모자익병징을 나타내는 이병시금치를 채집하여 순무모자익 바이러스를 분류 동정하였다. 분리된 순무모자익바이러스를 지표식물에 접종한 결과 담배(B.Y)와 명아주에는 국부병반이 형성되었고 쑥갓, 시금치, 무우에는 모자익 병징이 나타났다. 이병시금치 잎을 착즙하여 순무모자익바이러스의 항혈청과의 혈청반응 시험 결과 양성 반응이 나타났다. 이병엽을 Dip법으로 시료를 제작하여 전자현미경에서 검경한 결과 대부분이 750nm의 사상 입자가 관찰되었다. 시금치에서 순무모자익바이러스의 발생분포는 수원, 안양, 대구, 진주 등 거의 전국적으로 발생하였다
Weeds are widely grown in the field and are infected by many viruses. A survey was conducted to identify viruses infecting weeds in Korea. Virus-infected weed samples including Rorippa indica (L.) Hiern, R. islandica (Oed.) Bord, Crepidiastrum denticulatum (Houtt.) Pak & Kawanno, Achyranthes japonica (Miq.) Nakai, and Chrysanthemum boreale (Makino) Makino were collected in Kyonggi Province. These weeds were grown in the greenhouse and were isolated on 10 test plants. Several virus isolates were isolated fron infected tissues and were further studied by host range assay, serological test, electron microscopy (EM), reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and sequencing. Each isolated virus strain was mechanically transmitted to weeds and various hosts including Nicotiana spp., Brassica spp., Vigna unguiculata, Capsicum annuum, and Cucumis sativus and showed systemic mosaic, vein clearing, necrosis, mottle, malformation, chlorosis, and/or death of host plants in some cases. Each virus was then purified using infected leaves and observed by EM. From these results three viruses were isolated and identified as Turnip mosaic virus (TuMV), Broad bean wilt virus (BBWV), and Cucumber mosaic virus (CMV). RT-PCR using virus-specific oligonucleotide primers and the cloning were conducted to determine the nucleotide sequences of coat proteins of the three viruses their amino acid sequence were deduced. The amino acid sequence homologies were about 92.7 to 99.7%, 96.2 to 97.7%, and 93.9 to 98.6% to other reported TuMV, BBWV, and CMV strains, respectively. These results suggest that many weeds may serve as primary inoculum source of diseases caused by TuMV, BBWV, CMV and that the management of these viral diseases can be achieved through weed control.
Using the Chinese cabbage (Brassica campestris) cultivar 'Chun-goang' as a host and turnip mosaic virus (TuMV) as a pathogen, we studied the effects of ambient temperature ($13^{\circ}C$, $18^{\circ}C$, $23^{\circ}C$, $28^{\circ}C$ and $33^{\circ}C$) on disease intensity and the speed of systemic infection. The optimal temperature for symptom expression of TuMV was $18-28^{\circ}C$. However, symptoms of viral infection were initiated at $23-28^{\circ}C$ and 6 days post infection (dpi). Plants maintained at $33^{\circ}C$ were systemically infected as early as 6 dpi and remained symptomless until 12 or 22 dpi, depending on growth stage at the time of inoculation. It took 45 days for infection of plants grown at $13^{\circ}C$. Quantitative realtime polymerase chain reaction (q-PCR) results showed that the accumulation of virus coat protein was greater in plants grown at $23-28^{\circ}C$. The speed of systemic infection increased linearly with rising ambient temperature, up to $23^{\circ}C$. The zero-infection temperature was $10.1^{\circ}C$. To study the effects of abruptly elevated temperatures on systemic infection, plants inoculated with TuMV were maintained at $10^{\circ}C$ for 20 d; transferred to a growth chamber at temperatures of $13^{\circ}C$, $18^{\circ}C$, $23^{\circ}C$, $28^{\circ}C$, or $33^{\circ}C$ for 1, 2, or 3 d; and then moved back to $10^{\circ}C$. The numbers of plants infected increased as duration of exposure to higher temperatures and dpi increased.
Plants protect against viruses through passive and active resistance mechanisms, and in most cases characterized thus far, natural recessive resistance to potyviruses has been mapped to mutations in the eukaryotic initiation factor eIF4E or eIF(iso)4E genes. Five eIF4E copies and three eIF(iso)4E copies were detected in Brassica rapa. The eIF4E and eIF(iso)4E genes could interact with turnip mosaic virus (TuMV) viral protein linked to the genome (VPg) to initiate virus translation. From the yeast two-hybrid system (Y2H) and bimolecular fluorescence complementation (BiFC) assays, the TuMV-CHN2/CHN3 VPgs could not interact with BraA.eIF4E.a/c or BraA.eIF(iso)4E.c, but they could interact with BraA.eIF(iso)4E.a in B. rapa. Further analysis indicated that the amino acid substitution L186F (nt T556C) in TuMV-UK1 VPg was important for the interaction networks between the TuMV VPg and eIF(iso)4E proteins. An interaction model of the BraA. eIF(iso)4E protein with TuMV VPg was constructed to infer the effect of the significant amino acids on the interaction of TuMV VPgs-eIF(iso)4Es, particularly whether the L186F in TuMV-UK1 VPg could change the structure of the TuMV-UK1 VPg protein, which may terminate the interaction of the BraA.eIF(iso)4E and TuMV VPg protein. This study provides new insights into the interactions between plant viruses and translation initiation factors to reveal the working of key amino acids.
For several years, temperatures in the Korean peninsula have gradually increased due to climate change, resulting in a changing environment for growth of crops and vegetables. An associated consequence is that emerging species of insect vector have caused increased viral transmission. In Jeju Island, Korea, occurrences of viral disease have increased. Here, we report characterization of five newly collected turnip mosaic virus (TuMV) isolates named KBJ1, KBJ2, KBJ3, KBJ4 and KBJ5 from a survey on Jeju Island in 2017. Full-length cDNAs of each isolate were cloned into the pJY vector downstream of cauliflower mosaic virus 35S and bacteriophage T7 RNA polymerase promoters. Their fulllength sequences share 98.9-99.9% nucleotide sequence identity and were most closely related to previously reported Korean TuMV isolates. All isolates belonged to the BR group and infected both Chinese cabbage and radish. Four isolates induced very mild symptoms in Nicotiana benthamiana but KBJ5 induced a hypersensitive response. Symptom differences may result from three amino acid differences uniquely present in KBJ5; Gly(382)Asp, Ile(891)Val, and Lys(2522)Glu in P1, P3, and NIb, respectively.
Korean ginseng (Panax ginseng) is a dicotyledonous, medicinal, perennial plant belonging to the genus Panax of the family Araliaceae. We investigated the occurrence and incidence of plant viruses in Panax ginseng in Korea. A total of 656 leaf samples were combined into one and total RNA was extracted from the polled sample, using RNA sequencing (RNA-Seq), a metatranscriptome analysis of the plant virome was conducted. The virus present in Panax ginseng was confirmed by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) assay using virus-specific primers. In RNA-Seq data analysis, the multiplication protein of four viral contigs including Aristotelia chilensis virus 1 (AcV1), Turnip mosaic virus (TuMV), Watermelon mosaic virus (WMV), and Tobamovirus multiplication protein were discovered. From our metatranscriptome analysis and RT-PCR assay, TuMV and WMV were detected, whereas the three viruses reported in China such as tomato yellow leaf curl China virus; panax notoginseng virus A; and panax virus Y were not found in this study. The distribution of domestic ginseng viruses seems different from that recorded in China. Overall, this is the first plant virome analysis of Panax ginseng in Korea.
The studies on the ecology of virus disease on Chinese cabbage (Brassica campestris subsp. pekinensis) cultivated in alpine area of Kangwon province during summer season to analyse its influence on damage and develope a prediction model were performed from 1993 to 1997. Virus disease on Chinese cabbage occurring in the alpine area showed various symptom types and among there, necrotic spots and dwarf were mainly detected. The disease was increased from early August and continued mid September in every year. The occurrence of virus disease was the highest in 1994 with 20.5%, and the number of aphid vectors were also the highest during the same period. The number of aphids in the alpine areas showed twice peaks every year. For the analysis of damage by virus infection, the infection and injured ratio of all treatments were more than 90% and 80%, respectively. The most important factor for the occurrence of virus disease on Chinese cabbage was temperature. Factors influencing the development of the viral disease in the alpine area were maximum temperature and number of aphid vectors.
강원 고랭지의 대표적 지대인 평창의 대관령, 홍천의 내면 그리고 횡성의 둔내지역에서 재배되고 있는 주요 원예작물에 대해 1994년$\sim$1997년까지 4년에 걸쳐 실시한 병해조사의 결과는 다음과 같다. 1) 배추와 무에서는 순무모자이크바이러스(TuMV)가 '92년부터 고랭지에 다발생하여 '94년과 '96년에 피해가 심하였으며, 이 바이러스병과 함께 무름병의 발생이 심한 편이었으며, 최근에는 무사마귀병의 피해고 '96년부터 점증 추세에 있으며 수년 전까지 피해가 심했던 뿌리 마름병은 최근 발생이 지극히 저조한 점이 특이하다. 거의 모든 채소작물에서 무름병, 잿빛곰팡이병, 노균병, 흰가루병, 잘록병, 검은무늬병 등의 발생이 심한 것이 특징인데 저지대와 달리 고랭지 기후환경과 무관하지 않았을 것이다. 한편 조사기간 중 새로운 미기록종으로는 셀러리의 바이러스(BBWV)와 잿빛곰팡이병(Botrytis cinerea), 메론의 점무늬병(Cercospora citullina), 딸기의 흰가루병(Erysiphe polygori), 양상추의 흰가루병(Erysiphe cichoraceaium) 등이 밝혀졌으며 기주 미기록으로는 파슬리의 무사마귀병(Plasmodiophora brassicae)이 밝혀진 것이 특이하다. 2)여러 가지 화훼작물에는 주로 바이러스병, 잿빛곰팡이병, 시들음병, 흰무늬병 등의 발생이 많았으며 특히 자생 나리류에 흰무늬병(Cercospora spp.) 발생이 심하였다. 미기록종으로는 꽃도라지의 시들음병(Fusarium oxysporum f. sp. eustomae), 바이러스병(BBWV, CMV), 균핵병(Sclerotinia sclerotiorum), 잿빛곰팡이병(B. cinerea), 카네이션의 반점병(Cladosporium echinulatum), 용담의 시들음병(Fusarium oxysporum), 잎마름병(Alternavia dianthi) 등과 Phytoplasma에 의한 스타티스의 빗자루병, 리아트리스의 빗자루병, 자생나리류의 흰무늬병(Cercospora sp.), 스토크의 TuMV 등이 동정되었다.
Kim, Jinhee;Kim, Do-Sun;Lee, Eun Su;Ahn, Yul-Kyun;Chae, Won Byoung;Lee, Soo-Seong
원예과학기술지
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제35권2호
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pp.232-242
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2017
The goal of marker-assisted backcrossing (MAB) is to significantly reduce the number of breeding generations required by using genome-based molecular markers to select for a particular trait; however, MAB systems have only been developed for a few vegetable crops to date. Among the types of molecular markers, SNPs (single-nucleotide polymorphisms) are primarily used in the analysis of genetic diversity due to their abundance throughout most genomes. To develop a MAB system in Chinese cabbage, a high-throughput (HT) marker system was used, based on a previously developed set of 468 SNP probes (BraMAB1, Brassica Marker Assisted Backcrossing SNP 1). We selected a broad-spectrum TuMV (Turnip mosaic virus) resistance (trs) Chinese cabbage line (SB22) as a donor plant, constructing a $BC_1F_1$ population by crossing it with the TuMV-susceptible 12mo-682-1 elite line. Foreground selection was performed using the previously developed trsSCAR marker. Background selection was performed using 119 SNP markers that showed clear polymorphism between donor and recipient plants. The background genome recovery rate (% recurrent parent genome recovery; RPG) was good, with three of 75 $BC_1F_1$ plants showing a high RPG rate of over 80%. The background genotyping result and the phenotypic similarity between the recurrent parent and $BC_1F_1$ showed a correlation. The plant with the highest RPG recovery rate was backcrossed to construct the $BC_2F_1$ population. Foreground selection and background selection were performed using 169 $BC_2F_1$ plants. This study shows that, using MAB, we can recover over 90% of the background genome in only two generations, highlighting the MAB system using HT markers as a highly efficient Brassica rapa backcross breeding system. This is the first report of the application of a SNP marker set to the background selection of Chinese cabbage using HT SNP genotyping technology.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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