• 대한바이러스학회지
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• 제28권2호
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• pp.165-174
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• 1998

Characterizations of the VP4 (P type) and VP7 (G type) genes of Korean isolates of bovine rotavirus were performed using RT-PCR/RFLP and nucleotide sequencing analysis. After RT-PCR amplification of partial length (1094bp) of the VP4 and full length (1062bp) of the VP7 genes, amplified PCR products were digested with restriction endonucleases and digestion patterns were compared with those of reference rotaviruses. With the VP4 genes, four RFLP (A-D) profiles were observed; three (A, Band C) were the same as those of bovine rotavirus NCDV (P[1]), IND (P[5]) and B223 (P[11]), respectively. Profile D was the same as that of porcine rotavirus OSU (P[7]). With the VP7 genes, five RFLP profiles (I-V) were observed; three of them (I, II and III) were the same as those of bovine rotavirus NCDV (G6), Cody 1-801 (G8), and B223 (G10), respectively. Profile IV and V were atypical to those of reference bovine rotaviruses used in this study. These two profiles were identified as G6 and G5, respectively, after analyzing and comparing the nucleotide sequences. The G typing analysis revealed that 61.9% (26/42) were G6, which included G6 subtype; 28.6% (12/42) were G5; 7.1% (3/42) were G10; 2.4% (1/42) were G8. The P typing analysis revealed that 54.8% (23/42) were P[5]; 28.6% (12/42) were P[7]; 11.8% (5/42) were [11]; 4.8% (2/42) were P[1]. Our results showed that G6/P[5] were the most prevalent rotaviruses in diarrheic calves in Korea. Also, this is the first report that G5/P[7] rotaviruses were identified from cattle with diarrhea.

• 미생물학회지
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• 제30권5호
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• pp.397-402
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• 1992

서울지역의 소아설사환자가 가검물로부터 분리한 로타바이러스의 VP7을 코딩하는 RNA분절 cDNA를 합성한 후 로타바이러스 혈청형1인 WA1과 RE9의 아홉 번째 RNA분절과 비교하였더니 90%이상의 유사성을 보였다. 염기서열로부터 유추된 아미노산 서열중 혈청간에 변이가 많은 VR5와 VR8 지역을 비교한 결과 역시 혈청형 1인 RE9과 WA1 바이러스주와 매우 높은 유사성을 지님을 알 수 있었다.

• 대한바이러스학회지
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• 제27권2호
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• pp.239-255
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• 1997

전염성 췌장괴저바이러스 (Infectious pancreatic necrosis virus) DRT 주의 VP1유전자를 대 장균 발현운반체와 Baculovirus에 삽입하여 대장균과 진핵세로에서 VP1단백질의 발현을 연구하였다. 재조합체 pMal-pol 클론 [7]에서 2.7 Kb 단편인 VP1 유전자를 제한효소 XbaI으로 절단하여 Baculovirus 운반체인 pBacPAK9에 클로닝하여 pBacVP1이라 명명하였다. 이 pBacVP1에 클로닝된 VP1유전자를 제한효소 SacI과 PstI으로 절단하여 대장균 발현 운반체인 pQE-30에 클로닝하여 pQEVP1이라 명명하였다. 또한 VP1 단백질의 C-말단에 6개의 히스티딘 $6{\times}His$이 붙어 있는 단백질을 만들기 위하여, pQEVP1 클론의 His부위를 EcoRI으로 절단하고, 또한 pBacVP1을 EcoRI으로 절단하여 생긴 부위에His-EcoRI DNA 단편을 교체시켜 재클로닝하여 pBacHis-VP1을 만들었다. pBacHis-VP1 DNA와 Bsu36I로 처리된 LacZ-Hyphantria cunea nuclear polyhedrosis virus (LacZ-HcNPV)를 함께 lipofectin을 이용하여 곤충세포 (Spodoptera frugiperda cell)에 동시 감염을 시켜서 재조합 바이러스를 선발하여, VP1-HcNPV-1이라 명명하였다. pQEVP1 클론은 6개의 히스티딘 단편이 부착된 VP1단백질을 Ni-NTA resin 크로마토그래피법으로 정제하여 SDS-PAGE와 Western blot으로 확인하였고, 단백질의 활성과 구조에 영향을 주지 않는 6개의 히스티딘 단편 ($6\;{\times}\;His$)이 부착된 94 kDa의 VP1단백질을 정제할 수 있었다. 또한 재조합 바이러스에 감염된 곤충세포에서 VP1 단백질이 발현된 것을 전기영동과 Western blot으로 검색을 한 결과 95 kDa VP1 단백질이 발현이 되었음을 확인하였다.

• 대한바이러스학회지
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• 제28권3호
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• pp.247-265
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• 1998

To determine the sequence and expression of the VP7 gene of Korean isolates (CAU-9), viral RNA was purified and used for cDNA amplification by RT-PCR. The VP7 cDNA was cloned, sequenced, and expressed using baculovirus expression system. The result showed that the sequence homologies CAU-9 compared with foreign isolated strains Wa, 417, TMC-II, 95B and SA11 were ranged from 74.0% to 95.1 % of nucleotide sequence and 35% to 43% of amino acid sequence, respectively. High homology of CAU-9 was observed in Japanease isolates 417 (nucleotide sequence homology was 95.1% and amino acid sequence homology was 43%). To express VP7 gene, the VP7 cDNA was cloned into pCR-Bac vector and inserted into the genome of baculovirus adjacent to the polyhedrin promoter by cotransfection of Spodoptera frugiperda (Sf9) insect cells with wild type baculovirus DNA. In antigenic analysis of Sf9 cells inoculated with the recombinant VP7, immunofluorescence assay revealed positive for viral antigens. In metabolic labeling of Sf9 cell lysates infected with recombinant baculoviruses, it was revealed that the protein of 34 kDa was expressed. The limited study of expressed VP7 protein inoculated with guinea pigs failed to elicit neutalizing antibody. As a results, the sequence analysis and expression of VP7 protein of rotavirus CAU-9 isolated from an infant in Korea could permit the conformation and development of virus like particles which may be useful in designing vaccine strategy.

• 한국정보처리학회논문지
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• 제7권11호
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• pp.3500-3508
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• 2000

ATM 네트워크에서 오류가 발생한 VP를 복원하기 위해 많은 자기치료 (Self-healing) 알고리즘이 이미 제안되어 왔다. 알고리즘 중 가장 많이 사용되는 것은 백업 VP를 이용하는 방법이다. 백업 VP를 이용한 알고리즘의 문제점은 백업 VP의 오류가 발생하였을 경우 심각한 문제가 발생하게 되며, 이를 보완하기 2차 백업 VP를 설정하는 알고리즘 제안되었다. 2차 백업 VP를 두는 알고리즘의 경우는 초기 계산량이 너무 많은 단점이 있다. 본 논문에서는 서비스 레벨에 따라 차등의 알고리즘을 두고 3가지 CASE별로 복구알고리즘을 적용하고 또한2차 백업으로 설정 알고리즘의 문제를 해결하여, 상대적으로 고가의 서비스가 되는 실시간 서비스 오류를 방지하는 자기치료 알고리즘을 제안한다. 또한 시뮬레이션을 통해 기존의 알고리즘과 비교하여 성능을 분석하였다.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제14권2호
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• pp.148-154
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• 2011

목적: 저자들은 지역사회에서, 로타바이러스 장염에 걸린 소아들에서 질환의 중증도와 로타바이러스 VP7 유전형과 VP4 유전형의 분포에 대해 알아보고자 하였다. 방법: 2007년 12월부터 2008년 6월까지 로타바이러스 장염으로 병원에 입원한 156명의 소아들에서 대변 샘플을 수집하였다. 모든 환자들에 대한 질환 중증도는 Vesikari 점수를 이용하여 평가하였다. 로타바이러스 ds-RNA를 분리한 후, 역전사 중합효소 연쇄반응과 다중 중합효소 연쇄반응을 이용하여 cDNA를 합성하였다. 마지막으로 유전형을 확인하였다. 결과: 156명의 환자 샘플에서, VP7(G)는 147명(94.2%)에서 확인되었고 VP4(P)는 140명(89.7%)에서 확인되었다. G1 유전형(147명 중 116명; 78.9%)과 P[8] 유전형(140명 중 137명)이 각각 가장 많았다. VP7과 VP4 조합형은 138명에서 확인할 수 있었는데, G1P[8] 조합형이 111명(80.4)으로 가장 많았다. 다른 조합형들은 종류가 다양하였고 분포가 낮았다. 전체 조합형 중 9.4%가 새로운 로타바이러스 백신에 포함되지 않은 것이었다. 로타바이러스 장염의 질환 중중도는 $11.8{\pm}3.3$ ($mean{\pm}2SD$)였다. 전체 환자에서 경증 내지 중등도가 37.8%였고, 중증은 62.2%였다. 결론: 로타바이러스 유전자 조합형 중 가장 흔한 것은 G1P[8]이었다. 새로운 백신에 포함되지 않은 유전자 조합형은 9.4%였다. 로타바이러스 장염으로 입원한 소아들의 질환 중증도분포는 경증과 중등도보다 중증에서 높게 나타났다.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제9권2호
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• pp.147-152
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• 2006

목 적: 최근 새로이 개발된 두 개의 백신(Rotarix, RotaTeq)의 효능은 지역사회에 유행하는 로타바이러스 genotype에 따라 영향을 받을 수 있다. 저자는 제주지역에 유행하는 로타바이러스 genotype의 분포를 알아보고자 하였다. 방 법: 2005년 7월부터 2006년 6월까지 급성 설사로 제주대학교병원 소아과에 내원 또는 입원하여 로타바이러스 위장관염으로 진단 받았던 154명 중 81명에서 대변 검체를 수집하였다. 대변 검체에서 RNA를 추출하여 역전사-중합효소 반응(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)을 시행하여 로타바이러스 VP7 genes을 증폭하였으며 여섯개(1, 2, 3, 4, 8, 9)의 G 유전형을 확인하였다. 결 과: 역전사-중합효소 반응을 시행한 81개의 대변 검체에서 모두 VP7유전자가 증폭됨을 확인하였다. 이들 검체에서 VP 7 단백의 유전형을 보면 G1이 53예(65.5%)로 가장 많았고 그 다음으로 G2 12예(14.8%), G3 11예(13.6%), G8 1예(1.2%), G9 1예(1.2%), G4 0예(0%) 그리고 G1/G3 혼합형이 3예(3.7%)로 나타났다. 결 론: 제주 지역의 로타바이러스 VP7 genotypes의 분포는 국내의 다른 지역들과 달랐으며, G1 유전형이 가장 흔하게 검출되었다.

• 대한바이러스학회지
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• 제30권2호
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• pp.101-112
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• 2000

Rotaviruses are the most common cause of severe vomiting and diarrhea in children worldwide and classified as a genus in the family Reoviridae. Rotavirus has eleven segmented dsRNAs and the virion consists of three shells. Outer capsid VP7 and VP4 induce neutralizing antibodies and are classified into G types (glycoprotein VP7) and P types (protease-sensitive VP4). Characterization of VP7 gene of Korean isolates of human rotavirus was performed using multiplex PCR and nucleotide sequence analysis. After RT-PCR amplification of full length (1,062 bp) of VP7 genes, the amplified PCR products were G typed by multiplex PCR and the nucleotide sequences were compared with those of reference rotavirus from GenBank. The G type analysis revealed that 25% (2/8) belong to G1, whereas 37.5% (3/8) benong to G2 and G4, respectively. The Korean isolates within the same serotypes showed high homology of nucleotide sequences and could be discriminated from foreign isolates exception with two strains (CAU009 and CAU022). But Korean isolates CAU009 and CAU022 were close related into japanease isolates 417 (99.2%) and indian isolates (97.6%) than Korean isolatese. Our results showed that these two strains were supposed to be originated from abroad. As a results, The G typing and nucleotide sequence analysis of VP7 gene of rotavirus isolated from infants in Korea could be used for identification, serotying and determination of novel or unusual strains of rotaviruses.

• Plant Resources
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• 제1권1호
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• pp.33-37
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• 1998

Carotenoid compounds in embryos of wild-type(WT) and viviparous mutants of maize(Zea mays L.) were analyzed using high performance liquid ehromatography (HPLC) with a photodiode array detector. Zeaxanthin accumulates in WT embryos as the major carotenoid. Phytoene accumulates in vp2 and vp5. Phytofluene in w3 and ${\xi}$-carotene in the vp9 mutant embryos. This indicates that the vp2 and vp5 mutants impair phytoene desaturase from 15-cis-phytoene to 15-cis-phytofluene. The w3 mutant has neither an isomerase from 15-cis-phytofluene to all-trans-phytofuene nor phytofluene desaturase from phytofluene to ${\xi}$-carotene. The vp9 mutant does not have the ${\xi}$-carotene desaturase from ${\xi}$-carotene to lycopene. Our analysis shows that the terminal carotenoid. ${\gamma}$-carotene(${\beta},{\Psi}$-carotene), accumulates in the vp7 mutant embryos. The ${\varepsilon}$-carotene(${\varepsilon},{\varepsilon}$-carotene), a product of ${\delta}$-carotene(${\varepsilon},{\Psi}$-carotene) in some plants, however, has not been found in maize embryos. The vp7 mutant impairs a cyclization step from ${\gamma}$-carotene to both ${\beta}$-carotene and ${\alpha}$-carotene. We suggest that monocyclic ${\gamma}$-carotene is the sole precursor of both bicyclic ${\beta}$-carotene(${\beta},{\beta}$-carotene) and ${\alpha}$-carotene(${\beta},{\varepsilon}$-carotene) in maize.

• 대한수의학회지
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• 제46권1호
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• pp.7-12
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• 2006

We have studied pharmacokinetics of a new anti-human immunodeficiency virus (HIV) agent VP-0501 and its amino acid prodrug VP-0501AL which is designed to improve oral bioavailability. After oral administration at 100 mg/kg dose in rats (n = 4), VP-0501 was not detectable in plasma (<50 ng/ml), while after the administration of VP-0501AL, VP-0501 was quantitatively detected, at least for 8 hrs, with Cmax of ca. $2.5{\mu}g/ml$ and AUC of $8hr^{\ast}{\mu}g/ml$. When VP-0501 was intravenously administered at 50mg/kg, this compound appeared at a marginal level in plasma with AUC of $2hr^{\ast}{\mu}g/ml$, $t_{1/2}$ of 2 hr, $C_0$ of $0.7{\mu}g/ml$, and MRT of 3 hr. On the other hand, with intravenous VP-0501AL at the same dose, both the prodrug VP-0501AL and its metabolite VP-0501 appeared comparatively at higher level in the plasma: pharmacokinetic parameters of VP-0501AL including $Vd_{\beta}$, AUC, $t_{1/2,{\beta}}$, $C_0$, $CL_{tot}$, and MRT were ca. 2 L/kg, $70hr^{\ast}{\mu}g/ml$, 2 hr, $180{\mu}g/ml$, 0.7 L/hr/kg, and 1 hr, respectively. These results demonstrate that attachment of amino acid alanine to VP-0501 is an effective approach for improvement of its oral bioavailability. Therefore, VP-0501AL is expected to become a new highly bioavailable and potent anti-AIDS drug candidate/lead compound.