• Journal of the Korean Academy of Child and Adolescent Psychiatry
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• 제11권1호
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• pp.3-15
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• 2000

연구목적：자폐장애의 원인을 유전학적으로 규명하려는 연구가 시도되고 있으며, 그 중 fragile X 증후군과의 연관성에 대한 연구가 활발히 진행되고 있다. Fragile X 염색체(Xq27.3)는 세포유전학적 방법으로 증명할 수 있으나 검사에 많은 제약과 단점이 있으므로, 본 연구에서는 보다 신뢰성이 높은 분자생물학적 방법으로 FMR-1 유전자내 CGG 삼염기 반복부위를 분석하여 자폐장애와 fragile X 증후군의 연관성을 규명하고자 하였다. 방 법：자폐장애 환아(99명)와 정상대조군(8명)을 대상으로 FMR-1 유전자의 CGG 반복배열 부위를 sense와 antisense primer를 이용하여 PCR법으로 분석하였으며, 동시에 세포유전학적 검사도 시행하였다. PCR 분석에서 CGG 반복수가 50 이상인 경우에 대해서는 StB12.3 혹은 Pfxa3 probe를 이용한 Southern blot hybridization으로 확인하였다. 결 과：FMR-1 유전자의 CGG 반복배열에 대한 PCR 분석 결과 CGG 삼염기의 반복배열의 수는 자폐장애 환자군과 정상대조군 사이에 통계적으로 유의한 차이가 없었다(p=0.207). 자폐장애 환자에서 CGG반복수가 50회 이상인 조기변이(premutation) 환자가 2명 있었으나 Southern blot hybridization 결과 완전변이(full mutation)로 판정할 수 있는 경우는 없었다. 세포유전학적 검사에서 환자군 모두에서 정상 핵형을 나타내었으며 fragile X 염색체는 확인되지 않았다. 결 론：이상의 결과에서 자폐장애 환자가 FMR-1 유전자의 CGG 삼염기 반복부위 이상, 즉 fragile X 염색체 이상을 동반하지 않았음을 증명할 수 있었다. 이는 fragile X 증후군을 자폐장애의 직접적인 원인이라고 보기에는 어려움이 있음을 시사한다.

• 한국균학회지
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• 제30권1호
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• pp.66-72
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• 2002

Phytophthora capsici 집단의 유전적 특성 분석용 DNA marker를 선발하고자 HindIII로 처리된 P. capsici 95CY3119 균주의 genomic DNA library를 임의로 cloning 시킨 후 southern blot 분석을 실시하여 선발된 clone들의 특성을 조사하였다. Probe로 사용하기 위해 선발된 clone 내에 삽입된 DNA 단편들은 HindIII로 처리된 P. capsici 95CY3119의 genomic DNA와 특이적으로 강하게 반응했다. 조사된 probe 중 PC9은 HindIII로 처리된 국내 P. capsici 균주들의 genomic DNA와 Southern 분석시 많은 밴드를 형성하였으며, 분리포장 단위별 균주들 간에는 물론 동일 포장 분리균주들 간에도 그 차이를 나타냈다. 그 밴드 양상을 기초로 집괴분석을 실시한 결과, 각 균주의 유전적 다양성이 잘 나타났다. Prove PC22는 다른 Phytophthora속과 Pythium속 균주들의 genomic DNA들과의 Southern hybridization에서는 반응을 나타내지 않았지만 특이적으로 P. capsici 균주들과는 다수의 밴드를 형성하였다. 이들 P. capsici 종특이적 DNA probe들은 추후 국내 및 전세계에 분포하는 P. capsici 집단의 유전적 다양성 분석 및 종동정에 유용한 marker로서 활용될 수 있을 것이다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제21권5호
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• pp.657-662
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• 2008

To develop transgenic orchardgrass (Dactylis glomerata L.) resistant to high temperature, the recombinant DgHSP17.2 gene was introduced into orchardgrass plants using the Agrobacterium-mediated transformation method and expressed constitutively under the control of the CaMV 35S promoter. The results of genomic DNA PCR and Southern analysis showed a DNA band and hybridization signal on agarose gel and X-ray film in transgenic orchardgrass plants harboring the recombinant DgHSP17.2 gene, but a DNA band and hybridization signal were not observed in the wild type and empty vector control plants. The same result was also obtained in RT-PCR and Southern blot analysis, and these transgenic orchardgrass plants did not show any morphological aberration both in the culture bottle and soil mixture. When leaf discs cut from transgenic orchardgrass plants with recombinant DgHsp17.2 gene were exposed to lethal temperature (heat treatment at $60^{\circ}C$ for 50 min), 60-80% of the leaf discs showed only damage symptoms, but non-transgenic leaf discs showed a lethal condition. These results indicate that the DgHsp17.2 gene may act as a protector from heat stress in plants.

• 한국균학회지
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• 제25권1호통권80호
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• pp.1-5
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• 1997

여름느타리버섯 균사체의 cDNA library로부터 ${\beta}-tubulin$ 유전자를 분리하여 염기서열을 분석하였다. 분리된 ${\beta}-tubulin$ cDNA유전자는 27nt의 5'-untranslation region과 1341nt의 open reading frame, 191nt의 3'-untranslation region으로 구성되어 있었다. ORF는 445개의 아미노산들로 구성되어 있으며, 동물, 식물, 사상균에서 보고된 ${\beta}-tubulin$과 80% 이상의 상동성을 보였다. 분리된 Myc7tub clone을 사용하여 Southern hybridization한 결과 여름느타리버섯에는 두 가지의 isotype ${\beta}-tubulin$이 존재할 것으로 생각된다.

• BMB Reports
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• 제38권4호
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• pp.386-390
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• 2005

Based on the reported cDNA sequences of $BmK{\alpha}Txs$, the genes encoding toxin $BmK{\alpha}Tx11$ and $BmK{\alpha}Tx15$ were amplified by PCR from the Chinese scorpion Buthus martensii Karsch genomic DNA employing synthetic oligonucleotides. Sequences analysis of nucleotide showed that an intron about 500 bp length interrupts signal peptide coding regions of $BmK{\alpha}Tx11$ and $BmK{\alpha}Tx15$. Using cDNA sequence of $BmK{\alpha}Tx11$ as probe, southern hybridization of BmK genome total DNA was performed. The result indicates that $BmK{\alpha}Tx11$ is multicopy genes or belongs to multiple gene family with high homology genes. The similarity of $BmK{\alpha}$-toxin gene sequences and southern hybridization revealed the evolution trace of $BmK{\alpha}$-toxins: $BmK{\alpha}$-toxin genes evolve from a common progenitor, and the genes diversity is associated with a process of locus duplication and gene divergence.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제30권2호
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• pp.143-149
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• 2003

This experiment was carried out to confirm the stability of bar gene introduced into petunia plant through Agrobacerium-mediated transformation. Twenty-five transgenic plants T$_{0}$ plants, back cross (BC$_1$) populations to wild type and F$_1$plants between different T$_{0}$ plants were prepared, and polymerase chain reaction(PCR), PCR-Southern blot analysis, and field test with 0.1% Basta treatment were done. The results of PCR, PCR-Southern blot hybridization, and field test indicated that NPTII and bar gene introduced into the genome of petuina plants were stably transmitted to their progenies, and conferred the plants resistance to herbicide, Basta.sta.

• 한국식품영양학회지
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• 제9권4호
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• pp.459-465
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• 1996

지금까지 많은 연구가 되어 있지 않던 Bacillus thuringiensis serovar. darmstadiensis의 내독소를 Renografin-76 단계적 기울기 원심분리로 분리하여 전자 현미경으로 관찰하여 이중피라미드 구조를 가진 독소 단백질을 확인하였으며 B. thuringiensis serovar. kurstaki HD1의 독소 생성유전자와 B. thuringiensis serovar. darmstadiensis의 유전자가 유사성이 있다는 보고를 근거로 하여 B. thuringiensis serovar. HD1의 독소 생성유전자를 가진 프로브(pUYBT 9044)로 이용하여 colony hybridization 및 Southern hybridization 한 결과 2.6Kb EcoRI 단편 및 3.6Kb Hind III 단편을 선발할 수 있었다. 이들 단편들은 B. thuringiensis serovar. kurstaki HD1 독소 유전자와 hybridization시 유사성이 있었다. 특히 3.5Kb HindIII 단편은 2.6Kb EcoR I 단편에 클로닝되어 있는 1.8Kb의 HD1 독소 유전자와 유사성이 있는 부분을 공유하고 있었으며 1.0Kb 정도의 EcoR I-HindIII 부분이 더 삽입한 것을 알 수 있었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제13권2호
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• pp.282-286
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• 2003

The purpose of this study was to isolate a specific DNA probe for the strain ATTC 25611 of the species Prevotella intermedia by using a new rapid screening mothod. The whole-genomic DNA of P. intermedia ATCC 25611 was isolated and purified. The HindIII-digested genomic DNAs from the strain were cloned by the random cloning method. To screen the strain-specific DNA probe, inverted dot blot hybridization tests were performed. In this assay, 20 ng of recombinant plasmids containing the HindIII-digested genomic DNA fragment were boiled and blotted onto a nylon membrane, and hybridized with digoxigenin-dUTP labeled genomic DNAs in a concentration of 100 ng/ml. Southern blot analysis was performed in order to confirm the results of the inverted dot blot hybridization tests. The data showed that a Pi34 probe (2.1 kbp; 1 out of 32 probes) was specific for P. intermedia strain ATCC 25611 and could be useful for the detection and identification of the strain, particularly in epidemiological studies of periodontal disease.

• 대한바이러스학회지
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• 제28권2호
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• pp.175-182
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• 1998

We investigated the rate of hepatitis G virus infection among 50 patients who were not infected with the hepatitis C virus but showed symptoms of hepatitis. Viral RNA was extracted from the patients' sera and cDNA was synthesized and amplified by RT-PCR (reverse transcription-polymerase chain reaction) using random hexamer and 5 primers (470-20-1-77F, 470-20-1-211R, 470-20-1-211R-biotin, GV57-4512MF, GV57-4657MR). The amplified PCR products were confirmed by electrochemiluminescence (ECL), liquid hybridization (LH) and Southern blotting (SB). Among the 50 PCR products, by means of ECL, we found 4 samples to be positive and 5 samples to be indeterminate. The GV45-89M probe (5'-CYCGCTGRTITGGGGTGTACfGGAAGGC-3') was end-labelled with gamma-$^{32}P$ ATP and used for liquid hybridization with the PCR products. By using liquid hybridization, we detected specific bands from 4 positive sera and also from one indeterminate serum as determined by ECL. An 1.5% agarose gel electrophoresis of the 9 PCR products which were HGV positive or indeterminate as determined by ECL showed a 160bp band from 4 positive and one indeterminate serum. The 5 PCR products proved to be positive when SB was applied with the GV45-89M probe as well as when LH was applied. LH and SB were shown to have higher sensitivity and specificity than ECL. Two cases among 5 positive cases had relatively high SGOT, SGPT, ALP values when compared with other 48 cases. In summary, we confirmed hepatitis G virus infection in 5 cases among 50 Korean patients showing symptoms of viral hepatitis.

• 미생물학회지
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• 제35권3호
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• pp.205-210
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• 1999

Vibrio cholerae 는 사람에게 설사를 일으키는 병원성 세규닝며 본 연구에 이용된 V.cholerae KNIH002 는 국내의 설사질환 환자로부터 분리하였다. 콜레라 독소 검출용 프라이머를 이용하여 PCR 로 증폭한 산물을 탐침자로 이용하여 Southern hybridization을 실시한 결과 PstI 및 BglII로 이중절단된 4.5-kb 절편내에서 ctx 유전자가 존재함을 확인하였다. 따라서 염색체 DNA를 PstI 및 BglII로 절단 후 V. cholerae KNIH002 의 유전자 mini-libraries를 제조하였다. 그리고 동일 탐침자를 이용하여 colony hybridization을 실시한 결과 제조된 유전자 mini-libraries 로부터 신호를 나타내는 한 개의 클론을 선발하였다. 선발된 클로닝 지니는 플라스미드를 pCTX75 라 명명하였으며, 이 클론은 CHO 세포에 대한 세포 독력이 나타남을 확인하였다. 염기서열을 결정한 결과 클로닝된 플라스미드에는 ace 와 zot 유전자들은 각각 ATG 개시코돈과 TGA 종결코돈을 포함하여 291 bp와 1,200 bp 로 구성되어져 있었다. ace 유전자의 염기서열은 V.cholerae E7946 EI Tor Ogawa strain 이 것과 100% 일치하였다. 그러나 zot 유전자의 염기서열 및 아미노산 서열은 V. cholerae 395 Classical Ogawa strain 의 것과 각각 99% 및 98.8% 의 상동성을 보였다. 특히, V.cholerae 395 Classicale Ogawa strain 의 Zot 폴리펩타이드에서 100번, 272번, 281번째 alanine 은 V.cholerae KNIH002에서 모두 valine 으로 치환되어져 있었다.