• 제목/요약/키워드: Virus detection

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남.서해안과 동중국해 자연산 어류에서 Red Sea Bream Iridovirus (RSIV)의 검출 (Detection of Red Sea Bream Iridovirus (RSIV) from marine fish in the Southern Coastal Area and East China Sea)

  • 이월라;김석렬;윤현미;키타무라신이치;정성주;오명주
    • 한국어병학회지
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    • 제20권3호
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    • pp.211-220
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    • 2007
  • Red sea bream iridovius (RSIV)는 우리나라와 일본의 참돔 (Pagrus major), 돌돔(Oplegnathus fasciatus) 등 주로 돔류에 질병을 유발하는 어류 병원바이러스로 알려져 왔으나, 돔류 이외에도 감수성을 나타내는 어종이 매우 다양하며 아시아를 중심으로 고수온기에 대량 폐사를 유발하는 중요한 원인체로 보고되고 있다. 본 연구는 RSIV에 대한 자연산어류에서 검출동향의 모니터링을 통해 금후 red sea bream iridoviral disease (RSIVD)에 대한 예방학적 접근의 일환으로서 자연산 어류로부터의 RSIV 검출 및 지리적 분포, 보균 어종에 대한 유전학적인 조사를 실시하였다. 조사는 2003년과, 2005년도에 동중국해역 3지점, 서해안 5지점 그리고 남해안 5지점에서 어류를 채집하여 PCR을 이용한 검출결과, 자연산 해산어류 160마리 중 39마리에서 RSIV가 검출되어 24.3%의 높은 검출율을 보였으며 특히 조사된 어류 중 상어목에서 가장 높은 검출율을 보였다. 자연산 어류에서 분리한 RSIV 분리주는 양식산어류에서 분리된 RSIV-K strain과 염기서열 분석에서 97.2%~100%, 아미노산 분석에서 94.7~100% 유사성을 나타내었으며 megalocytivirus Subgroup Ⅲ에 속함을 확인하였다.

정신과(精神科) 입원(入院) 환자(患者)의 C형(型) 간염(肝炎) 항체(抗體) 양성솔(陽性率) (Detection of Antibody to Hepatitis C Virus in Psychiatric Inpatients)

  • 전진숙;한호성
    • 생물정신의학
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    • 제2권1호
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    • pp.100-106
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    • 1995
  • 직접적인 근거를 제시하기는 힘드나 정신장애에서 자가면역적 요소가 병인적으로 중요하다는 단편적인 보고들이 있다. 특히 바이러스 감염은 정신장애를 유발하거나 나중에 정신장애에 대한 소지를 증가시킬 가능성이 높다. 저자들은 최근에 많은 관심을 끌고 있는 C형 간염 항체(이하 anti-HCV)의 양성율이 자가면역적 관점 및 수혈 외에도 성행위 또는 약물의 존자에서 많다는 전파경로상의 특정 때문에 정신과 환자에서 일반 인구군보다 높을 것으로 추정되어 이를 확인해 보고자 본 연구를 시행하였다. 1992년 12월 초부터 1994년 5월 말까지 정신과에 입원한 환자 중에서 무작위로 효소면역측정법 (Abbott HCV EIA kit) 에 의해서 혈청내 anti-HCV를 검사하였으며, anti-HCV 양성 환자와 anti-HCV 음성인 환자를 구분하여 여러 변인별로 비교 분석하였다. 정신과 입원환자 113명중 12명(10.6%) 에서 anti-HCV 양성이었다. anti-HCV 양성자중 간기능검사상 이상이 있는 경우가 50.0% 로서 이중 83.0%는 주정 의존자였으며, 간기능검사상 정상인 환자의 83.3%는 비주정의존자였다. 정신과 진단별 anti-HCV 양성율은 주정의존 환자의 22.2%, 정신증 환자의 2.3% (주로 양극성장애), 신경증(불안장애, 적응장애)환자의 22.2%에서 anti-HCV 양성이 나타났다. 연령, 출생계절, 임파구(%), 간기능 등 변인에 대한 유의한 상관성은 관찰되지 않았다. 결론적으로 정신과 입원환자는 정상 대조군 (3.0%)에 비해 최소한 3.5배 이상 anti-HCV 양성율이 높으므로 (P<0.05), 이에 대한 주의를 환기시킬 필요가 있다.

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새로운 항HIV-1제, KR-V series의 개발을 위한 약물동태연구 (Pharmacokinetic analysis for the development of new potent anti-HIV-1 agents, the KR-V series)

  • 이영미;김진석;한상섭;신호철
    • 대한수의학회지
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    • 제40권3호
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    • pp.471-478
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    • 2000
  • 새로운 항HIV 후보물질인 19개의 KR-V 경구제제의 생체이용률을 평가하기 위해 랫드에서 정맥 및 경구투여후 약물동태를 연구하였다. 혈장내 KR-V 화합물들의 검출은 HPLC-UVD 법을 이용하여 분석하였다. 19개 KR-V series 중 KR-V 3, 10, 14, 16 및 18-1만이 랫드에서 경구로 흡수되어 생체이용성을 나타내었다. 10mg/kg의 정맥투여후 약물 통태 연구에 있어서는 5개물질, KR-V3, 10, 14, 16 및 18-1의 소실 반감기는 서로 비슷하였으나 KR-V 3, 10, 14 및 16의 총청소율($CL_{total}$, >4L/hr/kg)은 KR-V 18-1(1.1L/hr/kg) 보다 유의성있게 높았다. KR-V 3, 10, 14 및 16에 비해 KR-V3 18-1이 혈중곡선하면적(AUC, $8.97{\mu}g{\cdot}hr/ml$)은 크고 겉보기분포용적(Vd, 0.58L/kg)은 적었다. 50mg/kg의 경구투여후 약물동태 연구에 있어서는 KR-V 18-1의 반감기가 다른 4개의 물질에 비해 비록 짧았지만 경구 AUC($3.659{\mu}g{\cdot}hr/ml$), 최고혈중농도($C_{max}$, $1.891{\mu}g/ml$) 는 현저히 높았다. 또한 별도의 in virus 실험결과 생체이용률을 나타낸 이들 5개의 물질들 중 KR-V 18-1만이 HIV-1 돌연변이종(mutants)에 대한 억제효과를 나타내었다. 따라서 KR-V 18-1이 항에이즈(AIDS)제의 새로운 후보물질 혹은 선도물질로서 가능성이 기대되었다.

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2019년 충남지역에서 발생한 식중독 현황과 원인분석 (Analysis of Food Poisoning Outbreaks Occurred in Chungnam Korea, 2019)

  • 이현아;남해성;최지혜;박성민;박종진;김현민;천영희;박준혁
    • 한국환경보건학회지
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    • 제46권2호
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    • pp.184-191
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    • 2020
  • Objectives: This study was performed to analyze cases of food poisoning outbreaks reported in Chungcheongnamdo Province in 2019 and report it as effective data for preventing food poisoning in the future. Methods: Food poisoning outbreaks were analyzed to detect virus, bacteria, and protozoa according to the Manual for Detection of Foodborne Pathogens in Outbreaks to clarify the causes of food poisoning that occurred in Chungcheongnam-do Province in 2019. Results: Among the 79 cases of food poisoning outbreaks, 59 cases (74.7%) were in general restaurants, 15 cases (19.0%) in food service institutions, three cases at banquets, and two cases in take-out food. The 42 cases at general seafood restaurants made up the majority of food poisoning in Chungcheongnam-do. Food poisoning pathogens were shown in 13 cases (86.7%) out of the 15 cases at food service institutions, and 10 cases were related to Norovirus. Among the 79 cases, food-borne pathogens were identified in 35 cases of outbreaks, accounting for 44.3%. The confirmed pathogens were as follows: bacteria (24 cases), Norovirus (12 cases) and Kudoa septempunctata. (five cases). The food-borne bacteria were pathogenic E. coli (12 cases), Staphylococcus aureus (six cases), Salmonella spp. (two cases), Campylobacter jejuni, Bacillus cereus, Clostridium perfringens, and Vibrio parahaemolyticus (one case). Conclusions: To prevent food poisoning, it is necessary to analyze regional characteristics and environments and to hold a campaign for the prevention of food poisoning based on that analysis. In addition, when food poisoning occurs, the results of analyzing its cause and spread based on accurate epidemiological survey need to be shared.

Distribution of HPV Genotypes in Cervical Cancer in Multiethnic Malaysia

  • Raub, Sayyidi Hamzi Abdul;Isa, Nurismah Md.;Zailani, Hatta Ahmad;Omar, Baharudin;Abdullah, Mohamad Farouk;Amin, Wan Anna Mohd;Noor, Rushdan Md.;Ayub, Mukarramah Che;Abidin, Zainal;Kassim, Fauziah;Vicknesh, Visvalingam;Zakaria, Zubaidah;Kamaluddin, Muhammad Amir;Tan, Geok Chin;Syed Husain, Sharifah Noor Akmal
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제15권2호
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    • pp.651-656
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    • 2014
  • Background: Cervical cancer is the third commonest type of cancer among women in Malaysia. Our aim was to determine the distribution of human papilloma virus (HPV) genotypes in cervical cancer in our multi-ethnic population. Materials and Methods: This was a multicentre study with a total of 280 cases of cervical cancer from 4 referral centres in Malaysia, studied using real-time polymerase chain reaction (qPCR) detection of 12 high risk-HPV genotypes. Results: Overall HPV was detected in 92.5% of cases, in 95.9% of squamous cell carcinomas and 84.3%of adenocarcinomas. The five most prevalent high-risk HPV genotypes were HPV 16 (68.2%), 18 (40%), 58 (10.7%), 33 (10.4%) and 52 (10.4%). Multiple HPV infections were more prevalent (55.7%) than single HPV infections (36.8%). The percentage of HPV positive cases in Chinese, Malays and Indians were 95.5%, 91.9% and 80.0%, respectively. HPV 16 and 18 genotypes were the commonest in all ethnic groups. We found that the percentage of HPV 16 infection was significantly higher in Chinese (75.9%) compared to Malays (63.7%) and Indians (52.0%) (p<0.05), while HPV 18 was significantly higher in Malays (52.6%) compared to Chinese (25.0%) and Indians (28%) (p<0.05). Meanwhile, HPV 33 (17.9%) and 52 (15.2%) were also more commonly detected in the Chinese (p<0.05). Conclusions: This study showed that the distribution of HPV genotype in Malaysia is similar to other Asian countries. Importantly, we found that different ethnic groups in Malaysia have different HPV genotype infection rates, which is a point to consider during the implementation of HPV vaccination.

Integrating market chain assessments with zoonoses risk analysis in two cross-border pig value chains in Lao PDR

  • Okello, Anna L;Tiemann, Tassilo T;Inthavong, Phouth;Khamlome, Boualam;Phengvilaysouk, Ammaly;Keonouchanh, Soukanh;Keokhamphet, Chattouphone;Somoulay, Virasack;Blaszak, Kate;Blacksell, Stuart D;Okello, Walter O;Allen, John
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제30권11호
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    • pp.1651-1659
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    • 2017
  • Objective: Lao PDR's recent accession to the World Trade Organization necessitates a greater understanding of the patterns and risk of livestock production in order to better align national policy with the Agreement on the Application of Sanitary and Phytosanitary Measures. This eco-health study was conducted to improve understanding of the interrelations between market chains and zoonotic infection risks at two strategic cross border points between Lao PDR, Thailand and Viet Nam. Methods: Information gained from smallholder farmer/trader interviews was integrated with serological surveys for pig-associated zoonoses-including hepatitis E virus (HEV), Taenia solium (T. solium) and trichinella-to identify potential linkages between disease risk and pig production and slaughter in low input systems common across the country. Results: Trichinella and HEV exposure was high in both humans and pigs in both study areas, significantly associated with pig slaughter and the subsequent consumption and handling of raw pork products. T. solium demonstrated a strong geographical and ethnic association with the northern study area bordering Vietnam. With the right knowledge and accessible, affordable inputs, the majority of smallholder farmers indicated a willingness to invest more in pig production, which could simultaneously improve livelihoods and decrease exposure to HEV, Trichinella, and T. solium through increased access to formal markets and an improved slaughter processes. Conclusion: The linkages identified when assessing disease risk in the context of potential economic and cultural drivers of transmission highlight the importance of a systems-based approach for the detection and control of zoonotic disease, and contributes to an improved understanding of the Lao PDR livestock sector.

유리비드를 포함한 PDMS 마이크로칩을 이용한 고감도 감염성 병원균 측정에 관한 연구 (Highly Sensitive Detection of Pathogenic Bacteria Using PDMS Micro Chip Containing Glass Bead)

  • 원지영;민준홍
    • KSBB Journal
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    • 제24권5호
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    • pp.432-438
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    • 2009
  • 본 연구는 환경샘플 중 병원균을 진단하기 위한 목적을 가진다. 최소 챔버 칩에서 환경 샘플 중 병원균을 농축하고 mRNA를 증폭하여 효과적이고 간단한 진단방법을 고안하였다. PDMS로 면적 $1.5\;cm{\times}\;1.5\;cm$, 높이 $100\;{\mu}L$의 칩을 제작하여 유리에 부착시켰다. RNase에 의한 진단 오류 또는 실패를 막고자 RNase away 처리를 하고, RNA와 PDMS의 결합을 막기 위해 BSA 처리를 하였다. 수질에 있는 병원균은 매우 적은 농도로 존재하므로 농축의 과정이 필요하다. 농축의 방법에는 여러 가지가 있으나 본 연구에서는 유리 비드를 칩 내에 삽입하고 저농도의 시료를 주입함으로서 고농도로 농축을 하는 방법을 사용하였다. 그러나 부피가 작은 칩 내에서 수행하기에는 내부 압력이 작용하여 문제가 발생하여 $100\;{\mu}m$의 유리 비드를 사용하고 유리비드의 칩 내부 이탈을 방지하기 위하여 댐을 만들어 농축에 가장 적합한 칩의 형태를 잡았다. 시료의 주입속도에 따라 내부 압력이 상승하여 댐의 기능이 상실하여 유리 비드가 이탈하게 되므로 그것을 방지하기 위하여 칩 내에 댐을 강화하여 만들고 내부압력 증가가 방지되는 최적의 댐을 개발하여 시료의 주입 속도 5 mL/min까지 유리 비드의 이탈을 막았다. 유리 비드에서의 RNA 농축은 pH 5에서 효과적이고 pH가 증가할수록 유리 비드와 RNA의 결합이 끊어지는 현상을 보였으므로 시료에 pH 5의 버퍼를 첨가하여 농축을 진행하고 중성의 NASBA 용액을 주입하여 유리비드에서 탈착된 농축된 고농도의 RNA를 증폭하였다. NASBA는 항온 수조에서 온도에 변화 없이 $41^{\circ}C$에서 1시간 30분 동안 진행하며 증폭된 mRNA는 직접 확인하였다. 이 방법은 LOC 기술을 적용하여 저농도의 시료를 효과적으로 측정할 수 있도록 편리한 바이오 칩을 개발함으로써 대용량의 샘플 중 극 저농도의 대장균을 효과적으로 검출할 수 있는 장점을 가지고 있다.

구제역 관리를 위한 혈청학적 예찰계획 평가 (Evaluation of Serological Surveillance System for Improving Foot-and-Mouth Disease Control)

  • 박선일;신연경
    • 한국임상수의학회지
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    • 제30권4호
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    • pp.258-263
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    • 2013
  • The primary goal of this study was to compute sample sizes required to achieve the each aim of a variety of foot-and-mouth disease (FMD) surveillance programs, using a statistically valid technique that takes the following factors into account: sensitivity (Se) and specificity (Sp) of diagnostic test system, desired minimum detectable prevalence, precision, population size, and desired power of the survey. In addition, sample sizes to detect FMD if the disease is present and also as proof of freedom were computed. The current FMD active surveillance programs consist of clinical, virological, and serological surveillance. For the 2012 serological surveillance, annual sample sizes (n = 265,065) are planned at four separate levels: statistical (n = 60,884) and targeted (n = 115,232) at breeding pig farms and slaughter house, in together with the detection of structural proteins (SP) antibodies against FMD (n = 88,949). Overall, the sample size was not designed taking the specific aims of each surveillance stream into account. The sample sizes for statistical surveillance, assuming stratified two-stage sampling technique, was based to detect at least one FMD-infected case in the general population. The resulting sample size can be used to obtain evidence of freedom from FMD infection, not for detecting animals that have antibodies against FMD virus non-structural proteins (NSP). Additionally, sample sizes for targeted surveillance were not aimed for the population at risk, and also without consideration of statistical point of view. To at least the author's knowledge, sampling plan for targeted, breeding pig farms and slaughter house is not necessary and need to be included in the part of statistical surveillance. Assuming design prevalence of 10% in an infinite population, a total of 29 animals are required to detect at least one positive with probability of 95%, using perfect diagnostic test system (Se = Sp = 100%). A total of 57,211 animals needed to be sampled to give 95% confidence of estimating SP prevalence of 80% at the individual animal-level with a precision of ${\pm}5%$, assuming 800 herds with an average 200 heads per farm, within-farm variance of 0.2, between-farm variance of 0.05, cost ratio of 100:1 of farm against animals. Furthermore, 779,736 animals were required to demonstrate FMD freedom, and the sample size can further be reduced depending on the parameters assumed.

Polymerase Chain Reaction(PCR)을 이용한 Iridovirus의 검색 (Rapid Diagnosis of Iridovirus Infection by Polymerase Chain Reaction)

  • 차승주;도정완;김현주;조화자;문창훈;박정민;박명애;김수미;손상규;방종득;박정우
    • 한국어병학회지
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    • 제11권1호
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    • pp.61-67
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    • 1998
  • PCR을 사용하여 양식 해산어에 iridovirus 감염 여부를 신속히 진단하고자 하였다. 먼저 폐사를 유발하는 iridovirus의 genomic DNA를 pUC19 vector에 cloning한 후 이 clone들의 염기 서열을 GenBank의 염기 서열과 비교 분석하였다. 이들의 염기 서열을 기초로 하여 PCR primer를 제조한 후 PCR을 수행하였다. 정상적인 어류 세포에서는 DNA의 증폭이 일어나지 않았으나 iridovirus에 감염된 세포와 순수 분리된 iridovirus에서는 DNA의 증폭이 일어났다. 이로부터 짧은 시간 내에 폐사를 유발하는 iridovirus를 신속히 진단할 수 있음이 확인되었으며 이러한 PCR을 이용한 진단은 iridovirus의 감염을 확인할 수 있는 간단하고도 정확한 방법을 제공해준다.

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한국 이매패류 내 VHSV 검출 및 잠재적 위험성 분석 (Detection and Analysis of the Potential Risk of VHSV in Bivalves in Korea)

  • 최재찬;김영철;최환준;박전오;정현도
    • 한국어병학회지
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    • 제28권1호
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    • pp.27-35
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    • 2015
  • Viral hemorrhagic septicemia virus (VHSV)는 세계적으로 담수와 해산어에 심각한 경제적 손실을 야기시키는 주요바이러스이다. 이매패류는 감염어로부터 해수로 방출된 바이러스를 여과섭식작용을 통해 축적하는 것으로 알려져 있어 carrier로써의 가능성이 보고된 바 있으므로. 본 연구에서는 이를 확인하기 위해 국내 어류 양식장 주변에 서식하는 참굴(Crassotrea gigas)과 담치(Mytilus edulis)를 샘플링하였고, RT-PCR법을 통해 바이러스를 검출하여 패류 내 VHSV존재를 확인하였다. 기존 병성감정기관에서 사용하는 primer로는 IVa genotype만을 검출할 수가 있었기 때문에 Glycoprotein(G) gene의 conserved region에 대한 primer를 제작하여 VHSV의 4가지 타입 모두 검출할 수 있게 하였고 이를 본 연구에 사용하였다. 총 84개 중 22개의 시료가 nested PCR을 통해 양성으로 확인되었고, 이 중 6개의 양성시료를 시퀀싱하여 유전학적 분석을 실시하였다. 그 결과 국내 여러 지역의 패류에서 검출된 VHSV는 모두 IVa genotype으로 아주 제한적인 결과를 보여주었으며, 이는 국내 어류에게 질병을 일으키는 VHSV의 타입은 IVa genotype이라는 이전의 보고와 상응하는 결과를 나타냈다고 할 수 있다. 결론적으로 본 연구에서는 양식장 주변에 서식하는 이매패류의 여과섭식작용으로 인한 축적되는 바이러스로 인한 전염가능성과 패류 내 존재하는 바이러스와 어류에서 질병을 발생시키는 바이러스와의 상호관계를 조사하였으며, 향후 다른 genotype의 유입 및 검출을 위한 연구는 계속적으로 필요하다고 생각된다.