Genetic polymorphism and molecular authentication were investigated with the commercial medicinal herb, Peony (Paeonia spp.), using random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. To identify the polymorphism of the RAPD patterns among plant origins, 20 different random primers were applied to the genomic DNA extracted from Paeonia spp. plants such as Paeonia (P.) lactiflora, P. officinale and P. japonica. Ten primers out of 20 primers could be used to discriminate the plant species in the same genus and 72 out of 81 scored DNA fragments (88.9%) generated with these primers were polymorphic. Especially, four primers, such as OPA1, OPA3, OP9, and OPA13, were useful to discriminate the plant origins among the species of Peony. In the results of cluster analysis using RAPD data obtained from the 10 primers, Peony (Paeonia spp.) plants used in this study were grouped into the two distinctive clusters, genetically. Herb medicine, especially P. lactiflora, were easily identified, when species-specific primers were applied to the investigation for discriminating herb medicine currently traded in domestic herb market, Kyungdongmart. Consequently, RAPD analysis was useful method to discriminate plant origins and the commercial medicinal herbs, Paeonia spp..
Abiotic stress is one of the most serious problems in plant productivity because it dramatically delays plant growth and development. One of the abiotic stresses, soil salinity, has an adverse effect on plant growth, particularly in areas where irrigation is necessary like semiarid Asia and Africa. Among several physiological parameters, anthocyanin accumulation is a valuable indicator of the condition of the plant, and it tends to increase under salt stress conditions because of its protective role in such an environment. Consequently, it may be important to search for well adapted genotypes for upcoming climate changes. Anthocyanins are known to have important roles in defense against biotic and abiotic stresses, providing important functions for protecting plant cells from reactive oxygen species. In this study, we investigated the anthocyanin accumulation between two Korean sorghum genotypes, Sodamchal and Nampungchal. The two genotypes were subjected to a regulated salinity condition, and the anthocyanin contents were evaluated in both. In Nampungchal, the anthocyanin content increased with 150 mM NaCl treatment during the time course of the experiment. However, the anthocyanin content of Sodamchal decreased in the same condition. The measured values of the anthocyanin content should be useful to identify the intensity of the salt tolerance in Sorghum bicolor L. Furthermore, we studied gene expression profiling of salt stress related genes with qRT-PCR. These results suggest that Nampungchal is a more tolerant genotype to salt stress compared to Sodamchal. This information should be useful for breeding salt-resistant cultivars in sorghum.
You Ju-Han;Cho Heung-Won;Jin Yeon-Hee;Yun Hee-Bin;Lee Gwi-Yong;Han Ju-Hwan;Lee Cheol-Hee
Korean Journal of Plant Resources
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v.18
no.3
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pp.390-402
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2005
This study was carried out systematically to grasp the resource plants in construct-reserved site of ecological forest, Jecheon-si, Chungcheongbuk-do, Korea. This site was located at $37^{\circ}12'$ in latitude and $127^{\circ}57'$ in longitude and the period of survey was from March to October, 2004. The vascular plants were summarized as 371 taxa; 83 families, 238 genera, 324 species, 44 varieties and 3 forma. And in the results of survey on resource plants, we confirmed 178 taxa of ornamental plants$(47.98\%)$, 232 taxa of edible plants$(62.53\%)$, 257 taxa of medicinal plants$(69.27\%)$ and 154 taxa of other useful plants$(41.51\%)$. The rare and endangered plants designated by Korea Forest Service were 4 taxa; Eranthis stellata, Paeonia japonica, Viola albida and Scopolia japonica.
In this review, we described the catalogues of the rice proteome which were constructed in our program, and functional characterization of some of these proteins was discussed. Mass-spectrometry is the most prevalent technique to rapidly identify a large number of proteome analysis. However, the conventional Western blotting/sequencing technique has been used in many laboratories. As a first step to efficiently construct protein cata-file in proteome analysis of major cereals, we have analyzed the N-terminal sequences of 100 rice embryo proteins and 70 wheat spike proteins separated by two-dimensional electrophoresis. Edman degradation revealed the N-terminal peptide sequences of only 31 rice proteins and 47 wheat proteins, suggesting that the rest of separated protein sports are N-terminally blocked. To efficiently determine the internal sequence of blocked proteins, we have developed a modified Cleveland peptide mapping method. Using this above method, the internal sequences of all blocked rice proteins(i, e., 69 proteins) were determined. Among these 100 rice proteins, thirty were proteins for which homologous sequence in the rice genome database could be identified. However, the rest of the proteins lacked homologous proteins. This appears to be consistent with the fact that about 45% of total rice cDNA have been deposited in the EMBL database. Also, the major proteins involved in the growth and development of rice can be identified using the proteome approach. Some of these proteins, including a calcium-binding protein that tuned out to be calreticulin, gibberellin-binding protein, which is ribulose-1.5-bisphosphate carboxylase/oxygense active in rice, and leginsulin-binding protein in soybean have functions in the signal transduction pathway. Proteomics is well suited not only to determine interaction between pairs of proteins, but also to identify multisubunit complexes. Currently, a protein-protein interaction database for plant proteins(http://genome.c.kanazawa-u.ac.jp/Y2H)could be a very useful tool for the plant research community. Also, the information thus obtained from the plant proteome would be helpful in predicting the function of the unknown proteins and would be useful be in the plant molecular breeding.
New types of cytoplasmic male sterility in Brassica species would be very useful for the production of F$_1$, hybrid seeds. Leaves and stems of rapid cycling stock of B.juncea (CrGC4-3) containing Anand CMS were used as experimental materials for plant regeneration from protoplast culture. Very high plant regeneration rate (85%) was found in the Kao & Michayluk medium supplemented with 2 mg/L zeatin, 0.5 mg/L BAP, and 1 mg/L NAA when only leaf, not stem, segments were cultured. Protoplasts were isolated from leaves using mixtures of enzymes (1% Cellulycin, 0.5% Macerozyme) in 0.4 M mannitol and 50 mM $CaCl_2$.$2H_2$O. Mcrocalli induced from protoplasts were transferred to the shoot regeneration medium containing 2 mg/L BAP, 2 mg/L zeatin, and 0.5 mg/L NAA. After 60 days of initial protoplast culture, regenerated plantlets were obtained, acclimatized, transplanted into the pots, and grown up to the flowering stage.
Kim, Min-Jea;Choi, Sun-Hee;Kim, Tae-Sung;Park, Min-Hye;Lim, Hee-Rae;Oh, Kyung-Hee;Kim, Tae-San;Lee, Min-Hyo;Ryu, Ki-Hyun
The Plant Pathology Journal
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v.20
no.3
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pp.206-211
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2004
Transgenic Nicotiana benthamiana plants harboring coat protein (CP) gene of Zucchini green mottle mosaic virus (ZGMMV) were generated for virus-resistant screening and complementation analysis of related viruses for environmental safety assessment (SA) of living modified organism (LMO) purposes. Transformation of leaf disc of N.benthamiana was performed by using Agrobacterium-mediated method and the pZGC-PPGA748 containing the ZGMMV CP and NPTII genes. Two kinds of transgenic homozygous groups, virus-resistant and virus-susceptible N.benthamiana lines, were obtained by screening of challenging homologous virus for Tl generations. These two pathologically different lines can be useful for host-virus interactions and LMO environmental SA.
Two-dimensional gel electrophoresis (2-DGE) is one of the most important technologies for high-resolution separation of proteins for proteomics. In this study, we present a detail 2-DGE protocol which allows detection and quantification of total plant proteins separated on gels to improve matching in image analysis. This protocol highlighted here may be useful for researchers, who like to first study for the development of protein biomarkers involved in development, biotic and abiotic stresses in plant.
Deep rooting, which enables plants to extract water from greater soil depths, is a critical strategy for improving plant survival under water-deficient conditions. However, as it is difficult to observe intact root systems belowground, several techniques have been developed to screen deep- and shallow-rooting phenotypes in rice. Here, we introduce a simple and convenient method for deep- and shallow-rooting phenotyping using a unique combination of sand, soil, and plastic mesh netting. Vandana, a drought-tolerant rice variety, and Dongjin, a Korean japonica rice variety, were used to analyze root phenotypes. No significant differences in root length were observed in rice grown under irrigated conditions regardless of net position, whereas roots were significantly longer, and ratio of deep root (RDR) values were significantly higher in Vandana rice grown under semi-drought conditions. In summary, this simple and useful method represents a low-cost means of phenotyping the roots of rice and other crops grown in various-sized pots and at multiple plant growth stages.
Brucella (B.) canis is mainly transmitted by direct or indirect contact with aborted fetuses and placenta. It's also known to be able to infect human, which likely results in providing veterinarians and companion animal owners for infectious risk. To develop diagnostic ELISA, we cloned and expressed rp1L gene of B. canis, which encodes the ribosomal protein L7/L12. Using this purified recombinant protein, indirect-ELISA (iELISA) was evaluated using 78 positive and 44 negative sera. The sensitivity and the specificity of iELISA were 94% and 89%, respectively. The results indicated that indirect-ELISA using recombinant ribosomal protein L7/L12 may be useful for diagnosis of canine brucellosis.
Six-hundred bacterial strains from human milk and milk from Sahiwal cows, Holstein Friesian cows, and buffaloes were screened for their ability to suppress phytopathogenic fungi under in vitro conditions. A consortium of 3 strains, viz., Bacillus lentimorbus B-30486 (B-30486), B. subtilis B-30487 (B-30487), and B. lentimorbus B-30488 (B-30488), isolated from Sahiwal cow milk resulted in better biological control and plant-growth promotion than single-strain treatments. For commercial-scale production of a bioinoculant, the solid-state fermentation of sugarcane agro-industrial residues, i.e., molasses, press mud, and spent wash, using the consortium of B-30486, B-30487, and B-30488, resulted in a value-added product, useful for enhancing plant growth. The application of the consortium to sugarcane fields infested with Fusarium moniliforme and Colletotrichum falcatum resulted in a reduction of mortality and significantly higher (P=0.05) plant height, number of tillers, and cane girth when compared with the control. Furthermore, under field conditions, the treatment of sugarcane with the consortium resulted in significantly (P=0.05) greater plant growth compared with nonbacterized plants. Accordingly, this is the first report on the effective use of bacteria isolated from milk for biological control and enhancing plant growth under field conditions. Furthormore, a solid-state fermentation technology was developed that facilitates the economic utilization of agro-industrial residues for environmental conservation and improving plant and soil health.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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