• 한국자원식물학회지
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• 제33권2호
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• pp.116-129
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• 2020

돌나물과(Crassulaceae)의 돌나물속(genus Sedum)은 약 400여종이 전 세계적으로 광범위하게 분포하고 있으며, 기린초속(genus Phedimus)은 약 20종이 아시아부터 유럽까지 분포하고 있다. 일반적으로 현대 분류체계에서는 기린초속과 돌나물속을 독립된 각각의 속으로 인정하고 있으나, 한국산에 대한 연구에서는 기린초속이 돌나물속 아래 가는기린초아속(subgenus Aizoon)으로 사용되고 있어, 가는기린초아속이 기린초속으로 승격되는 것이 타당한지 정리가 필요하다. 본 연구 결과, 식물의 전체적인 크기와 외형, 잎의 형태 등의 영양형질과 종피 표면의 무늬와 같은 생식형질이 기린초속과 돌나물속의 식별에 주요한 자료로 판단되었다. 특히, 종자의 표면 무늬는 돌나물속은 육각형의 무늬와 그 속에 하나의 유두상 돌기를 가지고, 기린초속은 사각형의 무늬와 양 끝에 하나씩 유두상 돌기를 가져 두 속을 구분하는 중요한 식별형질로 판단된다. 본 연구의 외부형태학적 결과는 돌나물속과 기린초속을 독립된 각각의 속으로 인정하는 분류체계를 지지한다.

• 한국자원식물학회지
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• 제19권2호
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• pp.323-330
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• 2006

한국산 박쥐나물속(Parasenecio)의 외부형태학적 형질 및 체세포 염색재수의 분류학적 가치를 평가하기 위하여 본 연구를 수행하였다. 외부형태학적 형질인 초장, 경생엽수, 잎의 모양, 엽병 형태, 총포편수, 소화 수, 암술대의 털 존재 유무, 소화의 가는 통부와 법은 통부의 비, 열매의 크기 등이 종을 식별하는 형질로 가치를 지니고 있었으며, 이러한 형질을 기초로 할 때, 귀박쥐나물(Parasenecio. auriculata var. auriculata), 나래 박쥐나물(P. auriculata var. kamtschatica), 민박쥐나물(P. hastata subsp. orientalis), 참나래박쥐(P. koraiensis), 병풍쌈(P. firmus), 어리병풍(P. pseudotaimingasa)의 6분류 군에 대한 국내의 분포를 확인할 수 있었으나, 게박쥐나물(P. adenastylodes)과 박쥐나물(P. auriculata var. matsumurana)의 분류학적 위치 및 국내 분포 여부에 대하여 추후 연구되어야 할 것으로 생각되었다. 게박쥐나물과 귀박쥐나물, 나래박쥐나물, 민박쥐나물, 병풍함과 어리평풍의 체세포 염색제수는 모두 2n=60이었으며, 이중 게박쥐나물과 귀박쥐나물, 나래박쥐나물, 민박쥐나물은 일본산과 중국산의 염색계수와 일치하였으며, 병풍쌈과 어리병풍의 체세포 염색체수는 본 연구에서 처음으로 밝혀졌다.

• 미생물학회지
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• 제52권3호
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• pp.365-374
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• 2016

고위도에서의 온도 상승은 $0.6^{\circ}C$/10 년으로, 이는 토양 유기 탄소에 대한 미생물의 분해 활성 증가를 유도한다. 게다가, 분해된 토양 유기 탄소는 이산화탄소 또는 메탄 같은 온실가스로 전환, 방출되어 기후 변화를 가속화시킨다. 따라서, 토양 유기 탄소 분해와 관련된 미생물의 다양성 및 기능 이해를 위한 토양 해동 모델 연구가 필요하다. 이러한 연구를 위하여 Alaska Council의 두 깊이의 토양(SPF와 PF라 각각 명명한 30-40와 50-60 cm 깊이의 토양)을 $0^{\circ}C$에서 108일 동안 배양하였다. 환경 모사 실험 동안 pyrosequencing을 수행하였고, metagenome을 분석하여 총 111,804개의 미생물 sequence를 얻었다. 이 중, 574-1,128개의 세균 operational taxonomic unit (OTU)과 30-57개의 고세균 OTU를 확인하였다. 토양 배양에 따라 두 토양 모두에서 Crenarchaeota phyla의 상대적 분포가 증가하였으며, Actinobacteria와 Firmicutes phyla의 분포가 SPF와 PF에서 각각 크게 증가하였다. 추출한 토양 유기 탄소에 대한 무게 측정 및 gel permeation chromatography를 통해, 환경 모사 실험이 진행되는 동안 토양 유기 탄소의 주요 구성 성분인 부식산(humic acids)이 중합화(humification)되는 것을 확인하였다. 결론적으로, 냉대 툰드라 동토의 해동은 Crenarchaeota, Actinobacteria 및 Firmicutes phyla의 증가를 야기시키며, 미생물에 의한 토양 유기 탄소 분해 및 이용을 야기시키는 것으로 예측된다.

• 미생물학회지
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• 제49권2호
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• pp.150-155
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• 2013

Pyrosequencing을 이용하여 영산강 유역의 세균 군집 현황을 조사하였다. 영산강 본류 및 지천 14개 지점을 선정하여 5-7월동안 시료채취를 하였다. 총 42개의 시료를 가지고 총 989,380 reads을 얻었으며 taxonomic 분류와 OTU 분포도 분석을 실시하였다. Phylum 계층의 세균 구조 결과를 통해서 지천의 특성, 토지 이용, 시기적인 요인 등 환경적 요인에 따라 세균 군집 구조가 민감하게 변하는 경향을 나타내었다. 또한, OTU 분석을 근거한 오염원 추적기법(microbial source tracking; MST)을 통해 분변오염을 추적해보았다. Firmicutes가 가장 수질에 영향을 주는 taxa로 관찰되었다. 본 연구를 통해서, 현재 사용하는 수질 지표, BOD, pH 등에 더하여 pyrosequencing을 이용한 세균군집 조사 결과가 보다 효율적인 하천의 물관리 정책을 위해서 유용한 정보가 될 수 있을 것으로 기대한다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제55권3호
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• pp.287-294
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• 2017

The present study was performed to record new definitive hosts of Isthmiophora hortensis, and to describe morphological characteristics derived from a variety of worm samples for clarification of its taxonomic validity. Morphological characteristics with dimensions were observed in worm samples (n=21) from naturally infected wild animals, including a raccoon dog Nyctereutes procyonoides from Gimhae-si (City), Gyeongsangnam-do, stray cats and a striped field mouse from several localities, and a wild boar Sus scrofa, from Gurye-gun (County), Jeollanam-do. In addition, adult flukes (n=45) recovered in albino rats experimentally infected with the metacercariae from a freshwater fish species were also subjected to morphological studies. The mean ratios of the body length (BL) to body width (BW) were 5.86 and 5.76 in worms from wild animals and experimental rats, respectively. Those of the ventral sucker to oral sucker were 2.92 and 3.01 in worms from 2 groups. The mean percentages of the hindbody length (HBL) to BL were 42.1 and 41.2 in 2 groups. Those of uterine fields to BL were 9.8 and 12.2 in the 2 worm groups. By the present study, the 2 species of wild animals, the raccoon dog and wild boar, have been added as new definitive hosts for I. hortensis. The morphological characteristics of adult flukes derived from a variety of host source were redescribed to support the taxonomic validity of this echinostome species.

• 식물분류학회지
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• 제32권4호
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• pp.397-416
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• 2002

한국산 제비꽃속 노랑제비꽃절 (Viola section Chamaemelanium) 식물에 대해 광학현미경 및 전자현미경을 사용하여 형태 분류학적 연구를 수행하였다. 지하경과 지상경의 특징, 자방 돌기 그리고 주두의 모양과 돌기 등의 특징에 의해 V. orientalis와 V. brevistipulata가 구별되었다. 나아가 후자는 잎의 특징에 따라 3 변종 즉 var. brevistipulata, var. minor 그리고 var. laciniata 등으로 세분되었다. Viola brevistipulata var. laciniata는 거치 수가 가장 많고, 불규칙한 치상의 복거치를 갖는다. 그러나 다른 두 변종은 규칙적인 파상 또는 치상의 거치를 갖는다. 세 변종간 잎의 크기는 V. brevistipulata var. brevistipulata가 가장 크고 V. brevistipulata var. minor가 가장 작다. 이들 중 V. brevistipulata var. laciniata는 한국 미기록 종이다. 또한 자방과 주두에 발달된 돌기물의 모양 및 배열양상은 본 절내 종을 동정할 때 중요한 표징형질로 확인되었다.

• 한국작물학회:학술대회논문집
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• 한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
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• pp.245-245
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• 2017

Heavy metal pollution of agricultural soils affects land productivity and has impact on the quality of surrounding ecosystem. Soil microbial community parameters are used as reliable indices for assessing quality of agricultural lands under metal stress. This study investigated bacterial community structure of polluted and undisturbed paddy soils to elucidate soil factors that are related to alteration of bacterial communities under conditions of metal pollution. No obvious differences in the richness or diversity of bacterial communities were observed between samples from polluted and control areas. The bacterial communities of three locations were distinct from one another, and each location possessed distinctive set of bacterial phylotypes. The abundances of several phyla and genera differed significantly between study locations. Variation of bacterial community was mostly related to soil general properties at phylum level while at finer taxonomic levels concentrations of arsenic and lead were significant factors. According to results of bacterial community functional prediction, the soil bacterial communities of metal polluted locations were characterized by more abundant DNA replication and repair, translation, transcription and nucleotide metabolism pathway enzymes while amino acid and lipid metabolism as well as xenobiotic biodegradation potential was reduced.Our results suggest that the soil microbial communities had adapted to the elevated metal concentrations in the polluted soils as evidenced by changes in relative abundances of particular groups of microorganisms at different taxonomic resolution levels, and by altered functional potential of the microbial communities.

• 대한한의학방제학회지
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• 제24권4호
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• pp.323-333
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• 2016

Objectives : The purpose of this study was to investigate musk deer in taxonomic status and genus species. We investigated the characteristic of musk deer for medicinal usages. Methods : To identifications of musk deer on the taxonomic status and genus species, the literary investigation were conducted on the Korean, China, and Japan pharmacopoeia and published herbal books, CITES Species Lists too. Results : Musk deer placement in a separate family status is the Moschidae. M. chrysogaster Hodgson and M. sifanicus Przewalski was the same species. So, Alpine musk deer revised M. chrysogaster Hodgson[=M. sifanicus Przewalski]. Geographic distribution of M. moschiferus L. divided Sibirica group and himalaica group. Group himalaica contains three subspecies: Korean musk deer(M. moschiferus parvipes Hol.), Chinese musk deer(M. chrysogaster Hodgson), and Himalayan musk deer(M. leucogaster Hodgson). The genetic divergence between M. moschiferus L. and other species was clearly distinguished from the others. M. berezovskii Flerove was less than the others. However, the divergence among M. chrysogaster Hodgson, M. fuscus Li, and M. leucogaster Hodgson were quite low. Musk deers are mostly distributed around the high-plateau. Moschus were from Nepal, Bhutan, Russia, China. Forest musk deer(M. berezovskii Flerove) farming was conducted in China from 1950s. In the Korean hebal pharmacopoeia, Moschus include l-muscone($C_{16}H_{30}O$ : 238.40) over 2% for quantitative test. Conclusions : There are three species of musk deer, Siberian musk deer(M. moschiferus L.), forest musk deer(M. berezovskii Flerove), and Alpine musk deer(M. chrysogaster Hodgson) for medicinal usages.

• 한국자원식물학회지
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• 제15권1호
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• pp.26-35
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• 2002

물푸레나무과의 미선나무는 한국고유속 단일종으로 열매의 형태와 꽃의 색 등과 같은 외부형태학적 특징에 의해 근연속인 개나리속과 구별된다. 미선나무는 꽃의 색과 시과의 형태에 따라 여러개의 종내분류군들이 보고되어 있지만, 이들의 분류학적정체성과 계급의 설정 등에 관하여는 학자들간에 많은 논란이 있다. 본 연구에서는 RAPD 분석을 실시하여 이를 토대로 미선나무의 종내분류군들의 한계를 규명하고 집단간의 유전적 다형현상과 유연관계를 논의 하고자 하였다. 16개의 random primer를 이용한 효소중합반응을 실시하여, 70개의 공통적인 band를 포함하여 212개의 표식인자가 관찰되었고, 그 결과는 Nei의 유전적거리를 이용하여 분석하였다. 분류군간에는 0.108에서 0.321의 유전적 변이가 관찰되었고, UPGMA에 의한 군집분석을 통하여 동일분류군보다는 몇몇 지역집단간에 유집군이 형성되었으며, 종내분류군간에 는 뚜렷한 연속성이 관찰되지 않았다. RAPD분석 결과는 미선나무의 종내분류군들은 개체변이이고 이를 동일종으로 처리되어야 한다는 의견을 지지하고 있다. 또한, RAPD분석은 미선나무 집단이 다양한 유전적 다형성을 지닌 높은 유전자 푸울을 유지하고 있다는 것을 확인하는데 매우 유용하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제27권7호
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• pp.1288-1299
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• 2017

Composting is widely used to transform waste into valuable agricultural organic fertilizer. Anaerobic ammonium-oxidizing (anammox) bacteria play an important role in the global nitrogen cycle, but their role in composting remains poorly understood. In the present study, the community structure, diversity, and abundance of anammox bacteria were analyzed using cloning and sequencing methods by targeting the 16S rRNA gene and the hydrazine oxidase gene (hzo) in samples isolated from compost produced from cow manure and rice straw. A total of 25 operational taxonomic units were classified based on 16S rRNA gene clone libraries, and 14 operational taxonomic units were classified based on hzo gene clone libraries. The phylogenetic tree analysis of the 16S rRNA gene and deduced HZO protein sequences from the corresponding encoding genes indicated that the majority of the obtained clones were related to the known anammox bacteria Candidatus "Brocadia," Candidatus "Kuenenia," and Candidatus "Scalindua." The abundances of anammox bacteria were determined by quantitative PCR, and between $2.13{\times}10^5$ and $1.15{\times}10^6$ 16S rRNA gene copies per gram of compost were found. This study provides the first demonstration of the existence of anammox bacteria with limited diversity in cow manure composting.