• 제목/요약/키워드: Subtration hybridization

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Isolation and Characterization of UV-inducible gene in Eukaryotic cells

  • Choi, In-Soon
    • Journal of Life Science
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    • 제11권1호
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    • pp.52-56
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    • 2001
  • The present study intends to characterize the DNA damage-inducible responses in eukaryotic cells. The fission yeast, S. pombe, which displays efficient DNA repair systems, was used in this study as a model system for higher eukaryotes. To study UV-inducible responses in S. pombe, five UV-inducible cDNA clones were isolated from S. pombe by using subtration hybridization method. To investigate the expression of isolated genes, the cellular levels of the transcripts of these genes were determined by Northern blot analysis after UV-irradiation. The transcripts of isolated gene (UV130) increased rapidly and reached maximum accumulation after UV-irradiation. Compared to the message levels of control, the levels of maximal increase were approximately 5 fold to UV-irradiation. In order to investigation whether the increase of UV130 transcripts was a specific results of UV-irradiation, UV130 transcript levels were examined after treating the cells to Methylmethane sulfonate (MMS). The transcripts of UV130 were not induced by treatment of 0.25% MMS. These results implied that the effects of damaging agents are complex and different regulatory pathways exist for the induction of these genes. To characterize the structure of UV130 gene, nucleotide sequences were analyzed. The nucleotide sequence of 1,340 nucleotide excluding poly(A) tail contains one open reading frame, which encodes a protein of 270 amino acids. The predicted amino acid sequences of UV130 do not exhibit any significant similarity to ther known sequences in the database.

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Caenorhabditis elegans에서 분리한 자외선 유도유전자 (UV100과 UV150)의 발현 및 특성에 관한 연구 (Characterization of Expression of UV-Inducible Gene (UV100 and UV150) in Caenorhabditis elegans)

  • 신수화;최은영;최인순
    • 생명과학회지
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    • 제16권4호
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    • pp.704-709
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    • 2006
  • 본 연구는 DNA 상해유도기작을 규명하기 위하여 꼬마선충 (Caenorhabditis elegans) 으로 부터 subtraction hybridization 방법을 이용하여 자외선 유도 유전자인 UV100과 UV150을 분리하고 그 유전자 구조와 발현양상을 조사하였다. 분리한 유전자의 발현양상을 Northern hybridization 방법으로 살펴본 결과 자외선 조사 후에 최대 2배 이상의 발현 증가를 나타내었다. 이 결과 이미 밝혀진 다른 UV-inducible 유전자와 유사하게 UV100과 UV150 유전자는 자외선에 의해서만 발현이 증가됨을 알 수 있었다. 또한 분리한 유전자의 기능을 알기 위하여 RNAi 실험을 한 결과 분리한 자외선 유도유전자는 발생단계에 따라 다양한 DNA 회복기작을 나타냄을 알 수 있었다.

효모 Schizosaccharomyces pombe에서 자외선 유도유전자 UVI-155의 분리 및 특성 연구 (Characterization of UV-Inducible Gene(UVI-155) in Schizosaccharomyces pombe)

  • 진지영;최인순
    • 생명과학회지
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    • 제16권1호
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    • pp.126-130
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    • 2006
  • 본 연구는 DNA상해유도기작을 규명하기 위하여 하등 진핵생물인 분열형 효모 Schizosaccharomyces pombe로부터 subtraction hybridization방법을 이용하여 자외선 유도 유전자인 UVI-155을 분리하고 그 유전자 구조와 발현양상을 조사하였다. UVI-155 유전자의 발현양상을 Northern hybridization 방법으로 살펴본 결과 자외선(ultraviolet-light) 조사 1시간 후에 최대의 발현 증가를 나타내었다. 반면 알킬화제 인 MMS (methyl methanesulfonate) 처리에 의해서도 발현이 증가되었다. 이 결과 다른 UV-inducible 유전자와는 다르게 UVI-l55 유전자는 UV와 MMS 등의 DNA 상해에 모두 발현이 증가됨을 알 수 있었다. 또 한 유전자의 기능을 알기 위하여 null-mutant세포 주를 제조하여 그 특성을 살펴본 결과 이 유전자는 세포의 성장에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.