Jung, Yong;Seo, Hwa-Jeong;Park, Yu-Rang;Kim, Ji-Hun;Bien, Sang Jay;Kim, Ju-Han
Genomics & Informatics
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v.9
no.1
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pp.19-27
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2011
Gene Expression Omnibus (GEO) has kept the largest amount of gene-expression microarray data that have grown exponentially. Microarray data in GEO have been generated in many different formats and often lack standardized annotation and documentation. It is hard to know if preprocessing has been applied to a dataset or not and in what way. Standard-based integration of heterogeneous data formats and metadata is necessary for comprehensive data query, analysis and mining. We attempted to integrate the heterogeneous microarray data in GEO based on Minimum Information About a Microarray Experiment (MIAME) standard. We unified the data fields of GEO Data table and mapped the attributes of GEO metadata into MIAME elements. We also discriminated non-preprocessed raw datasets from others and processed ones by using a two-step classification method. Most of the procedures were developed as semi-automated algorithms with some degree of text mining techniques. We localized 2,967 Platforms, 4,867 Series and 103,590 Samples with covering 279 organisms, integrated them into a standard-based relational schema and developed a comprehensive query interface to extract. Our tool, GEOQuest is available at http://www.snubi.org/software/GEOQuest/.
The Journal of Korean Institute of Communications and Information Sciences
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v.16
no.12
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pp.1423-1434
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1991
This paper extends TTCN, a conformance test notation, using object oriented concepts including object, class and inheritance. In distributed system environments, since test systems that should test the implementations for application protocols whether they conform to the standard protocol include protocol test behaviours executed in parallel, the converntional TTCN can't describe whole thest suites explicitly. ISO is working the extension of TTCN including parallel notations, but concurrently if TTCN could be applied by the object model that regards a parallel test component as a object, we would gain the advantages of reliability and software reusability, and make TTCN a test language.
The Transactions of the Korea Information Processing Society
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v.6
no.3
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pp.804-811
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1999
The object-oriented methods are being rapidly accepted as the solution for the software crisis. Object-oriented systems are composed of the integration of independent object modules; their merits are such that it is possible to reuse objects already developed, and that, when changes are required, modifications are restricted to some independent objects such that their affects to other objects are so little. In this paper, we deal with the macro assembler for next-generation microprocessors which has the merits of object methods. Whenever a microprocessor is newly developed, new assembler should be developed or the existing assembler be modified. In the former, it leads to the loss of time and money by the repeated developments, and, in the latter, it causes the problem of inefficient productivity since other modules are to be analyzed for the affections followed by modifications of one module, especially in the existing assemblers. To resolve these problems, the object-oriented macro assembler suggested in this paper consists of independent objects separable such that it shows reusability and reduces the inefficient productivity by minimizing the affects to other objects. Moreover, the object-oriented macro assembler integrates a macro pre-processor into an assembler, and uses automata for analyzing input streams to reduce the compile time.
The Transactions of the Korea Information Processing Society
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v.7
no.3
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pp.842-851
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2000
Developers can reuse not only class code but also wide range of knowledge on domain by reusing framework. Existing Object-Oriented Methodology and Catalysis Methodology were presented when redefining component in the course of redesigning framework. However, existing methodologies have weakness that entire process is waterfall mode or design of interface lays too much stress on implementation stage. So, this thesis will present Component-Oriented Methodology for the reuse of framework, and construct the environment for framework and domain development. That is, domain is analyzed by input of domain knowledge on real world to create software based on component, and hotspot is identified through analyzed information, and refactoring by putting additional information on users and developers. After that, I will create domain framework and application framework depending on domain. In this Component-Oriented Methodology, information is searched, understood and extracted or composite through component library storage internally. Then this information is classified into the information on component, and used as additional information in redesigning. With this, developer can obtain reusability, easiness and portability by constructing infrastructure environment that allows to register, update and delete component through Component Management System(CMS) under he development environment which can be easily applied to his own application using framework component, in this thesis, CoRBA(Common Object Request Broker Architecture) environment.
This paper presents a structured framework for developing the embedded subsystem, called ESDMP (Embedded Subsystem Development Methodology for POP), which is one of core components at the development of POP (Point Of Production) system. It is essential that embedded subsystem development methodology must be closely related to the general information system development methodology from the early stage of system development. Therefore, this paper investigates the PDSM (Production System Development Methodology) that is developed by Korea Technology and Information Promotion Agency for SMEs and widely utilized at the fields of POP system development, and proposes the embedded subsystem development methodology aligned with each step of PSDM. The main characteristics of proposed methodology are as follows : First, it is developed to link each step of embedded subsystem development with relating steps of PSDM from the early stage of feasibility study. Second, it provides the procedure for designing and implementing hardware and software simultaneously. Third, it includes the method of reusability for developed products and modules.
Spreadsheet is one of the most widely used programming tool because of its ease of use, however there have been few researches on applying object-oriented techniques in developing spreadsheet applications. Generally, spreadsheet applications contain a lot of errors, and spreadsheet has some drawbacks such as low reusability and hard maintenance. In order to solve these problems, we introduce an object-oriented spreadsheet system, named XCEL. It enables users to develop applications using systematic techniques with data modelling method, and allows users to apply object-oriented technologies to spreadsheet programming. The data modelling method allows to define classes using XML and flowchart, and the spreadsheet represents an object with contiguous cells. XCEL has advantage that users can apply object-oriented technology to spreadsheet programming.
Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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2018.05a
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pp.608-610
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2018
The future of Internet of Things ecosystem seems to be worth it, however by using a monolithic approach we might end up by dealing with complexity of the system as long as the statistics show that by 2020 IoT devices will reach around 50 billion. The microservice architecture approach utilizes the service-oriented architecture together with best practices and latest developments in software virtualization to overcome complexity issues, allow reusability of services or microservices instead of creating new ones. The microservice architecture provides secure platforms if it is developed and deployed in a container. Thus, this paper surveys on the microservices, microservices architecture and containers, microservices based Internet of Things.
Journal of the Korean Institute of Intelligent Systems
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v.12
no.4
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pp.328-333
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2002
The deeper the hierarchy of a inheritance structure is, the better the reusability of the structure is, but the more difficult the understandability and the maintainability of it is. On the contrary, the shallower the hierarchy is, the worse the abstraction of the inheritance structure is, but the better the understandability and modifiability of it is. Therefore, it is to be desired that a deep hierarchy of a inheritance structure should be split to be shallow for the maintainability of a system. This paper proposed a complexity metric that is based on DIT and NOC of Chidamber and Kemerer, and solved the ambiguity of the metrics of them, which was pointed out by Li. The metric is a simple and heuristic one for measuring the complexity of class inheritance structures by considering the number of ancestor classes and descendant classes and the depth of inheritance hierarchy. This provides a quantitative information for assessing the complexity of a inheritance structure in splitting it.
Due to the classes in object-orientation, which are too detailed and specific, their reusability can be decreased. Components, considered to be more coarse-grained compared to objects, help maintain software complexity effectively and facilitate software reuse. Furthermore, component technology becomes essential by the appearance of the new frameworks, such as MDA, SOA, etc. Consequently, it is necessary to reengineer an existing object-oriented system into a component-based system suitable to those new environments. In this paper, we propose a model-based quantitative reengineering methodology to identify components from object-oriented systems. We expand system model and process, which are defined in our prior work, more formally and precisely. A system model, constructed from object-oriented system, is used to extract and refine components in quantitative ways. We develop a supporting tool and show effectiveness of the methodology through applying it to an existing object-oriented system.
As software is large and sophisticate, in order to increase the productivity and efficiency of programs in programming development environments, it is necessary to support the integrated system that offers user interface integrated editing, compiling, debugging, and running steps. The key tool in such environments is an incremental translation. In this paper, in order to increase the productivity and reusability of software, the goal is to construct the integrated incremental interpretation system that supports friendly user interface with editor, debugger, and incremental interpreter. We define the new object-oriented language, IMPLO(IMPerative Language with Object) using EBNF notation, and construct the integrated incremental interpretation system using incremental interpreter of the language. To do so, we extend attribute grammars for specifying static semantics and present new action equations to describe the dynamic semantics. We executed the incremental interpretation by using analyzing the dynamic semantics and then implemented integrated incremental interpretation system with editor and debugger in C, Lex and Yacc using X windows on SUN. We obtain about 50% speedups in case of incremental execution time for example programs.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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