Kang, Sang Moon;Joun, Yong-Seung;Lee, Kee-Young;Kang, Hyun;Lee, Sung-Gyu
Biomedical Science Letters
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v.27
no.4
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pp.231-238
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2021
Several structural proteins present in keratinocytes of the skin are known to play an important role in the formation of epidermal tissue and barrier function, and the absence of structural proteins in keratinocytes causes various skin diseases. In this study, 42 types of tetrapeptides derived from the sequence of Loricrin, a kind of terminally differentiating structural protein, were synthesized, and skin anti-aging properties were measured by measuring the elastase inhibition, proliferation of skin cells. The anti-aging efficacy was verified and, based on this, it succeeded in selecting one of the most excellent peptides. It is expected that the selected tetrapeptide can be used as a raw material for various cosmetics and quasi-drugs based on anti-aging and skin cell proliferation effects.
Histone deacetylase (HDAC) inhibitors of cyclic peptide have been proved to be the most complex but the most stable and relative efficient inhibitors because of their large cap region. In this paper, a series of studies were carried out to evaluate the efficacy of synthetic bicyclic tetrapeptide inhibitors 1-5 containing hydroxamic acid referring molecular docking, anti-proliferation, morphology and apoptosis. Docking analysis, together with enzyme inhibitory results, verified the selective capability of inhibitor 4 to HDAC4, which might closely related to haematological tumorigenesis, with Phe227, Asp115, Pro32, His198 and Ser114 participating into hydrophobic interactions and Van der Waals force which was familiar with former study. Moreover, inhibitor 4 inhibited K562 cell line at the $IC_{50}$ value of 1.22 ${\mu}M$ which was 51-67 times more efficient than that for U937 and HL60 cell lines. Inhibitor 4 exhibited the cell cycle-arrested capability to leukemia at S phase or G2/M phase as well as apoptosis-induced ability in different degrees. Finally, we considered that bicyclic tetrapeptide inhibitors were promising inhibitors used in cancer treatment and inhibitor 4 could prevent K562 cell line well from proliferation, arrest cell cycle and induce K562 towards apoptosis to achieve the goals of reversing cancer cells which could become a potential leukemia therapeutic agent in the future.
All kinds of tissue valves must be pretreated for the inactivation of immunologic properties and the strengthening of tissue before implantation. However, the tissue valves are gradually denatured with the calcification process and they eventually lose their functions. Recent reports have shown the existence of specific calcium binding non collagenous proteins in the calcified area of implanted biomaterials. This experiment was intended to confirm the effect of pretreatment with RGDS(Arg-Gly-Asp-Ser) tetrapeptide on the calcification of subcutaneously implanted bovine pericardium in rats. RGDS tetrapeptide has the same amino acid sequence of attachment site of specific calcium binding non collagenous proteins. Material and Method: All bovine pericardial pieces were fixed with 0.6% glutaraldehyde. The pretreatments were done using 5 different methods, groupI, with normal saline for 60 minutes, groupII, with 0.5% GRSD(Gly-Arg-Scr-Asp) tetrapeptide solution for 60 minutes, group III : with 0.5% RGDS(Arg-Gly-Asp-Ser) tctrapeptide for 30 minutes, group IV ; with 0.5% RGDS for 60 minutes, and group V : with 0.5% RGDS for 120 minutes. The pretreated bovine pericardial pieces were implanted subcutaneously at the abdominal sites of rats. 30 days after the implantation, the implanted bovine pericardial tissue were examined radiologically, biochemically, and histologically to measure the severity of calcification. Result: On the radiological examination, group I ; 68.42$\pm$3.06, group II , 64.25$\pm$5.58 showed significant difference with group III: 48.00$\pm$3.57, group IV; 43.67$\pm$2.31, and group V ; 2.58$\pm$2.47(p<0.05). There was no difference between group I and II(p=0.105). On the biochemical examination, the amount of calcium in group I was , 33.09$\pm$6.59 mg, in group II ; 28.12$\pm$5.50mg, in group III ; 25.42$\pm$7.67mg, in group Ⅵ ; 20.51$\pm$5.11mg, and in group V : 15.43$\pm$4.25mg.
The cephabacins produced by Lysobacter lactamgenus are ${\beta}$-lactam antibiotics composed of a cephem nucleus, an acetate residue, and an oligopeptide side chain. In order to understand the precise implication of the polyketide synthase (PKS) module in the biosynthesis of cephabacin, the genes for its core domains, ${\beta}$-ketoacyl synthase (KS), acyltransferase (AT), and acyl carrier protein (ACP), were amplified and cloned into the pET-32b(+) expression vector. The sfp gene encoding a protein that can modify apo-ACP to its active holo-form was also amplified. The recombinant KS, AT, apo-ACP, and Sfp overproduced in the form of $His_6$-tagged fusion proteins in E. coli BL21(DE3) were purified by nickel-affinity chromatography. Formation of stable peptidyl-S-KS was observed by in vitro acylation of the KS domain with the substrate [L-Ala-L-Ala-L-Ala-L-$^3H$-Arg] tetrapeptide-S-N-acetylcysteamine, which is the evidence for the selective recognition of tetrapeptide produced by nonribosomal peptide synthetase (NRPS) in the NRPS/PKS hybrid. In order to confirm whether malonyl CoA is the extender unit for acetylation of the peptidyl moiety, the AT domain, ACP domain, and Sfp protein were treated with $^{14}C$-malonyl-CoA. The results clearly show that the AT domain is able to recognize the extender unit and decarboxylatively acetylated for the elongation of the tetrapeptide. However, the transfer of the activated acetyl group to the ACP domain was not observed, probably attributed to the improper capability of Sfp to activate apo-ACP to the holo-ACP form.
We have shown that carboxy-peptidase destroys the biological activity of angiotensin octa-and deca-peptides. Since Proline occurs as the seventh amino acid from the amino end of the chain and since carboxypeptidase does not cleave proline from a peptid chain, it is evident that the heptapeptid H.asp-arg-val-tyr-ileu-his-pro.OH is formed by this hydrolysis. This peptide must then be biologically inactive. In order to determine whether the phenyl group of the C-terminal amino acid was the necessary requirement for biological activity of the octapeptide, $ala^8$ angiotensin octapeptide(amino acids of peptides numbered from amino end) was synthesized. For this synthesis the four dipeptides were prepared: carbobenzoxy-L-prolyl-L-alanine-P-nitrobenzyl-ester, m.p. $134-135^{\circ}C,$ carbobenzoxy-L-isoleucyl-imidazole benzyl-L-histidine methyl ester, m.p. $114-116^{\circ}C,$ carbobenzoxy-L-valyl-L-tyrosine hydrazide and carbobenzoxy B-benzyl-L-aspartyl-nitro-L-arginine. The first three dipeptides were obtained as crystalline compounds. Imidazole-benzyl-L-histidine was used in the hope that it would block the histidine imidazole against side reactions in steps subsequent to the formation of the C-terminal tetrapeptide. Also, it was through that the imidazole benzylated peptides would be easier to crystallize. This, however, was not the case. The tetrapeptide, carbobenzoxy-L-isoleucyl-L-im, benzyl-histidyl, L-prolyl-L-alanine-nitrobenzyl ester was not obtained in a crystalline form. Neither could the mono-or dihydrobromide of the tetrapeptide free base be induced to crystallize. Carbobenzoxy-L-valyl-L-tyrosine azide was condensed with the tetrapeptide free base to yield the protected hexapeptide; carbobenzoxy-L-valyl-L-tyrosyl-L-isoleucyl-L-im, benzyl, histidyl-L-Prolyl-L-alanine-nitrobenzyl ester. Upon removal of the carbobenzoxy group with hydrogen bromide in acetic acid an amorphous free base hexapeptide ester was obtained. This compound gave the correct C, H, N analysis and contained the six amino acids in the correct ratio. The octapeptide was obtained by condensing this hexapeptide with carbobenzoxy-B-benzyl-L-aspartyl-nitro, L-arginine using the mixed anhydride method of condensation. This amorphous product was proven to be homogenous by chromatography in two solvent systems and upon hydrolysis yielded the eight amino acids in correct ratio. The five protecting groups were removed from the octapeptide by hydrogenolysis over palladium black catalyst. Biological assay of the free peptide indicated that it possessed less than 0.1 per cent of both pressor and oxytocic activity of the phenylalanine8 angiotensin. This suggests that the phenyl group is a point of attachment between angiotensin and its biological receptor site.
Proteasome, a multicatalytic protease complex, has been validated as a promising therapeutic target in oncology. Carfilzomib (Kyprolis$^{(R)}$), a tetrapeptide epoxyketone, irreversibly inhibits the chymotrypsin-like (CT-L) activity of the proteasome and has been recently approved for multiple myeloma treatment by FDA. A chemistry effort was initiated to discover the compounds that are reversibly inhibit the proteasome by replacing the epoxyketone moiety of carfilzomib with a variety of ketones as reversible and covalent warheads at the C-terminus. The newly synthesized compounds exhibited significant inhibitory activity against CT-L activity of the human 20S proteasome. When the compounds were tested for cancer cell viability, 14-8 was found to be most potent in inhibiting Molt-4 acute lymphoblastic leukemia cell line with a $GI_{50}$ of $4.4{\mu}M$. Cytotoxic effects of 14-8 were further evaluated by cell cycle analysis and Western blotting, demonstrating activation of apoptotic pathways.
Proceedings of the Korean Society of Sericultural Science Conference
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2003.04a
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pp.74-74
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2003
Tetrapeptide FMRFamide, originally isolated and then characterized from the mollusc (Clam) Macrocallista, had been demonstrated to have action as a cardioexcitatory agent. During the next two decades since its discover, neuropeptide FMRFamide and a large family of related peptides have been shown to exist in the central nervous system and gut of a wide variety of invertebrates and vertebrates including insect species. (omitted)
Park, Kyoung-Sook;Yi, So-Yeon;Kim, Un-Lyoung;Lee, Chang-Soo;Chung, Jin-Woong;Chung, Sang-J.;Kim, Moon-Il
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.19
no.9
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pp.911-917
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2009
The apoptotic caspases have been classified in accordance with their substrate specificities, as the optimal tetrapeptide recognition motifs for a variety of caspases have been determined via positional scanning substrate combinatorial library technology. Here, we focused on two proteolytic recognition motifs, DEVD and IETD, owing to their extensive use in cell death assay. Although DEVE and IETD have been generally considered to be selective for caspase-3 and -8, respectively, the proteolytic cleavage of these substrates does not display absolute specificity for a particular caspase. Thus, we attempted to monitor the cleavage preference for caspase-3, particularly using the recombinant protein substrates. For this aim, the chimeric GST:DEVD:EGFP and GST:IETD:EGFP proteins were genetically constructed by linking GST and EGFP with the linkers harboring DEVD and IETD. To our best knowledge, this work constitutes the first application for the monitoring of cleavage preference employing the recombinant protein substrates that simultaneously allow for mass and fluorescence analyses. Consequently, GST:IETD:EGFP was cleaved partially in response to caspase-3, whereas GST:DEVD:EGFP was completely proteolyzed, indicating that GST:DEVD:EGFP is a better substrate than GST:IETD:EGFP for caspase-3. Collectively, using these chimeric protein substrates, we have successfully evaluated the feasibility of the recombinant protein substrate for applicability to the monitoring of cleavage preference for caspase-3.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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