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등온 증폭법과 Real-time PCR을 이용한 Salmonella 검출 (Detection of Salmonella Using the Loop Mediated Isothermal Amplification and Real-time PCR)

  • 안영창;조민호;윤일규;정덕현;이은영;김진호;장원철
    • 대한화학회지
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    • 제54권2호
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    • pp.215-221
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    • 2010
  • 살모넬라는 음식과 식수에서 흔히 나오는 중요한 병원체로 세계 곳곳에서 급성 위장염과 같은 감염증을 일으키며, 일반적으로 인간의 혈청형 임상종으로는 Salmonella enterica의 혈청형인 S. Typhimurium과 S. Enteritidis가 있다. 일반적인 검출 방법으로 살모넬라를 기본으로 하여 선택적인 배양으로 샘플을 수집하였고 살모넬라를 일으키는 군체의 특징을 생화학과 혈청학상인 테스트를 하였으나 이러한 방법들은 일반적으로 시간이 걸리고 높은 감도를 보이지 않았다. 최근, 등온증폭반응법과 real-time PCR법을 이용하여 높은 감도, 특이성으로 현재 병원성 박테리아에 빠르게 수행할 수 있게 되었다. 본 연구에서는 등온증폭반응과 real-time PCR법을 사용하여 S. Typhimurium과 S. Enteritidis의 검출하였다. 선택적인 타겟 유전자로, invA를 살모넬라종의 염기서열에 특이적으로 임의복제 하였다. 등온증폭반응과 real-time PCR은 살모넬라종으로부터 임의의 염기서열을 증폭하여 검출하였고, invA는 S. Typhimurium과 S. Enteritidis의 두 가지 종을 모두 검출하였다. 이러한 등온증폭반응과 real-time PCR법으로 S.Typhimurium과 S. Enteritidis의 검출 가능성을 보였으며, 살모넬라 종에 대한 특이성, 민감성을 갖춘 유용한 검출방법을 제시하였다.

니켈-크롬 합금 보철물 주위 치은 열구내에서 발견된 니켈 내성 균주에 관한 분자생물학적 연구 (A STUDY OF NI-RESISTANT BACTERIA ISOLATED FROM GINGIVAL CREVICULAR FLUID ON THE PATIENTS WEARING NI-CR ALLOY PROSTHESIS (IN TERMS OF MOLECULAR BIOLOGICAL ASPECTS))

  • 채영아;우이형;이성복
    • 대한치과보철학회지
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    • 제41권2호
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    • pp.207-222
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    • 2003
  • As a material of metal-ceramic prosthesis, nickel as a form of Ni-Cr alloy has been used for many dental prostheses in many cases. However, several problems in use of the alloy have been revealed (ex ; tissue stimulation, skin allergy, hypersensitivity cytotoxicity and carcinogenecity). Little is known about nickel with respect to the relationship between Ni-prosthesis and gaining of Niresistance in oral microorganisms. The present study was undertaken to check whether use of Ni-prosthesis leads to occurrence of Ni-resistant microorganisms. So this study may suggest the possible relationships between the oral microorganisms and nickel-resistance in oral environment. Bacteria were isolated from the gingival crevicular fluid on the patients wearing Ni-Cr prosthesis. The isolated bacteria were tested fir their Ni-resistance in nickel containing media at different concentration from 3mM to 110mM. E. coli HB101 was used as control. The Ni-resistant bacteria were isolated and biochemically identified. The Ni-resistant bacteria were tested several biochemical, molecular-biological tests. Performed tests were : measuring the growth curve, antibiotic test, growth ability test in liquid media, isolation of the chromosome and plasmid, digestion of DNA by restriction enzyme, electrophoresis of chromosome and plasmid DNA, identification of Ni-resistant genes by the DNA hybridization. The results were as follows 1) The bacteria isolated from gingival crevicular fluid on the patients wearing Ni-Cr alloy prosthesis showed nickel-resistance. 2) The isolated microorganisms grew at nickel containing media of high concentrations (60mM-110mM). 3) Based on the biochemical tests, the isolated microorganisms were identified as Enterococcus faecalis(13 cases), Klebsiella pneumoniae(1 case) and Enterobacter gergoviae(1 case). 4) Enterococcus faecalis expressed not only nickel resistance but also the multi-drug resistance to several antibiotics ; chloramphenicol, kanamicin, streptomycin, lincomycin, clindamycin, However, all strain showed the sensitivity against the tetracycline. 5) DNA hybridization result suggests that there is no homology between the previously known gene of nickel resistance in Klebsiella pneumoniae and chromosomal DNA of Enterococcus faecalis.

생쥐 난자의 체외 성숙에 미치는 Melatonin의 영향 (Effects of Melatonin on the Meiotic Maturation of Mouse Oocytes in vitro)

  • 안희진;배인하
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제31권3호
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    • pp.155-168
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    • 2004
  • Objective: Melatonin, which is secreted by pineal gland play an important role in the regulation of ovarian function via seasonal rhythm and sleep in most mammals. It also has a role in the protection of cells by removing toxic oxygen free radicals brought about by metabolism. In the present study, effects of melatonin on the mouse oocyte maturation were examined using two different culture conditions provided with 5% or 21% oxygen concentration. Material and Method: Immature mouse oocytes were obtained from the ovarian follicles of $3{\sim}4$ weeks old ICR strain mice intraperitoneally injected with 5 I.U. PMSG 44 hour before. Under stereomicroscope, morphologically healthy oocytes with distinct germinal vesicle (GV) were liberated from the graafian follicles and collected using mouth-controlled micropipette. They were then cultured for 17 hour at $37^{circ}C$, 5% $CO_2$ and 21% $O_2$ (95% air) or 5% $CO_2$, 5% $O_2$ and 90% $N_2$. New modified Hank's balanced salt solution (New MHBS) was used as a culture medium throughout the experiments. Effects of melatonin were examined at a concentration of $0.0001{\mu}M$, $0.01{\mu}M$ or $1.0{\mu}M$. For the prevention of spontaneous maturation of immature oocytes during culture, dibutyryl cyclic AMP (dbcAMP) and/or hypoxanthine were included in the medium. Results: Under 21% oxygen condition, oocytes cultured in the presence of $0.01{\mu}M$ melatonin showed a significantly higher maturation rates, in terms of germinal vesicle breakdown (95.0% vs 89.0%) and polar body formation (88.1% vs 75.4%), compared to those cultured with $0.0001{\mu}M$ or $1.0{\mu}M$ melatonin. However, no difference was observed in oocytes cultured under 5% oxygen whether they were treated with melatonin or not. In the presence of $0.01{\mu}M$ melatonin, oocytes either cultured under 21% or 5% oxygen exhibited no difference in the polar body formation (85.6% vs 86.7%). However, in the absence of melatonin, oocytes cultured under 21% oxygen exhibited lower polar body formation (74.7%). When oocytes were cultured in the presence of dbcAMP alone or with varying concentrations of melatonin, those treated with both compounds always showed better maturation, i.e., germinal vesicle breakdown and polar body formation, compared to those cultured with dbcAMP alone. At the same concentration of melatonin, however, oocytes exposed to 21% oxygen showed poor maturation than those to 5% oxygen. Similar results were obtained from the experiments using hypoxanthine instead of dbcAMP. Conclusion: Based upon these results, it is suggested that melatonin could enhance the meiotic maturation of mouse oocytes under 21% oxygen concentration, and release oocytes from the meiotic arrest by dbcAMP or hypoxanthine regardless of the concentration of oxygen, probably via the removal of oxygen free radicals.

인삼의 부산물을 이용한 식의성 단백질의 효율 향상을 위한 연구 (A Study on the Improvement of Dietary Protein-efficiency by Supplement of the Panax Ginseng-by-products.)

  • 황우익;이성동
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제3권1호
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    • pp.1-34
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    • 1979
  • Our nation is confronted with the situation that the rice, a principal food, short of some essential amino acids, leads to imbalanced meals insufficient in the nutrient of Protein, to bring many difficulties in the elevation of nutritional state in our nation. While. our country has been produced much amounts of Panax Ginseng roots which has a stimulating effects on the metabolism of protein, lipid and nucleic acids in the body. And the leaf and trunk of Panax Ginseng were also produced a considerable amounts as the by-products. Author believe that these by-products (leaf and trunk) of Panax Ginseng might have some components possessing simillar activity with Panax Ginseng root although the quantity and qualify of the functional components may more or less be different. Therefore, this study was demised to observe the supplemental effect of the Panax Ginseng-by-Products on the dietary protein efficiency and nutritional state of rats. The feeds used for this experiment were rice containing 30% barely, fish four, and the leaf, trunk and small root of the Panax Ginseng, and the contents of the general nutrients including protein, lipid and carbohydrate etc. in each feed were analyzed for the combination of each feed. And, being based on analytical values of Protein in food. fish Pour as Protein source was added were rice containing 30% barely to be include 8.6 to 8.7%, 12%, 15% and 18% of protein. Then 2% of the leaf, trunk or small reef of Panax Ginseng was supplemented into each of above protein diet group, ton 16 kinds of diets were Prepared. The male albino rats from a Pure strain, weighing 70g to 80g. were used for experimental animals. They were maintained with coresponding fist for f and 8 weeks, and the growth rate, consumption of diets and protein, efficiency of feed and Protein in animals were determined. The lipids, proteins and cholesterols in serum and liver were also determined quantitatively after they were sacrificed in coresponding term. The results obtained are summarized as follows: 1. Body weigh of diet group containing 8.6 to 8.7%,12%, and 15% of protein are increased remarkably by supplement of 2% of the leaf or small root of Panax Ginseng in comparison with each of controls. But this tendency could not observed in diet group containing 18eA Proteins. 2. Feed efficiency showed same tendency in comparison with changes of gained body weight. Specially, in each of diets containing 8.7%, 12%, 15% and 18% of Proteins, supplement of the leaf of Panax Ginseng showed the better feed efficiency than supplement of the trunk or small root. 3. In feeding group for 8 weeks, protein efficiency showed worst efficiency in diet containing 18% proteins and showed the best efficiency was the diet group containing 12% Proteins. And the efficiency was improved according to supplement of the leaf of Panax Ginseng. 4. Nitrogen contents in serum and liver did not show large differences each other in all diet groups. But contexts of total cholesterol and 1ipid were decreased markedly in diet groups containing 12%, 15% and 18% of proteins in comparison with diet group containing 8.6% to 8.8% of proteins.

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주요 식중독 그람 음성 세균 4속의 REP-PCR genotyping (REP-PCR Genotyping of Four Major Gram-negative Foodborne Bacterial Pathogens)

  • 정혜진;서현아;김영준;조준일;김근성
    • 한국식품과학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.611-617
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    • 2005
  • 본 연구에서는 E. coli. Salmonella, Shigella, Vibrio 등 4속의 주요 식중독유발 그람 음성 세균들을 대상으로 반복성 염기서열인 REP DNA sequence를 응용한 REP-PCR을 실시하였다. 이전의 보고에서 이들 4속의 식중독 유발세균 중 각각 혹은 일부를 대상으로 반복성 염기서열을 이용한 PCR을 적용한 사례는 있지만 그때 적용한 primer, PCR 반응조건 및 전기영동조건 등이 다양하였다. 그러므로 본 연구에서는 이와같은 4속의 세균들에 대하여 최적화된 동일한 primer와 PCR 반응조건 및 전기영동조건을 표준조건으로서 적용하였다. 그 결과로서 모든 4속의 식중독 세균 균주마다 REP-PCR 후 생성되는 fingerprinting pattern에서 속마다 1-3개의 공통적이며 독특한 band가 생성되는 것이 확인되어 이러한 pattern을 이용한 속 수준의 분리 동정과 그와 같은 주요 band들 이외의 부수적인 band들을 고려하여 종 수준까지의 분리도 가능함을 확인하였다. 따라서 본 연구를 통하여 반복적 DNA 염기서열을 이용한 REP-PCR이 주요 식중독 세균의 분리 동정 방법으로 사용될 수 있음을 확인하였다. 또한 본 연구를 통하여 얻은 결과는 더 많은 속(genus)의 식중독세균을 대상으로 한 새로운 분리 동정 방법을 확립하기 위하여 사용될 수 있을 것이다.

두유내의 고온성 Flat-sour 변질균의 분리.동정 및 열저항성에 관한 연구 (Studies on Thermophilic Flat-sour Bacteria in Soymilk: Isolation, Indentification and Determination of Heat Resistance)

  • 정제봉;이균희;손헌수;김석민
    • 한국식품과학회지
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    • 제20권2호
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    • pp.218-224
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    • 1988
  • 두유제조공정 중 열처리 공정을 최적화 하기 위하여, 두유에서 4균주의 열저항성이 큰 flat-sour 변질균을 분리하였다. 분리균주들은 호기성 포자형성간균으로서 $-65^{\circ}C$에서도 성장하였으며, 형태학적 및 생리학적인 특징들로부터 모두 Bacillus stearothermophilus로 동정할 수 있었다. 3분리균주 및 Bacillus stearothermophilus ATCC 12980의 두유(pH 7.0) 및 pH 7.0 완충용액 내 에서의 열저항성을 측정하기 위하여, 각각의 균주에 대한 110, 115, 121 및 $125^{\circ}C$에서의 열치사에 관한 직선회귀식을 구하였다. 두유의 구성성분이 포자의 열저항성을 증가시킨다는 점은 뚜렷하게 확인되지 않았으며, 균주간에 있어서도 D값의 대소관계가 온도에 따라 변화하여, 주어진 모든 온도에서 일관성있게 가장 큰 열 저항성을 보인 균주는 없었다. 4균주의 평균 D값은 110, 115, 121 및 $125^{\circ}C$에서 각각 77.27, 20.20, 2.76 및 1.39분이었으며, 평균 z값은 $8.36^{\circ}C$이었다.

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Bisphenol A 분해균주 Acinetobacter calcoaceticus BP-2의 분리 및 bisphenol A 분해 특성 (Isolation of Acinetobacter calcoaceticus BP-2 Capable of Degradation of Bisphenol A)

  • 권기석;김동걸;이중복;신기선;금은주;손호용
    • 생명과학회지
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    • 제16권7호
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    • pp.1158-1163
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    • 2006
  • BPA는 에폭시 수지 및 플라스틱 생산의 단량체로서 사용되어 왔으며, 접착제, 페인트, 광학렌즈, 건축자재, 전자제품 소재 등 다양한 제품을 생산하는 데 사용되고 있다. 그러나 BPA의 급성세포독성 및 내분비교란활성이 보고되면서 BPA의 분해에 대한 연구가 집중되고 있다. 본 연구에서는 BPA의 광분해 및 화학적 분해의 문제점을 극복하고, 실제적 BPA의 생물학적 분해를 목표로 BPA분해균을 플라스틱 공장의 토양으로부터 분리하였다. 분리균주 중 가장 활성이 우수한 BP-2는 5mM의 BPA처리에서 성장할 수 있었으며, pH 7, $30^{\circ}C$의 최적 배양조건에서 $53.3{\mu}g\;ml^{-1}\;day^{-1}$의 분해속도를 나타내었다. 균주 동정결과 BP-2는 Acinetobacter calcoaceticus로 확인되었으며, 3.5g-건조중량$1^{-1}$의 고농도 휴식 세포 반응 결과 $89.7{\mu}g\;ml^{-1}\;h^{-1}$의 BPA분해속도를 나타내었다. 이러한 결과는 고농도 세포농도를 유지하는 경우, BP-2균주가 실제적 BPA분해를 위한 생물촉매로 사용될 수 있음을 제시하고 있다.

알코올성 간질환 마우스에서 발생한 장 내 및 장간막 림프육종 (Intestinal and Mesenteric Lymphosarcoma on Alcohol Liver Disease in the Mice)

  • 위엔동웨이;양해걸;홍일화;기미란;박진규;구문정;이혜림;유성은;정규식
    • 생명과학회지
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    • 제17권11호
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    • pp.1593-1595
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    • 2007
  • 알코올 유도성 조직 손상에 있어서 adrenomedullin의 발현 및 그 영향에 대한 연구 중, 실험 마우스 중의 한 개체에서 장간막 림프절과 장 내에서 림프육종이 발생한 것을 확인하였다. 림프육종은 마우스 계통에 따라 발생율이 다르지만 알려진 바로는 두 번째로 발생율이 높은 자발성 종양 질환 중 하나이다. 본 증례에서 육안적인 관찰 결과, 절제된 장에서 다소 경도가 높거나 연한 경도를 가지는 부분이 혼재된 크림색의 mass가 내강으로 돌출된 것과 함께 장간막에서 역시 동일한 형태의 mass가 관찰되었다. 종양성 세포들은 주로 점막 내로 침습하고 있는 모습을 나타내고 있으며 원형의 과염색성 핵과 소량의 세포질을 함유하고 있었다. 본 림프계 종양에 있어서 그 세포들의 기원은 CD20, CD3, vimentin에 대한 면역염색을 실시하여 확인하였다.

N-3계 지방산 적절 함량 식이의 docosahexaenoic acid 첨가가 기억력 관련 뇌 기능에 미치는 영향 (Effect of Treatment with Docosahexaenoic Acid into N-3 Fatty Acid Adequate Diet on Learning Related Brain Function in Rat)

  • 임선영
    • 생명과학회지
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    • 제19권7호
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    • pp.917-922
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    • 2009
  • SD계 흰쥐를 사용하여 motor activity 실험에서 동물들의 자발적인 운동성을 측정한 결과, 주어진 시간 내 움직인 시간과 움직인 거리에는 n-3 지방산이 적절히 함유된 식이군 (Adq group)과 DHA가 첨가된 식이군(Adq+DHA group)간에 유의적 차이를 관찰할 수가 없었다. 학습효과 실험에서 n-3 지방산이 적절히 함유된 식이군 (Adq group)의 경우 목적 플랫트폼까지 걸리는 시간이 DHA 첨가 식이군(Adq+DHA group)에 비하여 다소 길었으나 유의적 차이는 관찰할 수가 없었다. 수영 속도(swimming speed)에서 DHA 첨가 식이군(Adq+DHA group)의 경우, n-3 지방산이 적절히 함유된 식이군 (Adq group)에 비해 유의적으로 빨랐으나 수영 풀에서 움직인 거리 (swimming distance)에는 두 식이군 간의 유의적 차이가 없었다. 두 식이군의 흰쥐들이 수영한 시간(swimming time)과 쉬고 있는 시간(resting time)의 경우, 쉬는 시간에는 유의적 차이가 없었으나 수영 시간 또한 n-3 지방산이 적절이 함유된 식이(Adq group)로 사육된 쥐가 DHA가 첨가된 식이로 사육된 쥐(Adq+DHA group)보다 수영한 시간이 길었으나 여기서도 유의적 차이는 없었다. 기억력 테스트에서 n-3 지방산이 적절히 함유된 식이군(Adq group) 및 DHA가 첨가된 식이군(Adq+DHA group) 모두는 목적 플랫트폼이 있었던 A 지역에 대한 기억이 우수하여 다른 지역들인 B, C, D를 지나가는 횟수보다 유의적으로 많았음을 관찰하였다(p<0.05). 이상의 결과로부터 임신에서부터 성인이 될 때까지 n-3 지방산이 적절히 함유된 식이로 사육된 쥐와 비교할 때 DHA가 첨가된 식이로 사육된 흰쥐가 Morris water maze를 이용한 공간기억력 실험에서 다소 우수한 기억 학습효과를 나타내었으나 유의적 차이는 없었음을 관찰 할 수가 있었다.

무가선 트램용 매립형궤도 아스팔트 포장층의 부착특성 및 변형발생특성 분석 (Investigation of the Bond and Deformation Characteristics between an Asphalt layer and a Concrete Slab used as the Trackbed Foundation of an Embedded Rail System for Wireless Trams)

  • 조호진;강윤석;이수형;박재범;임유진
    • 한국철도학회논문집
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    • 제19권2호
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    • pp.224-233
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    • 2016
  • 무가선 트램 궤도구조는 도심지 가로망 내에 구축되는 관계로, 포장면 레벨 및 평탄성 확보를 위하여 기존 도로포장면과 동일하게 아스팔트 포장 덧씌우기 형태로 콘크리트 슬래브 상에 포설하게 된다. 그러나, 이들의 거동특성이 분명하게 파악된 바 없다. 본 연구에서는 무가선 트램용 매립형궤도 기초구조를 구성하는 아스팔트 포장층의 복합포장단면 내 거동특성을 분석하기 위하여 이들 이질 궤도 구성층재료 사이의 인장부착강도와 전단부착강도 파악을 위한 실내시험을 실시하였다. 이러한 실내부착강도 시험을 위하여 콘크리트 슬래브와 상단 아스팔트 포장층 사이에 사용할 부착재료를 선정하고 이에 따른 부착방식을 결정하였다. 트램용 매립형궤도 구성층 사이의 인장부착강도와 전단저항 실내시험결과로부터 공용성 및 내구성 확보를 위한 가장 핵심적인 설계 파라미터를 추출할 수 있었다. 또한 복합단면에 대한 유한요소해석으로부터 층간경계부에서의 인장변형률 특성을 분석하였다.