• 대한의생명과학회지
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• 제18권1호
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• pp.83-85
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• 2012

Vancomycin-resistant (VR)-E. faecium and VR-E. faecalis were isolated simultaneously from a rectal swab of a patient diagnosed with pneumonia in an intensive care unit (ICU). The patient was treated with various antibiotics including vancomycin. Only VR-E. faecium was continually isolated from the rectal swab at one and two weeks of the treatment. Identical vanA, IS1216V, and IS1542 genes were detected in both VR-E. faecium and VR-E. faecalis isolates which showed equal resistance against vancomycin and teicoplanin, but IS1251 was not detected. VR-E. faecium showed stronger multi-drug resistance than VE-E. faecalis. This result supports the reason why VR-E. faecium is one of the major pathogens in nosocomial infections.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제38권3호
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• pp.179-181
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• 2000

Stool and cellotape anal swab examinations were carried out in August 1997 on handicapped people at an institution located in Chorwon-gun, Kangwon-do, Korea. A total of 112 stool samples (78 males and 34 females) revealed three cases of Trichuris trichiura infection and one case of Enterobius vermicularis infection. Other helminth eggs were not detected. The overall prevalence rate was 35.7% (38.5% for males and 29.4% for females). More than two different kinds of parasites were found in 42.0% of the positive stool samples (17 cases). The infection rates for protozoan cysts are as follow : Entamoeba coli (25.0%), E. histoIUtica (1.8%), Endolinax nana (21.4%), Iodoamoeba butschlii (1.8%) and Giardia lamblia (0.9%). In cellotape anal swab examinations (165 samples), the prevalence rate of E. vemicularis was 20.6% (25.7% of males and 9.6% of females). In conclusion, the handicapped people in the institution showed higher infection rates of protozoan parasites and E. vemicularis, possibly due to more accessibility to the infection.

• Plant Biotechnology Reports
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• 제2권1호
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• pp.47-58
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• 2008

To select agronomically useful transgenic plants, a large number of transgenic events are initially produced, gene transfer confirmed, and advanced to obtain homozygous lines for testing in field trials. Direct in planta assays for identifying the transgene carriers in the segregating progeny are based on the activity of selectable marker gene and are easy, simple and inexpensive. For this purpose, expression of bar gene as measured by tolerance to damage by glufosinate ammonium, the active ingredient in the herbicide BASTA, was investigated. Dose damage curves were generated by leaf paint tests with BASTA on four genotypes of sorghum. Transgenic plants were characterized in terms of sensitivity to the concentration of glufosinate ammonium. In transgenics, symptoms of BASTA swab tests at different growth stages and PCR analysis for cry1B were carried out and correlated. Germination tests could not be employed for large scale evaluation of transgenic progeny because of mortality of tolerant seedlings after transplantation to soil. Based on the above findings, a simple, inexpensive, time-saving, two-step scheme for effective evaluation of transgenics and their progeny containing bar gene as selection marker using BASTA swab tests is described.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제61권1호
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• pp.47-53
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• 2019

This study was performed to evaluate the microbial and temperature changes of boxed beef during transport and distribution under vacuum and modified atmosphere packaging (MAP), and to compare between excision and swab sampling for 15 days. The top round and striploin (quality grade 1) from Hanwoo steers at 2 days post-slaughter were obtained from a local meat processing plants and chilled at $4{\pm}2^{\circ}C$ in a cold room. The boxes were transported under refrigeration ($4{\pm}2^{\circ}C$) to the laboratory within half an hour. Vacuum and MAP packs were subsequently taken out from cool boxes, and microbiological examinations were carried out at 0, 6, 12, and 24 h of storage time. MAP was more effective than vacuum packaging for the inhibition of total aerobic, lactic acid bacteria and Pseudomonas (p < 0.05). Microbial loads of swab methods were slightly lower than those of excision ones (p < 0.05). The results of this study could be utilized by meat consumers in future studies as well as by manufacturers to determine the ideal storage conditions for cool boxed meat, thus ensuring reduced economic losses due to spoilage.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제33권1호
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• pp.123-126
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• 2023

The prevalence of candidiasis, a contagious disease with high morbidity and mortality, has sharply increased globally over the last two decades. Candida albicans can cause serious infections in patients with weak immunity and in recipients of prolonged antibiotic treatment. Consequently, rapid and accurate identification of species can play an important role in the treatment of candidiasis. Here, we investigated the positive rate and infection trend of C. albicans according to age, specimen type, and sex using multiplex real-time polymerase chain reaction-based testing of samples collected for the diagnosis of sexually transmitted diseases in Korea between 2018 and 2020. When the type of specimen collected was a swab, the positive rate of C. albicans was higher among younger women, and tended to decrease with age. Analysis of swab samples revealed higher positive rates than urinalysis. The reduction trend in positive rates by age was comparable between the overall samples and urine specimens. Among male patients, the positive rate did not differ substantially across the various types of specimens collected. Previous studies have shown a higher prevalence of non-albicans Candida species than C. albicans in clinical specimens, and exclusion of the former from our analysis may be a limitation of this study. However, our findings contribute significantly to the literature because globally, there is a paucity of epidemiological studies using molecular techniques to detect C. albicans in sexually transmitted disease test samples.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제44권3호
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• pp.351-360
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• 2002

한국산 수출용 냉장 돈육의 등심 시료를 3개 수출업체(I II III)에서 채취하여 2$^{\circ}C$에서 50일간 저장하면서 5일$\sim$10일 간격으로 9회에 걸쳐 미생물 변화와 관능적 품질특성을 조사하였으며, 그 결과는 다음과 같다. 저장기간 중 총세균 수 및 대장균군 수 측정은 swab법과 조직절편법을 이용하여 측정한 결과, swab법으로 측정한 균 수가 대체적으로 높은 수준으로 나타났으며, 수출업체 시료간에는 I업체 시료가 저장 50일째까지 가식 수준을 유지한 반면, III업체 시료의 경우 총세균 수는 swab법으로 측정하였을 때 약 15일, 조직절편법으로 측정하였을 때 약 30일째 이후에는 이미 가식 수준을 넘게 나타났다. 대장균군 수도 III업체의 시료가 다른 업체와 비교하였을 때 가장 높은 수준으로 나타났는데, 이것은 수출업체간에 위생관리 상태에 따라 고기 품질 및 유통기간에 큰 차이가 있는 것으로 판단되었다. 따라서 I업체에 비해 위생도가 상대적으로 낮은 것으로 평가된 II업체 및 III업체에서는 도축과 가공 등 각 생산단계별로 더욱 세심한 위생관리체계를 구축하여야 할 필요성이 있을 것으로 판단되었다. 7점 척도묘사평가법으로 관능검사를 실시한 결과 근내지방도는 I업체 시료가 가장 낮았고, 상대적으로 II업체 및 III업체 시료가 높은 것으로 평가되었다. 신선육의 육색, 육즙 및 신선육 풍미는 세 업체 시료간에 차이가 없었으나 III업체 시료에서 전반적인 기호도가 가장 높게 나타났다. 그러나 조리육의 경우 풍미, 이상취, 다즙성, 전반적인 기호도에서 세 업체 시료간에 유의적인 차이는 없었다.

• Journal of Oral Medicine and Pain
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• 제31권1호
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• pp.1-16
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• 2006

최근 진단분야에 있어서의 가장 획기적인 진보로는 향상된 진단 술식의 민감도와 특이도를 들 수 있으며 이는 다양한 면역 화학물질과 분자생물학적 시약의 활용도가 증가되고 이와 더불어 진단용 기구의 수준 향상으로 가능해진 미세 술식의 발달에 따른 결과이다. 이러한 기술의 발전은 임상검사용 검체 뿐만 아니라 DNA의 공급원으로서의 타액의 진단학적 가치를 고려하게 되었다. 본 연구는 인체의 타액에서 genomic DNA를 분리하고 이를 혈액 및 협점막 swab에서 분리한 genomic DNA와 비교 검토해 봄으로써 타액 검체의 진단학적 활용도를 살펴보고, 타액 검체의 다양한 보관 과정이 genomic DNA의 분리에 미치는 영향을 살펴보고자 시행되었으며, 또한 분리된 genomic DNA의 안정도를 살펴보고자 중합효소 연쇄반응 분석법을 이용하여 $\beta$-globin 유전자의 증폭을 시행하였다. 10명의 피검자(평균 나이: $29.9{\pm}9.8$ 세)를 대상으로 혈액, 비자극성, 자극성 전타액 및 협점막 swab을 채취한 후 이로부터 genomic DNA를 분리하였다. 여러 다양한 보관조건이 genomic DNA에 미치는 영향을 알아보기 위하여 건강한 20명의 피검자(평균 나이: $32.3{\pm}6.6$ 세)를 대상으로 자극성 전타액을 채취하여 실온, $4^{\circ}C$, $-20^{\circ}C$, $-70^{\circ}C$, 자연 건조 및 동결 건조 상태에서 1, 3, 5 개월 동안 보관한 후 genomic DNA를 분리, 조사하였으며, 분리된 genomic DNA의 안정도를 살펴보고자 중합효소 연쇄반응 분석법을 이용하여 989-bp의 $\beta$-globin 유전자를 증폭한 후 전기영동 검사를 시행하여 다음과 같은 결론을 얻었다. 1. 타액으로부터 분리한 genomic DNA의 농도는 혈액의 경우에 비하여 유의하게 낮았으며(p<0.05), 타액군 간에는 유의한 차이가 없었다. 자극성 전타액과 이를 동결 건조한 검체에서 분리한 genomic DNA의 순도는 혈액의 경우에 비하여 유의하게 높았으며(p<0.05), 협점막 swab으로부터 분리한 genomic DNA 의 순도는 타액의 경우에 비하여 유의하게 낮게 나타났다(p<0.05). 2. 실온에서 보관한 타액 검체로부터 분리한 genomic DNA의 농도는 1 개월 후부터 점차적으로 감소되었으며, 3 개월과 5개월 동안 보관한 타액 검체에서는 유의하게 감소되었다(각각 p<0.05, p<0.01). DNA의 순도 또한 점차적으로 감소되어 3 개월과 5 개월 동안 보관한 타액 DNA의 순도는 신선한 타액과 1 개월 동안 보관된 타액 검체의 순도보다 낮게 나타났다(p<0.05). 3. 타액 검체를 $4^{\circ}C$와 $-20^{\circ}C$에서 보관한 후 분리한 genomic DNA의 농도는 3 개월의 보관 기간 동안 유의한 변화가 없었으나, 보관 기간 5 개월 후의 검체에서는 유의하게 감소되었다(p<0.05). 4. 타액을 $-70^{\circ}C$에서 보관한 검체와 동결 건조한 후 보관한 검체로부터 분리한 genomic DNA의 농도는 보관 기간에 따른 유의한 차이를 보이지 않았으나, 보관 후 5 개월 후의 검체에서는 DNA의 농도가 감소되는 경향을 보였다. 5. 타액을 자연 건조한 후 즉시 genomic DNA를 분리한 결과, 신선한 타액에 비하여 약 60%의 DNA를 얻을 수 있었다. 자연 건조한 후에 실온에서 보관한 타액 검체로부터 분리한 genomic DNA 농도는 보관 2 주 만에 급격하게 감소되었다(p<0.05). 6. 중합효소 연쇄반응 방법을 이용한 $\beta$-globin 유전자의 증폭은 동결 건조한 후 보관한 타액의 경우 보관 기간 5 개월까지의 모든 검체에서 가능하였으며, 보관 기간 1 개월을 기준으로 보았을 때 $-20^{\circ}C$와 $-70^{\circ}C$에서 보관한 타액의 경우 모든 검체에서, $4^{\circ}C$에서 보관한 타액의 경우 일부분의 검체에서만 증폭이 가능하였고, 실온에서 보관한 타액과 자연 건조 후 실온에서 보관한 타액의 경우는 증폭이 이루어지지 않았다.

• 한국축산식품학회지
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• 제33권5호
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• pp.655-663
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• 2013

본 연구에서는 Salmonella invA 유전자를 마커로 Salmonella 특이 LAMP primer를 제작하였고, inclusivity 및 exclusivity 실험 결과는 각각 100%로 관찰되었다. 순수 배양된 Salmonella 희석액에서의 검출한계는 18.17분에서 $3.2{\times}10^3$ CFU/mL ($R^2$ = 0.9446)으로 관찰되어 신속 간단하고 민감도가 높아 Salmonella 검출을 위한 방법으로 효과적일 뿐만 아니라 간접적인 정량기법으로서도 활용 가능함을 알 수 있었다. 1차 증균 배지인 BPW에 S. Enteritidis 접종 후 0시간 및 12시간 배양 후 LAMP의 검출한계는 각각 $3.2{\times}10^3$ CFU/mL 및 $3.2{\times}10^0$ CFU/mL으로 관찰되었고, 오리도체 시료가 포함된 BPW에 S. Enteritidis 접종 후 0시간 및 12시간 증균액에서의 LAMP 검출한계는 각각 $3.2{\times}10^3$ CFU/mL 및 $3.2{\times}10^0$ CFU/mL으로 관찰되어 PCR과 비교하였을 때 오리도체시료 성분에 의한 영향이 비교적 낮았음을 알 수 있었다. 또한, 실제 도압장에서 채취한 오리도체시료를 BPW에 6시간 배양한 1차 증균액에 개발한 LAMP기법을 적용한 결과, 96%의 민감도 및 84%의 특이도를 보여 오리도체에서의 Salmonella 신속 스크리닝 기법으로서 효과적으로 활용될 수 있음을 알 수 있었다.

• 한국식품영양과학회지
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• 제34권10호
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• pp.1611-1618
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• 2005

일반 음식점인 한식당의 시설과 기구의 미생물 오염도를 확인하기 위해 부산지역에서 세곳의 대형한식당을 선정하여 여름기간 중 위생평가를 실시하였다. 총 175개의 Swab 샘플이 식당의 시설과 기구의 표면에서 채취되어 총균수와 대장균군수가 측정되었다. 또한 식당내부의 공기속에 존재하는 총균, 대장균군, 포도상균 그리고 곰팡이와 효모의 오염도를 측정하기 위해 36개의 공기샘플이 채취되었다. 모든 채취된 샘플은 아이스박스에 담기어 실험실로 이송되어 분석되었다. 실험결과 대부분의 Swab된 표면들이 많은 수의미생물과 대장균군에 의해 오염된 것으로 확인되었다. 미생물의 오염정도는 샘플이 채취된 장소별로 차이가 있었다. 총균수 측정결과200$cm^{2}$의 단위면적당 검출되지 않는 것에서부터 최고 2.14$\times$$10^{9}$의 수치가 관찰되었고 대장균군인 경우에는 검출되지 않은 것에서부터 최고 8.34$\times$$10^{7}$의 수치가 검출되었다. 한식당의 공기오염도 측정결과 대부분의 측정 지역에서 일반세균, 대장균군, 포도상구균 그리고 곰광이와효모가 검출되었다. 미생물에 의해 심각하게 오염된 부분은 바닥, 트렌치, 물병내부, 플라스틱 소쿠리, 고무장갑, 선반 그리고 포장되지 않은 물수건으로 확인되었다. 이러한 장소는 위 생표준작업기준의 관리점으로 지정하여 중점적으로 관리되어야만 할 것이다. 또한 식중독사고의 발생위험을 감소시키기 위해서 육안검사와 더불어 주기적인 미생물 검사가 식당의 오염도가 높은 장소에서 수행되어져야만 할 것이다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제26권3호
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• pp.215-220
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• 1988

국내 일부 지역 국민학교 학동에 있어서 요충 감염상태를 알아보고자 하였다. 즉, 1984년 10월 서을 지역의 한 국민학교와 경기도 양주군의 한 국민학교, 1986년 10월 경기도 의정부의 한 국민학교에 대하여 항문주위 도말검사를 오전 9시∼12시 사이에 1회 실시하였다. 한편 1988년 10월 상기 국민학교 3학년 학동들에게 요충감염에 영향을 미칠 것으로 생각되는 가정환경 요인들에 대하여 설문 조사를 시행하였다. 국민학교 학동의 요충란 양성률은 평균 16.0%(2,156명 조사)였고 남자가 14.5%(1,118명), 여자 가 17.6%(1,038명)로서 여자에서 약간 높았다. 또 저학년보다 고학년에서 낮은 양성률을 보였다. 지역별로는 서울의 유현국민학교 학동이 13.6%로 가장 낮은 양성률을 보였고 경기도의 호암국민학교가 17.5%, 덕산국민학교가 17.6%의 양성률을 각각 보였다. 학동의 요충 감염에 영향을 미칠 것으로 생각되는 여러 가정환경 요인들중 가장의 직업, 형제수, 어린이 방의 유무, 목욕실 유무 등이 유의한 요인으로(p<0.1) 나타났다. 이상의 결과는 학동의 요충 감염이 아직도 높은 상황임을 보이고 있으나, 과거 10연전의 성적과 비교해 볼 때 감소되고 있으며, 특히 생활수준과 가정환경 요인의 개선이 감염률의 감소에 영향을 미치고 있음을 알 수 있었다.