Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
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2010.02a
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pp.172-172
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2010
In the area of optoelectronic devices based on GaN and related ternary compounds, the two-dimensional system like as quantum wells (QWs) has been investigated as an effective structure for improving the light-emitting efficiency. Generally, the quantum well active regions in III-nitride light-emitting diodes grown on conventional c-plane sapphire substrates have critical problems given by the quantum confined Stark effect (QCSE) due to the effects of strong piezoelectric and spontaneous polarizations. However, the QWs grown on nonpolar templates are free from the QCSE since the polar-axis lies within the growth plane of the template. Also the unique characteristic of linear polarized light emission from nonpolar QW structures is attracting attentions because it is proper to the application of back-light units of liquid crystal display. In this study, we characterized optical properties of the a-plane InGaN/GaN QW structures by temperature-dependent photoluminescence (TDPL) measurements. From the photoluminescence (PL) spectrum measured at 300 K, green emission centered at 520 nm was observed for the QW region. Since indium incorporation on nonpolar QWs is lower than that on c-plane, this high indium-doping on a-plane InGaN QWs is not common. Therefore, the effect of high indium composition on optical properties in a-plane InGaN QWs will be extensively studied.
The P. fragi lipase overexpressed in E. coli as a fusion protein of 57 kilodalton (kDa) has been purified through glutathione-agarose affinity chromatography by elution with free glutathione. The general properties of the purified GST-fusion protein were characterized by observing absorbance of released p-nitrophenoxide at 400 nm which was hydrolyzed from the substrate p-nitrophenyl palmitate. The optimum condition was observed at 25 $^{\circ}C$, pH 7.8 with 0.4 ${\mu}g$ of protein and 1.0 mM substrate in 0.6% (v/v) TritonX-100 solution. Also the lipase was activated by Ca+2, Mg+2, Ba+2 and Na+ but it was inhibited by Co+2 and Ni+2. pGEX-2T containing P. fragi lipase gene as expression vector was named pGL191 and used as a template for the site-directed mutagenesis by sequential PCR steps. A Ser-His-Asp catalytic triad similar to that present in serine proteases may be present in Pseudomonas lipase. Therefore, the PCR fragments replacing Asp217 to Arg and His260 to Arg were synthesized, and substituted for original fragment in pGL19. The ligated products were transformed into E. coli NM522, and pGEX-2T harboring mutant lipase genes were screened through digestion with XbaI and StuI sites created by mutagenic primers, respectively. No activity of mutant lipases was observed on the plate containing tributyrin. The purified mutant lipases were not activated on the substrate and affected at pH variation. These results demonstrate that Asp217 and His260 are involved in the catalytic site of Pseudomonas lipase.
Students and other new readers of modernist poetry often experience difficulty with the influential early work of Ezra Pound. Although these typically brief poems may appear (deceptively) simple, an understanding of the relationship between Imagism and Vorticism is crucial to reading-or teaching-them effectively, which in turn requires significant familiarity with relevant poetics theories as well as representative poems. This essay clarifies the complex relations Imagism and Vorticism as two distinct styles that are too often conflated to the detriment of an accurate understanding of either one (and, in consequence, of the later modernist poetry that builds on their discoveries). In order to elucidate the modernists' justification of free verse over traditional metrical composition, I begin with an elaboration of T. E. Hulme's 1911 theory of the "cheerful, dry, and sophisticated" modern classicism on which both Imagism and Vorticism were largely predicated, developing Hulme's important distinction between the version of classicism that is "static" (and gives rise to Imagism) and the one that is "dynamic" (and leads to Vorticism and beyond it). In the following two sections, I draw upon and synthesize a broad range of Pound's own poetics statements to reveal the evolution of first sound ("melopoeia") and then the image ("phanopoeia") throughout his early work. Although the body of this article is analytical and historical in nature, it concludes with a practical template prompt for a creative response assignment, appropriate to undergraduate and graduate students, designed to help new readers recognize for themselves how Vorticist art works and why it matters.
Ceramic ZnS nanocomposites were prepared by mechanical processing and one-step heat sintering with powder mixtures of fly ash, waste glass, and ZnS (template-free hydrothermal method manufacturing). Chemical durability and morphological characteristics of heat-treated samples at 800 ℃ with/without acid treatment were evaluated. The photocatalytic activities were estimated with methyl orange (MO), methylene blue (MB), acetaldehyde (ATA), and 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2,4-D) as photodegradation targets. Crystallization behaviors of the prepared ceramic ZnS nanocomposites were investigated using X-ray diffraction (XRD), field emission-scanning electron microscopy (FE-SEM), and energy dispersive X-ray spectrometry (EDS). In addition, compressive and bending strength as mechanical properties were evaluated. Ceramic ZnS nanocomposites were found to showed improvement in optimal photocatalytic reaction and physical properties regardless of acid treatment when the amount of ZnS nanoparticles was increased from 7.0 to 25.0 wt%. Degrees of photocatalytic decomposition of MO, ATA, 2,4-D, and MB by acid treated ceramic ZnS nanocomposites containing 25 wt% ZnS were about 0.185, 0.121, 0.216, 0.236, respectively, after UV irradiation for 180 min.
Surface plasmon resonance (SPR) which is utilized in thin film refractometry-based sensors has been concerned on measurement of physical, chemical and biological quantities because of its high sensitivity and label-free feature. In this paper, an application of SPR to detection of alcohol content in wine and liquor was investigated. The result showed that SPR sensor had high potential to evaluate alcohol content. Nevertheless, food industry may need SPR sensor with higher sensitivity. Herein, we introduced a nano-technique into fabrication of SPR chip to enhance SPR sensitivity. Using Langmuir-Blodgett (LB) method, gold film with nano-structured surface was devised. In order to make a new SPR chip, firstly, a single layer of nano-scaled silica particles adhered to plain surface of gold film. Thereafter, gold was deposited on the template by an e-beam evaporator. Finally, the nano-structured surface with basin-like shape was obtained after removing the silica particles by sonication. In this study, two types of silica particles, or 130 nm and 300 nm, were used as template beads and sensitivity of the new SPR chip was tested with ethanol solution, respectively. Applying the new developed SPR sensor to a model food of alcoholic beverage, the sensitivity showed improvement of 95% over the conventional one.
We present a highly effective T-DNA inserted gene screening method as part of a reverse genetics model system using the Chinese cabbage (Brassica rapa L. spp. pekinensis). Three-step two-dimensional (2D) matrix strategies are potentially accurate and useful for the identification of specific T-DNA inserted mutants from a large population. To construct our Chinese cabbage model, we utilized a forward genetics screening approach for the abnormal phenotypes that were obtained from transgenic plants of Brassica rapa generated with Agrobacteria tumefaciens containing the pRCV2 vector. From one transgenic plant with an abnormal phenotype, we observed that the st1 gene (which is related to senescence-associated process proteins) contained a T-DNA fragment, and that its expression level was decreased. This T-DNA insert was then used as a control to construct an effective screening pool. As a result, the optimum template concentration was found to be 0.1-1 ng in our PCR strategy. For other conditions, positive changes to the Gibbs free energy prevented the formation of oligo dimers and hairpin loop structures, and autosegment extension gave better results for long fragment amplification. Using this effective reverse genetics screening method, only 23 PCR reactions were necessary to select a target gene from a pool of 100 individual DNAs. Finally, we also confirmed that the sequence we obtained from the above method was identical to the flanking sequence isolated by rescue cloning.
Cell-free extracts prepared from cultured insect cells, Spodoptera. frugiperda, were analyzed for activation of early gene transcription of an insect baculovirus, Autographa californica nuclear polyhedrosis virus (AcNPV). The template DNA used for in vitro transcription assays contained promoter sites for the baculovirus genes that have been classified as immediate early ($\alpha$) or early genes. These genes are located in the HindIII-K/Q region of the AcNPV genome. Nuclei isolated from the AcNPV-infected Spodoptera frugiperda cells were also used for in vitro transcription analysis by RNase-mapping the labeled RNA synthesized from in vitro run-on reaction in the isolated nuclei. The genes studied by this technique were p26 and pl0 genes which were classified as delayed early and late gene, respectively. We found that transcription of the genes from the HindIII-K region was accurately initiated and unique in the whole cell extract obtained from uninfected cells, although abundance of the in vitro transcripts was reverse to that of in vivo RNA. With isolated nuclei transcription of the p26 gene was inhibited by $\alpha$-amanitin suggesting that the p26 gene was transcribed by host RNA polymerase II. However, transcription of the pl0 gene in isolated nuclei was not inhibited by $\alpha$-amanitin, but rather stimulated by the inhibitor. We also found that the synthesis of $\alpha$-amanitin-resistant RNA polymerase was begun before 6 hr p.i., the time point at which the onset of viral DNA replication as well as the appearance of a-amanitin-resistant viral transcripts were detected. These studies give us strong evidence to support the previous data that early genes of AcNPV were transcribed by host RNA polymerease III, while transcription of late genes was mediated at least by a novel $\alpha$-amanitin-resistant RNA polymerase.
Kim, Dong-Woo;Kim, Dong-Kyu;Kim, Cheol-Woong;Koh, Jae-Cheon;Park, DaeWon
Korean Chemical Engineering Research
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v.48
no.3
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pp.332-336
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2010
Ionic liquid immobilized on mesoporous amorphous silica was prepared from the coupling of 1-(triethoxysilylpropyl)-3-n-alkyl-imidzolium halides with tetraethyl orthosilicate(TEOS) through template-free condensation under strong acidic conditions. The immobilized 1-n-butyl-3-methyl imidazolium bromide ionic liquid on amorphous silica(BMImBr-AS) was proved to be an effective heterogeneous catalyst for the synthesis of dimethyl carbonate(DMC) from transesterification of ethylene carbonate(EC) with methanol. High temperature, high carbon dioxide pressure and long reaction time were favorable for the reactivity of BMImBr-AS. Kinetic studies based on two step reactions revealed that the proposed reaction model fitted well the experimental data. The apparent activation energy was estimated to be 67.4 kJ/mol.
To determine the site at which -1 ribosomal frameshifting occurs within the gag-pro overlap of HTL V-I. DNA fragment corresponding to a portion of the gene overlap was cloned into a SP6 vector. The resultant plasmid harbors the hybrid gene consisting of a synthetic gene encoding 5 amino acids derived from chick prelysozyme including the initiator methionine plus 141 nucleotides of gag-pro overlapping region followed by Staphylococcus aurcus protein A gene fragment. In vitro transcription by SP6 RNA polymerase with this DNA template made an abundant amount of single species mRNA. Cell-free translation programmed with the RNA transcribed in vitro yielded a polypeptide of 21 kDal in size. which could be purified into homogeneity by IgG-Sepharose affinity chromatography. In vitro system described in this study must be useful for rapid purification and sequencing of the Gag-Pro transframe protein. allowing to determine the exact frameshift site on mRNA and to identify the tRNA involved in frameshifting event for the expression of pro gene.
Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
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v.35
no.1
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pp.1-6
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2009
DNA double-strand breaks (DSBs) occur commonly in the all living and in cycling cells. They constitute one of the most severe form of DNA damage, because they affect both strand of DNA. DSBs result in cell death or a genetic alterations including deletion, loss of heterozygosity, translocation, and chromosome loss. DSBs arise from endogenous sources like metabolic products and reactive oxygen, and also exogenous factors like ionizing radiation. Defective DNA DSBs can lead to toxicity and large scale sequence rearrangement that can cause cancer and promote premature aging. There are two major pathways for their repair: homologous recombination(HR) and non-homologous end-joining(NHEJ). The HR pathway is a known "error-free" repair mechanism, in which a homologous sister chromatid serves as a template. NHEJ, on the other hand, is a "error-prone" pathway, in which the two termini of the broken DNA molecule are used to form compatible ends that are directly ligated. This review aims to provide a fundamental understanding of how HR and NHEJ pathways operate, cause genome instability, and what kind of genes during the pathways are associated with head and neck cancer.
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