• 제목/요약/키워드: Structure alignment

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Imprinting of Liquid Crystal Alignment on Polymer Layers

  • Wook, Jung-Jong;Kim, Jae-Hoon
    • 한국정보디스플레이학회:학술대회논문집
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    • 한국정보디스플레이학회 2003년도 International Meeting on Information Display
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    • pp.611-614
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    • 2003
  • We have investigated electric field effect on the formation of phase separated composite organic film structure which is utilized by anisotropic phase separation from LC and prepolymer mixtures. Application of bias field resulted in a significant change in liquid crystal alignment between glass substrate and polymer layer. The liquid crystal molecules segregated into the inter-electrodes and formed twisted structure which is the result of imprinting of LC alignment by the bias field on polymer layers during polymerization process.

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High-transmittance Multi-domain Vertical Alignment Liquid Crystal Device with Protrusion Structure

  • Kim, Ki-Han;Jeon, Eun-Young;Park, Byung Wok;Choi, Sun-Wook;Song, Dong Han;Kim, Hoon;Shin, Ki-Chul;Kim, Hee Seop;Yoon, Tae-Hoon
    • Journal of the Optical Society of Korea
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    • 제16권2호
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    • pp.166-169
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    • 2012
  • We propose a high-transmittance multi-domain vertical alignment liquid crystal device with a protrusion structure. Disclination lines, which inevitably appear at the boundaries of domains in a multi-domain structure, can be reduced by adding a protrusion structure on the top substrate. The transmittance was improved by 11% using the proposed structure with no change of either the dark state or the operating voltage.

광 PCB 접속용 플러거블 렌즈의 설계 및 제작 연구 (A Study on the design and fabrication of Pluggable Lens for Optical PCB Interconnection)

  • 김정훈;이태호;김동민;정명영
    • 마이크로전자및패키징학회지
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    • 제21권1호
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    • pp.25-29
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    • 2014
  • 본 연구에서는 기존의 PCB의 한계를 극복할 수 있는 광 PCB에 대한 연구를 수행하였으며, 고효율 수동정렬을 위한 플러거블 렌즈구조를 제안하였다. 제안된 구조는 광 도파로 수동 정렬시 발생할 수 있는 렌즈와 도파로 간의 정렬 오차를 개선하고자 도파로와 렌즈를 합한 형태이다. 또한 탈착에 의해 손상되는 렌즈표면을 보호하기 위한 보호벽 형태를 지님으로써, 고효율의 수동정렬이 가능하게 하였다. 최적화 시뮬레이션을 통하여 구조를 설계하였고, 반복적 포토 리소그래피와 열적 리플로우 공정을 통하여 플러거블 렌즈 구조 제작을 위한 공정 연구를 수행하였다. 렌즈일체형 플러거블 접속구조의 광도파로를 PDMS복제공정으로 제작된 mold를 이용하여 임프린트 공정을 통해 제작하였다. 따라서 본 논문에서는 수동정렬이 가능한 광PCB접속용 플러거블 렌즈 구조의 제작이 가능함을 확인하였다.

Protein Backbone Torsion Angle-Based Structure Comparison and Secondary Structure Database Web Server

  • Jung, Sunghoon;Bae, Se-Eun;Ahn, Insung;Son, Hyeon S.
    • Genomics & Informatics
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    • 제11권3호
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    • pp.155-160
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    • 2013
  • Structural information has been a major concern for biological and pharmaceutical studies for its intimate relationship to the function of a protein. Three-dimensional representation of the positions of protein atoms is utilized among many structural information repositories that have been published. The reliability of the torsional system, which represents the native processes of structural change in the structural analysis, was partially proven with previous structural alignment studies. Here, a web server providing structural information and analysis based on the backbone torsional representation of a protein structure is newly introduced. The web server offers functions of secondary structure database search, secondary structure calculation, and pair-wise protein structure comparison, based on a backbone torsion angle representation system. Application of the implementation in pair-wise structural alignment showed highly accurate results. The information derived from this web server might be further utilized in the field of ab initio protein structure modeling or protein homology-related analyses.

디지털도서관의 IT 거버넌스를 위한 전략적 연계의 사회적 자본 분석 모형 (A Study on Social Capital of Strategy Alignment to IT Govenance in Digital Libraries)

  • 이정수;김성희
    • 정보관리학회지
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    • 제26권3호
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    • pp.295-316
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    • 2009
  • 디지털도서관은 통합관리를 위해 정보기술의 표준화 모델인 아키텍처와 거버넌스를 도입하고 있으며, 도서관의 체계적인 정보기술 거버넌스는 도서관의 정보기술과 업무 부문의 효과적인 융합으로 통합적인 조직의 전략 및 목표를 개발하고, 추진하여 관리하는 조직 기능이라 할 수 있다. 이러한 맥락에서, 본 연구의 목적은 도서관 조직내의 정보기술 및 업무 관련 사회연결망 구조를 통해 도서관의 통합적 관리 운영을 위한 전략적 연계의 사회적 자본에 대한 분석 모델을 제시하는 데 있다. 전략적 연계를 위한 사회적 자본의 분석 모형은 첫째, 인적자원의 특성을 통한 전체 사회연결망 분석으로 둘째, 1) 커뮤니케이션 2) 경쟁력 및 가치 3) 거버넌스 4) 파트너쉽 5) 범위와 아키텍처 6) 역량의 전략적 연계 요소 분석으로 셋째, 전략적 통합성 및 기능적 통합성의 전략 적 연계 분석으로 설계하였다. 이러한 세 가지 사회적 자본은 사회연결망 분석 이론의 연결성, 중심성, 관계성으로 평가된다.

Novel Homeotropic Alignment Materials with Alkylcyclohexylbenzene as Side Chain in Polyimides

  • Lee, H.K.;Kim, Y.B.
    • 한국정보디스플레이학회:학술대회논문집
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    • 한국정보디스플레이학회 2003년도 International Meeting on Information Display
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    • pp.600-603
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    • 2003
  • VA-LCDs is widely used for recent LCD productions owing to wide viewing angle characteristics with an unusually high contrast ratio. To apply for VA-LCDs, the novel homeotropic alignment materials were synthesized, which have the liquid crystal molecule as a side chain at aromatic diamine in a polyimide structure. These polyimides generated a high pretilt angle $90^{\circ}C$. In this paper, the synthesis and alignment properties of new homeotropic alignment materials will be discussed..

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Vertical Alignment Nematic Liquid Crystal Display with Patterned Electrode Using Positive Liquid Crystal Materials

  • Shin, Hun-Ki;Yoon, Tae-Hoon;Kim, Jae-Chang
    • 한국정보디스플레이학회:학술대회논문집
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    • 한국정보디스플레이학회 2007년도 7th International Meeting on Information Display 제7권1호
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    • pp.499-501
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    • 2007
  • We propose a vertical-alignment liquid crystal display with patterned electrodes using a positive dielectric anisotropic liquid crystal. In this structure, the threshold and on-state voltages are reduced compared with previous vertical-alignment configuration with positive liquid crystal.

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정렬된 잔기 사이의 최대거리와 유사도 그래프에 기반한 단백질 구조 정렬 (Protein Structure Alignment Based on Maximum of Residue Pair Distance and Similarity Graph)

  • 김우철;박상현;원정임
    • 한국정보과학회논문지:데이타베이스
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    • 제34권5호
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    • pp.396-408
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    • 2007
  • 최근 인간 게놈 프로젝트를 통해서 인간의 DNA가 해석된 이후 유전자가 생성하는 단백질의 기능에 대한 관심이 높아지고 있다. 단백질의 기능은 서열의 유사도보다는 진화과정 상에서 잘 보존되는 구조의 유사도에 더 연관되어 있다. 이를 통해 두 개의 단백질 간에 구조 유사성이 관찰되면 이로부터 이들이 유사한 생물학적 기능을 가질 것을 기대할 수 있다. 따라서 유사한 단백질 구조를 가진 단백질을 찾기 위한 방법으로 단백질 구조 정렬에 대한 많은 연구들이 진행되었다. 하지만 기존의 연구들은 유사도로 주로 RMSD(Root Mean Square Deviation)를 사용했기 때문에 두 단백질의 정렬 결과가 유사한지 흑은 유사하지 않은지를 직관적으로 판단하기 쉽지 않다. 또한 대부분의 기존 연구들은 정렬 결과로 최적의 정렬 결과 하나만을 찾기 때문에 서로 다른 목적을 가지는 사용자들을 만족시키기 어렵다. 따라서 본 논문에서는 새로운 유사도인 MRPD(Maximum of Residue Pair Distance)와 다수의 정렬 결과를 하나의 그래프로 표현하는 SG(Similarity Graph)을 기반으로 여러 가지 정렬 결과를 한 번에 생성하는 단백질 구조 정렬 방식을 제안한다. 단백질 정렬에 MRPB를 유사도로 사용하면 RMSD를 사용하는 경우에 비해서 유사 정도를 직관적으로 이해할 수 있을 뿐 아니라 신속하게 결과를 얻을 수 있다. SG는 사용자가 다양한 후보 정렬 결과들 중에서 자신이 원하는 정렬결과를 신속히 검색할 수 있도록 지원한다. 따라서 본 논문에서 제안한 단백질 구조 정렬 알고리즘은 다양한 길이에 따른 다수의 최적 정렬들을 제시하여 사용자의 만족도를 향상시킬 수 있었으며, 다수의 정렬결과 검색임에도 불구하고 정렬 시간은 기존 방법들과 거의 비슷하다는 장점이 있다.

단백질 서열정렬 정확도 예측을 위한 새로운 방법 (A new method to predict the protein sequence alignment quality)

  • 이민호;정찬석;김동섭
    • Bioinformatics and Biosystems
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    • 제1권1호
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    • pp.82-87
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    • 2006
  • 현재 가장 많이 사용되는 단백질 구조 예측 방법은 비교 모델링 (comparative modeling) 방법이다. 비교 모델링 방법에서의 정확도를 높이기 위해서는 alignment의 정확도 역시 매우 필수적으로 필요하다. 비교 모델링 과정 중의 fold-recognition 단계에서 alignment의 정확도에 의해 template을 고르는 방법은 단지 가장 비슷한 template을 선택하는 방법에 비해 주목을 받지 못하고 있다. 최근에는 두 가지의 alignment에 사이의 shift 정보를 바탕으로 한 shift score라는 수치가 alignment의 성능을 표현하기 위해서 개발되었다. 우리는 더 정확한 구조 예측의 첫걸음이 될 수 있는 shift score를 예측하는 방법을 개발하였다. Shift score를 예측하기 위해 support vector regression (SVR)이 사용되었다. 사전에 구축된 라이브러리 안의 길이가 n 인 template과 구조를 알고 싶은 query 단백질 사이의 alignment는 n+2 차원의 input 벡터로 변환된다. Structural alignment가 가장 좋은 alignment로 가정되었고 SVR은 query 단백질과 template 단백질의 structural alignment과 profile-profile alignment 사이의 shift score를 예측하도록 training 되었다. 예측 정확도는 Pearson 상관계수로 측정되었다. Training 된 SVR은 실제의 shift score와 예측된 shift score 사이에 0.80의 Pearson 상관계수를 갖는 정도로 예측하였다.

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박형 병렬구조 XYθ 정렬 스테이지 개발 (Development of Thin and Parallel XYθ Alignment Stage)

  • 강동배;안중환;손성민
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제12권1호
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    • pp.74-79
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    • 2011
  • 정렬 시스템(Alignment System)은 다축의 스테이지를 이용하여 신속하게 물체를 정렬오차 범위 내로 위치결정시키는 역할을 한다. 본 연구에서는 병렬구조로 설계하여 두께가 얇고 높은 정밀도와 더불어 강성이 높은 XY${\theta}$ 정렬 스테이지를 개발하였다. 개발된 박형 병렬구조 XY${\theta}$정렬 스테이지는 직각도, 반복정밀도, 진직도 등의 3가지 측정항목에 대해 초정밀급을 달성하였으며 반복정밀도는 $1{\mu}m$미만이다. 비전시스템 및 정렬알고리즘을 활용한 정렬성능 평가에서는 정렬오차 ${\pm}6.25{\mu}m$를 달성하였다.