• Genomics & Informatics
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• v.16 no.4
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• pp.36.1-36.3
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• 2018

Next generation sequencing (NGS), a high-throughput DNA sequencing technology, is widely used for molecular biological studies. In NGS, RNA-sequencing (RNA-Seq), which is a short-read massively parallel sequencing, is a major quantitative transcriptome tool for different transcriptome studies. To utilize the RNA-Seq data, various quantification and analysis methods have been developed to solve specific research goals, including identification of differentially expressed genes and detection of novel transcripts. Because of the accumulation of RNA-Seq data in the public databases, there is a demand for integrative analysis. However, the available RNA-Seq data are stored in different formats such as read count, transcripts per million, and fragments per kilobase million. This hinders the integrative analysis of the RNA-Seq data. To solve this problem, we have developed a web-based application using Shiny, COEX-seq (Convert a Variety of Measurements of Gene Expression in RNA-Seq) that easily converts data in a variety of measurement formats of gene expression used in most bioinformatic tools for RNA-Seq. It provides a workflow that includes loading data set, selecting measurement formats of gene expression, and identifying gene names. COEX-seq is freely available for academic purposes and can be run on Windows, Mac OS, and Linux operating systems. Source code, sample data sets, and supplementary documentation are available as well.

• Journal of Korean Institute of Industrial Engineers
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• v.33 no.1
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• pp.1-10
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• 2007

The capabilities ofBusiness Process Management Systems (BPMS's) are continuously extended to increase theeffectiveness of the management and enactment of business processes. This paper identifies the challenge ofcase prediction, which for a specific case under the control of a BPMS deals with the estimation of the remaining time until it is completed. An accurate case prediction facility is a valuable tool for the operationalcontrol of business processes, as it enables the pre-active monitoring of time violations. Little research has beencarried out in this area and few commercial tools support case prediction. This paper lists the requirements onsuch a facility and sketches sonae directions to reach a solution. To illustrate the depth of the problem, a smallaspect of the problem is treated in more detail. It involves the complex relations between tasks and resources inbusiness processes, which makes an exact analytical approach mfeasible.

• Korean Journal of Computational Design and Engineering
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• v.13 no.1
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• pp.27-35
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• 2008

Digital Virtual Manufacturing is a technology facilitating effective product developments and agile productions via digital models representing the physical and logical schema and the behavior of real manufacturing systems. A digital virtual factory as a well-designed and integrated environment is essential for successful applications of this technology. In this research, we construct a sophisticated digital virtual factory for the section steel shop in a Korean shipbuilding company by 3-D CAD and virtual manufacturing simulation. The NIST-AMRF CIM hierarchical model and workflow analysis using IDEF methodology are also applied. This digital virtual factory can be applied for diverse engineering activities in design, manufacturing and control of the real factory, and improvements in quality of engineering and savings in time from design to production in shipbuilding are possible.

• IE interfaces
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• v.16 no.2
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• pp.156-166
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• 2003

Proposed in this paper is a standard-compliant business process modeling tool which is based on the UML(Unified Modeling Language) activity diagram and produces an XPDL(XML Process Definition Language) file as an output. The XPDL is a standard process definition exchange format by WfMC (Workflow Management Coalition). To develop an UML/XPDL-based modeling tool, the mapping of modeling elements between activity diagram and XPDL format is conducted after the detailed analysis of each modeling specification. As a result of this mapping, it is revealed that modeling elements of each activity diagram and XPDL must be expanded. So new modeling elements are identified and added to each specification. Based on this mapping, the prototype system is developed, and the usefulness of the developed system is shown through the case study.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2000.04b
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• pp.33-35
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• 2000

본 논문에서는 워크플로우 모델링 도구인 ICN(Information Control Net)모델을 기반으로 하는 워크플로우 제어 의존성 분석 메커니즘을 제안하였다. 즉, ICN 모델로 정의된 워크플로우의 각 액티버티들 간에 존재하는 제어 의존 관계를 표현하기 위한 제어 의존 넷(Control Dependency Net)을 정형적인 방법으로 정의하였고, ICN 모델로부터 제어 의존 넷을 생성하는 알고리즘을 정의하였다. 본 논문에서 제안한 워크플로우 제어 의존성 분석 메커니즘은 워크플로우 빌드타임(Build-time)측면과 워크플로우 런타임(Run-time)측면에서 중요한 의미를 갖는다. 전자의 측면에서는 워크플로우의 복잡성이 증가함에 따라 더욱 요구되고 있는 워크플로우의 시멘틱 에러 테스팅 기능에 효과적으로 적용될 수 있으며, 후자의 측면에서는 워크플로우의 성공적인 적용을 위해 필수적으로 요구되는 제어 흐름의 동적 변경(Dynamic Change)지원 기능의 완결성을 향상시키는데 효과적으로 활용될 수 있다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2005.11b
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• pp.181-183
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• 2005

본 논문에서는 워크플로우 마이닝을 위한 제어경로 분석 알고리즘에 관하여 기술한다. ICN(Information Control Nets)은 워크플로우를 모델링하기 위한 방법이다. 본 논문은 ICN 기반의 워크플로우 모델 정보로부터 워크플로우의 제어경로를 파악하기 위한 제어경로 분석 알고리즘을 제안한다. 제어경로은 실제 워크케이스로 발생할 수 있는 워크플로우 모델의 유형을 의미하며, 제어경로 분석은 각 워크케이스의 유형을 분류해 내는 것을 의미한다. 분류된 워크케이스의 유형 정보는 워크플로우 로그와의 비교 분석을 통해 마이닝에 적용할 수 있다.

• Proceedings of the Korean Operations and Management Science Society Conference
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• 2002.05a
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• pp.32-36
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• 2002

본 논문에서는 워크플로우 시스템의 관리에 유용한 잠재 규clr을 도출하기 위한 프레임워크를 제안한다. 워크플로우 시스템의 전반적인 수행과정 관리에는 워크플로우 시스템의 모니터링 기능이 이용된다. 그러나 기존의 모니터링 기능은 시스템 수행과정에 대만 관리가 해당 시점에 한정된다는 문제점과, 모니터링 툴이 제공하는 이력 정보는 가공되지 않은 단순한 데이터베이스 필드 수준이라는 문제점이 있다. 따라서 본 연구에서는 워크플로우 시스템에 데이터 마이닝 기법을 이용해 누적된 데이터로부터 얻을 수 잇는 공통의 잠재 규칙에 대한 정보를 제공함으로써 기존의 모니터링 기능을 보완한다. 제안된 방법론은 분석 데이터 추출. 전처리. 연관관계 분석등의 단계를 거치며. 이러한 과정을 통해 워크플로우 시스템 관리에 유용한 잠재 규칙이 도출된다. 도출된 잠재 규칙은 추후 워크플로우 시스템에서 BPR(Business Process Reengineering)의 근거로 사용될 수 있다.

• Proceedings of the Korea Association of Information Systems Conference
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• 2004.11a
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• pp.20-26
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• 2004

본 논문은 최근 실시간 기업(RTE: Real-Time Enterprise)의 구현도구로 각광을 받고 있는 BPM(Business Process Management)이 신속하고 다양한 모니터링 및 분석을 제공할 수 있는 새로운 모니터링 기법을 소개한다. 본 논문의 방법론은 기존의 프로세스 모니터링 서비스의 한계를 극복하고 개인에 따라 차별화된 모니터링 환경을 제공한다. 제시된 모형은 모니터링 객체(monitoring objects), 분석 기법(analysis methods), 표현 양식(presentation styles), 모니터링 이벤트(audit events)의 네 가지 축에 따라 모니터링 구정 요소들을 분해하고, 분해된 개별 단위들을 사용자가 자유롭게 조합하여 모니터링 서비스를 구성할 수 있도록 한다. 이는 기업의 경영자가 실시간으로 경영성과를 확인하도록 하고 추후의 경영활동에 반영하도록 하는 실시간 기업의 환경을 구축하도록 한다.

• Proceedings of the Korean Institute of Information and Commucation Sciences Conference
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• 1999.11a
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• pp.336-339
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• 1999

Education paradigm is moved from traditional face-to-face method to cyber education environment. Therefore, we extracted the components of cyber education system and their detail functions through analysis on the workflow of education and learning standard technology. In addition, we think that template system will make a big role in order to deploy the cyber education system. Therefore, we designed the template system for cyber education. In this paper, we particularly describe both evaluation funrtion on course learning records and statistics function ell evaluation records.

• 한국IT서비스학회:학술대회논문집
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• 2008.05a
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• pp.529-534
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• 2008

국제 전자거래 표준 언어인 ebXML은 비즈니스 프로세스의 모델링과 구현이 독립되어 있다. 특히 ebXML의 비즈니스 프로세스 구현 언어는 UML (Unified Modeling Language)기반의 BPSS (Business Process Specification Schema)에서 BPMN (Business Process Modeling Notation)기반의 ebBP (ebXML Business Process Specification Schema)로 변경되었다. ebXML은 단일화된 e-비즈니스 시장의 형성을 목표로 하고 있다. 따라서 ebBP가 비즈니스 프로세스 모델링으로 표현되는 다양한 업무 흐름을 지원 할 수 있는지 ebBP의 코레오그라피(Choreography) 표현 능력을 평가하는 것은 중요한 문제이다. 본 논문에서는 ebBP의 표현력을 워크플로우 패턴 입장에서 기존의 BPSS와 비교한다. 이 분석을 토대로 비즈니스 프로세스 모델에서 ebBP로 변환하는 방법을 제시한다.