• 제목/요약/키워드: TPR

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Crystal Structure of TTC0263, a Thermophilic TPR Protein from Thermus thermophilus HB27

  • Lim, Hyosun;Kim, Kyunggon;Han, Dohyun;Oh, Jongkil;Kim, Youngsoo
    • Molecules and Cells
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    • 제24권1호
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    • pp.27-36
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    • 2007
  • The hypothetical protein TTC0263 of Thermus thermophilus HB27 is a thermophilic tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein. In the present study, the TPR region (residues 26-230) was resolved at $2.5{\AA}$ with R-factors of $R/R_{free}$ = 23.6%/28.6% $R/R_{free}=23.6%/28.6%$. TTC0263 consists of 11 helices that form five TPR units. Uniquely, it contains one atypical "extended" TPR (eTPR) unit. This comprises extended helical residues near the loop region of TTC0263, such that the helical length of eTPR is longer than that of the canonical TPR sequence. In addition, the hybrid TPR domain of TTC0263 possesses oligomer-forming characteristics. TPR domains are generally involved in forming multi-subunit complexes by interacting with each other or with other subunit proteins. The dynamic structure of TTC0263 described here goes some way to explaining how TPR domains mediate the formation of multi-subunit complexes.

TPR-tree의 성능 예측을 위한 비용 모델 (A Cost Model for the Performance Prediction of the TPR-tree)

  • 최용진;정진완
    • 한국정보과학회논문지:데이타베이스
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    • 제31권3호
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    • pp.252-260
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    • 2004
  • 최근에 움직이는 객체의 미래 위치를 위한 TPR-tree가 제안되었으며, TPR-tree를 이용한 많은 연구들이 제안되었다. 그러나, TPR-tree가 시공간 데이타베이스에서 널리 사용됨에도 불구하고, TPR-tree를 위한 비용 모델은 제안되지 않았다. R-tree와 같은 공간 색인을 위한 비용 모델들은 움직이는 객체들의 미래 위치를 전혀 고려하지 않기 때문에, TPR-tree에 대한 시공간 질의를 위한 디스크 액세스 수를 정확하게 예측하지 못한다. 본 논문에서는 움직이는 객체들의 미래 위치를 고려한 TPR-tree를 위한 비용 모델을 처음으로 제안한다. 다양한 실험 결과, 제안된 TPR-tree의 비용 모델은 디스크 액세스 수를 정확하게 예측한다.

TPR*-트리의 성능 분석에 관한 연구 (A Performance Study on the TPR*-Tree)

  • 김상욱;장민희;임승환
    • 한국공간정보시스템학회 논문지
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    • 제8권1호
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    • pp.17-25
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    • 2006
  • TPR*-트리는 효과적으로 이동 객체의 미래 위치 예측을 수행하기 위하여 가장 널리 사용되는 인덱스 구조이다. 그러나 TPR*-트리는 인덱스 생성 이후 미래 예측 시점이 증가함에 따라 사장 영역과 영역중복의 문제가 커지며, 이로 인하여 질의 처리 시 액세스되는 TPR*-트리 노드들의 수가 많아지는 성능 문제가 발생한다. 본 논문에서는 실험을 통하여 이러한 성능 저하의 문제점을 정량적으로 규명한다. 먼저, 미래 예측 시점이 증가함에 따라 질의 처리 성능이 얼마나 저하되는가를 보이고, 이동 객체의 위치 갱신 연산이 이러한 성능 저하 문제를 얼마나 완화시키는가를 보인다. 이러한 공헌은 TPR*-트리의 추가적인 성능 개선을 위한 정책을 고안하는데, 중요한 실마리를 제공할 수 있을 것이다.

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함정전투체계 표적 색인을 위한 TPR-Tree 상향식 갱신 기법 (A Study on Bottom-Up Update of TPR-Tree for Target Indexing in Naval Combat Systems)

  • 고영근
    • 한국군사과학기술학회지
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    • 제22권2호
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    • pp.266-277
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    • 2019
  • In modern warfare, securing time for preemptive response is recognized as an important factor of victory. The naval combat system, the core of naval forces, also strives to increase the effectiveness of engagement by improving its real-time information processing capabilities. As part of that, it is considered to use the TPR-tree in the naval combat system's target indexing because spatio-temporal searches can be performed quickly even as the number of target information increases. However, because the TPR-tree is slow to process updates, there is a limitation to handling frequent updates. In this paper, we present a method for improving the update performance of TPR-tree by applying the bottom-up update scheme, previously proposed for R-tree, to the TPR-tree. In particular, we analyze the causes of overlaps occurring when applying the bottom-up updates and propose ways to limit the MBR expansion to solve it. Our experimental results show that the proposed technique improves the update performance of TPR-tree from 3.5 times to 12 times while maintaining search performance.

TPR/TPO 실험기법을 이용한 전이금속산화물의 산화-환원 특성 연구 (Redox Property of Transition Metal Oxides in Catalytic Oxidation)

  • 김영호;이호인
    • 공업화학
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    • 제10권8호
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    • pp.1161-1168
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    • 1999
  • 3주기 전이금속(Cr~Zn)의 산화물 및 V, Mo, W의 산화물에 대하여 temperature-programmed reduction/trmperature-programmed oxidation(TPR/TPO) 실험을 통하여 그 산화-환원 특성을 조사하였다. TPO 곡선의 산화피크는 TPR 곡선의 환원피크와 비슷하거나 약간 낮은 온도에서 나타났으며, 환원피크에 비하여 온도 폭이 넓었다. 3주기 전이금속한화물의 산화 및 환원 과정의 활성화에너지는 33~149 kJ/mol 범위에 있는 반면, V, Mo, W 산화물에서는 더 컸다. 금속산화물의 산화 및 환원 과정의 활성화에너지 변화는 금속-산소 결합세기에 비례하였다. 환원(TPR) 및 산화(TPO) 과정에 대한 활성화에너지 차이(${\Delta}E_a$)가 작을수록 o-자일렌 산화반응에서 금속산화물 촉매의 활성화에너지도 작았다. 금속한화물 촉매에서 o-자일렌 산화반응은 금속산화물 표면의 산화-환원 과정을 반복하는 Mars-van Krevelen 반응 메카니즘으로 설명될 수 있음을 확인하였다.

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온도제어를 위한 단상용 Fuzzy TPR 개발에 관한 연구 (Development of Single-phase Fuzzy TPR for temperature control)

  • 홍성훈;강문성
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 1996년도 하계학술대회 논문집 B
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    • pp.1053-1055
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    • 1996
  • This paper proposes a Fuzzy TPR having the control function to a TPR used for the conversion of electricity in industrial field. The Fuzzy TPR based on the Fuzzy Logic Control technique is composed of the parts to calculate the low-level value and the high-level value. These values are calculated by error and change in error which are refer to the look-up table. To show the usefulness of the proposed Fuzzy TPR, it is applied to industrial temperature control system. In the results of experiment, we see that the system is able to fast reach steady-state, and for our approach to be robust to external disturbance than the method using the conventional TPR.

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A New Flash TPR-tree for Indexing Moving Objects with Frequent Updates

  • Lim, Seong-Chae
    • International Journal of Internet, Broadcasting and Communication
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    • 제14권1호
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    • pp.95-104
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    • 2022
  • A TPR-tree is a well-known indexing structure that is developed to answer queries about the current or future time locations of moving objects. For the purpose of space efficiency, the TPR-tree employs the notion of VBR (velocity bounding rectangle)so that a regionalrectangle presents varying positions of a group of moving objects. Since the rectangle computed from a VBR always encloses the possible maximum range of an indexed object group, a search process only has to follow VBR-based rectangles overlapped with a given query range, while searching toward candidate leaf nodes. Although the TPR-tree index shows up its space efficiency, it easily suffers from the problem of dead space that results from fast and constant expansions of VBR-based rectangles. Against this, the TPR-tree index is enforced to update leaf nodes for reducing dead spaces within them. Such an update-prone feature of the TPR-tree becomes more problematic when the tree is saved in flash storage. This is because flash storage has very expensive update costs. To solve this problem, we propose a new Bloom filter based caching scheme that is useful for reducing updates in a flash TPR-tree. Since the proposed scheme can efficiently control the frequency of updates on a leaf node, it can offer good performance for indexing moving objects in modern flash storage.

속도 변화가 빈번한 이동 객체의 미래 시점 위치 추정에 적합한 색인 기법 (An Indexing Scheme for Predicting Future-time Positions of Moving Objects with Frequently Varying Velocities)

  • 임성채
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제15권5호
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    • pp.23-31
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    • 2010
  • 정보 기술과 이동 통신망의 발전에 따라 이동 객체의 위치 추적에 필요한 효과적인 색인 기법과 이를 통한 다양한 응용 서비스에 대한 사용자 요구가 커지고 있다. 이에 따라, 이동 객체의 현재 위치 추적과 미래 위치 추정에 사용되는 $TPR^*$-트리와 같은 색인 기법이 관심을 받고 있다. $TPR^*$-트리는 정적인 물체를 색인하기 위해 고안된 R-트리를 기본 구조로 하기 때문에, 갱신 비용이 크다는 단점이 있다. 따라서 이동 객체가 자주 속도나 위치 정보를 갱신하는 경우 트리 유지비용이 빠르게 증가할 수 있다. 특히, 이동 객체가 빠른 속도로 이동하는 경우 넓은 범위에 걸쳐 불필요한 노드 갱신이 발생할 수 있다는 문제점이 있다. 이런 문제점을 피하기 위해 논문에서는 루트노드의 자식노드에 이런 빠른 이동 속도의 객체만을 따로 색인하도록 하여 노드 갱신 비용을 크게 줄이는 방법을 제안한다. 제안된 방법을 통해 노드 갱신 비용을 최소화 하면서도 $TPR^*$-트리의 장점을 유지할 수 있었다. 이런 성능상의 장점을 보이기 위해 시뮬레이션 기법을 사용한 성능 비교를 수행하였다.

쿨링다운 노드를 사용한 TPR*-트리 효율화 기법 (A More Efficient TPR*-Tree with Cooling-down Nodes)

  • 임성채
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2011년도 한국컴퓨터종합학술대회논문집 Vol.38 No.1(B)
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    • pp.332-335
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    • 2011
  • GPS 칩을 내장한 다양한 이동 통신 기기의 사용으로 위치 정보를 이용한 응용이 점차 확산될 전망이다. 위치 정보를 기반으로 한 응용 시스템에서는 다수 이동 객체의 위치 정보를 실시간으로 기록하고, 미래 시점의 객체 위치를 추정할 수 있어야 한다. 이런 요구에 따라 효과적인 이동 객체 색인에 고안된 기법이 TPR*-트리이다. 하지만 TPR*-트리는 고정 위치 색인에 최적화된 R-트리에 기본을 두었기 때문에 갱신 비용이 매우 커질 수 있다는 문제가 있다. R-트리에서는 갱신 연산이 빈번하지 않을 수 있지만 TPR*-트리의 경우는 이동 객체가 속도를 변화시킬 때마다 갱신 연산이 요구되기 때문에 상대적으로 매우 큰 갱신 비용이 발생할 수 있다. 이런 문제점을 부분적으로 해결하기 위해 본 논문에서는 쿨링다운 노드를 사용한 TPR*-트리를 제안한다. 제안된 트리는 트리의 상위 계층에 일부 이동 객체를 버퍼링함으로써 갱신 연산을 최소화 할 수 있다. 또한 지나친 사장 영역(dead space)의 확대를 방지함으로써 검색 성능 저하를 효과적으로 줄일 수 있다.

Utilization of the Unlinked Case Proportion to Control COVID-19: A Focus on the Non-pharmaceutical Interventional Policies of the Korea and Japan

  • Yeri Jeong;Sanggu Kang;Boeun Kim;Yong Jin Gil;Seung-sik Hwang;Sung-il Cho
    • Journal of Preventive Medicine and Public Health
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    • 제56권4호
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    • pp.377-383
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    • 2023
  • Objectives: Korea and Japan have managed the spread of coronavirus disease 2019 (COVID-19) using markedly different policies, referred to as the "3T" and "3C" strategies, respectively. This study examined these differences to assess the roles of active testing and contact tracing as non-pharmaceutical interventions (NPIs). We compared the proportion of unlinked cases (UCs) and test positivity rate (TPR) as indicators of tracing and testing capacities. Methods: We outlined the evolution of NPI policies and investigated temporal trends in their correlations with UCs, confirmed cases, and TPR prior to the Omicron peak. Spearman correlation coefficients were reported between the proportion of UCs, confirmed cases, and TPR. The Fisher r-to-z transformation was employed to examine the significance of differences between correlation coefficients. Results: The proportion of UCs was significantly correlated with confirmed cases (r=0.995, p<0.001) and TPR (r=0.659, p<0.001) in Korea and with confirmed cases (r=0.437, p<0.001) and TPR (r=0.429, p<0.001) in Japan. The Fisher r-to-z test revealed significant differences in correlation coefficients between the proportion of UCs and confirmed cases (z=16.07, p<0.001) and between the proportion of UCs and TPR (z=2.12, p=0.034) in Korea and Japan. Conclusions: Higher UCs were associated with increases in confirmed cases and TPR, indicating the importance of combining testing and contact tracing in controlling COVID-19. The implementation of stricter policies led to stronger correlations between these indicators. The proportion of UCs and TPR effectively indicated the effectiveness of NPIs. If the proportion of UCs shows an upward trend, more testing and contact tracing may be required.