Ahn, Jun-Ho;Hwang, Sung-Hee;Cho, Hyun-Soo;Lee, Michael
Biomolecules & Therapeutics
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제27권3호
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pp.302-310
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2019
Melanoma cells have been shown to respond to BRAF inhibitors; however, intrinsic and acquired resistance limits their clinical application. In this study, we performed RNA-Seq analysis with BRAF inhibitor-sensitive (A375P) and -resistant (A375P/Mdr with acquired resistance and SK-MEL-2 with intrinsic resistance) melanoma cell lines, to reveal the genes and pathways potentially involved in intrinsic and acquired resistance to BRAF inhibitors. A total of 546 differentially expressed genes (DEGs), including 239 up-regulated and 307 down-regulated genes, were identified in both intrinsic and acquired resistant cells. Gene ontology (GO) analysis revealed that the top 10 biological processes associated with these genes included angiogenesis, immune response, cell adhesion, antigen processing and presentation, extracellular matrix organization, osteoblast differentiation, collagen catabolic process, viral entry into host cell, cell migration, and positive regulation of protein kinase B signaling. In addition, using the PAN-THER GO classification system, we showed that the highest enriched GOs targeted by the 546 DEGs were responses to cellular processes (ontology: biological process), binding (ontology: molecular function), and cell subcellular localization (ontology: cellular component). Ingenuity pathway analysis (IPA) network analysis showed a network that was common to two BRAF inhibitorresistant cells. Taken together, the present study may provide a useful platform to further reveal biological processes associated with BRAF inhibitor resistance, and present areas for therapeutic tool development to overcome BRAF inhibitor resistance.
Park, Joo-Hung;Lee, Jeong-Min;Lee, Eun-Jin;Hwang, Won-Bhin;Kim, Da-Jeong
Molecules and Cells
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제41권4호
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pp.290-300
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2018
Using an in vitro model of intestinal organoids derived from intestinal crypts, we examined effects of indole-3-carbinol (I3C), a phytochemical that has anticancer and aryl hydrocarbon receptor (AhR)-activating abilities and thus is sold as a dietary supplement, on the development of intestinal organoids and investigated the underlying mechanisms. I3C inhibited the in vitro development of mouse intestinal organoids. Addition of ${\alpha}$-naphthoflavone, an AhR antagonist or AhR siRNA transfection, suppressed I3C function, suggesting that I3C-mediated interference with organoid development is AhR-dependent. I3C increased the expression of Muc2 and lysozyme, lineage-specific genes for goblet cells and Paneth cells, respectively, but inhibits the expression of IAP, a marker gene for enterocytes. In the intestines of mice treated with I3C, the number of goblet cells was reduced, but the number of Paneth cells and the depth and length of crypts and villi were not changed. I3C increased the level of active nonphosphorylated ${\beta}$-catenin, but suppressed the Notch signal. As a result, expression of Hes1, a Notch target gene and a transcriptional repressor that plays a key role in enterocyte differentiation, was reduced, whereas expression of Math1, involved in the differentiation of secretory lineages, was increased. These results provide direct evidence for the role of AhR in the regulation of the development of intestinal stem cells and indicate that such regulation is likely mediated by regulation of Wnt and Notch signals.
Kim, Dae Hong;Lee, Ik Hwan;Nam, Seung Taek;Hong, Ji;Zhang, Peng;Lu, Li Fang;Hwang, Jae Sam;Park, Ki Cheol;Kim, Ho
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제25권10호
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pp.1640-1647
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2015
We recently reported that the antimicrobial peptide Lumbricusin (NH2-RNRRWCIDQQA), isolated from the earthworm, increases cell proliferation in neuroblastoma SH-SY5Y cells. Here, we investigated whether Lumbricusin has neurotropic activity in mouse neural stem cells (MNSCs) and a protective effect in a mouse model of Parkinson's disease (PD). In MNSCs isolated from mouse brains, Lumbricusin treatment significantly increased cell proliferation (up to 12%) and reduced the protein expression of p27Kip1 through proteasomal protein degradation but not transcriptional regulation. Lumbricusin inhibited the 6-OHDA-induced apoptosis of MNSCs, and also showed neuroprotective effects in a mouse PD model, ameliorating the motor impairments seen in the pole, elevated body swing, and rotation tests. These results suggest that the Lumbricusin-induced promotion of neural cell proliferation via p27Kip1 degradation has a protective effect in an experimental PD model. Thus, the antimicrobial peptide Lumbricusin could possibly be developed as a potential therapeutic agent for the treatment of PD.
Recent evidence has suggested that trunk neural crest cell generally assumed to have equivalent differentiation potentials, demonstrate differentiation bias along the anterior/posterior axis. In amphibian and fish, neural crest cells give rise to three chromatophore types, melanophores, xantho-phores, and iridophores. Each pigment cell type has distinct characteristics but there is speculation about the cellular plasticity that exists among them. Neural crest cells migrate along specific routes, ventromedially and dorsolaterally. Neural crest cells that travel dorsolaterally are the first cells to begin migration in the axolotl and are the major contributors to the visible pigment pattern. Many factors and mechanisms that are responsible for guiding migratory neural crest cells along potential pathways or determining their fate remain unknown. A single lineage of the crest, which becomes restricted to one of the three pigment cell types, gives us the opportunity to examine the existence of neural crest stem cell populations and cellular plasticity. Study presented here showed results from recent in vitro studies designed to identify parameters influencing differentiation events of individual neural crest-derived pigment cell lineages. Melanophore production from neural crest explants originating from different levels along the anterior/posterior axis of wild type-axolotl embryos were compared and demonstrate that the differentiation of melanophores is enhanced in subpopulation of neural crest treated with forskolin. Forskolin (an adenylate cyclase activator) increases intracellular CAMP concentration and eventually activates the protein kinase-A signaling pathway. Melanophore number, melanin content, and tyrosinase activity in explants taken from the anterior-most region of the crest increased significantly in response to forskolin treatment. This study suggests implications of region specific influences and developmental regulation in the development of pigment pattern.
Lee, Dong-Seol;Roh, Song Yi;Choi, Hojae;Park, Joo-Cheol
Molecules and Cells
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제43권8호
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pp.739-748
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2020
Stringent regulation of the chondrocyte cell cycle is required for endochondral bone formation. During the longitudinal growth of long bones, mesenchymal stem cells condense and differentiate into chondrocytes. Epiphyseal chondrocytes sequentially differentiate to form growth-plate cartilage, which is subsequently replaced with bone. Although the importance of nuclear factor 1C (Nfic) in hard tissue formation has been extensively studied, knowledge regarding its biological roles and molecular mechanisms in this process remains insufficient. Herein, we demonstrated that Nfic deficiency affects femoral growth-plate formation. Chondrocyte proliferation was downregulated and the number of apoptotic cell was increased in the growth plates of Nfic-/- mice. Further, the expression of the cell cycle inhibitor p21 was upregulated in the primary chondrocytes of Nfic-/- mice, whereas that of cyclin D1 was downregulated. Our findings suggest that Nfic may contribute to postnatal chondrocyte proliferation by inhibiting p21 expression and by increasing the stability of cyclin D1 protein.
신규 종양 유전자 Cancer Upregulated Gene (CUG) 2가 어떻게 유사-종양줄기세포 표현형을 유도하는지 잘 알려져 있지 않다. Cyclin E, c-Myc, Notch, 그리고 Yap1와 같은 종양단백질를 분해하여 그 발현을 조절하는 FBXW7 E3 ligase의 발현이 대장암, 자궁경부암, 그리고 위암 등 여러 암조직에서 낮아져 있음이 보고되고 있다. 그래서 우리는 이 FBXW7 단백질이 CUG2에 의한 종양형성에 관여할 수 있다는 가설을 세웠다. 이 연구에서 우리는 각 대조구 세포주보다 CUG2가 과발현된 A549 폐암 세포주와 BEAS-2B 기관지 세포주에서 FBXW7 단백질 발현이 낮게 나왔다. 여기서 MG132를 처리하게 되면 감소된 FBXW7과 FBXW7 기질로 알려진 Yap1 단백질 발현이 증가되는 결과를 관찰하였다. 종양줄기세포 현상에서 FBXW7의 역할을 규명하기 위하여, FBXW7 siRNA를 처리하였다. 대조구 세포주에서 감소된 FBXW7의 조건은 세포 이동 침습, 그리고 구형 형성이 증가되는 종양줄기세포 현상이 촉진되는 것을 관찰하였고, CUG2가 과발현된 두 세포주에서 FBXW7 발현 벡타 도입으로 FBXW7 발현 증가는 종양줄기세포 현상이 억제됨을 알 수 있었다. 또한 FBXW7의 감소는 EGFR-Akt-ERK1/2와 β-catenin-Yap1-NEK2 신호 경로를 활성화시키고, 반대로 FBXW7 발현 증가는 이 두 경로의 활성이 억제됨을 알 수 있었다. 이들 결과를 종합해 보면, CUG2 과발현은 FBXW7의 발현 감소로 이어지고, 이는 EGFR-Akt-ERK1/2와 β-catenin-Yap1-NEK2 신호경로를 활성화시켜 유사-종양줄기세포 현상을 촉진하는 것으로 생각된다.
생쥐 유전자를 과발현 시키거나 제거하는 유전자 조작 기술의 발달은 배 발생 단계나 출생 후 특정한 세포에서의 특정 단계에서의 유전자 기능을 이해하는 많은 기여를 하고 있다. 특히, 높은 상동 재조합 활성을 가지는 생쥐 배 줄기세포를 이용한 유전자 적중 기법은 인간 질환을 이해하는데 필수적인 동물 모델 개발에 중요한 기여를 하였다. 최근에는 Cre과 Flp와 같은 염기서열 특이적 재조합 효소와 라이겐드에 의한 조절 시스템의 도입으로 좀 더 정확하고 정교한 유전자 발현 조절을 위해 개발되어 복잡한 생명현상을 지배하는 메카니즘과 시간과 공간에서 작동하는 유전자의 기능을 이해하는데 많은 기여를 하고 있다. 마우스 게놈을 세밀하게 조작할 수 있는 새로운 분자생물학적 도구의 적용으로 in vivo상에서 유전자의 다양한 기능을 좀 더 정확하게 이해할 수 있는 기회가 열릴 것으로 기대된다.
BRCA1 is a tumor suppresser gene in familial cases of breast cancer. It has been controversial whether the subcellular localization of BRCA1 is located in nuclei or cytoplasm in normal human breast cells. We found that a p220 protein was expressed in Type II Normal human breast epithelial cells (NHBEC) but not in Type I NHBEC in Western blot analysis using the 17F8 (3A2) antibody. Immunostaining using the same antibody revealed positive staining in nuclei, cytoplasm and perinuclei of Type II cells and negative staining in Type I NHBEC. The p220 protein, however, was expressed in SV40 immortalized Type I NHBEC and tumorigenic cells derived from them after x-ray and neu oncogene treatment. The subcelluar localization was mostly cytoplasmic and punctate in the nuclei. The breast carcinoma cell lines, MCF-7 and T47D, also expressed the p220 protein. Using RT-PCR, we observed the expression of BRCA1 mRNA in both Type I and Type II NHBEC. This result indicated that there might be mechanisms involved in post-translational or translational regulation of BRCA1 gene. It is speculated that the absence of BRCA1 protein expression in Type I NHBEC might playa role in their susceptibility to neoplastic transformation.
Hepatocellular carcinoma is a major health burden, and though various treatments through much research are available, difficulties in early diagnosis and drug resistance to chemotherapy-based treatments render several ineffective. Cancer stem cell model has been used to explain formation of heterogeneous cell population within tumor mass, which is one of the underlying causes of high recurrence rate and acquired chemoresistance, highlighting the importance of CSC identification and understanding the molecular mechanisms of CSC drivers. Extracellular CSC-markers such as CD133, CD90 and EpCAM have been used successfully in CSC isolation, but studies have indicated that increasingly complex combinations are required for accurate identification. Pseudogene-derived long non-coding RNAs are useful candidates as intracellular CSC markers - factors that regulate pluripotency and self-renewal - given their cancer-specific expression and versatile regulation across several levels. Here, we present the use of microarray data to identify stemness-associated factors in liver cancer, and selection of sole pseudogene-derived lncRNA ZNF204P for experimental validation. ZNF204P knockdown impairs cell proliferation and migration/invasion. As the cytosolic ZNF204P shares miRNA binding sites with OCT4 and SOX2, well-known drivers of pluripotency and self-renewal, we propose that ZNF204P promotes tumorigenesis through the miRNA-145-5p/OCT4, SOX2 axis.
Syed Sayeed Ahmad;Hee Jin Chun;Khurshid Ahmad;Sibhghatulla Shaikh;Jeong Ho Lim;Shahid Ali;Sung Soo Han;Sun Jin Hur;Jung Hoon Sohn;Eun Ju Lee;Inho Choi
Journal of Animal Science and Technology
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제65권1호
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pp.16-31
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2023
Cultured meat is a potential sustainable food generated by the in vitro myogenesis of muscle satellite (stem) cells (MSCs). The self-renewal and differentiation properties of MSCs are of primary interest for cultured meat production. MSC proliferation and differentiation are influenced by a variety of growth factors such as insulin-like growth factors (IGF-1 and IGF-2), transforming growth factor beta (TGF-β), fibroblast growth factors (FGF-2 and FGF-21), platelet-derived growth factor (PDGF) and hepatocyte growth factor (HGF) and by hormones like insulin, testosterone, glucocorticoids, and thyroid hormones. In this review, we investigated the roles of growth factors and hormones during cultured meat production because these factors provide signals for MSC growth and structural stability. The aim of this article is to provide the important idea about different growth factors such as FGF (enhance the cell proliferation and differentiation), IGF-1 (increase the number of myoblasts), PDGF (myoblast proliferation), TGF-β1 (muscle repair) and hormones such as insulin (cell survival and growth), testosterone (muscle fiber size), dexamethasone (myoblast proliferation and differentiation), and thyroid hormones (amount and diameter of muscle fibers and determine the usual pattern of fiber distributions) as media components during myogenesis for cultured meat production.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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