하기 위해 분리된 균주의 그람염색을 수행한 후 Macrogen에서 16S rRNA 분석 결과, DKGF9(Lactobacillus plantarum), DKGF1(Lactobacillus paracasei ), DKGF8(Lactobacillus casei ), DK207(Lactobacillus casei ), DK211(Lactobacillus casei )이 확인되었다. 우리는 한국의 전통 발효 식품인 김치에서 분리된 5가지 LAB의 기본 생물학적 활성에 대한 실험을 수행했다. 37℃, 55℃, 65℃, 75℃에서 각각 5분, 15분 5균주의 내열성 확인 결과, 상업 균주인 Lactobacillus acidophilus LA-5의 내열성과 유사하거나 더 높음을 보여주었다. 장내부착능에서는 선발균주 모두 상용균주와 비교했을 때 107 CFU/mL 이상으로 우수한 결합능을 보여주었고, KCTC(한국생명공학연구원 생물자원센터)에서 분양받은 Escherichia coli KCTC1682, Salmonella enterica KCTC2054, Bacillus cereus KCTC3624 3종을 활용한 항균활성 결과, 모든 균주는 상업용 균주인 L. acidophilus LA-5와 비교하여 유사하거나 더 높은 항균 활성을 나타냈다. 단백질분해능력 실험에서, 5개의 균주는 clear-zone의 직경이 24시간에서 72시간으로 갈수록 점차 증가하고, L. paracasei DKGF1이 가장 큰 직경을 갖고 있어 단백질분해능력이 가장 우수한 것으로 나타났다. 5개의 균주로부터 선택된 3개의 균주는 ABTS, DPPH, FRAP, Hydroxyl radical scanenging 활성을 포함하여 다양한 항산화활성 효과를 나타냈다. 결과적으로, 5가지 균주 중에서 우수한 기능성을 갖는 L. paracasei DKGF1이 잠재적인 프로바이오틱스 활성을 나타내며, 건강 관련 제품의 개발에 유용한 균주라고 판단된다.
알칸디올로부터 유래된 주사슬의 탄소수가 6, 9, 11인 bis[3-(dialkyloxylphosphorothionyl)thio-2-methylpropanyloxy]alkane (BAPA)를 합성하였으며, 이를 zinc dialkyl dithiophosphates (ZDDP)와 비교하여 마모억제성능을 살펴보았다. 탄소 주사슬의 길이에 따른 BAPA의 내마모성능을 확인하기 위하여 4-ball 시험을 하였다. 기유무게의 1% 농도로 첨가제를 넣고 WSD (wear scar diameter)를 측정하였고, 각 0.472, 0.459, 0.480 mm로 나타났다. 또한 BAPA 화합물 중 bis[methacryloyloxy]nonane (BMOO9)의 곁사슬인 dialkyl dithiophosphoric acid (DDP)의 탄소수를 4, 8, 12로 변화시켜 합성하여, 4-ball 시험을 하였다. 그 결과로 WSD의 값은 각각 0.537, 0.459, 0.531 mm로 측정되었다. 곁사슬이 짧으면 필름이 얇게 형성되고, 길면 필름형성을 방해하여 탄소수가 8개일 때의 값이 제일 좋게 나타났다. ZDDP의 경우 동일한 조건에서 WSD의 값이 0.563 mm로 측정되었고, 합성한 BAPA의 화합물이 마모억제용 첨가제로 더 우수한 성능을 갖는다는 것을 확인하였다.
환경스트레스 중의 하나인 저온에 대한 생육기의 포도나무의 반응을 분석하고자 -$2^{\circ}C$에서 4일 동안 저온처리 한두 품종('Campbell Early'와 'Muscat Baily A')의 포도나무잎을 이용하여 전사체를 분석하였고 특이발현유전자(differentially expressed genes, DEGs)를 검색하였다. 영하의 저온에 반응한 'Campbell Early'의 DEG를 기능별로 분석한 결과 생물대사에서 17,424개, 세포구성에서 28,954개, 분자기능에서는 6,972개의 유전자와 관련이 있었다. 발현이 유도되는 유전자로는 dehydrin xero 1, K-box region and MADS-box transcription factor family protein과 MYB domain protein 36이 있으며, 억제되는 유전자로는 light-harvesting chlorophyll B-binding protein 3, FASCICLIN-like arabinoogalactan 9와 pectin methylesterase 61 등이 있었다. 'Muscat Baily A'의 DEG는 생물대사에서 1,157개, 세포구성에서 1,350개, 분자기능에서는 431개의 유전자와 관련이 있었다. 발현이 유도되는 유전자로는 NB-ARC domain-containing disease resistance protein, fatty acid hydrozylase syperfamily와 isopentenyltransferase 3이 있으며, 억제되는 유전자로는 binding, IAP-like protein 1과 pentatricopeptide repeat superfamily protein 등이 있었다. Real-time PCR을 이용하여 영하의 저온에서 특이적으로 발현하는 유전자들을 검정하였으며, InterPro Scan을 통해 단백질 도메인을 분석한 결과 두 품종 모두에서 ubiquitin-protein ligase가 가장 많았다. 영하의 저온에 노출된 신초의 전사체 정보를 바탕으로 포도나무에서 저온 내성을 발현하는 기작을 연하는 데에 분자수준의 정보를 제공하고, 내한성 포도를 육종하는데 이용될 수 있을 것이다.
갓김치로부터 분리된 유산균 5종(Lactobacillus acidophilus GK20, Lactobacillus brevis GK55, Lactobacillus paracasei GK74, Lactobacillus plantarum GK81, 및 Leuconostoc mesenteroides GK104)의 활성산소종에 대한 저항성 및 항산화 활성을 조사하였다. Hydrogen peroxide (0.5 mM)와 반응 5시간후 L. acidophilus GK20, L. brevis GK55, L. paracasei GK74 및 L. plantarum GK81들은 50% 이상의 생존율을 보였으며, superoxide anions에 의한 저해율은 L. acidophilus GK20와 L. paracasei GK74가 가장 낮았고, hydroxyl radical과의 반응에서는 L. paracasei GK74와 L. plantarum GK81이 가장 안정하였다. 한편, L. plantarum GK81는 실험 균주 중 가장 높은 DPPH 소거능($70.8{\pm}10.1%$)을 나타내었는데, 세포(IC)보다는 세포추출물(ICFE)의 활성이 더 높았다. 또한 L. plantarum GK81의 ICFE는 다른 균주들에 비해 높은 superoxide radical 소거능을 보였고, 이 균주의 IC와 ICFE에 의한 환원력은 BHA와 vitamin C보다 유의적으로 더 높게 나타났으며, L.paracasei GK74 IC의 환원력도 vitamin C와 비슷한 수준으로 나타났다. L. brevis GK55, L. paracasei GK74 및 L.mesenteroides GK104 IC의 $Fe^{2+}$-chelating 활성은 30% 이상이었고, L. plantarum GK81의 ICFE는 45% 이상의 활성을 나타내었다. 따라서 실험 균주 중 L. plantarum GK81은 다른 균들에 비해 ROS에 대해 비교적 안정하고, 항산화 활성도 가장 높은 것으로 확인되었다.
The presence of Citrus tristeza virus (CTV) has previously been reported in citrus growing regions of Turkey. All serologically and biologically characterized isolates including I$\breve{g}$d${\i}$r, which was the first identified CTV isolates from Turkey, were considered mild isolates. In this study, molecular characteristics of the I d r isolate were determined by different methods. Analysis of the I$\breve{g}$d${\i}$r isolate by western blot and BD-RT-PCR assays showed the presence of MCA13 epitope, predominantly found in severe isolates, in the I$\breve{g}$d${\i}$r isolate revealing that it contains a severe component. For further characterization, the coat protein (CP) and the RNA-depen-dent RNA polymerase (RdRp) genes representing the 3' and 5' half of CTV genome, respectively, were amplified from dsRNA by RT-PCR. Both genes were cloned separately and two clones for each gene were sequenced. Comparisons of nucleotide and deduced amino acid sequences showed that while two CP gene sequences were identical, two RdRp clones showed only 90% and 91% sequence identity in their nucleotide and amino acid sequences, respectively, suggesting a mixed infection with different strains. Phylogenetic analyses of the CP and RdRp genes of I$\breve{g}$d${\i}$r isolate with previously characterized CTV isolates from different citrus growing regions showed that the CP gene was clustered with NZRB-TH30, a resistance breaking isolate from New Zealand, clearly showing the presence of severe component. Furthermore, two different clones of the RdRp gene were clustered separately with different CTV isolates with a diverse biological activity. While the RdRp-1 was clustered with T30 and T385, two well-characterized mild isolates from Florida and Spain, respectively, the RdRp-2 was most closely related to NZRB-G90 and NZRB-TH30, two well-characterized resistance breaking and stem pitting (SP) isolates from New Zealand confirming the mixed infection. These results clearly demonstrated that the I$\breve{g}$d${\i}$r isolate, which was previously described as biologically a mild isolate, actually contains a mixture of mild and severe strains.
HI몰랄리티가 9.5 $mol/kg-H_2O$인 HI의 전해-전기투석을 시판의 양이온교환막(CMB)을 이용하여 요오드의 존재하에 실험을 진행하였다. 수소이온 투과의 선택성을 증가시키기 위해, 막은 전자선 가속기를 이용하여 방사선 처리하였다. 방사선 처리한 막의 막특성(막 저항, 이온교환용량, 함수율)을 측정하였다. 각각의 방사선량에서 처리한 막의 2 $mol/dm^3$의 KCl 용액에서 막저항, 이온교환용량과 함수율은 처리하지 않은 막과 거의 동등의 값을 가졌다. HI몰랄리티가 9.5 $mol/kg-H_2O$인 HI의 전해-전투기투석을 $75^{\circ}C$, 9.6 $A/dm^2$에서 진행하였다. 전자선 가속기에 의해 방사선 처리한 양이온교환막은 처리하지 않은 막과 비교하여 고분자의 가교구조와 함께 수소이온투과의 높은 선택성을 가졌다.
Khan, Abdul Latif;Hamayun, Muhammad;Ahmad, Nadeem;Hussain, Javid;Kang, Sang-Mo;Kim, Yoon-Ha;Adnan, Muhammad;Tang, Dong-Sheng;Waqas, Muhammad;Radhakrishnan, Ramalingam;Hwang, Young-Hyun;Lee, In-Jung
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제21권9호
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pp.893-902
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2011
Endophytic fungi are little known for their role in gibberellins (GAs) synthesis and abiotic stress resistance in crop plants. We isolated 10 endophytes from the roots of field-grown soybean and screened their culture filtrates (CF) on the GAs biosynthesis mutant rice line - Waito-C. CF bioassay showed that endophyte GMH-1B significantly promoted the growth of Waito-C compared with controls. GMH-1B was identified as Penicillium minioluteum LHL09 on the basis of ITS regions rDNA sequence homology and phylogenetic analyses. GC/MS-SIM analysis of CF of P. minioluteum revealed the presence of bioactive $GA_4$ and $GA_7$. In endophyte-soybean plant interaction, P. minioluteum association significantly promoted growth characteristics (shoot length, shoot fresh and dry biomasses, chlorophyll content, and leaf area) and nitrogen assimilation, with and without sodium chloride (NaCl)-induced salinity (70 and 140 mM) stress, as compared with control. Field-emission scanning electron microcopy showed active colonization of endophyte with host plants before and after stress treatments. In response to salinity stress, low endogenous abscisic acid and high salicylic acid accumulation in endophyte-associated plants elucidated the stress mitigation by P. minioluteum. The endophytic fungal symbiosis of P. minioluteum also increased the daidzein and genistein contents in the soybean as compared with control plants, under salt stress. Thus, P. minioluteum ameliorated the adverse effects of abiotic salinity stress and rescued soybean plant growth by influencing biosynthesis of the plant's hormones and flavonoids.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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