• 식물병연구
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• 제16권3호
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• pp.224-231
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• 2010

1999년부터 2004년 사이에 벼흰잎마름병의 원인균인 Xanthomonas oryzae pv. oryzae를 전국적으로 분리하여 Biolog와 지방산 분석법을 이용하여 동정하였다. 한국의 벼 판별품종을 기준으로 분류한 결과 1999년도와 2002에 각각 분리된 벼흰잎마름병균은 모두 K1 레이스에 속하였다. 2003년도에 분리된 벼흰잎마름병균의 경우는 50% 이상이 K3 레이스에 속하였으며 대부분 전라도 지역에서 분리된 균주였다. 분리 년도 별로 단인자 벼 저항성 품종에 대한 균들의 반응을 보았을 때 많은 K1 레이스로 분류된 균주들이 단인자 저항성 품종에 대해 달리 반응을 보였다. Southern bolt 결과, 동일한 레이스에서도 다양한 비병원성 유전자들을 가지고 있었다. 이러한 결과들은 하나의 레이스가 여러 개의 벼 저항성 유전자와 반응한다는 것을 제시한다. 전남과 전북에서 분리된 모든 K3 레이스들은 Xa3 단인자 저항성 품종을 침해하였는데 이러한 결과는 전남과 전북에 Xa3 저항성원을 지닌 벼 품종의 과다한 재배로 인하여 Xa3 침해 균주의 선별적 증식이 유도된 것으로 추측된다. 이러한 다양한 비병원성 유전자 패턴 및 단인자 저항성 유전자에 대한 반응을 고려하여 국내 분리된 벼흰잎마름병균들을 19개의 병원형으로 분류하였다. 새롭게 분류된 병원형들은 국내의 새로운 저항성 품종을 육종하는데 도움이 될 것이다.

• 대한세포병리학회지
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• 제7권1호
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• pp.1-11
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• 1996

19세기말과 20세기초에 각각 비르효와 파파니콜로에 의해 명료하게 된 세포 병리학과 탈락세포학의 개념에서 오늘날의 암진단의 일차적인 방법이 발전해 왔다. 파파니콜로의 탈락세포학의 개념에서 1960년대 초반에 세침흡인 세포검사가 개발되었다. 이 세침흡인 세포검사는 주된 진단방법이 되어져, 절개생검을 감소하게 하고 의료비용의 효과적인 이용에 공헌하였다. 1980년대에는 면역생화학적 기술들이 암 진단에 보충역활을 하게 되었다. 단 클론 항체를 이용하는 면역과산화효소법이 먼저 암의 본성을 밝히는 보조적인 방법으로 쓰여졌다. 특정 단클론 항체들이 이용가능하게 되어 세포산물이나 표면 표지자들을 인지하는 것을 훨씬 용이하게 하였다. 예를 들면 중간세사에 대한 항체들이 분화가 나쁜 종양의 조직기원을 결정하는데 가치가 있는 것이 증명되었다. 종양표지자들은 종양존재의 생화학적 표시자로 이용될 수도 있는데 이러한 종양표지자들은 혈장이나 다른 체액들에서 검출할 수 있다. 이 종양표지자들을 농출한 것을 진단적 검사에 이용하여 이미 진단된 암의 임상 경과를 추적하고 암 발생의 위험이 있는 집단에서 특정 종양을 발견해 내기 위한 선별검사로써 이용할 수 있다. 유세포 검사는 백혈병이나 림프종 세포들의 면역표현형을 알아내고, 종양세포들의 DNA함유량을 알아내며, 세포증식율을 알아내는 등의 몇가지의 세포의 특성을 분류해내는데 유용한 도구이다. 분자생물학적 방법들은, 암 환자를 진료하는데 있어 진단, 예후평가 및 치료 등의 분야에서 일보 전진하게 하였다. 핵산교잡법이 Southern blots, Nothern blot, Dot blot 및 in situ hybridization으로 이용된다. 분자생물학 및 그 기술이 암종 생물학을 이해하고 유전자 조작을 기초로한 치료법을 계획하는데 밝은 새로운 지평선을 열어줄 수 있을 것이다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제32권3호
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• pp.256-264
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• 2004

본 연구는 벼의 세균병 중 치명적인 흰잎마름병을 유발하는 Xanthomonas oryzae pv. oryzae를 검출할 수 있는 프라이머를 개발하기 위해 실시하였다. X. o. pv. oryzae str. KACC10331의 hpaA유전자 염기서열로부터 흰잎마름병만을 특이적으로 검출할 수 있는 프라이머를 제작하여 중합효소연쇄반응에 사용하였다. 개발된 특이 프라이머는 X. o. pv. oryzae str. KACC10331과 X. campestris pv. vesicatoria, X. campestris pv. campestris, X. axonopodis pv. citri 그리고 X. axonopodis pv. glycines의 phaA유전자 염기서열의 상동성을 비교하여, 그 중 X. o. pv. oryzae만이 가지는 특이적인 부분을 바탕으로 각각 20-mer인 XOF와 XOR를 제작하였다. 제작된 프라이머를 이용하여 중합효소 연쇄반응을 실시한 결과 반응 후 생성된 단편의 크기는 534-bp였다. 반응 후 생성된 단편은 Southern hybridization을 통하여 Xanthomonas 균주들의 hpaA유전자 존재 여부 및 그 상동성을 비교분석하기 위해 사용하였다. 또한 제작된 프라이머를 이용하여 흰잎마름병에 감염된 벼 잎에서의 검출 여부를 확인하였고 X. o. pv. oryzae의 순수 균주 배양액을 중합효소연쇄반응에 이용하여 검출한계를 검정하였다. 본 연구에서 제작된 프라이머를 사용한 중합효소연쇄 반응 방법은 X. o. pv. oryzae의 검출 뿐만 아니라 흰잎마름병의 발생 예찰에 매우 유용할 것으로 판단 되었다.

• 한국육종학회지
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• 제41권4호
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• pp.564-567
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• 2009

"보석"은 국립식량과학원 벼맥류부에서 2008년도에 육성한 조생 고품질 내냉성 품종으로 주요특성과 수량성을 요약하면 다음과 같다. 1. 보통기 보비재배에서 평균 출수기가 7월 29일, 남부중산간지에서는 7월 26일로 오대벼보다 3일정도 빠른 조생종이다. 2. 오대벼에 해 주당수수와 수당립수는 많고, 등숙비율은 다소 높으나 현미천립중은 오대벼보다 가벼운 편이다. 3. 위조현상은 없고 성숙기 하엽노화가 늦고 수발아는 오대벼 보다 잘되는 편이다. 유묘기 내냉성은 오대벼와 비슷하나 내염성은 임실율이 높은 품종이다. 4. "보석"은 도열병에 강한 반응을 보이나 줄무늬잎마름병, 흰잎마름병($K_1{\sim}K_3$) 및 충에 약한 반응을 보였다. 5. "보석" 쌀은 심복백이 거의 없고 투명하며 외관 품위가 오대벼보다 양호하다. 6. 쌀수량은 5.03 MT/ha로 오대벼와 비슷하였다.

• 한국육종학회지
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• 제50권4호
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• pp.522-528
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• 2018

통일형 중생종 '새미면'은 가공업체의 가격경쟁력 및 가공적성에 대한 요구에 부흥하기 위하여 개발된 아밀로스 함량이 높은 쌀국수 전용품종이다. 내병성 등 재배 안정성 및 수량성을 개량하기 위하여 $IR50^*2$/YR18241-B-B-115-1-1 계통에 초다수 성인 '밀양181호(한아름)'을 삼원 교잡한 후 잡종집단 육성 및 선발 등 계통관리를 하였다. 2010년 국립식량과학원에서 생산력 검정시험 결과 초다수성이며 직립형인 YR24235-10-1-3 계통을 선발하여 '밀양278호'로 명명한 후 중부 및 남부 평야지 6개소에서 지역적응성시험을 수행하였다. '새미면'의 출수기는 8월 12일로 중생종이며 도열병, 줄무늬잎마름병, 및 흰잎마름병(K1-K3a)에 저항성이고 벼멸구 등 주요 해충에는 감수성이다. '새미면'은 쌀국수 및 쌀파스타 제조에 중요한 요소인 아밀로스함량이 26.7%이며 알카리붕괴도가 3.5로 낮은 특성을 보였다. '새미면'은 쌀수량이 7.08 MT/ha로서 대비품종인 '다산'에 비해 6% 높았으며, 남부 및 중부 평야지에 적합한 품종이다.

• 한국식물병리학회:학술대회논문집
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• 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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• pp.130-130
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• 2003

Gummy stem blight pathogen is very difficult not only to monitor the inoculum levels prior to host infection, and also it is destructive and hard to control in field condition. We have applied RAPD technique to elucidate the genetic diversity of the genomic DNA of Didymella bryoniae and also to generate specific diagnostic DNA probe useful for identification and detection. The 40 primers produced clear bands consistently from the genomic DNA of twenty isolates of Didymella bryoniae, and two hundred seventy-three amplified fragments were produced with 40 primers. The combined data from 273 bands was analyzed by a cluster analysis using UPGMA method with an arithmetic average program of NTSYS-PC (Version 1.80) to generate a dendrogram. At the distance level of 0.7, two major RAPD groups were differentiated among 20 strains. RAPD group (RG) I included 8 isolates from watermelon except one isolate from melon. RAPD group (RG) IV included 12 isolates from squash, cucumber, watermelon and melon.. In amplification experiment with SCAR specific primer RG1F-RG1R resulted in a single band of 650bp fragment only for 8 isolates out of 20 isolates that should be designated as RAPD Group 1. However, same set of experiment done with RGIIF-RGIIR did not result in any amplified product.. Our attempts to detect intraspecific diversity of ITS region of rDNA by amplifying ITS region and 17s rDNA region for 20 isolates and restriction digestion of amplified fragment with 12 enzymes did not reveal polymorphic band. In order to develop RAPD markers for RGIV specific primer, a candidate PCR fragment( ≒1.4kb) was purified and Southern hybridized to the amplified fragment RGIV isolates. This promising candidate probe recognized only RGIV isolates

• The Plant Pathology Journal
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• 제34권3호
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• pp.171-181
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• 2018

Fruit rot is the principal phytopathological problem of pipiana pumpkin (Cucurbita argyrosperma Huber) in the state of Guerrero. The aims of this research were to 1) identify the causal agent of southern blight on pumpkin fruits by morphological, pathogenic, and molecular analysis (ITS1, 5.8S, ITS2); 2) evaluate in vitro Trichoderma spp. strains and chemical fungicides; and 3) evaluate under rainfed field conditions, the strains that obtained the best results in vitro, combined with fungicides during two crop cycles. Number of commercial and non-commercial fruits at harvest, and seed yield ($kg\;ha^{-1}$) were registered. Morphological, pathogenic and molecular characterization identified Sclerotium rolfsii as the causal agent of rot in pipiana pumpkin fruits. Now, in vitro conditions, the highest inhibition of S. rolfsii were obtained by Trichoderma virens strain G-41 (70.72%), T. asperellum strain CSAEGro-1 (69%), and the fungicides metalaxyl (100%), pyraclostrobin (100%), quintozene (100%), cyprodinil + fludioxonil (100%), and prochloraz (100%). Thiophanate-methyl only delayed growth (4.17%). In field conditions, during the spring-summer 2015 cycle, T. asperellum strain CSAEGro-1 + metalaxyl, and T. asperellum + cyprodinil + fludioxonil, favored the highest number of fruits and seed yield in the crop.

• 한국환경복원기술학회지
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• 제16권1호
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• pp.147-157
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• 2013

Rice is a main crop and rice field is the most important farmland in Korea. This study was conducted to propose the methodology assessing impact and vulnerability on rice production by climate change at the regional and national level in Korea. We evaluated a vulnerability of rice paddy according to the outbreak of a main disease and pest of a rice plant. As results, Jeju-do, Gyeongsangnam-do, and Jeollanam-do were more vulnerable area than others. In contrast, the southern central region including Gyeonggi-do was less vulnerable than others. The vulnerable index was significantly higher in 2050s (0.5589) than in present (0.3500). This result showed that the vulnerable to the disease and pest enlarge in the future. The adaptive capacity highly contributed to the vulnerability assessment index. The daily maximum temperature of June and the daily average temperature from May to August also contributed the climate exposure index. The area of occurring sheath blight, rice leaf blast and striped rice borer was related to the system sensitivity index. The ability of water supply (readjustment area of arable land per paddy field area) and rice production technique (rice yield per hectare) were the highly contributed variables to the adaption capacity index.

• 한국작물학회:학술대회논문집
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• 한국작물학회 2022년도 추계학술대회
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• pp.257-257
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• 2022

Late blight, caused by the hemibiotrophic oomycete pathogen Phytophthora infestans, has been the most important disease limiting potato production worldwide. P. infestans undergo major population shifts in agricultural systems via the successive emergence and migration of asexual lineages. The phenotypic and genotypic bases of these selective sweeps are largely unknown but management strategies need to adapt to reflect the changing pathogen population. Here, we used molecular markers to divide the 86 South Korea isolates into six clonal lineages: KR_1_A1, KR_2_A2, SIB-1, US-11, SIB-1 like, and KR-2 like. We documented the emergence of a new lineage, termed SIB-1 like, and KR-2 like, and their rapid replacement of other lineages to exceed 35% of the pathogen population across South Korea. Genome analyses of the Korean P. infestans populations revealed extensive genetic polymorphism, particularly in effector genes. Importantly, SIB-1 like isolates carry an intact Avr8 effector gene that triggers resistance in potato carrying the corresponding R immune receptor gene R8 cloned from Solarium demissum. These findings point toward a strategy for deploying genetic resistance to mitigate the impact of the SIB-1 like lineage and illustrate how pathogen population monitoring, combined with genome analysis, informs the management of devastating disease epidemics. Further study is being done on pathogenicity of the SIB-1 like isolates on cultivated potatoes and changes in expression patterns of disease effector genes within the SIB-1 like isolates

• 한국육종학회지
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• 제40권3호
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• pp.324-327
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• 2008

'온누리' 품종은 작물과학원 호남농업연구소에서 2005년도에 육성한 중만생 고품질 복합내병성 품종으로 주요특성과 수량성을 요약하면 다음과 같다. 1. '온누리'는 남서해안지, 호남평야지, 중북부내륙지 및 남부중산간지 보통기 표준재배에서 평균 출수기가 8월 12일로 '남평벼'보다 3일 빠른 중만생종이다. 2. 주당수수는 '남평벼'와 비슷하나 수당립수는 많고 등숙 비율은 낮으며 현미천립중은 '남평벼'보다 무거운 편이다 3. 성숙기 하엽노화가 늦고 수발아는 '남평벼'보다 높은 편이다. 춘천 내냉성 검정 결과 '남평벼'에 비해 유묘기 내냉성 및 출수지연일수는 비슷하나 내냉성 임실율은 높았다. 4. 잎도열병에 중도저항성을 보이며 흰잎마름병($K_1{\sim}K_3$), 줄무늬잎마름병에는 저항성이나 오갈병과 검은줄오갈병에는 약하다. 5. 심복백은 거의 없고 '남평벼' 수준으로 맑고 투명하다. 아밀로스함량은 '남평벼'와 비슷하나 단백질함량이 낮고 밥맛이 매우 양호하다. 6. 쌀수량은 보통기 표준재배에서 5.94 MT/ha로 '남평벼'보다 9% 증수 되었으며 이모작재배에서는 5.17 MT/ha, 만식재배에서 5.48 MT/ha로 각각 '남평벼'보다 3, 12% 증수하였다.