Purpose: The utility of 18-fluordesoxyglucose positron emission tomography ([18F]-FDG-PET) combined with computer tomography or magnetic resonance imaging (MRI) in gastric cancer remains controversial and a rationale for patient selection is desired. This study aims to establish a preclinical patient-derived xenograft (PDX) based [18F]-FDG-PET/MRI protocol for gastric cancer and compare different PDX models regarding tumor growth and FDG uptake. Materials and Methods: Female BALB/c nu/nu mice were implanted orthotopically and subcutaneously with gastric cancer PDX. [18F]-FDG-PET/MRI scanning protocol evaluation included different tumor sizes, FDG doses, scanning intervals, and organ-specific uptake. FDG avidity of similar PDX cases were compared between ortho- and heterotopic tumor implantation methods. Microscopic and immunohistochemical investigations were performed to confirm tumor growth and correlate the glycolysis markers glucose transporter 1 (GLUT1) and hexokinase 2 (HK2) with FDG uptake. Results: Organ-specific uptake analysis showed specific FDG avidity of the tumor tissue. Standard scanning protocol was determined to include 150 μCi FDG injection dose and scanning after one hour. Comparison of heterotopic and orthotopic implanted mice revealed a long growth interval for orthotopic models with a high uptake in similar PDX tissues. The H-score of GLUT1 and HK2 expression in tumor cells correlated with the measured maximal standardized uptake value values (GLUT1: Pearson r=0.743, P=0.009; HK2: Pearson r=0.605, P=0.049). Conclusions: This preclinical gastric cancer PDX based [18F]-FDG-PET/MRI protocol reveals tumor specific FDG uptake and shows correlation to glucose metabolic proteins. Our findings provide a PET/MRI PDX model that can be applicable for translational gastric cancer research.
Background: The prognostic value of human epidermal growth factor receptor-2 (HER-2/neu) for survival of patients with colorectal cancer (CRC) is still ambiguous. We therefore performed a meta-analysis to evaluate its prognostic significance. Materials and Methods: We searched the MEDLINE and EMBASE databases for published literature investigating associations between HER-2/neu status and overall survival of patients with CRC. A meta-analysis was performed using a DerSimonian-Laird model and publication bias was investigated by Begg's and Egger's tests. Subgroup analysis was also conducted according to the study design type, study quality score, cut-off value for HER-2/neu overexpression, publication region, patient number and publication year. Results: A total of 17 eligible studies involving 2,347 patients were identified for this meta-analysis. The combined hazard ratio (HR) was 1.31 (95% confidence interval (CI): 0.96-1.79), suggesting that HER-2/neu overexpression was not significantly associated with overall survival of patients with CRC. However, subgroup analysis revealed that HER-2/neu overexpression had an unfavorable impact on survival when the analysis was restricted to subgroups of study quality score ${\leq}5 $(HR=1.56, 95%CI: 1.17-2.10), Asian patients (HR=1.74, 95%CI: 1.22-2.49), patient number ${\leq}106$ (HR=1.57, 95%CI: 1.01-2.44), publication year before 2003 (HR=1.59, 95%CI: 1.02-2.49), and prospectively designed study (HR=3.62, 95%CI: 1.42-9.24). The effect disappeared in subgroups of study quality scores > 5 (HR=0.69, 95%CI: 0.33-1.44), non Asian patients (HR=1.14, 95%CI: 0.77-1.70), patients' number > 106 (HR=1.07, 95%CI: 0.67-1.72), publication year after 2003 (HR=1.13, 95%CI: 0.76-1.69), and retrospectively designed study (HR=1.22, 95%CI: 0.89-1.67). Conclusions: Our meta-analysis suggests that HER-2/neu overexpression might not be a significantly prognostic indicator for patients with CRC. Further studies are required to confirm these results.
The objective of this research was to classify intact soybeans and foreign objects using near-infrared (NIR) spectroscopy. Intact soybeans and foreign objects were scanned using a NIR spectrometer equipped with scanning monochromator. NIR spectra of intact soybeans and foreign objects in the wavelength range from 900 to 1800 nm were collected. The classification of intact soybeans and foreign objects were conducted by using partial least-square discriminant analysis (PLS-DA) and soft independent modelling of class analogy (SIMCA) multivariate methods. Various types of data pretreatments were tested to develop the classification models. Intact soybeans and foreign objects were successfully classified by the PLS-DA prediction model with mean normalization pretreatment. These results showed the potential of NIR spectroscopy combined with multivariate analysis as a method for classifying intact soybeans and foreign objects.
Over the past decade, the development of the Web explosively increased the data. Feature selection step is an important step in extracting valuable data from a large amount of data. This study proposes a novel opinion mining model based on combining feature selection (FS) methods with Word embedding to vector (Word2vec) and BOW (Bag-of-words). FS methods adopted for this study are CFS (Correlation based FS) and IG (Information Gain). To select an optimal FS method, a number of classifiers ranging from LR (logistic regression), NN (neural network), NBN (naive Bayesian network) to RF (random forest), RS (random subspace), ST (stacking). Empirical results with electronics and kitchen datasets showed that LR and ST classifiers combined with IG applied to BOW features yield best performance in opinion mining. Results with laptop and restaurant datasets revealed that the RF classifier using IG applied to Word2vec features represents best performance in opinion mining.
Thomas Weikert;Saikiran Rapaka;Sasa Grbic;Thomas Re;Shikha Chaganti;David J. Winkel;Constantin Anastasopoulos;Tilo Niemann;Benedikt J. Wiggli;Jens Bremerich;Raphael Twerenbold;Gregor Sommer;Dorin Comaniciu;Alexander W. Sauter
Korean Journal of Radiology
/
v.22
no.6
/
pp.994-1004
/
2021
Objective: To extract pulmonary and cardiovascular metrics from chest CTs of patients with coronavirus disease 2019 (COVID-19) using a fully automated deep learning-based approach and assess their potential to predict patient management. Materials and Methods: All initial chest CTs of patients who tested positive for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 at our emergency department between March 25 and April 25, 2020, were identified (n = 120). Three patient management groups were defined: group 1 (outpatient), group 2 (general ward), and group 3 (intensive care unit [ICU]). Multiple pulmonary and cardiovascular metrics were extracted from the chest CT images using deep learning. Additionally, six laboratory findings indicating inflammation and cellular damage were considered. Differences in CT metrics, laboratory findings, and demographics between the patient management groups were assessed. The potential of these parameters to predict patients' needs for intensive care (yes/no) was analyzed using logistic regression and receiver operating characteristic curves. Internal and external validity were assessed using 109 independent chest CT scans. Results: While demographic parameters alone (sex and age) were not sufficient to predict ICU management status, both CT metrics alone (including both pulmonary and cardiovascular metrics; area under the curve [AUC] = 0.88; 95% confidence interval [CI] = 0.79-0.97) and laboratory findings alone (C-reactive protein, lactate dehydrogenase, white blood cell count, and albumin; AUC = 0.86; 95% CI = 0.77-0.94) were good classifiers. Excellent performance was achieved by a combination of demographic parameters, CT metrics, and laboratory findings (AUC = 0.91; 95% CI = 0.85-0.98). Application of a model that combined both pulmonary CT metrics and demographic parameters on a dataset from another hospital indicated its external validity (AUC = 0.77; 95% CI = 0.66-0.88). Conclusion: Chest CT of patients with COVID-19 contains valuable information that can be accessed using automated image analysis. These metrics are useful for the prediction of patient management.
Background: Methyl donor status influences DNA stability and DNA methylation although little is known about effects on DNA methyltransferases. The aim of this study was to determine whether methyl-donor status influences DNA methyltransferase (Dnmt) gene expression in cervical cancer cells, and if so, whether there are associated effects on global DNA methylation. Materials and Methods: The human cervical cancer cell line, C4-II, was grown in complete medium and medium depleted of folate (F-M+) and folate and methionine (F-M-). Growth rate, intracellular folate, intracellular methionine and homocysteine in the extracellular medium were measured to validate the cancer cell model of methyl donor depletion. Dnmt expression was measured by qRT-PCR using relative quantification and global DNA methylation was measured using a flow cytometric method. Results: Intracellular folate and methionine concentrations were significantly reduced after growth in depleted media. Growth rate was also reduced in response to methyl donor depletion. Extracellular homocysteine was raised compared with controls, indicating disturbance to the methyl cycle. Combined folate and methionine depletion led to a significant down-regulation of Dnmt3a and Dnmt3b; this was associated with an 18% reduction in global DNA methylation compared with controls. Effects of folate and methionine depletion on Dnmt3a and 3b expression were reversed by transferring depleted cells to complete medium. Conclusions: Methyl donor status can evidently influence expression of Dnmts in cervical cancer cells, which is associated with DNA global hypomethylation. Effects on Dnmt expression are reversible, suggesting reversible modulating effects of dietary methyl donor intake on gene expression, which may be relevant for cancer progression.
This study attempted to test whether or not students' collaborative argumentation and explanation activity while using concept mapping did improve understanding on texts. Total of 52 college students participated in this study. They were randomly assigned to one of four experimental conditions. The experiment lasted for two or three weeks and students were tested on comprehension level of a text material that they have studied over the period. As a result, with two independent factors of explanation and collaboration, there was a significant interaction effect without main effects. That is, individual did better when they did have to explain what they were doing. However, this is not the case when students collaborate. Students in the paired condition, they did better when they do not have to explain what they were doing with concept maps. This study showed efficiency with using computerized software does not always guarantee higher understanding on text materials. Instructional contexts and variables, collaboration and explanation, needs to be considered. Collaborating with others and explaining their own learning processes should be carefully designed when they are combined with concept mapping contexts. How to minimize learning obstacles from discussing ideas with others are a critical issue for future research.
Fifteen soils including volcanic ash, acid sulfate and degraded saline soils were investigated for Languir adsorption isotherm of ammonium using $NH_4H_2PO_4$. The results are as follows. Languir adsorption maxima of ammonium (LAMA) ranged from 2.4me/100g soil to 12.3 and the average was 5.3. Initial concentration of 30 to 60 or 40 to 80 ppm(as N) appears to be suitable for LAMA measurement. There were two LAMA in some soils. Difference between adsorption constants (bonding energy) was mostly greater than that between LAMA. LAMA ranged from 9.4% to 72% of cation exchange capacity and average was 47%. It did not show any clear tendency with CEC, pH, organic matter content, base saturation percent, P, K, Ca, Mg, Na and Si. Except volcanic ash soils which were grouped into two groups according to ammonium adsorption LAMA was significantly (r=0.951 at 1%) correlated with adsorption at 200ppm. This single concentration seems suitable for LAMA measurement. Probable mechanism of ammonium adsorption was discussed, in which the associated anions were combined with iron and aluminum and then ammonium was bound to phosphorus. Applicability of Langmuir adsorption isotherm model to the soils under field condition was also discussed.
Associations of GSTT1, GSTM1 and CYP1A1 gene variants with risk of developing oral cancer were evaluated in this study. A case-control study was conducted in Pashtun population of Khyber Pakhtunkhwa province of Pakistan in which 200 hospital based oral cancer cases and 151 population based healthy controls exposed to similar environmental conditions were included. Sociodemographic data were obtained and blood samples were collected with informed consent for analysis. GSTM1 and GSTT1 were analysed through conventional PCR method while specific RT-PCR method was used to detect CYP1A1 polymorphisms. Results were analyzed for conditional logistic regression model by SPSS version 20. The study shows that patients with either GSTM1 or GSTT1 null genotypes have significantly higher risk of oral cancer (adjusted odds (OR): (3.019 (1.861-4.898) and 3.011(1.865-4.862), respectively), which further increased when either one or both null genes were present in combination (adjusted odds (OR): (3.627 (1.981-6.642 and 9.261 (4.495-19.079), respectively). CYP1A1 rs4646903 gene variants individually showed weak association OR: 1.121 (0.717-1.752); however, in the presence of GSTM1 and/or GSTT1 null genotypes further increasing the association (adjusted odds (ORs): 4.576 (2.038-10.273), 5.593 (2.530-12.362) and 16.10 (3.854-67.260 for GSTM/GSTT null and CYP1A1 wild type, GSTM/GSTT either null and CYP1A1 variant alleles, and all 3 gene polymorphisms combinations, respectively). Our findings suggest that presence of GSTM1 and/or GSTT1 null genotypes along with variant alleles of CYP1A1 may be the risk alleles for oral cancer susceptibility in Pashtun population.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
/
v.43
no.1
/
pp.128-134
/
2014
To develop a crab-like flavorant from snow crab cooker effluent (SCCE, $20^{\circ}Brix$), optimal reaction conditions were determined using response surface methodology (RSM) combined with reaction flavoring technology (RFT). Using five variables (proline, glycine, arginine, methionine, fructose), RSM based on a five-level central composite design was applied to evaluate sensory acceptance (odor, taste, and overall acceptance) as dependent variables. A model equation obtained from RSM showed 0.88 of R-square for odor, 0.90 for taste, and 0.95 for overall acceptance with 0.07 lack of fit in overall acceptance (P<0.05). Odor score (predicted value) was 7.21 in the saddle point. Optimal flavoring conditions for making a crab-like flavorant were as follows: addition of 0.29 g of proline, 0.63 g of glycine, 0.61 g of arginine, 0.02 g of methionine, and 1.07 g% (w/v) of fructose into SCCE with RFT (90 min at $130^{\circ}C$). Odor score obtained under optimal conditions was 7.56, which was higher than the predicted value.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.