• 제목/요약/키워드: VCG (Vegetative Compatibility Group)

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Glomerella cingulata의 병원성과 체세포화합성군(Vegetative Compatibility Group) 과의 관계 (Relationship Between Virulence and Vegetative Compatibility Group of Glomerella cingulata Isolates)

  • 남명현;유성준;김홍기
    • 한국식물병리학회지
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    • 제12권4호
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    • pp.395-401
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    • 1996
  • 국내의 고추, 사과, 포도, 스타티스(statice)에서 분리한 Glomerella cingulata 균주들의 병원성과 체세포화 합성군(vegetative compatibility group : VCG)과의 관계를 조사하였다. 사과, 포도, 스타티스에서 분리된 균주들은 전기주에 모드 병원성을 나타내었으나 고추에는 병원성이 없었다. 한편, 고추에서 분리된 균주들은 무상처접종시 병원성을 나타내지 못하였다. Nitrate nonutilizing(nit) mutant는 1.5%의 KClO\ulcorner을 첨가한 최소배지에서 선발하였다. nit mutnat들은 nit1, nit2, nit3, nitM의 4가지 표현형 중 하나에 속하였다. VCG는 표현형이 다른 nit mutan간의 대치배양을 통해 결정하였는데 사과, 포도, 스타티스에서 분리한 균주들간에는 같은 VCG를 나타낸 반면 고추에서 분리된 균주들은 다른 VCG로 나타났다. 따라서 G. cingulata 균주들의 체세포화합성은 병원성과 밀접하게 관련되어 있음을 알수 있었다. 또한 동일한 VCG에 속하며 기주가 다른 균주들의 대치배양시 heterokaryon을 형성했으나 자낭을 형성하지는 않았다.

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딸기 시들음병균(Fusarium oxysporum f. sp. fragariae)의 균주간 Vegetative Compatibility, 동위효소 Polymorphism과 병원성 (Vegetative Compatibility, Isozyme Polymorphisms and Pathogenicity of Isolates of Fusarium oxysporum f. sp. fragariae)

  • 현재욱;김순옥;박원목
    • 한국식물병리학회지
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    • 제12권1호
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    • pp.33-40
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    • 1996
  • 우리나라 여러 딸기 재배지에서 전형적인 시들음 증상을 나타내는 이병식물에서 분리한 32개의 Fusarium oxysporum 균주들을 vegetative compatibility와 전기영동에 의한 동위효소상의 차이에 의해 분류하고 이들과 병원성과의 관계를 알아보았다. Nitrate nonutilizing(nit) mutant를 이용하여 vegetative compatibility group으로 분류해 본 결과 크게 A, B, C, D의 4개 그룹으로 나눌 수 있었으며 A그룹에는 15개 균주, B그룹에는 7개 균주, C와 D그룹에는 각각 2개 균주, 그리고 single VCG인 6개 균주가 존재하였다. 전기영동에 의한 esterase, catalase, acid phosphatase, leucin-aminopeptidase(LAP)의 동위효소상을 비교하여 본 결과 I, II, III, IV의 4개 그룹으로 나눌 수 있었으 I 그룹에는 18개 균주, II그룹에는 2개 균주, III그룹에는 6개 균주, IV그룹에는 6개 균주로 분류할 수 있었다. 또한, VCG의 A와 D그룹에 속하는 모든 균주들의 동위효소상의 I 그룹에 속하였으며 VCG B그룹의 7개 균주들 중에서 5개 균주가 동위효소상의 IV그룹, 7개 균주들 중에서 5개 균주가 동위효소상의 IV그룹, 나머지 2개 균주는 I 그룹과 III 그룹에 속하였으며 C그룹의 균주는 III과 IV 그룹에 속하였고, single VCGs들은 III 그룹에 4개 균주, II 그룹에 2개 균주가 속하므로 VCG와 동위효소상 간에는 밀접한 관계가 있음을 알 수 있었다. 4개 딸기 품종에 대해 병원성을 비교하여 본 결과 VCG A에서 선발된 2개 균주들은 보교조생에 대해 가장 병원성이 강하였으며 정보나 여홍에 대해서도 강한 병원성을 가지고 있었다. 반면에 B 그룹에서 선발된 2개 균주들은 4개 품종에 대해 병원성이 약하거나 거의 없었으며 C 그룹에서 선발된 1개 균주는 여홍에 대해 상대적으로 가장 강한 병원성을 가지고 있었다.

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국내에서 분리한 토마토 시들음병균(Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici)의 체세포 화합성군 (Vegetable Compatibility Grouping of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici Isolated from Korea)

  • 유성준;김홍기;유승헌
    • 한국식물병리학회지
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    • 제11권4호
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    • pp.330-337
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    • 1995
  • Forty-six isolates of Fusarium oxysporum collected from infected tomato plants and soils in greenhouses in Sedo, Chungnam and Angang, Kyeongbuk and 8 isolates of F. oxysporum f. sp. lycopersici from Japan and USA were used to determine vegetative compatibility groups (VCGs). Vegetative comaptibility was assessed on the basis of heterokaryon formation among nitrate nonutilizing mutants. All Korean isolates of F. oxysporum f. sp. lycopersici used in this study belonged to the same type of VCG (003) regardless of their geographic origin, cultivar and race, but they were incompatible with the foreign isolates of VCG 0030, 0031, 0032 and 0033. Based on the results, the Korean isolates of F. oxysporum f. sp. lycopersici were classified as a new VCG 003.

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Characterization of Fusarium oxysporum f. sp. fragariae Based on Vegetative Compatibility Group, Random Amplified Polymorphic DNA and Pathogenicity

  • Nagarajan Gopal;Kang Sung-Woo;Nam Myeong-Hyeon;Song Jeong-Young;Yoo Sung-Joon;Kim Hong-Gi
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제22권3호
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    • pp.222-229
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    • 2006
  • Twenty-two isolates of Fusarium oxysporum f. sp. fragariae were obtained from diseased strawberry plants and their characteristics were investigated by vegetative compatibility group (VCG), random amplified polymorphic DNA (RAPD), and pathogenicity. Three major VCGs (A, B, and C) and one incompatible group were identified by nitrate reductase complementation test. The virulence pattern of the 22 isolates was studied in relation to four cultivars including Dochiodome, Red-pearl, Maehyang and Akihime. RAPD markers were used to determine genetic relationship, and created three major clusters among the 22 isolates of F. oxysporum f. sp. fragariae. Isolates belong to VCG-C were strongly pathogenic, and relatively high correlation was existed among VCG and RAPD, and virulence. In addition, VCG and RAPD pattern between pathogenic and non-pathogenic isolates were distinctly different.

Vegetative Compatibility Group of Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici in Korea

  • Kim, Sung-Ho;Kim, Jong-Tae;Jang, Chang-Soon;Yoo, Sung-Jun;Kim, Hong-Gi
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제21권3호
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    • pp.214-220
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    • 2005
  • Vegetative compatibility groups (VCGs) of Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici isolates collected from tomatoes in Korea were analyzed to determine the genetic characteristics and compared to those of foreign isolates. In comparison of VCG specificity with foreign VCG subgroup testers, Korean isolates were revealed to be VCG 0094 and to be similar to those of Israel and Florida, USA having a 'Universal' property. Results of this study will contribute the effective control of disease through precise estimation of fungal damage, the prediction of new pathogenic isolates appearance, and the movement of foreign pathogens.

Vegetative Compatibility Groups and Virulence Variation Among Isolates of Pyrenophora graminea

  • Arabi, Mohammad Imad Eddin;Jawhar, Mohammad
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제27권2호
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    • pp.116-119
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    • 2011
  • Pyrenophora graminea, the causal agent of leaf stripe disease, is an economically important pathogen of barley found worldwide. Forty-four isolates of diverse geographical origin within Syria were grouped into vegetative compatibility groups (VCGs) by demonstrating heterokaryosis by complementation tests using nitrate nonutilizing (nit) mutants. All isolates were grouped into three VCGs-1-A, 1-B and 1-C. No self-incompatibility was observed in any of the isolates tested. VCG 1-A was the most common group within growing regions in Syria and proved to be the most virulent of the VCGs identified. These data indicate that the level of virulence in P. graminea is related to VCG.

Vegetative Compatibility Grouping and Pathogenicity of Colletotrichum gloeosporioides Isolates from Different Host Plants

  • Ahn, Il-Pyung;Kim, Soonok;Im, Kyung-Hwan;Lee, Yong-Hwan
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제19권6호
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    • pp.269-273
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    • 2003
  • A total of 57 isolates of Colletotrichum gloeosporioides were recovered from diseased tissues of Hall's crab apple (Malus haliana), 3 cultivars of edible apple (M. pumila var. dulcissima), red pepper (Capsicum annum), and grapevine (Vitis vinifera) fruits. All isolates showed strong virulence on their own host plants. Isolates from edible apple exhibited high level of cultivar specificity in pathogenicity tests. Ten isolates from apple cultivar 'Fuji' were virulent on 'Jonathan' and 'Rall's Genet'. However, 12 isolates from 'Jonathan' and 'Rall's Genet' were not virulent on 'Fuji'. Among the 24 isolates from red pepper, only seven and two isolates were infective on edible apple and grapevine fruits, respectively. All six isolates from grapevine were only virulent on their own host. These isolates were grouped into five vegetative compatibility groups (VCGs), A, B, C, D, and E, by demonstrating heterokaryosis through complementation using nitrate-nonutilizing (nit) mutants. Among them, isolates belong to VCG-A and VCG-D accounted for 24 and 17 isolates; those in VCG-A exhibited wide host range involving Hall's crab apple, all three edible apple cultivars, and red pepper. On the other hand, isolates of VCG-D and VCG-E showed limited host range specific to red pepper and grapevine, respectively. Taken together, the data suggest that among C. gloeosporioides isolates, the concepts of pathotype and/or forma specialis may exist, and that three is a relationship between host specificity and VCG grouping among C. gloeosporioides isolates.

한국의 잔디에서 분리한 Sclerotinia homoeocarpa 균의 체세포화합성군 분류 (Vegetative Compatibility Grouping of Sclerotinia homoeocarpa Isolates Infecting Turfgrass in South Korea)

  • 장석원;장태현;홍점규;박종현;정석우
    • 아시안잔디학회지
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    • 제25권2호
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    • pp.171-176
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    • 2011
  • 동전마름병을 일으키는 Sclerotinia homoeocarpa는 한국에서 가장 일반적인 한지형 잔디 병원균이다. 경기도, 충청남도, 전라북도, 경상북도 등 다양한 지역에서 분리한 13개 균주로부터 유도된 nit 변이균주를 이용하여 의한 체세포화합성군(vegetative compatibility group, VCG) 평가가 이루어졌다. 돌연변이주는 질소동화작용에 근거하여 nit1, nit2, nit3, NitM 등 4가지 유형으로 분류되었다. 균주간에 돌연변이주 발생정도는 크게 차이가 있었으며 최대 15개의 변이주를 생산한 균주가 있는 반면에 전혀 형성하지 못한 균주도 존재하였다. 선택배지에서 4가지 돌연변이주 유형 중에 nit1과 NitM의 발생빈도(80%)가 높았으며, nit2와 nit3은 발생빈도가 매우 낮았다. 한 개의 큰 체세포화합성군 그룹과 4개의 작은 그룹이 18개 돌연변이주로부터 결정되었다. Nit 변이균주를 이용하여 의한 VCG 평가는 매우 효율적이었으며, 향후 한국의 Sclerotinia homoeocarpa균의 효율적 관리를 위한 생태학적 역학적인 면을 연구하기 위해서는 보다 많은 지역으로부터 분리된 균주의 평가가 필요하다.

Evidence for Genetic Similarity of Vegetative Compatibility Groupings in Sclerotinia homoeocarpa

  • Chang, Seog Won;Jo, Young-Ki;Chang, Taehyun;Jung, Geunhwa
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제30권4호
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    • pp.384-396
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    • 2014
  • Vegetative compatibility groups (VCGs) are determined for many fungi to test for the ability of fungal isolates to undergo heterokaryon formation. In several fungal plant pathogens, isolates belonging to a VCG have been shown to share significantly higher genetic similarity than those of different VCGs. In this study we sought to examine the relationship between VCG and genetic similarity of an important cool season turfgrass pathogen, Sclerotinia homoeocarpa. Twenty-two S. homoeocarpa isolates from the Midwest and Eastern US, which were previously characterized in several studies, were all evaluated for VCG using an improved nit mutant assay. These isolates were also genotyped using 19 microsatellites developed from partial genome sequence of S. homoeocarpa. Additionally, partial sequences of mitochondrial genes cytochrome oxidase II and mitochondrial small subunit (mtSSU) rRNA, and the atp6-rns intergenic spacer, were generated for isolates from each nit mutant VCG to determine if mitochondrial haplotypes differed among VCGs. Of the 22 isolates screened, 15 were amenable to the nit mutant VCG assay and were grouped into six VCGs. The 19 microsatellites gave 57 alleles for this set. Unweighted pair group methods with arithmetic mean (UPGMA) tree of binary microsatellite data were used to produce a dendrogram of the isolate genotypes based on microsatellite alleles, which showed high genetic similarity of nit mutant VCGs. Analysis of molecular variance of microsatellite data demonstrates that the current nit mutant VCGs explain the microsatellite genotypic variation among isolates better than the previous nit mutant VCGs or the conventionally determined VCGs. Mitochondrial sequences were identical among all isolates, suggesting that this marker type may not be informative for US populations of S. homoeocarpa.

Random Amplified Polymorphic DNA(RAPD)를 이용한 딸기 시들음병균(Fusarium oxysporum f. sp. fragariae)의 분류 (Differentiation of Fusarium oxysporum f. sp. fragariae Isolates by Random amplified Polymorphic DNA (RAPD) Analysis.)

  • 현재욱;박원목
    • 한국식물병리학회지
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    • 제12권1호
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    • pp.41-46
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    • 1996
  • 본 실험은 이병 딸기의 조직에서 분리 동정된 시들음병균(Fusarium oxysporum f. sp. fragariae) 균주들의 유?거 변이를 random amplified polymorphic DNA(RAPD) marker들을 이용하여 조사하였다. 총 24개의 딸기 시들음병 균주들의 DNA를 주형으로 하여 16개의 random 10-mer primer들을 사용하여 증폭시킨 결과 총 231개의 marker들을 이용하여 유전적 변이를 조사해 본 결과 크게 RAPD I과 RAPD II의 2개 그룹으로 나눌 수 있었다. RAPD I그룹에 속하는 균주는 VCG A에 속하는 Y1, K1, K2, K3, K4, N2, N3, N4-1, N6-1, N6-2, N8, N9, N10, M1-2-1 균주, VCG B에 속하는 M4-1 균주 그리고 VCG C에 속하는 N1, Y2 균주들이었고, RAPD II그룹에는 VCG B에 속하는 M1-1, M2-2-1, M2-4-2, M3-2, M3-3-2 균주와 VCG D에 속하는 N1 1 균주가 속하였다. 이들 2그룹 간에는 31%의 유사성이 있었다.

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