• 제목/요약/키워드: Unrecorded Fungi

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Penicillium from Rhizosphere Soil in Terrestrial and Coastal Environments in South Korea

  • Park, Myung Soo;Lee, Jun Won;Kim, Sung Hyun;Park, Ji-Hyun;You, Young-Hyun;Lim, Young Woon
    • Mycobiology
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    • 제48권6호
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    • pp.431-442
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    • 2020
  • Penicillium, the most common genus plays an important ecological role in various terrestrial and marine environments. However, only a few species have been reported from rhizosphere soil. As part of a project to excavate Korean indigenous fungi, we investigated rhizosphere soil of six plants in the forest (terrestrial habitat) and sand dunes (coastal habitat) and focused on discovering Penicillium species. A total of 64 strains were isolated and identified as 26 Penicillium species in nine sections based on morphological characteristics and the sequence analysis of β-tubulin and calmodulin. Although this is a small-scale study in a limited rhizosphere soil, eight unrecorded species and four potential new species have been identified. In addition, most Penicillium species from rhizosphere soil were unique to each plant. Penicillium halotolerans, P. scabrosum, P. samsonianum, P. jejuense, and P. janczewskii were commonly isolated from rhizosphere soil. Eight Penicillium species, P. aurantioviolaceum, P. bissettii, P. cairnsense, P. halotolerans, P. kananaskense, P. ortum, P. radiatolobatum, and P. verhagenii were recorded for the first time in Korea. Here, we provide the detailed morphological description of these unrecorded species.

Blastobotrys illinoisensis, an Unrecorded Anamorphic Yeast Strain Isolated from the Gut of the Earthworm Eisenia fetida

  • Ji Yun Son;Myung Kyum Kim
    • 한국균학회지
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    • 제50권4호
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    • pp.373-381
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    • 2022
  • Strain E4, an unrecorded species of dimorphic fungi, was isolated from the gut of earthworms collected in Gyeonggi Province, South Korea. Nucleotide sequence analysis of the D1/D2 region of the large subunit (LSU) rRNA gene and the internal transcribed spacer (ITS) region revealed that this species is a member of the genus Blastobotrys, Blastobotrys illinoisensis. Strain E4 differed from its closest known species, B. mokoenaii and B. malaysiensis, by harboring 3-5 and 12-14 nucleotide substitutions in the D1/D2 and ITS regions, respectively. Phylogenetic analysis based on concatenated sequences of the D1/D2 region of the LSU rRNA gene and the ITS region also indicated that strain E4 belongs to the Blastobotrys clade and is distinct from other related species in the clade. The previously unreported isolate could be distinguished from closely related species by its inability to ferment carbon sources. To our knowledge, this is the first report on the isolation of Blastobotrys species from the gut of earthworms in Korea. The strain used was E4 (=KCTC 27831=JCM 33428).

Re-Identification of Aspergillus Subgenus Circumdati Strains in Korea Led to the Discovery of Three Unrecorded Species

  • Anbazhagan Mageswari;Yunhee Choi;Le Dinh Thao;Daseul Lee;Dong-Hyun Kim;Myung Soo Park;Seung-Beom Hong
    • Mycobiology
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    • 제51권5호
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    • pp.288-299
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    • 2023
  • Aspergillus is one of the largest and diverse genera of fungi with huge economical, biotechnological, and social significance. Taxonomically, Aspergillus is divided into six subgenera comprising 27 sections. In this study, 235 strains of Aspergillus subgenus Circumdati (section: Candidi, Circumdati, Flavi, Flavipedes, Nigri, and Terrei) preserved at the Korean Agricultural Culture Collection (KACC) were analyzed and re-identified using a combined dataset of partial b-tubulin (BenA), Calmodulin (CaM) gene sequences and morphological data. We confirmed nineteen species to be priorly reported in Korea (A. neotritici, A. terreus, A. floccosus, A. allahabadii, A. steynii, A. westerdijkiae, A. ochraceus, A. ostianus, A. sclerotiorum, A. luchuensis, A. tubingensis, A. niger, A. welwitschiae, A. japonicus, A. nomius, A. tamarii, A. parasiticus, A. flavi, and A. oryzae). Among the studied strains, three species (A. subalbidus, A. iizukae, and A. uvarum), previously unreported or not officially documented, were discovered in Korea, to the best of our knowledge. We have given a detailed description of the characteristic features of the three species, which remain uncharted in Korea.

Unrecorded Fungi Isolated from Fire Blight-controlled Apple Orchard Soil in Korea

  • Soo Young Chi;Jun Woo Cho;Hyeongjin Noh;Minseok Kim;Ye Eun Kim;Seong Hwan Kim
    • 한국균학회지
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    • 제51권4호
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    • pp.491-504
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    • 2023
  • To explore fungal diversity in orchard soil where fire-blighted apple trees are buried, we collected soil samples from apple orchards in Chungju, Korea. Fungal isolates were obtained from DG18 agar and identified at the species level based on morphological features and phylogenetic analyses. The colony characteristics and microstructures were examined using a light microscope and a scanning electron microscope after culturing on potato dextrose agar (PDA), malt extract agar (MEA), Czapek yeast agar (CYA), and oatmeal agar (OA) The PCR-amplified products of the ITS1-5.8S-ITS2 region and 28S large subunit of the nuclear ribosomal RNA gene, as well as partial sequences of the β-tubulin, calmodulin, and translation elongation factor 1-α genes were sequenced and analyzed phylogenetically. Seven previously unknown fungal species were explored in Korea. All samples, including Aspergillus aureolatus, Botryotrichum atrogriseum, Dactylonectria novozelandica, Fusarium denticulatum, Paecilomyces tabacinus, Sarcopodium tibetense and Talaromyces stollii, had ascomycetes. Herein, we report their descriptions and features.

한국산(韓國産) 고등(高等) 균류(菌類)의 분류학적(分類學的) 연구(硏究)(제6보)(第6報) (Taxonomic Investigations on Korean Higher Fungi(VI))

  • 박완희;민경희;김양섭;박용환;김병각
    • 한국균학회지
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    • 제16권4호
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    • pp.226-229
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    • 1988
  • 1984년(年) 6월(月)부터 1987년(年) 11월(月)까지 불암산(佛岩山) 기슭에 있는 서울산업대학(産業大學) 캠퍼스에서 채집(採集)한 한국산(韓國産) 균류(?類) 120여종(餘種)을 관찰(觀察)한 결과(結果), 말기록속(末記錄屬) 1속(屬)과 미기록종(未記錄種) 2종(種) 동정(同定)하였기에 보고(報告)하는 바이다. 말기록속(末記錄屬)은 반달버섯속 Hapalopilus이고 미기록종(未記錄種)은 질산벚꽃버섯 Hygrophorus nitratus(Pers. ex Pers.) Fr,와 노란반달버섯 Hapalopilus rutilans(Pers. ex Fr.) Karst. 이다.

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서울대학교(大學校) 수원(水原)캠퍼스에서 채집(採集)한 목재부후균(木材腐朽菌)(I) (Wood-Rotting Fungi Collected in Suweon Campus of Seoul National University (1))

  • 라용준;신현동
    • 한국균학회지
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    • 제10권4호
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    • pp.203-206
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    • 1982
  • 1981년(年) 9월(月)부터 1982년(年) 10월(月)까지 서울대학교(大學校) 수원(水原)캠퍼스내(內)에서 목재부후균(木材腐朽菌)을 채집(採集)하였다. 이들은 2목(目), 8과(科), 22속(屬), 34종(種)으로 분류(分類)되였으며, 그 중(中) 한국산(韓國産) 미기록속(未記錄屬) Gloeoporus와 미기록종(未記錄種) G. adustus(Willd. ex Fr.) $Pil\acute{a}t$ 및 G. dichrous(Fr.) Bres.가 발견(發見)되었다. 이들 신종(新種)에 대해 우리말 버섯이름이 주어졌으며, 자실체(子實體)에 대한 기술(記述)을 덧붙였다. 채집(採集)된 34종(種)에 대해 각각(各各) 서식(棲息)하는 나무의 속명(屬名)을 기재(記載)하였다. 각(各) 표본(標本)은 서울대학교(大學校) 농과대학(農科大學) 농생물학과(農生物學科)에 보존(保存)되어 있다. 한국산(韓國産) 미기록종(未記錄種)의 동정(同定)에 협조(協助)하여 주신 미국(美國) Virginia주립대학교(州立大學校) Orson K. Miller, Jr. 교수(敎授)에게 감사(感謝)를 드린다.

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토천궁의 뿌리에서 분리된 2종의 국내 미기록 내생균: Pithomyces chartarum and Plectosphaerella niemeijerarum (Two Unrecorded Enophytic Fungi Isolated from Root of Ligusticum chuanxiong in Korea: Pithomyces chartarum and Plectosphaerella niemeijerarum)

  • 박혁;정충렬;엄안흠
    • 한국균학회지
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    • 제47권4호
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    • pp.329-335
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    • 2019
  • 경북 영주의 산림약용자원연구소에서 재배된 토천궁의 뿌리에서 내생균을 분리하였다. 분리된 균주는 형태적 특성의 분석과 internal transcribed spacer, large subunit rDNA, beta-tubulin 영역의 분자 생물학적 계통분석을 이용해 동정하였다. 연구 과정에서 2종의 국내 미기록종 내생균 균주를 확인하였고, 확인된 종은Pithomyces chartarum 과 Plectosphaerella niemeijerarum이다. 미기록종 내생균 균주의 형태적 특성 확인 및 분자계통 분석의 결과에 대해 기술하였다.

표주박이끼(Funaria hygrometrica)에서 분리된 2종의 국내 미기록 내생균 (Two Unrecorded Endophytic Fungi Isolated from Funaria hygrometrica in Korea)

  • 최현숙;박혁;엄안흠
    • 한국균학회지
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    • 제47권4호
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    • pp.313-318
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    • 2019
  • 표주박이끼의 헛뿌리(rhizoid)에서 내생균을 분리하였다. 분리된 균주는 형태적 특성 및 internal transcribed spacer, large subunit rDNA 영역의 분자적 분석을 토대로 동정하였다. 연구 과정에서 2종의 국내 미기록종 내생균 균주를 확인하였고, 확인된 종은 Curvularia protuberata, Didymella anserina이다. 미기록종 내생균 균주의 형태적 특성 및 계통 분석 결과에 대해 기술하였다.

꼬마초롱이끼(Mnium heterophyllum)와 가는털깃털이끼(Hypnum plumaeforme)에서 분리한 국내 미기록 내생균: Biscogniauxia petrensis, Cercophora thailandica (Unrecorded Endophytic Fungi Isolated from Mnium heterophyllum and Hypnum plumaeforme in Korea: Biscogniauxia petrensis and Cercophora thailandica)

  • 최현숙;박혁;어주경;엄안흠
    • 한국균학회지
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    • 제48권1호
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    • pp.55-61
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    • 2020
  • 꼬마초롱이끼의 헛뿌리와 가는털깃털이끼의 잎에서 내생균을 분리하였다. 분리된 균주는 형태적 특성과 internal transcribed spacer, large subunit rDNA, Beta-tublin 영역 및 RNA polymerase II second largest subunit gene의 분자적 분석을 토대로 동정하였다. 연구 과정에서 2종의 국내 미기록종 내생균인 Cercophora thailandica와 Biscogniauxia petrensis를 확인하였다. 분리된 미기록종 내생균 균주의 형태적 특성 확인 및 계통 분석 결과에 대해 기술하였다.

식물 근권토양에서 분리한 수지상균근균 (Notes on Some Unrecorded Species of Arbuscular Mycorrhizal Fungi Collected from Rhizospheres of Plants in Korea)

  • 이은화;이정윤;어주경;가강현;엄안흠
    • 한국균학회지
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    • 제42권4호
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    • pp.306-311
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    • 2014
  • 본 연구에서는 우리나라 목본식물의 근권에서 수지상균 근균을 분리하여 배양하였다. 형태 및 18S rDNA 염기서열 분석을 통해 총 4개 속 5개 종의 수지상균근균을 동정하였으며 이들 균은 현재까지 국내미기록종이다; Acaulospora cavernata, Claroideoglomus luteum, Diversispora aurantium, D. trimurales, Rhizophagus irregularis. 각 종의 형태적 특징 및 계통관계를 제시하였다. 본 연구는 우리나라 수지상균 근균의 다양성 연구에 유용할 것으로 판단된다.